MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 11282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007643	GTG	3	9	341183	341191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_007643	CAC	2	6	341213	341218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_007643	CGA	2	6	341922	341927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_007643	ACCGT	2	10	341938	341947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1005	NC_007643	ACA	2	6	341951	341956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_007643	C	7	7	342018	342024	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1007	NC_007643	CG	3	6	342046	342051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_007643	GA	3	6	342052	342057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_007643	TTC	2	6	342581	342586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_007643	T	6	6	342621	342626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_007643	AGGGG	2	10	342649	342658	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_007643	CGA	2	6	342691	342696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_007643	GA	4	8	342695	342702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_007643	CCGG	2	8	342744	342751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_007643	CTTC	2	8	342756	342763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_007643	GGC	2	6	342772	342777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_007643	CGC	3	9	343349	343357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_007643	CGA	3	9	344527	344535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_007643	G	6	6	346791	346796	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_007643	CGG	2	6	346844	346849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_007643	CCG	2	6	346869	346874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_007643	CGG	2	6	346883	346888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_007643	CGG	2	6	346909	346914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_007643	G	6	6	346913	346918	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_007643	CCTGG	2	10	347559	347568	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1026	NC_007643	CAC	2	6	347623	347628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_007643	GGC	2	6	347681	347686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_007643	GGA	2	6	347729	347734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_007643	TCC	2	6	350083	350088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_007643	GAAAAA	2	12	354538	354549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_007643	CGA	3	9	354600	354608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_007643	CGA	2	6	354663	354668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_007643	TGC	2	6	354674	354679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_007643	GC	4	8	355870	355877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_007643	GAC	2	6	355890	355895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_007643	CG	3	6	355908	355913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_007643	A	6	6	355914	355919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_007643	AAGCCC	2	12	355997	356008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_007643	GGGAT	2	10	356034	356043	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_007643	TGG	2	6	356051	356056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_007643	CTC	2	6	356070	356075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_007643	GC	3	6	356977	356982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_007643	C	6	6	357031	357036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1044	NC_007643	CCG	2	6	357045	357050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_007643	CCG	2	6	357086	357091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_007643	GCGA	2	8	357466	357473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_007643	CG	3	6	357483	357488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_007643	CGGA	2	8	357493	357500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_007643	CG	3	6	357553	357558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_007643	GTG	2	6	357878	357883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_007643	CCGC	2	8	357893	357900	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1052	NC_007643	CAAG	2	8	357952	357959	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_007643	A	6	6	358016	358021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_007643	GCC	2	6	358025	358030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_007643	CGG	2	6	358038	358043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_007643	CGT	2	6	359823	359828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_007643	GGTT	2	8	359844	359851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_007643	CGG	2	6	359853	359858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_007643	A	6	6	359870	359875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_007643	GTC	2	6	359935	359940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_007643	CGG	2	6	359957	359962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_007643	CTCC	2	8	360005	360012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1063	NC_007643	CGC	2	6	360078	360083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_007643	CGC	2	6	360135	360140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_007643	C	6	6	360843	360848	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1066	NC_007643	G	6	6	360860	360865	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_007643	CCTG	2	8	362259	362266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_007643	CCCG	2	8	362295	362302	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1069	NC_007643	CCGC	2	8	362307	362314	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1070	NC_007643	GAGG	2	8	362331	362338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_007643	AC	3	6	362352	362357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_007643	G	7	7	362366	362372	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_007643	CGGT	2	8	362384	362391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_007643	CCG	2	6	362488	362493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_007643	CGC	2	6	362497	362502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_007643	GCCG	2	8	362893	362900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_007643	CGGC	2	8	362917	362924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_007643	GCC	2	6	362946	362951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_007643	A	7	7	362958	362964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_007643	CGG	2	6	362994	362999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_007643	CCTT	2	8	363055	363062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_007643	CCA	2	6	363176	363181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_007643	CGG	2	6	363210	363215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_007643	T	6	6	363217	363222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_007643	A	6	6	363248	363253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_007643	CCG	2	6	363254	363259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_007643	GC	3	6	363278	363283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1091	NC_007643	CTTC	2	8	363335	363342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1098	NC_007643	CG	3	6	366284	366289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_007643	TTGG	2	8	366345	366352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_007643	C	6	6	366401	366406	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1101	NC_007643	GTC	3	9	366417	366425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_007643	T	7	7	367156	367162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_007643	GCGG	2	8	368043	368050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_007643	C	6	6	368061	368066	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1105	NC_007643	ACC	2	6	368069	368074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_007643	GAA	2	6	368091	368096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_007643	CCG	2	6	368114	368119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_007643	CGG	2	6	368557	368562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_007643	TGGC	2	8	368617	368624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_007643	GGCCG	2	10	368646	368655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1111	NC_007643	C	7	7	368669	368675	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_007643	GC	3	6	369617	369622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_007643	CG	3	6	369645	369650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_007643	GATG	2	8	369673	369680	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_007643	CTT	2	6	369725	369730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_007643	AGC	2	6	369767	369772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_007643	A	6	6	369787	369792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_007643	CCACT	2	10	371441	371450	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1119	NC_007643	CAC	2	6	371467	371472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_007643	CGA	2	6	371520	371525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_007643	ATTA	2	8	371578	371585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_007643	TC	3	6	371969	371974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_007643	CGGC	2	8	376770	376777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_007643	GCG	2	6	376794	376799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_007643	AAC	2	6	376849	376854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_007643	GT	3	6	376999	377004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_007643	CGAAA	2	10	377028	377037	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1128	NC_007643	AG	3	6	377099	377104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_007643	GCCT	2	8	377165	377172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_007643	C	6	6	377189	377194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1131	NC_007643	CTCC	2	8	379269	379276	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1132	NC_007643	CGC	2	6	379279	379284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_007643	GCC	2	6	380285	380290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_007643	G	6	6	380291	380296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_007643	C	6	6	380303	380308	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1136	NC_007643	GCG	2	6	380336	380341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_007643	A	7	7	380365	380371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_007643	ATC	2	6	383648	383653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_007643	GGGC	2	8	391627	391634	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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1398	NC_007643	CGAAG	2	10	470976	470985	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1403	NC_007643	CGGGG	2	10	471121	471130	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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1405	NC_007643	C	6	6	471160	471165	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1406	NC_007643	GGCG	2	8	471175	471182	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1407	NC_007643	CGG	2	6	471203	471208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1408	NC_007643	CAC	2	6	472244	472249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_007643	GGC	2	6	472270	472275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_007643	GC	4	8	473653	473660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1411	NC_007643	CG	3	6	473670	473675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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