MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_005296	GACC	2	8	4432070	4432077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12502	NC_005296	GCG	2	6	4432078	4432083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_005296	TAC	2	6	4432106	4432111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_005296	GGC	2	6	4433129	4433134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12505	NC_005296	AGAA	2	8	4433144	4433151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_005296	GGC	2	6	4433153	4433158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_005296	CGC	2	6	4433170	4433175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_005296	TCT	2	6	4435904	4435909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_005296	GGAA	2	8	4435976	4435983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_005296	GACG	2	8	4436017	4436024	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12511	NC_005296	AGG	2	6	4436084	4436089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_005296	TGC	2	6	4436095	4436100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_005296	GCG	2	6	4436116	4436121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_005296	CGC	2	6	4436132	4436137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_005296	GCC	2	6	4436141	4436146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12516	NC_005296	GCG	2	6	4436150	4436155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_005296	CGT	2	6	4436159	4436164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_005296	CTAC	2	8	4439669	4439676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12519	NC_005296	ACCGC	2	10	4439695	4439704	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12520	NC_005296	GGC	2	6	4441532	4441537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_005296	CAG	2	6	4441544	4441549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_005296	GCC	2	6	4446077	4446082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12523	NC_005296	GCC	3	9	4446474	4446482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12524	NC_005296	GCCG	2	8	4448008	4448015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_005296	GCG	2	6	4448055	4448060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12527	NC_005296	CGGGCG	2	12	4448672	4448683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12530	NC_005296	AGG	2	6	4450949	4450954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_005296	GCG	2	6	4452056	4452061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12533	NC_005296	GCCG	2	8	4452110	4452117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12535	NC_005296	CG	3	6	4452652	4452657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12539	NC_005296	GC	3	6	4453338	4453343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12540	NC_005296	ATGG	2	8	4453362	4453369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_005296	GCTT	2	8	4453386	4453393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12542	NC_005296	GGC	2	6	4453397	4453402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12550	NC_005296	GGA	2	6	4453604	4453609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_005296	GCG	2	6	4454756	4454761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_005296	CA	3	6	4456864	4456869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12554	NC_005296	GA	3	6	4456926	4456931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_005296	AGC	2	6	4458093	4458098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_005296	GCG	2	6	4458172	4458177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_005296	A	7	7	4458187	4458193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_005296	GAC	2	6	4458959	4458964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_005296	GATC	2	8	4458974	4458981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12560	NC_005296	GCG	2	6	4459003	4459008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_005296	CGG	2	6	4461668	4461673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12563	NC_005296	GCC	2	6	4461750	4461755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12564	NC_005296	GGC	2	6	4462842	4462847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_005296	ACG	2	6	4462873	4462878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12566	NC_005296	GAC	2	6	4462900	4462905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_005296	CG	3	6	4464890	4464895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12568	NC_005296	TCTT	2	8	4466211	4466218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12569	NC_005296	C	6	6	4466277	4466282	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12570	NC_005296	AGA	2	6	4466288	4466293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12572	NC_005296	GC	3	6	4466307	4466312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12573	NC_005296	CGGTC	2	10	4467408	4467417	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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12583	NC_005296	TCG	2	6	4468492	4468497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12585	NC_005296	TCC	2	6	4469156	4469161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12588	NC_005296	C	11	11	4475547	4475557	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12589	NC_005296	GCAC	2	8	4475640	4475647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12590	NC_005296	CG	3	6	4475722	4475727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12591	NC_005296	C	7	7	4475774	4475780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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12594	NC_005296	TGT	2	6	4475857	4475862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_005296	TC	3	6	4475866	4475871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12596	NC_005296	CTG	3	9	4477381	4477389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_005296	GCT	2	6	4477401	4477406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_005296	CAA	2	6	4477443	4477448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12599	NC_005296	TGA	2	6	4477530	4477535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12601	NC_005296	AGCA	2	8	4478464	4478471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12602	NC_005296	CGG	2	6	4478495	4478500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_005296	GCA	2	6	4479533	4479538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12605	NC_005296	GCA	2	6	4479550	4479555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_005296	ACG	2	6	4479584	4479589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_005296	CGG	2	6	4479593	4479598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12608	NC_005296	CGA	2	6	4479601	4479606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_005296	CGC	2	6	4481581	4481586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12610	NC_005296	GTG	2	6	4483864	4483869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_005296	GAT	2	6	4486428	4486433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_005296	GCC	2	6	4488317	4488322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12613	NC_005296	GGC	2	6	4488327	4488332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_005296	TTAC	2	8	4489029	4489036	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12615	NC_005296	ACG	2	6	4489059	4489064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_005296	GAC	2	6	4489069	4489074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_005296	GGT	2	6	4489944	4489949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_005296	GC	3	6	4489951	4489956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12619	NC_005296	GA	3	6	4490026	4490031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_005296	CCG	2	6	4490138	4490143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12621	NC_005296	CTG	2	6	4490155	4490160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_005296	TCG	2	6	4490201	4490206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_005296	CAT	2	6	4490250	4490255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_005296	GC	4	8	4491242	4491249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12625	NC_005296	TCC	2	6	4491711	4491716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12626	NC_005296	GTT	2	6	4491723	4491728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12628	NC_005296	GTC	2	6	4494139	4494144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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