MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007764	CCGT	2	8	21	28	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007764	GAT	2	6	34	39	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007764	GAG	2	6	65	70	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007764	GCT	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007764	ACC	2	6	882	887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007764	AGG	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007764	GCT	2	6	6892	6897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007764	ACA	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007764	GAC	2	6	9966	9971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007764	CAT	2	6	9993	9998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007764	T	6	6	10632	10637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007764	GA	3	6	10654	10659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007764	AG	4	8	10709	10716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007764	AGG	2	6	11309	11314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007764	AGG	2	6	11510	11515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007764	CGA	2	6	11610	11615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007764	GC	3	6	11632	11637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007764	GAG	2	6	11684	11689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007764	GGC	2	6	11690	11695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007764	AGA	2	6	11741	11746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007764	TTGC	2	8	13567	13574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007764	CGA	2	6	15249	15254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007764	GGA	2	6	16371	16376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007764	GTGA	2	8	16450	16457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007764	AAG	2	6	16459	16464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007764	ATA	2	6	17935	17940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007764	TCG	2	6	18717	18722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007764	GCC	2	6	18747	18752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_007764	ATA	2	6	18948	18953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007764	AG	3	6	18960	18965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007764	TC	3	6	30648	30653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007764	GTC	2	6	30680	30685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007764	GCC	2	6	30716	30721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007764	CAT	2	6	30801	30806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007764	ACGAA	2	10	30810	30819	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007764	TCGG	2	8	31450	31457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007764	CTC	2	6	31466	31471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007764	GAG	2	6	31472	31477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007764	TCC	2	6	35526	35531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007764	CGA	2	6	37890	37895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007764	T	7	7	37928	37934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007764	TCG	2	6	37954	37959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007764	TGG	2	6	37971	37976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007764	GCGA	2	8	37981	37988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007764	TA	3	6	40074	40079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007764	CGAA	2	8	40155	40162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007764	CGC	2	6	40964	40969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007764	GCC	2	6	40972	40977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007764	GAT	2	6	41001	41006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007764	CGG	2	6	41088	41093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007764	GACC	2	8	41097	41104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007764	CCGC	2	8	41131	41138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_007764	GGCGC	2	10	41220	41229	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007764	GCC	2	6	41376	41381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007764	GCC	2	6	43982	43987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007764	GC	3	6	43995	44000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_007764	TCC	2	6	44027	44032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007764	TAG	2	6	44053	44058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007764	CGC	2	6	44223	44228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_007764	AGAA	2	8	44260	44267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007764	TGA	2	6	44280	44285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007764	GCG	2	6	44318	44323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007764	TTGAA	2	10	44360	44369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007764	CTG	2	6	44426	44431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007764	CGGT	2	8	44848	44855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007764	ACC	2	6	44885	44890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007764	GCA	2	6	46264	46269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007764	CAG	2	6	46272	46277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007764	TTGCT	2	10	46692	46701	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007764	TCTG	2	8	47950	47957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007764	CAA	2	6	47960	47965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007764	TGGA	2	8	48924	48931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007764	GGA	3	9	48929	48937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007764	GGC	2	6	48991	48996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007764	C	7	7	49031	49037	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_007764	G	6	6	50668	50673	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007764	AGG	2	6	50745	50750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007764	GCG	2	6	50755	50760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007764	AG	3	6	50862	50867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007764	ACG	2	6	50898	50903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007764	GCG	2	6	50928	50933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007764	ATC	2	6	50953	50958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007764	GGC	2	6	50993	50998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007764	CGC	2	6	51003	51008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007764	CTG	2	6	51009	51014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007764	GGA	2	6	51047	51052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007764	GC	3	6	51095	51100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007764	CG	3	6	51130	51135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007764	CG	3	6	55406	55411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007764	ATG	2	6	55583	55588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007764	GAC	2	6	55612	55617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007764	ATC	2	6	55677	55682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007764	GACG	2	8	57771	57778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007764	GCC	2	6	62413	62418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007764	CTC	2	6	65176	65181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007764	AT	3	6	65302	65307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007764	GAT	2	6	65324	65329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007764	CAA	2	6	65359	65364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007764	TGC	2	6	65386	65391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007764	CTG	2	6	67093	67098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007764	GGA	2	6	67111	67116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007764	GGA	2	6	67133	67138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007764	AGG	2	6	67927	67932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007764	GGGGC	2	10	70300	70309	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007764	GGA	2	6	70318	70323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007764	CTT	2	6	75242	75247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007764	ATT	2	6	75275	75280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007764	CTG	2	6	75317	75322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007764	CGG	2	6	75354	75359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007764	TAA	2	6	75398	75403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007764	AAG	2	6	75798	75803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007764	GGGC	2	8	75817	75824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007764	CGCA	2	8	75863	75870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007764	AG	3	6	75951	75956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007764	CGC	2	6	75989	75994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007764	ATCA	2	8	76071	76078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007764	CTC	3	9	76860	76868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007764	CGG	2	6	78276	78281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007764	ATA	2	6	78289	78294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007764	ATGT	2	8	78299	78306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007764	T	6	6	78407	78412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007764	CGG	2	6	78422	78427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007764	AGC	2	6	78459	78464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_007764	GAA	2	6	79819	79824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007764	TCG	2	6	79845	79850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007764	CG	3	6	79849	79854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007764	GCT	2	6	79873	79878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007764	GGAT	2	8	79942	79949	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007764	TGC	2	6	79952	79957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007764	TCT	2	6	79965	79970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007764	CG	3	6	80057	80062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007764	AGG	2	6	80084	80089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007764	GCT	2	6	80161	80166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007764	GA	3	6	80202	80207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007764	GA	3	6	80213	80218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007764	GCC	2	6	81559	81564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007764	CAT	2	6	81584	81589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007764	ACG	2	6	84445	84450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_007764	AGC	2	6	86807	86812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007764	GCAA	2	8	86815	86822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007764	TTA	2	6	86913	86918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007764	GC	3	6	86923	86928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007764	CAT	2	6	86934	86939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_007764	A	6	6	95193	95198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007764	CAA	2	6	95209	95214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_007764	TCC	2	6	222013	222018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
421	NC_007764	TTG	2	6	222019	222024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_007764	GAT	2	6	222025	222030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_007764	CAG	2	6	222108	222113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_007764	GCC	2	6	222127	222132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_007764	TCG	2	6	222175	222180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_007764	GCCG	2	8	222198	222205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
428	NC_007764	CAT	2	6	222213	222218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_007764	CAC	2	6	222261	222266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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435	NC_007764	CTT	2	6	222422	222427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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437	NC_007764	CA	3	6	222510	222515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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443	NC_007764	CGG	2	6	223402	223407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_007764	AAT	2	6	223449	223454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_007764	GGA	2	6	223505	223510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
448	NC_007764	GGA	2	6	223613	223618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
449	NC_007764	GTT	2	6	223625	223630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_007764	TCGC	2	8	223712	223719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_007764	CGTT	2	8	223803	223810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_007764	CCG	2	6	223843	223848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_007764	CTC	2	6	223913	223918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
454	NC_007764	CT	3	6	223920	223925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
455	NC_007764	A	6	6	223969	223974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_007764	CGC	2	6	223983	223988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
457	NC_007764	AGG	2	6	224025	224030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
458	NC_007764	CGC	2	6	224031	224036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_007764	TTC	2	6	224143	224148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_007764	CCG	2	6	224154	224159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
463	NC_007764	CCATG	2	10	224195	224204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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