MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_005296	CGG	2	6	5150302	5150307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_005296	CGG	2	6	5150338	5150343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_005296	CCA	2	6	5150349	5150354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15004	NC_005296	CG	3	6	5150356	5150361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15005	NC_005296	TCAG	2	8	5150375	5150382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15006	NC_005296	TCA	2	6	5150390	5150395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_005296	GGC	2	6	5150504	5150509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_005296	GCC	2	6	5150551	5150556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15009	NC_005296	CG	3	6	5152050	5152055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15010	NC_005296	CG	3	6	5152064	5152069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15011	NC_005296	CGGC	2	8	5152551	5152558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15012	NC_005296	CGGT	2	8	5152578	5152585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15013	NC_005296	CGG	2	6	5152603	5152608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_005296	TCAC	2	8	5152645	5152652	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15015	NC_005296	CACGCG	2	12	5154401	5154412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15016	NC_005296	GA	3	6	5154437	5154442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_005296	TTAC	2	8	5154454	5154461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15018	NC_005296	AGAT	2	8	5154471	5154478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_005296	GGC	2	6	5154509	5154514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_005296	GCG	2	6	5155065	5155070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_005296	CGC	2	6	5155079	5155084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15022	NC_005296	GCCG	2	8	5155131	5155138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15023	NC_005296	GAC	2	6	5155450	5155455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15024	NC_005296	CGA	2	6	5155470	5155475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_005296	CGC	3	9	5155489	5155497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15026	NC_005296	CGC	2	6	5155519	5155524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15027	NC_005296	GCC	2	6	5155567	5155572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15028	NC_005296	CG	4	8	5159148	5159155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15029	NC_005296	AGC	2	6	5160336	5160341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_005296	TGC	2	6	5160424	5160429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_005296	GGAT	2	8	5160435	5160442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_005296	GCG	2	6	5161559	5161564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_005296	CTG	2	6	5162604	5162609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_005296	CGC	2	6	5162742	5162747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15035	NC_005296	GCG	2	6	5162783	5162788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_005296	CCGC	2	8	5164103	5164110	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15037	NC_005296	CAC	2	6	5165141	5165146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15038	NC_005296	GC	3	6	5165153	5165158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15039	NC_005296	TTG	2	6	5165243	5165248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_005296	CCGC	2	8	5169604	5169611	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15041	NC_005296	CAC	2	6	5169614	5169619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15042	NC_005296	GCC	2	6	5169664	5169669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15043	NC_005296	GCA	2	6	5169844	5169849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_005296	TGA	2	6	5173040	5173045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_005296	TCGG	2	8	5173076	5173083	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15046	NC_005296	TCGC	2	8	5173128	5173135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15047	NC_005296	CTC	2	6	5177025	5177030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15048	NC_005296	CGC	2	6	5177035	5177040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15049	NC_005296	CA	5	10	5177051	5177060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15050	NC_005296	ACA	2	6	5177104	5177109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_005296	GAC	3	9	5177119	5177127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_005296	GC	3	6	5177195	5177200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15053	NC_005296	CAA	2	6	5177217	5177222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_005296	GCG	2	6	5179989	5179994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_005296	GATC	2	8	5180969	5180976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15056	NC_005296	GCA	2	6	5181026	5181031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_005296	TGC	2	6	5181082	5181087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_005296	CTCG	2	8	5181104	5181111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15059	NC_005296	TGA	2	6	5181173	5181178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_005296	GC	3	6	5183365	5183370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15061	NC_005296	CG	3	6	5183411	5183416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15062	NC_005296	AG	3	6	5183418	5183423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_005296	GAG	2	6	5183439	5183444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_005296	GA	3	6	5183490	5183495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_005296	CCT	2	6	5184500	5184505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15066	NC_005296	CGT	2	6	5185759	5185764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_005296	GCT	2	6	5185842	5185847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_005296	GAAT	2	8	5185982	5185989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_005296	CAT	2	6	5186037	5186042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_005296	GC	3	6	5186084	5186089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15071	NC_005296	AGA	2	6	5186090	5186095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_005296	CAG	2	6	5186453	5186458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15073	NC_005296	CGC	2	6	5186938	5186943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15074	NC_005296	CGG	2	6	5186967	5186972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15075	NC_005296	CG	3	6	5186975	5186980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15076	NC_005296	CCG	2	6	5186986	5186991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15077	NC_005296	TTCG	2	8	5186994	5187001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15078	NC_005296	GATT	2	8	5187020	5187027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_005296	AAG	2	6	5187035	5187040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_005296	GCC	2	6	5187707	5187712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15081	NC_005296	CGC	2	6	5187726	5187731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15082	NC_005296	CGA	2	6	5187753	5187758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15083	NC_005296	CAC	2	6	5187895	5187900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15084	NC_005296	AAGC	2	8	5187959	5187966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15085	NC_005296	CT	3	6	5187999	5188004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15086	NC_005296	GCG	2	6	5188029	5188034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15087	NC_005296	CCT	2	6	5189683	5189688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15088	NC_005296	CT	3	6	5190805	5190810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15089	NC_005296	GAC	2	6	5191698	5191703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_005296	CGA	2	6	5191773	5191778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_005296	GCG	2	6	5191851	5191856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_005296	GACC	2	8	5191858	5191865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15093	NC_005296	GCG	2	6	5191923	5191928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_005296	GCA	2	6	5191936	5191941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_005296	CGC	2	6	5191950	5191955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15096	NC_005296	GC	3	6	5191991	5191996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15097	NC_005296	TGT	2	6	5192366	