MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia felis URRWXCal2 chromosome

Total Repeats: 6774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007109	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007109	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007109	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007109	ATATGA	2	12	892	903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007109	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007109	AAG	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007109	GTT	2	6	6267	6272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007109	A	8	8	6309	6316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007109	ACT	2	6	6413	6418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007109	TTTA	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007109	TATTT	2	10	7689	7698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007109	CAT	2	6	7740	7745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007109	TTTTAA	2	12	7765	7776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007109	T	7	7	7796	7802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007109	CAA	2	6	7843	7848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007109	CTC	2	6	7858	7863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_007109	T	6	6	7881	7886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007109	TA	3	6	8972	8977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007109	TAT	2	6	8989	8994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007109	CAA	2	6	8996	9001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007109	AGG	2	6	9009	9014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007109	A	6	6	9136	9141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007109	TAA	2	6	9145	9150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007109	TTA	2	6	9260	9265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007109	AAG	3	9	9331	9339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007109	AT	3	6	9347	9352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007109	TAA	2	6	9397	9402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007109	TAA	2	6	9415	9420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007109	AAC	2	6	9469	9474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007109	GGT	2	6	9487	9492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007109	A	6	6	9552	9557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007109	AGT	2	6	9567	9572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007109	GGT	2	6	9583	9588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007109	GCT	2	6	9595	9600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007109	GAA	2	6	9628	9633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007109	TAA	2	6	9663	9668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007109	TTG	2	6	10476	10481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007109	TG	3	6	10480	10485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007109	GAA	2	6	10509	10514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007109	GTA	2	6	10519	10524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007109	CGA	2	6	10528	10533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007109	A	6	6	10545	10550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007109	T	7	7	10566	10572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007109	CAA	2	6	10590	10595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007109	CTC	2	6	10603	10608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007109	GCGA	2	8	10631	10638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007109	TAA	2	6	10655	10660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007109	ATC	2	6	10692	10697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007109	TAT	2	6	10751	10756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007109	G	6	6	10791	10796	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007109	TAT	2	6	10846	10851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007109	CCA	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007109	TGG	2	6	10902	10907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007109	ATT	2	6	10917	10922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007109	GGA	2	6	10930	10935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007109	ATTA	2	8	11331	11338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007109	A	6	6	11343	11348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007109	GTA	2	6	11360	11365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007109	GTT	2	6	11406	11411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007109	GAG	2	6	11436	11441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007109	A	7	7	11472	11478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007109	T	6	6	11494	11499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007109	TCG	2	6	11510	11515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007109	TTC	2	6	11529	11534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007109	CAA	2	6	11561	11566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007109	CCT	2	6	11589	11594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_007109	T	6	6	11594	11599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007109	TTA	2	6	12588	12593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007109	CAA	2	6	12626	12631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007109	AT	3	6	12640	12645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007109	ATA	2	6	12647	12652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007109	AAAG	2	8	12693	12700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007109	TGG	2	6	12718	12723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007109	TAT	2	6	12805	12810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007109	GAA	2	6	12860	12865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007109	CGA	2	6	12879	12884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007109	T	8	8	12917	12924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007109	TCGCT	2	10	12947	12956	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007109	ACA	2	6	13004	13009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007109	T	6	6	13111	13116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007109	GTT	2	6	14097	14102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007109	GAG	2	6	14127	14132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007109	TGC	2	6	14141	14146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007109	A	7	7	14164	14170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007109	CTT	2	6	14657	14662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007109	GAA	2	6	14674	14679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007109	T	6	6	14682	14687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007109	TAAA	2	8	14716	14723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007109	TAA	2	6	14762	14767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007109	TTA	2	6	14790	14795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007109	CAA	2	6	14799	14804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007109	TCAT	2	8	14837	14844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007109	TCT	2	6	14888	14893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007109	GAT	2	6	14904	14909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007109	CTTT	2	8	14971	14978	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007109	GCTTG	2	10	15057	15066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007109	TAA	2	6	15225	15230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007109	ATA	2	6	15249	15254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007109	TAATA	2	10	15266	15275	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007109	TAA	2	6	15296	15301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007109	AAT	2	6	20522	20527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007109	ATT	2	6	20564	20569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007109	TAT	2	6	20631	20636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007109	TAT	2	6	20647	20652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007109	AAT	2	6	20659	20664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007109	TA	3	6	20709	20714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007109	TTAT	2	8	20730	20737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007109	TA	3	6	20758	20763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007109	TTTAA	2	10	20768	20777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007109	GTT	2	6	25931	25936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007109	A	7	7	26015	26021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007109	ACA	2	6	26078	26083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007109	A	7	7	26083	26089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007109	AT	3	6	26119	26124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007109	ACC	2	6	26168	26173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007109	AAT	2	6	26249	26254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007109	ATA	2	6	26278	26283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007109	TAA	2	6	26292	26297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007109	TTTA	2	8	26301	26308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007109	TA	3	6	26360	26365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007109	AAT	2	6	26763	26768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007109	AT	3	6	26861	26866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007109	GAA	2	6	28176	28181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007109	ATT	2	6	28934	28939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007109	GAA	2	6	28950	28955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007109	T	7	7	31142	31148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007109	GCGA	2	8	31180	31187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007109	ATA	2	6	31215	31220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007109	A	7	7	31220	31226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007109	A	6	6	31993	31998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007109	A	6	6	32017	32022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007109	AT	3	6	32026	32031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007109	A	6	6	32045	32050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007109	T	6	6	32063	32068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007109	TA	3	6	32175	32180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007109	ATT	2	6	32182	32187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007109	TAA	2	6	32210	32215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007109	TATT	2	8	33311	33318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007109	CAA	2	6	33378	33383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007109	TGCTA	2	10	34343	34352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007109	ATA	2	6	34359	34364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007109	GGA	2	6	34400	34405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007109	TGA	2	6	35010	35015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007109	GCT	2	6	35036	35041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007109	GGT	2	6	35053	35058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007109	GAC	2	6	35074	35079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007109	TAAA	2	8	36709	36716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007109	A	7	7	36714	36720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_007109	ATT	2	6	130266	130271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_007109	TA	4	8	133606	133613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_007109	TA	3	6	138113	138118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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