MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 megaplasmid

Total Repeats: 963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006569	G	6	6	800	805	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006569	GC	3	6	823	828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_006569	CAC	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_006569	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006569	AGT	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006569	TGG	2	6	3941	3946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006569	CCG	2	6	3958	3963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_006569	GCC	2	6	4893	4898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_006569	T	6	6	4912	4917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006569	ACCG	2	8	4954	4961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006569	TGGCG	2	10	9392	9401	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006569	GGC	2	6	10637	10642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006569	GCC	2	6	10649	10654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_006569	CGA	2	6	11236	11241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006569	GGT	2	6	11253	11258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006569	GC	3	6	12043	12048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006569	C	6	6	12798	12803	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_006569	GCG	2	6	12810	12815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_006569	AGAA	2	8	12839	12846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006569	GC	3	6	12924	12929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006569	GC	3	6	14922	14927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006569	GAT	2	6	15508	15513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006569	CTCTC	2	10	20364	20373	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_006569	CTT	2	6	20410	20415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006569	CG	3	6	20438	20443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006569	CG	3	6	22995	23000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_006569	GGTG	2	8	23007	23014	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006569	TTA	2	6	24545	24550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006569	TAAA	2	8	24563	24570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006569	ATG	2	6	24571	24576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006569	CTGCG	2	10	24610	24619	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_006569	CCGC	2	8	24626	24633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_006569	GCA	2	6	24640	24645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006569	GT	3	6	24720	24725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006569	CGC	2	6	24733	24738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_006569	C	6	6	24738	24743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_006569	GC	3	6	24756	24761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006569	TAGG	2	8	24849	24856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006569	ATT	2	6	30797	30802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006569	AAT	2	6	30808	30813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006569	TGA	2	6	34223	34228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006569	ATT	2	6	34276	34281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006569	GAGT	2	8	34324	34331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006569	CCG	2	6	34402	34407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_006569	CAC	2	6	34454	34459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_006569	AGA	2	6	34511	34516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006569	GGC	2	6	34539	34544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006569	GCC	2	6	34556	34561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_006569	CCCG	2	8	34572	34579	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_006569	ACA	2	6	34601	34606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006569	GC	3	6	36561	36566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006569	TCG	3	9	36575	36583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006569	TCC	3	9	36585	36593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_006569	CGG	2	6	36628	36633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006569	CGG	2	6	36659	36664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006569	AGAA	2	8	36679	36686	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006569	TTTC	2	8	36702	36709	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_006569	GTC	2	6	36757	36762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006569	CCG	2	6	37086	37091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_006569	ATGC	2	8	37105	37112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_006569	GCGG	2	8	37519	37526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006569	CGG	2	6	37529	37534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006569	CG	3	6	39846	39851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006569	TC	3	6	41433	41438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_006569	ATGA	2	8	41456	41463	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006569	CGGCG	2	10	42456	42465	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_006569	AGG	2	6	45078	45083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006569	CGGG	2	8	50897	50904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006569	CGG	2	6	50910	50915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006569	ATC	2	6	51537	51542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006569	TTG	2	6	51609	51614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006569	TG	3	6	51651	51656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006569	CG	3	6	51672	51677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006569	G	6	6	51693	51698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006569	GAGC	2	8	51706	51713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_006569	GCCCC	2	10	51753	51762	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
77	NC_006569	CT	4	8	51824	51831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006569	CCT	2	6	51832	51837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_006569	TCT	2	6	51870	51875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006569	CCG	2	6	51876	51881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_006569	CG	3	6	53025	53030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006569	GCC	2	6	53500	53505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_006569	GCC	2	6	53507	53512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_006569	CGG	2	6	53521	53526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006569	CACC	2	8	53527	53534	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_006569	GCGCCC	2	12	56432	56443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_006569	CGCGC	2	10	56495	56504	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_006569	CAT	2	6	56524	56529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006569	GCCC	2	8	56544	56551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_006569	CGG	2	6	56553	56558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006569	