MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 12148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007761	CCGTC	2	10	3882818	3882827	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11002	NC_007761	TTG	2	6	3883307	3883312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_007761	AAT	2	6	3884293	3884298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_007761	AAC	2	6	3884378	3884383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_007761	GAT	2	6	3884400	3884405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_007761	CTC	2	6	3884453	3884458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11007	NC_007761	GCC	2	6	3884472	3884477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_007761	TCC	2	6	3884523	3884528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_007761	GAC	2	6	3884543	3884548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_007761	CCA	2	6	3884674	3884679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_007761	GAG	2	6	3884704	3884709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_007761	ACC	2	6	3886686	3886691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_007761	GC	3	6	3886700	3886705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_007761	TACA	2	8	3888566	3888573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_007761	AGG	2	6	3888621	3888626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_007761	TTC	2	6	3889775	3889780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_007761	AGA	2	6	3889798	3889803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_007761	AG	3	6	3889830	3889835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_007761	AATAT	2	10	3889882	3889891	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_007761	AGC	2	6	3889921	3889926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_007761	GATG	2	8	3893206	3893213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_007761	GCC	2	6	3893226	3893231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_007761	TGCC	2	8	3894783	3894790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_007761	GCCG	2	8	3894795	3894802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11025	NC_007761	GC	3	6	3897495	3897500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_007761	TGT	2	6	3897516	3897521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_007761	GATCT	2	10	3897538	3897547	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11028	NC_007761	GCC	2	6	3897591	3897596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_007761	CGG	2	6	3897614	3897619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_007761	AGG	2	6	3897657	3897662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_007761	TCC	2	6	3898980	3898985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_007761	AGA	2	6	3898987	3898992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_007761	TCA	2	6	3899030	3899035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_007761	A	7	7	3899042	3899048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_007761	TGC	2	6	3899064	3899069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_007761	T	6	6	3899112	3899117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_007761	GCCG	2	8	3900105	3900112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11038	NC_007761	CAAAA	2	10	3900142	3900151	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11039	NC_007761	AGA	2	6	3900931	3900936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_007761	CCG	2	6	3900938	3900943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11041	NC_007761	CCGG	2	8	3902239	3902246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11042	NC_007761	ACG	2	6	3902267	3902272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_007761	CG	3	6	3902271	3902276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_007761	GGC	2	6	3904276	3904281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_007761	AGCTT	2	10	3904317	3904326	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11046	NC_007761	GCA	2	6	3904334	3904339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_007761	TGA	2	6	3904374	3904379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_007761	CGC	2	6	3904421	3904426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11049	NC_007761	TTC	2	6	3907585	3907590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_007761	CGG	2	6	3908779	3908784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_007761	CCGCT	2	10	3909504	3909513	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11052	NC_007761	AGC	2	6	3909519	3909524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_007761	GCG	2	6	3909525	3909530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_007761	ACC	2	6	3909561	3909566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_007761	TCG	2	6	3909613	3909618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_007761	TCC	2	6	3910067	3910072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_007761	GAC	2	6	3910172	3910177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_007761	CGG	2	6	3910192	3910197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_007761	CGC	2	6	3914348	3914353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11060	NC_007761	CCG	2	6	3914355	3914360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11061	NC_007761	GCA	2	6	3914372	3914377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_007761	TCA	2	6	3914399	3914404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_007761	TC	4	8	3915401	3915408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_007761	ATC	2	6	3915466	3915471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_007761	ATG	2	6	3915493	3915498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_007761	AAT	2	6	3915504	3915509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_007761	GA	3	6	3915585	3915590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_007761	AGG	2	6	3917662	3917667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_007761	CTG	2	6	3918079	3918084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_007761	AGG	2	6	3918134	3918139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_007761	AGG	2	6	3921331	3921336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_007761	CCGC	2	8	3922553	3922560	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11073	NC_007761	CTCC	2	8	3922678	3922685	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11074	NC_007761	ATC	2	6	3922709	3922714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11076	NC_007761	GGA	2	6	3923597	3923602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_007761	GAC	2	6	3923620	3923625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_007761	GGA	2	6	3923635	3923640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_007761	GACA	2	8	3924583	3924590	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11080	NC_007761	ATCGCC	2	12	3924602	3924613	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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11083	NC_007761	A	6	6	3924685	3924690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_007761	AGG	2	6	3924757	3924762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_007761	GAT	2	6	3924770	3924775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11087	NC_007761	CG	3	6	3927125	3927130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11088	NC_007761	TCG	2	6	3930248	3930253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_007761	CG	3	6	3930279	3930284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11090	NC_007761	TCC	2	6	3931574	3931579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11091	NC_007761	CGG	2	6	3931590	3931595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_007761	CCA	2	6	3931610	3931615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11093	NC_007761	CTC	2	6	3931654	3931659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_007761	CG	3	6	3931660	3931665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11095	NC_007761	AAT	2	6	3931764	3931769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11097	NC_007761	CGC	2	6	3936076	3936081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11098	NC_007761	CGA	2	6	3936087	3936092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_007761	TGG	2	6	3937162	3937167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_007761	TGCC	2	8	3937219	3937226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11101	NC_007761	TCT	2	6	3937234	3937239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_007761	CCG	2	6	3939423	3939428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11103	NC_007761	CGG	2	6	3940230	3940235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_007761	GCGG	2	8	3940271	3940278	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11105	NC_007761	GCG	2	6	3940336	3940341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_007761	ATT	2	6	3940354	3940359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_007761	GCAC	2	8	3940370	3940377	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11108	NC_007761	CCCG	2	8	3940389	3940396	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11109	NC_007761	CAT	2	6	3940465	3940470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_007761	CGC	2	6	3940501	3940506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_007761	TTG	2	6	3940533	3940538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_007761	CCCGG	2	10	3940782	3940791	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11113	NC_007761	CCT	2	6	3943087	3943092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_007761	AAGGC	2	10	3943563	3943572	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11115	NC_007761	GGC	2	6	3944937	3944942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11119	NC_007761	TTC	2	6	3946086	3946091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_007761	TCA	2	6	3946117	3946122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11121	NC_007761	GGA	2	6	3946125	3946130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_007761	GCG	2	6	3947717	3947722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_007761	GCA	2	6	3947747	3947752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_007761	TAT	2	6	3947753	3947758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_007761	TTG	2	6	3947768	3947773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_007761	CCCCT	2	10	3947800	3947809	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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