MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodospirillum rubrum ATCC 11170 chromosome

Total Repeats: 11282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_007643	CAT	2	6	2985654	2985659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_007643	CT	3	6	2985672	2985677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_007643	GCA	2	6	2985738	2985743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_007643	ATC	2	6	2985769	2985774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_007643	GGA	2	6	2985859	2985864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_007643	ACT	2	6	2985883	2985888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_007643	GAA	2	6	2985896	2985901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_007643	AGA	2	6	2985933	2985938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_007643	AGG	2	6	2985978	2985983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_007643	GAAG	2	8	2986094	2986101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_007643	ACGGGC	2	12	2986116	2986127	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_007643	ATG	2	6	2986129	2986134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_007643	GTC	2	6	2986140	2986145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_007643	CGC	2	6	2986166	2986171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_007643	GATGGC	2	12	2986224	2986235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8016	NC_007643	CGG	3	9	2986256	2986264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_007643	CG	3	6	2986310	2986315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8018	NC_007643	TGTCG	2	10	2986320	2986329	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8019	NC_007643	CTT	2	6	2987846	2987851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_007643	GCC	2	6	2987858	2987863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8021	NC_007643	CCT	2	6	2988222	2988227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_007643	GGC	2	6	2988228	2988233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_007643	AAACC	2	10	2988677	2988686	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8024	NC_007643	CGGCG	2	10	2992205	2992214	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8025	NC_007643	TTTC	2	8	2993679	2993686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8026	NC_007643	TTTC	2	8	2994311	2994318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8027	NC_007643	CGG	2	6	2994329	2994334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_007643	GAC	2	6	2994354	2994359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_007643	GGCGC	2	10	2994413	2994422	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8030	NC_007643	CGA	2	6	2994450	2994455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_007643	C	7	7	2994499	2994505	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8032	NC_007643	CAT	2	6	2994515	2994520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_007643	GCG	2	6	2994547	2994552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_007643	C	6	6	2994985	2994990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8035	NC_007643	GGC	2	6	2995004	2995009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_007643	C	6	6	2995038	2995043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8037	NC_007643	CG	3	6	2995047	2995052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8038	NC_007643	TCG	2	6	3000905	3000910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_007643	CGGA	2	8	3000914	3000921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8040	NC_007643	C	6	6	3005022	3005027	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8041	NC_007643	GCG	3	9	3005031	3005039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_007643	CAG	2	6	3005041	3005046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_007643	C	6	6	3005099	3005104	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8044	NC_007643	ACC	2	6	3005111	3005116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_007643	GC	3	6	3005166	3005171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_007643	TCA	2	6	3005192	3005197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_007643	CGG	2	6	3005199	3005204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_007643	CGC	2	6	3006984	3006989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_007643	GTG	2	6	3008566	3008571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_007643	GGC	2	6	3011498	3011503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_007643	GGA	2	6	3012241	3012246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_007643	GC	3	6	3012270	3012275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8053	NC_007643	ATG	2	6	3012288	3012293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_007643	GAA	2	6	3012364	3012369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_007643	A	6	6	3012368	3012373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_007643	TC	3	6	3012374	3012379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_007643	GCCC	3	12	3012388	3012399	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8058	NC_007643	AGA	2	6	3012465	3012470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_007643	CCG	2	6	3012471	3012476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_007643	CAG	2	6	3014861	3014866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_007643	GCG	2	6	3014927	3014932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_007643	CGC	2	6	3014937	3014942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_007643	CTC	2	6	3015016	3015021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_007643	TCCC	2	8	3015029	3015036	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8065	NC_007643	TCCAT	2	10	3015069	3015078	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8066	NC_007643	GGACA	2	10	3015091	3015100	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8067	NC_007643	GC	3	6	3016902	3016907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_007643	AGACC	2	10	3017014	3017023	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8069	NC_007643	CTTT	2	8	3017099	3017106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8070	NC_007643	GCC	2	6	3017119	3017124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_007643	A	8	8	3018450	3018457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_007643	G	8	8	3018458	3018465	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_007643	CGGGAA	2	12	3018537	3018548	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8074	NC_007643	TAAT	2	8	3018591	3018598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_007643	TCAT	2	8	3018600	3018607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8076	NC_007643	TTC	2	6	3022081	3022086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_007643	GCG	2	6	3022105	3022110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_007643	CGC	2	6	3022133	3022138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_007643	CGG	2	6	3023025	3023030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_007643	CGG	2	6	3023052	3023057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_007643	CCG	3	9	3023069	3023077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_007643	CCT	3	9	3024090	3024098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_007643	CGCGC	2	10	3024107	3024116	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8084	NC_007643	GCCCCC	2	12	3024210	3024221	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
8085	NC_007643	AAG	2	6	3026764	3026769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_007643	C	7	7	3026932	3026938	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8087	NC_007643	CG	3	6	3029760	3029765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8088	NC_007643	CCA	2	6	3029793	3029798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_007643	ACCC	2	8	3029826	3029833	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8090	NC_007643	CAA	2	6	3029834	3029839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_007643	CGG	2	6	3029851	3029856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_007643	ATC	2	6	3029861	3029866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_007643	CCCTC	2	10	3029869	3029878	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
8094	NC_007643	CCCG	2	8	3030492	3030499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8095	NC_007643	TCA	2	6	3030519	3030524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_007643	CCA	2	6	3032582	3032587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_007643	CGCC	2	8	3032651	3032658	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8098	NC_007643	GCG	2	6	3032693	3032698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_007643	CGC	2	6	3033634	3033639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_007643	CCA	2	6	3033665	3033670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8101	NC_007643	A	8	8	3033670	3033677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_007643	TCC	2	6	3033741	3033746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_007643	GCCT	2	8	3033781	3033788	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8104	NC_007643	GTC	2	6	3033794	3033799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_007643	ACCAT	2	10	3033813	3033822	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8106	NC_007643	CGC	2	6	3033890	3033895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_007643	CCAC	2	8	3034644	3034651	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8108	NC_007643	CGG	2	6	3034715	3034720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8110	NC_007643	CGG	2	6	3039362	3039367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_007643	AAC	2	6	3039422	3039427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_007643	GA	3	6	3040409	3040414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_007643	GTT	2	6	3041995	3042000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_007643	GCCC	2	8	3042023	3042030	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8115	NC_007643	CCA	3	9	3042032	3042040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_007643	CGG	2	6	3042059	3042064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_007643	GCC	2	6	3042093	3042098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8118	NC_007643	CGC	2	6	3042099	3042104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_007643	CCCG	2	8	3042108	3042115	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8120	NC_007643	CCG	2	6	3042172	3042177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8121	NC_007643	G	6	6	3042183	3042188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_007643	GGA	2	6	3042203	3042208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_007643	GC	3	6	3042228	3042233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8124	NC_007643	GA	3	6	3042308	3042313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_007643	TGA	3	9	3042316	3042324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_007643	CGATGC	2	12	3042328	3042339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_007643	ATG	2	6	3042348	3042353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_007643	GAT	2	6	3042368	3042373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_007643	ATG	2	6	3042381	3042386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8131	NC_007643	ATG	2	6	3042402	3042407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_007643	GAT	2	6	3042413	3042418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_007643	ATG	2	6	3042426	3042431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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