MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 7980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_006142	TGT	2	6	165518	165523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_006142	TTG	2	6	165552	165557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_006142	CAAA	2	8	165558	165565	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_006142	TGT	2	6	165576	165581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_006142	AAAT	2	8	165590	165597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_006142	GTA	2	6	165623	165628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_006142	ATTGTC	2	12	169853	169864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1008	NC_006142	T	6	6	169947	169952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_006142	T	6	6	169959	169964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_006142	GTA	2	6	169973	169978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_006142	ATT	2	6	170072	170077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_006142	AAT	2	6	170106	170111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_006142	TTA	2	6	170134	170139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_006142	ATA	2	6	170144	170149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_006142	TAAAG	2	10	170150	170159	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_006142	TAA	2	6	170177	170182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_006142	TAA	2	6	170185	170190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_006142	TC	3	6	170193	170198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_006142	AGT	3	9	170209	170217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_006142	AGAA	2	8	170258	170265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_006142	TAT	2	6	170299	170304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_006142	AGT	2	6	170331	170336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_006142	TA	3	6	170369	170374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_006142	ATGT	2	8	170376	170383	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_006142	ATA	2	6	170389	170394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_006142	TCTA	2	8	170406	170413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_006142	TCT	2	6	170463	170468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_006142	ATC	2	6	170523	170528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1030	NC_006142	ATA	2	6	170547	170552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_006142	TTA	2	6	170578	170583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_006142	AT	3	6	170608	170613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_006142	TACTT	2	10	170643	170652	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_006142	ATT	2	6	170705	170710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_006142	ATAA	2	8	170772	170779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_006142	TG	3	6	172328	172333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_006142	TAA	2	6	172355	172360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_006142	TTA	2	6	173221	173226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_006142	A	6	6	173242	173247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_006142	TA	4	8	173256	173263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_006142	TAA	2	6	173770	173775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_006142	TATGTA	2	12	173779	173790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_006142	GAAA	2	8	173796	173803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_006142	TTG	2	6	175661	175666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_006142	GCATT	2	10	175675	175684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_006142	ATTG	2	8	175703	175710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_006142	AT	3	6	175736	175741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_006142	TTA	2	6	175742	175747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_006142	TTA	2	6	175768	175773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_006142	AT	3	6	175796	175801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_006142	GTTTC	2	10	175805	175814	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1052	NC_006142	TTA	2	6	178024	178029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_006142	TA	3	6	178038	178043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_006142	TAA	2	6	178077	178082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_006142	ATA	2	6	178848	178853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_006142	T	6	6	178908	178913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_006142	A	7	7	178932	178938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_006142	CT	3	6	178971	178976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_006142	T	6	6	179005	179010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_006142	TATAG	2	10	179752	179761	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_006142	TAT	2	6	179792	179797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_006142	TAG	2	6	179799	179804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_006142	GTA	2	6	179821	179826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_006142	ACT	2	6	179863	179868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_006142	TA	3	6	179944	179949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_006142	ATTT	2	8	179966	179973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_006142	TCT	2	6	179975	179980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_006142	TTAC	2	8	179981	179988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_006142	AAT	2	6	181202	181207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_006142	TTC	2	6	181268	181273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_006142	CTT	2	6	181293	181298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_006142	A	6	6	181303	181308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1074	NC_006142	A	6	6	182829	182834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_006142	T	6	6	182903	182908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_006142	AT	3	6	184946	184951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_006142	TAATTT	2	12	184985	184996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_006142	T	6	6	185112	185117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_006142	ATTTT	2	10	185128	185137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1090	NC_006142	TAAT	2	8	185181	185188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_006142	TA	3	6	185193	185198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_006142	TAA	2	6	185239	185244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_006142	TAC	2	6	185839	185844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1098	NC_006142	TAA	2	6	188622	188627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_006142	TAA	2	6	188632	188637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_006142	AAAT	2	8	188645	188652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_006142	A	6	6	188662	188667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_006142	TTG	2	6	188668	188673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_006142	TATT	2	8	188699	188706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_006142	TATTTA	2	12	188737	188748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_006142	ATA	2	6	188753	188758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_006142	TA	3	6	188761	188766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_006142	TAT	3	9	189036	189044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_006142	TTG	2	6	189066	189071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_006142	A	6	6	189110	189115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_006142	TCT	2	6	189133	189138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_006142	CAC	2	6	189144	189149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1113	NC_006142	CTTT	2	8	189275	189282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_006142	T	6	6	189280	189285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_006142	AT	3	6	189288	189293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_006142	CTT	2	6	189299	189304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_006142	TAT	2	6	189488	189493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_006142	ATA	2	6	189494	189499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_006142	GTT	2	6	189552	189557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_006142	AATTT	2	10	189603	189612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_006142	T	6	6	189641	189646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_006142	TAA	2	6	189677	189682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_006142	ATTAT	2	10	189683	189692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_006142	TTA	2	6	189738	189743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_006142	T	7	7	189756	189762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_006142	TAAT	2	8	189794	189801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_006142	TA	3	6	189842	189847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_006142	TTA	2	6	189963	189968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_006142	TA	3	6	189978	189983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_006142	GTT	2	6	190027	190032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_006142	TGA	2	6	190074	190079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_006142	CTA	2	6	192398	192403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_006142	CTT	2	6	192408	192413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_006142	TTTAAT	2	12	192419	192430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_006142	T	7	7	192453	192459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_006142	TAG	2	6	192589	192594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_006142	ATA	2	6	192595	192600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1278	NC_006142	T	6	6	217253	217258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1399	NC_006142	TAA	2	6	233572	233577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1403	NC_006142	AATTG	2	10	233738	233747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_006142	TAA	2	6	233913	233918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_006142	GATT	2	8	234043	234050	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_006142	TAT	2	6	234084	234089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_006142	T	6	6	234124	234129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_006142	TAA	2	6	234218	234223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_006142	GTG	2	6	234235	234240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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