ACGAA	2	10	57434	57443	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_006569	GGC	2	6	57449	57454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006569	GCC	2	6	57459	57464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_006569	GCA	2	6	59720	59725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006569	AGAA	2	8	59728	59735	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006569	CCGG	2	8	60553	60560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_006569	AGG	2	6	60611	60616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006569	CAA	2	6	63148	63153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006569	AGA	2	6	63181	63186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006569	CGG	2	6	67468	67473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006569	G	6	6	67566	67571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006569	CAA	2	6	68404	68409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006569	GA	3	6	72741	72746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006569	ATG	2	6	73706	73711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006569	GGT	2	6	75852	75857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006569	ATA	2	6	75889	75894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006569	GCTC	2	8	75916	75923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_006569	GCT	2	6	75928	75933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_006569	AAG	2	6	75968	75973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006569	AC	3	6	76050	76055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_006569	CAT	2	6	76058	76063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006569	T	6	6	79309	79314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006569	TGA	2	6	79322	79327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006569	TAG	2	6	80494	80499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006569	AC	3	6	80545	80550	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_006569	TCC	2	6	80564	80569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_006569	TTC	2	6	80607	80612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006569	GGC	2	6	80663	80668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006569	CGAGG	2	10	81327	81336	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_006569	CTG	3	9	81358	81366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006569	ATCG	2	8	81388	81395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_006569	CACG	2	8	81405	81412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006569	TGG	2	6	81424	81429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006569	GCCT	2	8	81440	81447	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_006569	ACC	2	6	81575	81580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_006569	CTC	2	6	81597	81602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_006569	GCG	2	6	81622	81627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006569	CTT	2	6	81628	81633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006569	CCA	2	6	81693	81698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_006569	CACG	2	8	81726	81733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_006569	GTC	2	6	81745	81750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006569	CG	5	10	81923	81932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006569	GCG	3	9	81930	81938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006569	GTG	2	6	81976	81981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006569	GC	3	6	82003	82008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_006569	CGC	2	6	82013	82018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_006569	ACC	2	6	82124	82129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_006569	TCC	2	6	82150	82155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_006569	AGG	2	6	82185	82190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006569	ATT	2	6	82221	82226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006569	TCG	3	9	82243	82251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_006569	AGC	2	6	82272	82277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_006569	CG	3	6	82335	82340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_006569	TGG	2	6	82443	82448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006569	GTT	2	6	82496	82501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006569	GCA	2	6	82507	82512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_006569	GATA	2	8	82685	82692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006569	T	7	7	82764	82770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_006569	CGG	3	9	145170	145178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_006569	GC	3	6	145302	145307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
290	NC_006569	CG	3	6	145450	145455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
291	NC_006569	ATC	2	6	145480	145485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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426	NC_006569	GTCA	2	8	212726	212733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
427	NC_006569	GCC	2	6	214424	214429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
428	NC_006569	ATAA	2	8	214455	214462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_006569	TTA	2	6	214465	214470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_006569	GCC	2	6	214504	214509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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435	NC_006569	GGAGAA	2	12	214665	214676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
436	NC_006569	GC	3	6	214771	214776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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441	NC_006569	GCG	2	6	219651	219656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_006569	GAT	2	6	219679	219684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_006569	GCC	2	6	219882	219887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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451	NC_006569	CTC	2	6	224520	224525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
452	NC_006569	CGCT	2	8	224557	224564	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
453	NC_006569	AGA	2	6	229946	229951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_006569	CGC	2	6	231348	231353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_006569	TCG	2	6	234945	234950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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464	NC_006569	GCC	2	6	239704	239709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
465	NC_006569	GCC	2	6	240743	240748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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469	NC_006569	GCG	2	6	241989	241994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_006569	GCCC	2	8	243871	243878	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
474	NC_006569	CT	3	6	243889	243894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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492	NC_006569	GGCT	2	8	264583	264590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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