MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_005296	GGTT	2	8	3799045	3799052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_005296	CTT	2	6	3799095	3799100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_005296	CT	3	6	3799125	3799130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10504	NC_005296	ACG	2	6	3799221	3799226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_005296	TTA	2	6	3799236	3799241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_005296	CCG	2	6	3799261	3799266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10507	NC_005296	TCGC	2	8	3799313	3799320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10508	NC_005296	AAG	2	6	3799330	3799335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_005296	ATG	2	6	3799425	3799430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_005296	TTG	2	6	3799475	3799480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_005296	CAA	2	6	3799491	3799496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_005296	ATTCA	2	10	3799574	3799583	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10513	NC_005296	GGC	2	6	3799621	3799626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_005296	ACG	2	6	3799635	3799640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_005296	TCA	2	6	3800424	3800429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_005296	AGC	2	6	3800444	3800449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_005296	CGG	2	6	3800478	3800483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_005296	TTG	2	6	3800486	3800491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_005296	TC	3	6	3800524	3800529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10520	NC_005296	CGC	2	6	3800545	3800550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10521	NC_005296	GTT	2	6	3800557	3800562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_005296	CT	3	6	3800582	3800587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_005296	CCG	2	6	3800617	3800622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_005296	CAG	2	6	3800654	3800659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_005296	GGC	2	6	3800752	3800757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_005296	CGG	2	6	3800846	3800851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10527	NC_005296	CGT	2	6	3800873	3800878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_005296	CCG	2	6	3800964	3800969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10529	NC_005296	CAAC	2	8	3804490	3804497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10530	NC_005296	GAC	2	6	3804553	3804558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_005296	CTTA	2	8	3804597	3804604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10532	NC_005296	C	6	6	3804630	3804635	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10533	NC_005296	GCCC	2	8	3804636	3804643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10534	NC_005296	AGT	2	6	3804694	3804699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_005296	GGC	2	6	3804757	3804762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_005296	CCGGG	2	10	3804765	3804774	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10537	NC_005296	GCC	2	6	3804782	3804787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10538	NC_005296	CGGC	2	8	3804860	3804867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10539	NC_005296	ACC	2	6	3804890	3804895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10540	NC_005296	CTC	2	6	3805014	3805019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10541	NC_005296	G	6	6	3805134	3805139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_005296	GGA	2	6	3805192	3805197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_005296	TCC	2	6	3805534	3805539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10544	NC_005296	GCA	2	6	3806002	3806007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_005296	CGG	2	6	3806014	3806019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_005296	CGG	2	6	3806064	3806069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_005296	CGGC	2	8	3806104	3806111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10548	NC_005296	GATC	2	8	3806116	3806123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10549	NC_005296	TGT	2	6	3806135	3806140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_005296	CATA	2	8	3806168	3806175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10551	NC_005296	TCC	2	6	3806263	3806268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_005296	GGA	2	6	3806301	3806306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_005296	AGA	2	6	3806414	3806419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_005296	GC	4	8	3806442	3806449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10555	NC_005296	TCT	2	6	3806467	3806472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_005296	GCC	2	6	3806483	3806488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10557	NC_005296	GAG	2	6	3806984	3806989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_005296	CGT	3	9	3807035	3807043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_005296	CCG	2	6	3807055	3807060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10560	NC_005296	ATCG	2	8	3807097	3807104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10561	NC_005296	TGG	2	6	3807111	3807116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_005296	GGC	2	6	3807149	3807154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_005296	GCC	2	6	3807203	3807208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10564	NC_005296	GGCA	2	8	3807223	3807230	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10565	NC_005296	CGGG	2	8	3807261	3807268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10566	NC_005296	CGCGG	2	10	3807276	3807285	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10567	NC_005296	CAAC	2	8	3807312	3807319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10568	NC_005296	GCC	2	6	3807400	3807405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10573	NC_005296	CCG	2	6	3809441	3809446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10574	NC_005296	CGT	2	6	3809450	3809455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_005296	CG	3	6	3809459	3809464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10576	NC_005296	CG	3	6	3809474	3809479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10577	NC_005296	CGG	2	6	3809525	3809530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10585	NC_005296	CGG	2	6	3811034	3811039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10587	NC_005296	TCG	2	6	3811092	3811097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10590	NC_005296	CAGC	2	8	3811480	3811487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10591	NC_005296	CCCGC	2	10	3812285	3812294	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10592	NC_005296	GGCC	2	8	3812325	3812332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10593	NC_005296	CAG	2	6	3813191	3813196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10596	NC_005296	GCG	2	6	3813725	3813730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10597	NC_005296	CGCC	2	8	3813739	3813746	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10598	NC_005296	GCGCG	2	10	3813762	3813771	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10599	NC_005296	GCC	2	6	3814210	3814215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10601	NC_005296	CGG	2	6	3815286	3815291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_005296	CGC	2	6	3819036	3819041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10603	NC_005296	CTT	2	6	3819073	3819078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_005296	CTA	2	6	3819086	3819091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_005296	AC	4	8	3819102	3819109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10606	NC_005296	GCG	2	6	3819251	3819256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_005296	GAC	2	6	3819310	3819315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_005296	CG	3	6	3819429	3819434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10609	NC_005296	GCC	2	6	3819475	3819480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10610	NC_005296	CTG	2	6	3820203	3820208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_005296	AGC	2	6	3820246	3820251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_005296	CGGC	2	8	3820254	3820261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10613	NC_005296	CG	3	6	3820262	3820267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10614	NC_005296	GC	3	6	3820280	3820285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10615	NC_005296	GCA	2	6	3820332	3820337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10618	NC_005296	GAC	2	6	3820518	3820523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10620	NC_005296	CG	3	6	3820596	3820601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10621	NC_005296	GC	4	8	3820606	3820613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10622	NC_005296	GTC	2	6	3820846	3820851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_005296	TGA	2	6	3820860	3820865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10625	NC_005296	GC	3	6	3820894	3820899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10626	NC_005296	ATG	2	6	3820943	3820948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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