MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 1754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_007766	CTG	2	6	578249	578254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_007766	ACG	2	6	578258	578263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_007766	CG	3	6	578262	578267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_007766	CCGG	2	8	578271	578278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_007766	GGT	2	6	578326	578331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_007766	GGGC	2	8	578366	578373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_007766	CAT	2	6	578394	578399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_007766	GCC	2	6	578460	578465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_007766	GC	3	6	578516	578521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_007766	AAACCG	2	12	578551	578562	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_007766	GAT	2	6	579171	579176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_007766	TCA	2	6	579215	579220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_007766	GC	4	8	579283	579290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_007766	TCG	2	6	579304	579309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_007766	GAT	2	6	579943	579948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_007766	TCG	2	6	580020	580025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_007766	CAA	2	6	580051	580056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_007766	GCT	2	6	580060	580065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_007766	CG	3	6	580070	580075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_007766	GGGCCG	2	12	580086	580097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_007766	CGG	2	6	580219	580224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_007766	ATC	2	6	580246	580251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_007766	C	6	6	582074	582079	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1524	NC_007766	CA	3	6	584920	584925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_007766	CG	3	6	586338	586343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_007766	ATG	2	6	586364	586369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_007766	ATC	2	6	586385	586390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_007766	GCC	2	6	588993	588998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_007766	GCG	2	6	589011	589016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_007766	CA	3	6	590263	590268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_007766	CAG	2	6	590288	590293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_007766	TCT	2	6	590381	590386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_007766	GCG	2	6	590405	590410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_007766	GGC	2	6	594066	594071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_007766	CGA	2	6	594080	594085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_007766	ACCG	2	8	594479	594486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_007766	TC	3	6	595318	595323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_007766	GAT	2	6	595359	595364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_007766	CTT	2	6	595403	595408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_007766	CGC	2	6	595527	595532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_007766	CAG	2	6	595568	595573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_007766	CTG	2	6	598790	598795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_007766	AT	3	6	598805	598810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_007766	AGG	2	6	598940	598945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_007766	CGC	2	6	599606	599611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_007766	GC	3	6	599662	599667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_007766	CCTC	2	8	599694	599701	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1548	NC_007766	TCC	2	6	599742	599747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_007766	CCG	2	6	599751	599756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_007766	GC	3	6	599759	599764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_007766	TCCG	2	8	599793	599800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_007766	TTC	2	6	599816	599821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_007766	CG	3	6	599836	599841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_007766	CCG	2	6	599842	599847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_007766	CGGC	2	8	601787	601794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_007766	GCG	2	6	601849	601854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_007766	ATC	2	6	601917	601922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_007766	C	6	6	602048	602053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1559	NC_007766	GCC	2	6	602057	602062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_007766	CG	3	6	602084	602089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_007766	CTC	2	6	602100	602105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_007766	CG	3	6	603227	603232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_007766	TC	3	6	604424	604429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_007766	GCG	2	6	604452	604457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_007766	ATGA	2	8	604524	604531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_007766	CAGA	2	8	605884	605891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_007766	CG	3	6	605940	605945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_007766	GGA	2	6	608836	608841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_007766	TC	3	6	609567	609572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_007766	CGC	2	6	610294	610299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_007766	GGC	2	6	610326	610331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_007766	GCC	2	6	610337	610342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_007766	GACC	2	8	610359	610366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_007766	GC	3	6	610376	610381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_007766	TGG	2	6	610391	610396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_007766	CG	3	6	610408	610413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_007766	CGG	2	6	611885	611890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_007766	GAT	2	6	611894	611899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_007766	TGA	2	6	611913	611918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_007766	T	6	6	612336	612341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_007766	GCC	2	6	612351	612356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1582	NC_007766	GCC	2	6	613109	613114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_007766	CCA	2	6	613125	613130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_007766	GTG	2	6	613143	613148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_007766	GCCCAT	2	12	613163	613174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_007766	GCC	2	6	613179	613184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_007766	TCG	2	6	613186	613191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_007766	GAA	2	6	613193	613198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_007766	GCT	2	6	613227	613232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_007766	CTG	2	6	613280	613285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_007766	GC	3	6	613305	613310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_007766	CTG	2	6	613370	613375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_007766	TCC	2	6	613410	613415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1595	NC_007766	GAT	2	6	613550	613555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_007766	GC	3	6	613563	613568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_007766	ATC	2	6	613581	613586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_007766	GCG	2	6	613598	613603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_007766	CG	3	6	613602	613607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_007766	CGG	2	6	613620	613625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_007766	GCA	2	6	613643	613648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_007766	GAT	2	6	613665	613670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_007766	CCGC	2	8	613754	613761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1604	NC_007766	ACG	2	6	613816	613821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_007766	GGC	2	6	613833	613838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_007766	GGC	2	6	613971	613976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_007766	AGC	2	6	614023	614028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_007766	CGC	2	6	614034	614039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_007766	TGA	2	6	614060	614065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_007766	TGC	2	6	614131	614136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_007766	TCA	2	6	614144	614149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_007766	CGTGG	2	10	614151	614160	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1613	NC_007766	AAT	2	6	614168	614173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_007766	CG	3	6	614192	614197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_007766	CT	3	6	614230	614235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_007766	GTT	2	6	614244	614249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_007766	GGCG	2	8	614267	614274	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_007766	TGG	2	6	614297	614302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_007766	GAC	2	6	614304	614309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_007766	TCG	2	6	614339	614344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_007766	AAG	2	6	614385	614390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_007766	TCG	2	6	614396	614401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_007766	ATC	2	6	614416	614421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_007766	GCG	2	6	614542	614547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_007766	GAAA	2	8	614556	614563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_007766	GAT	2	6	614564	614569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_007766	ATT	2	6	614620	614625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_007766	GTCG	2	8	614687	614694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_007766	TC	3	6	614750	614755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_007766	CA	3	6	617557	617562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1635	NC_007766	CCG	2	6	617629	617634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.