MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_005296	AGCG	2	8	3934141	3934148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11002	NC_005296	GCAA	2	8	3934208	3934215	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11003	NC_005296	AGA	2	6	3934245	3934250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_005296	CGC	2	6	3934284	3934289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11005	NC_005296	GACTCT	2	12	3934386	3934397	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_005296	CCAG	2	8	3934425	3934432	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_005296	GCCGC	2	10	3934494	3934503	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11008	NC_005296	CCGG	2	8	3934514	3934521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11009	NC_005296	TGA	2	6	3934530	3934535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_005296	GCT	2	6	3934558	3934563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_005296	GCT	2	6	3934664	3934669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_005296	CAA	2	6	3935873	3935878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_005296	GC	3	6	3935910	3935915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_005296	GCG	2	6	3935938	3935943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_005296	GCC	2	6	3935945	3935950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11016	NC_005296	TCGCG	2	10	3935964	3935973	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11017	NC_005296	TCC	2	6	3937198	3937203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11018	NC_005296	GGC	2	6	3937263	3937268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_005296	GCC	2	6	3937414	3937419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11020	NC_005296	CG	3	6	3937428	3937433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11021	NC_005296	ATC	2	6	3939569	3939574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_005296	GAAA	2	8	3939588	3939595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_005296	GGT	2	6	3939645	3939650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_005296	CCG	2	6	3939668	3939673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_005296	GCG	2	6	3939682	3939687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_005296	CGT	2	6	3939723	3939728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11028	NC_005296	TCC	2	6	3939987	3939992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_005296	CGGC	2	8	3939993	3940000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11030	NC_005296	GC	3	6	3939999	3940004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11031	NC_005296	TTG	2	6	3940010	3940015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_005296	CG	4	8	3940030	3940037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11033	NC_005296	GTT	2	6	3940105	3940110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_005296	CTT	2	6	3940120	3940125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_005296	GC	3	6	3940148	3940153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_005296	AGA	2	6	3940155	3940160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_005296	GCG	2	6	3943793	3943798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_005296	CTG	2	6	3943815	3943820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_005296	GGCCG	2	10	3943886	3943895	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11040	NC_005296	CCG	2	6	3944961	3944966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11041	NC_005296	GTG	2	6	3944974	3944979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_005296	TCCC	2	8	3947082	3947089	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11043	NC_005296	CGCT	2	8	3947091	3947098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_005296	CCGC	2	8	3947101	3947108	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11045	NC_005296	CG	3	6	3948293	3948298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_005296	ACC	2	6	3948306	3948311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11047	NC_005296	CCG	2	6	3948319	3948324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11048	NC_005296	TCG	2	6	3948421	3948426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_005296	AAAT	2	8	3948475	3948482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_005296	GCC	2	6	3948484	3948489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11051	NC_005296	TTC	2	6	3948543	3948548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_005296	CGG	2	6	3948570	3948575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_005296	CGA	2	6	3948590	3948595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11055	NC_005296	CGGCG	2	10	3948851	3948860	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11056	NC_005296	ATG	2	6	3948913	3948918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11059	NC_005296	CTG	2	6	3949544	3949549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_005296	CG	3	6	3949564	3949569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11061	NC_005296	GC	4	8	3949583	3949590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11062	NC_005296	CG	3	6	3951081	3951086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11063	NC_005296	CGT	2	6	3951097	3951102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_005296	GC	3	6	3951143	3951148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_005296	ACTTGC	2	12	3951161	3951172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11068	NC_005296	CGAGC	2	10	3951378	3951387	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11069	NC_005296	AGC	2	6	3951392	3951397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_005296	CAT	2	6	3951465	3951470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11073	NC_005296	GCA	2	6	3957290	3957295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11084	NC_005296	GCC	2	6	3961167	3961172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11085	NC_005296	TCG	2	6	3961227	3961232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11088	NC_005296	GCC	2	6	3961353	3961358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11092	NC_005296	GC	3	6	3963583	3963588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11093	NC_005296	GC	3	6	3963679	3963684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11094	NC_005296	CG	3	6	3964576	3964581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11095	NC_005296	CG	3	6	3964594	3964599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11096	NC_005296	TTTTG	2	10	3964600	3964609	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_005296	CAG	3	9	3966789	3966797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_005296	GC	3	6	3966846	3966851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11099	NC_005296	TCGGT	2	10	3966878	3966887	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11100	NC_005296	TC	3	6	3968726	3968731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11101	NC_005296	GCAG	2	8	3968738	3968745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11102	NC_005296	GTA	2	6	3968829	3968834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_005296	CGCC	2	8	3968855	3968862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11104	NC_005296	GGC	2	6	3968869	3968874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_005296	CCGG	2	8	3968878	3968885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11106	NC_005296	CGC	2	6	3968903	3968908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11107	NC_005296	GCC	2	6	3968926	3968931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11109	NC_005296	TCA	2	6	3969029	3969034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_005296	TCG	2	6	3969058	3969063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_005296	GGC	2	6	3969066	3969071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_005296	GC	3	6	3969095	3969100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11113	NC_005296	CAGC	2	8	3969160	3969167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11114	NC_005296	T	6	6	3969261	3969266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_005296	CG	3	6	3969271	3969276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11120	NC_005296	CAC	2	6	3970534	3970539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11121	NC_005296	CGG	2	6	3970550	3970555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_005296	TCT	2	6	3970561	3970566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11124	NC_005296	TTGAG	2	10	3970603	3970612	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_005296	GCA	2	6	3970654	3970659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11127	NC_005296	GC	4	8	3972655	3972662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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