MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	CGC	2	6	9	14	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007778	TTC	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007778	CGG	3	9	144	152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007778	CGG	2	6	264	269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007778	ACGGC	2	10	307	316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007778	GAC	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007778	AGG	2	6	374	379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007778	CGA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007778	ATT	2	6	442	447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007778	CAT	2	6	464	469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007778	GCA	2	6	475	480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007778	CGCGG	2	10	605	614	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007778	GCT	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007778	CGG	2	6	2098	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007778	GACG	2	8	2107	2114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007778	CGG	2	6	2140	2145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007778	CCG	2	6	2200	2205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007778	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_007778	GCC	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_007778	CGG	2	6	2309	2314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007778	CGAAG	2	10	3616	3625	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007778	TTCG	2	8	4032	4039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_007778	GCG	2	6	5235	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007778	A	6	6	5330	5335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007778	GC	3	6	5415	5420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007778	GCG	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007778	GAT	2	6	9122	9127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007778	CGA	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007778	GA	3	6	9707	9712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007778	TTC	2	6	9716	9721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007778	T	6	6	9757	9762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007778	GGC	2	6	10133	10138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007778	TCG	2	6	10139	10144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007778	GGCG	2	8	10151	10158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007778	TGG	2	6	10243	10248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007778	GCG	2	6	10265	10270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007778	GCG	2	6	12852	12857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007778	CGG	2	6	14970	14975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007778	CGG	2	6	14977	14982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007778	CGG	2	6	18455	18460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007778	CAG	2	6	18534	18539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007778	CGG	2	6	18548	18553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007778	CG	3	6	18601	18606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007778	ACGG	2	8	18635	18642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007778	AAG	2	6	18674	18679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007778	ATTC	2	8	18688	18695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007778	ATGG	2	8	18702	18709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007778	CG	3	6	18740	18745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007778	GCT	2	6	18748	18753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007778	CGG	2	6	18780	18785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007778	CCCT	2	8	19715	19722	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_007778	GC	3	6	21305	21310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007778	ATC	2	6	21319	21324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007778	AGC	2	6	21335	21340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007778	CGG	3	9	21350	21358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007778	CCGGG	2	10	21398	21407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007778	GCG	3	9	21478	21486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007778	TCGC	2	8	22215	22222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007778	CTGC	2	8	22231	22238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007778	TC	3	6	22309	22314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007778	GC	3	6	22395	22400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007778	TCC	2	6	23306	23311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007778	CGG	2	6	23372	23377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007778	CGG	2	6	25040	25045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007778	GCCACC	2	12	25831	25842	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_007778	GCGCC	2	10	25894	25903	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_007778	GC	3	6	25939	25944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007778	GAC	2	6	26299	26304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007778	GCG	2	6	26328	26333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007778	GTC	2	6	27229	27234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007778	TCT	2	6	27261	27266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007778	GATG	2	8	27277	27284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007778	GCT	2	6	27308	27313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007778	TTG	2	6	27316	27321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007778	CG	3	6	27367	27372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007778	TGGT	2	8	27941	27948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007778	CGCGG	2	10	29231	29240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007778	GAA	2	6	29276	29281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007778	GTC	2	6	29300	29305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007778	CCA	2	6	29358	29363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007778	GCG	2	6	29385	29390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007778	GAC	2	6	29413	29418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007778	GCC	2	6	29433	29438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007778	TC	3	6	29967	29972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007778	CCG	2	6	30032	30037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007778	GGCG	2	8	30054	30061	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007778	GCGG	2	8	30103	30110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007778	CGGG	2	8	32932	32939	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007778	CGC	2	6	32954	32959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007778	CGG	2	6	33005	33010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007778	CGC	2	6	33011	33016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007778	CCG	2	6	36813	36818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007778	CG	3	6	36861	36866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007778	CGG	2	6	36913	36918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007778	CGTTG	2	10	37387	37396	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007778	CTA	2	6	37413	37418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007778	TGT	2	6	37434	37439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007778	CG	3	6	37838	37843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007778	CGA	2	6	37863	37868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007778	CAGCG	2	10	37881	37890	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007778	CGG	2	6	37915	37920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007778	AGA	2	6	37926	37931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007778	CCG	2	6	37932	37937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007778	CGA	2	6	37957	37962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007778	GAA	2	6	39206	39211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007778	GCG	2	6	39221	39226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007778	GC	3	6	39238	39243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007778	TTGATC	2	12	39341	39352	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007778	GACA	2	8	39393	39400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007778	TCG	3	9	39413	39421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007778	CAG	2	6	39432	39437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007778	GC	3	6	39699	39704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007778	TCG	2	6	40002	40007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007778	GGC	2	6	40017	40022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007778	ACG	2	6	40045	40050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007778	CGA	2	6	40084	40089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007778	TCGG	2	8	40165	40172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007778	CACCCT	2	12	42432	42443	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_007778	GCG	3	9	42457	42465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007778	CT	3	6	42466	42471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007778	GGAGGG	2	12	42484	42495	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007778	ATC	2	6	42958	42963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007778	CCGG	2	8	42983	42990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007778	GCCG	2	8	43001	43008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007778	TGC	2	6	43018	43023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007778	GAT	2	6	43069	43074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007778	GC	3	6	43106	43111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007778	CCG	3	9	43120	43128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_007778	GC	3	6	43135	43140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007778	TCG	2	6	43204	43209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007778	GA	3	6	43260	43265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007778	CGC	2	6	43564	43569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_007778	CG	3	6	43602	43607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007778	GTC	2	6	44005	44010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007778	CTGT	2	8	44036	44043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007778	CGC	2	6	44106	44111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007778	CTGT	2	8	45285	45292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007778	GAT	2	6	45433	45438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007778	ACG	2	6	45459	45464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007778	ACG	2	6	46048	46053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007778	AC	3	6	46126	46131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007778	TCG	2	6	48571	48576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007778	CACG	2	8	48609	48616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007778	GC	3	6	48633	48638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007778	GC	3	6	48643	48648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007778	GC	3	6	48707	48712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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