5192371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_005296	CGC	2	6	5192372	5192377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15099	NC_005296	GC	3	6	5195781	5195786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15100	NC_005296	ACT	2	6	5196198	5196203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_005296	CG	3	6	5196209	5196214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15102	NC_005296	TCG	2	6	5196251	5196256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15103	NC_005296	CG	4	8	5196331	5196338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15104	NC_005296	GCCGG	2	10	5196360	5196369	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15105	NC_005296	GTG	2	6	5196449	5196454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_005296	CG	4	8	5196480	5196487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15107	NC_005296	CTC	2	6	5197582	5197587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15108	NC_005296	TCTCGC	2	12	5197847	5197858	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15109	NC_005296	CGT	2	6	5198772	5198777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_005296	GCG	2	6	5201628	5201633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_005296	GGT	2	6	5201647	5201652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_005296	CGG	2	6	5203266	5203271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15113	NC_005296	GTT	2	6	5204780	5204785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_005296	GCC	2	6	5204799	5204804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15115	NC_005296	GGC	2	6	5204810	5204815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_005296	TC	3	6	5205751	5205756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15117	NC_005296	CTT	2	6	5205800	5205805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_005296	GT	4	8	5205934	5205941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_005296	GAC	2	6	5206012	5206017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15120	NC_005296	GAAAC	2	10	5206038	5206047	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15121	NC_005296	CCGG	2	8	5206057	5206064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15122	NC_005296	CTGCG	2	10	5206101	5206110	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15123	NC_005296	TGCG	2	8	5206115	5206122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15124	NC_005296	ATG	2	6	5206286	5206291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_005296	GGT	2	6	5207727	5207732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_005296	GCC	2	6	5207743	5207748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15127	NC_005296	GCG	2	6	5207749	5207754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_005296	CGC	2	6	5211794	5211799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15129	NC_005296	ACG	2	6	5211800	5211805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15130	NC_005296	GGC	2	6	5211806	5211811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15131	NC_005296	GGTG	2	8	5211817	5211824	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_005296	TGC	2	6	5211829	5211834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15133	NC_005296	GCG	2	6	5211871	5211876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15134	NC_005296	GCT	2	6	5212152	5212157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15135	NC_005296	TGA	2	6	5212192	5212197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15136	NC_005296	ATC	2	6	5212315	5212320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15137	NC_005296	CAGA	2	8	5212337	5212344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15138	NC_005296	GGCGC	2	10	5212348	5212357	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15139	NC_005296	TGA	2	6	5212379	5212384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_005296	TAC	2	6	5214325	5214330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15141	NC_005296	CAGC	2	8	5214396	5214403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15142	NC_005296	CGC	2	6	5214407	5214412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15143	NC_005296	ACG	2	6	5215422	5215427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15144	NC_005296	TTG	2	6	5215453	5215458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15146	NC_005296	CCA	2	6	5215532	5215537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15148	NC_005296	GTG	3	9	5215612	5215620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15149	NC_005296	TCA	2	6	5216480	5216485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15153	NC_005296	AGCG	2	8	5219011	5219018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15154	NC_005296	ATC	2	6	5219053	5219058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15158	NC_005296	GAG	2	6	5219432	5219437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_005296	GC	3	6	5219438	5219443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15160	NC_005296	CGGCG	2	10	5219522	5219531	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15161	NC_005296	CGGC	2	8	5221293	5221300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15162	NC_005296	ACT	2	6	5221374	5221379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15163	NC_005296	A	6	6	5221439	5221444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15164	NC_005296	CGA	2	6	5221473	5221478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15166	NC_005296	GCC	2	6	5221574	5221579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15168	NC_005296	CGGC	2	8	5221596	5221603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15169	NC_005296	CAT	2	6	5223307	5223312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15171	NC_005296	CGT	2	6	5223339	5223344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15175	NC_005296	CGC	2	6	5223979	5223984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15193	NC_005296	CCG	2	6	5230977	5230982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15261	NC_005296	ATA	2	6	5248534	5248539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15272	NC_005296	CTT	2	6	5249071	5249076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15290	NC_005296	GT	3	6	5250296	5250301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15319	NC_005296	A	6	6	5252307	5252312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15320	NC_005296	GA	4	8	5252335	5252342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15321	NC_005296	CCGCG	2	10	5252436	5252445	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15322	NC_005296	GCG	2	6	5252525	5252530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15334	NC_005296	TGAT	2	8	5259663	5259670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15335	NC_005296	CG	3	6	5259676	5259681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15339	NC_005296	CGAC	2	8	5259853	5259860	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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15358	NC_005296	CG	3	6	5265834	5265839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15359	NC_005296	TGT	2	6	5265846	5265851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15361	NC_005296	GGC	2	6	5265869	5265874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15362	NC_005296	GCG	2	6	5265877	5265882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15367	NC_005296	ACA	3	9	5265963	5265971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15370	NC_005296	GAG	2	6	5268493	5268498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15371	NC_005296	CGG	2	6	5268528	5268533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15372	NC_005296	GAGGGG	2	12	5268553	5268564	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15373	NC_005296	GC	3	6	5268574	5268579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15374	NC_005296	GGGGT	2	10	5268597	5268606	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15375	NC_005296	CG	3	6	5268611	5268616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15376	NC_005296	CCACC	2	10	5268637	5268646	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
15377	NC_005296	CGCT	2	8	5268648	5268655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15378	NC_005296	CCCTCC	2	12	5268667	5268678	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
15379	NC_005296	CGC	2	6	5268729	5268734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15382	NC_005296	CG	5	10	5270823	5270832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15383	NC_005296	GC	3	6	5271832	5271837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15385	NC_005296	AGCG	2	8	5271874	5271881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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