MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 1754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007766	AGA	2	6	21	26	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007766	GCG	2	6	27	32	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007766	GTTC	2	8	40	47	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007766	TGT	2	6	181	186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007766	ATA	2	6	218	223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007766	CG	3	6	251	256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007766	CGT	2	6	263	268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007766	GAA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007766	CCGG	2	8	367	374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007766	CGC	2	6	422	427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007766	TCC	2	6	467	472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007766	CGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007766	CGGC	2	8	596	603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007766	TCAA	2	8	614	621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007766	CTT	2	6	663	668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007766	GCCG	2	8	688	695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007766	GCA	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007766	ATT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007766	GA	3	6	3489	3494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007766	CAGA	2	8	3529	3536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007766	CTC	2	6	5802	5807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_007766	CGA	2	6	5815	5820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007766	TCC	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_007766	GCG	2	6	5856	5861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007766	CAC	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007766	GAG	2	6	5901	5906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007766	TC	3	6	5928	5933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007766	GCA	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007766	CGAC	2	8	6006	6013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007766	GGA	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007766	CGC	2	6	7833	7838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007766	TCATG	2	10	7861	7870	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007766	AAC	2	6	7876	7881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007766	GC	3	6	8354	8359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007766	CGG	2	6	9164	9169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007766	TGA	2	6	9170	9175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007766	CGG	2	6	9243	9248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007766	CG	3	6	9255	9260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007766	AGAA	2	8	9261	9268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007766	CA	3	6	11673	11678	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007766	AAT	2	6	15680	15685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007766	GC	4	8	15699	15706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007766	CAT	2	6	15784	15789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007766	GCA	2	6	15804	15809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007766	GCT	2	6	15878	15883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007766	GCG	2	6	15885	15890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007766	GGAA	2	8	15934	15941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007766	CTCCGT	2	12	16488	16499	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007766	TGA	2	6	16536	16541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007766	CCG	2	6	16545	16550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007766	CGG	2	6	16615	16620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007766	GA	3	6	16677	16682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007766	CGG	2	6	16739	16744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007766	GTG	2	6	16753	16758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007766	GAG	2	6	17662	17667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007766	GCC	2	6	18109	18114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007766	GAG	2	6	19470	19475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007766	CAT	2	6	19519	19524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007766	TCC	2	6	20622	20627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_007766	GAGGG	2	10	20703	20712	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007766	TGA	2	6	20775	20780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007766	TTA	2	6	20783	20788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007766	GCG	2	6	20882	20887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007766	CATC	2	8	21037	21044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007766	CT	3	6	21120	21125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007766	GA	3	6	21215	21220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007766	GCC	2	6	21271	21276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007766	CCA	2	6	21307	21312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_007766	GCA	2	6	21323	21328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007766	GCC	2	6	21332	21337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_007766	GCG	2	6	21369	21374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007766	GTC	2	6	21810	21815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007766	GCA	2	6	21843	21848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007766	CTT	2	6	21891	21896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007766	GGC	3	9	21936	21944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007766	GGC	2	6	22068	22073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007766	CGC	2	6	22092	22097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007766	TCT	2	6	22103	22108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007766	CGC	3	9	22496	22504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007766	TCC	2	6	22505	22510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007766	CAG	2	6	22568	22573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007766	TCA	2	6	22609	22614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007766	CCT	2	6	22633	22638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007766	AAG	2	6	22671	22676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007766	CAC	2	6	22737	22742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_007766	CGC	2	6	22796	22801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007766	CGT	2	6	22814	22819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007766	TTC	2	6	22839	22844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007766	CTC	3	9	22872	22880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007766	GCC	2	6	22970	22975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007766	TCC	2	6	23070	23075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_007766	ACC	2	6	23076	23081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007766	CCT	2	6	23082	23087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007766	CGC	2	6	23128	23133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007766	CGC	2	6	23136	23141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007766	TCG	2	6	23155	23160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007766	CCT	2	6	23210	23215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007766	TGG	2	6	23733	23738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007766	CTC	3	9	23758	23766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007766	GCT	2	6	23797	23802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007766	AGG	2	6	23846	23851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007766	CT	3	6	23867	23872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007766	CGC	2	6	24020	24025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007766	TCAA	2	8	24043	24050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_007766	GC	3	6	24056	24061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007766	GCT	2	6	24064	24069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007766	GCA	2	6	24106	24111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007766	GCC	2	6	24112	24117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_007766	TCA	2	6	24120	24125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007766	TCG	2	6	24143	24148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007766	CA	3	6	24152	24157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007766	CCT	2	6	24281	24286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_007766	CAC	2	6	24303	24308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_007766	GCG	2	6	24415	24420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007766	CGG	2	6	24425	24430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007766	CTT	3	9	24510	24518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007766	TCG	2	6	24559	24564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007766	CAG	2	6	24593	24598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007766	AGAC	2	8	24609	24616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007766	CTCG	2	8	27240	27247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_007766	GAA	2	6	27252	27257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007766	AACT	2	8	27286	27293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007766	CTG	2	6	28068	28073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007766	T	6	6	28194	28199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007766	GCG	2	6	28225	28230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007766	CAT	2	6	28281	28286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007766	ATC	2	6	29390	29395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007766	TAG	2	6	29405	29410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007766	CGC	2	6	29422	29427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007766	TCCG	2	8	30384	30391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007766	GGC	2	6	30453	30458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007766	GGT	2	6	30498	30503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007766	CTT	2	6	32224	32229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007766	TCC	2	6	32244	32249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_007766	CGGG	2	8	32272	32279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007766	GCC	2	6	36215	36220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007766	TCC	2	6	39433	39438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007766	GGT	2	6	39440	39445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007766	ATG	2	6	40396	40401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007766	CAG	2	6	40417	40422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007766	CGGC	2	8	44280	44287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007766	CTC	2	6	44290	44295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_007766	CGG	2	6	44372	44377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007766	AGG	2	6	44424	44429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007766	GAT	2	6	45172	45177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007766	GCG	2	6	45190	45195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007766	GTC	2	6	45202	45207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_007766	CGT	2	6	45227	45232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007766	AGG	2	6	45270	45275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007766	CGG	2	6	45635	45640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007766	CGG	2	6	45691	45696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_007766	GAG	3	9	50251	50259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_007766	GCG	2	6	58594	58599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_007766	TGG	2	6	58604	58609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_007766	GGA	2	6	58616	58621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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