MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_005296	TGGCC	2	10	3117973	3117982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8502	NC_005296	CGC	2	6	3117983	3117988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_005296	GCG	2	6	3117989	3117994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_005296	CTGC	2	8	3118363	3118370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8505	NC_005296	GAC	2	6	3118426	3118431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_005296	GC	3	6	3118521	3118526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8507	NC_005296	ACG	2	6	3118546	3118551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_005296	CAA	3	9	3119539	3119547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_005296	GTC	2	6	3120361	3120366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_005296	GCGA	2	8	3120377	3120384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8511	NC_005296	GCT	2	6	3120491	3120496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_005296	GAC	2	6	3120516	3120521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_005296	TTG	2	6	3120530	3120535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_005296	GTC	2	6	3122141	3122146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_005296	GCG	2	6	3122199	3122204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_005296	CCG	2	6	3122206	3122211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8517	NC_005296	CCG	2	6	3123392	3123397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8518	NC_005296	GC	3	6	3123403	3123408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8519	NC_005296	GGC	2	6	3123433	3123438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_005296	CG	3	6	3123506	3123511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8521	NC_005296	GCA	2	6	3123560	3123565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_005296	CGA	2	6	3123656	3123661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8523	NC_005296	CTTCAA	3	18	3123703	3123720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_005296	GCC	2	6	3123836	3123841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8525	NC_005296	ACAA	2	8	3127322	3127329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8526	NC_005296	CAA	2	6	3127334	3127339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_005296	ATG	2	6	3127346	3127351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_005296	CG	3	6	3128490	3128495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8529	NC_005296	CGG	2	6	3129031	3129036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_005296	GCAA	2	8	3129077	3129084	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8531	NC_005296	ACT	2	6	3129149	3129154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_005296	GCAATT	2	12	3129234	3129245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8533	NC_005296	TCG	3	9	3130295	3130303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_005296	ACA	2	6	3130309	3130314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_005296	CGC	2	6	3130317	3130322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8536	NC_005296	GGC	2	6	3130339	3130344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_005296	GCT	2	6	3131791	3131796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_005296	GGA	2	6	3134291	3134296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_005296	ATGA	2	8	3134304	3134311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_005296	GC	5	10	3134312	3134321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8541	NC_005296	GGC	2	6	3134325	3134330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_005296	CGA	2	6	3134767	3134772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_005296	TGGC	2	8	3134787	3134794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8544	NC_005296	TCC	2	6	3135389	3135394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8545	NC_005296	GCG	2	6	3135396	3135401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_005296	GATC	2	8	3136691	3136698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8547	NC_005296	TGC	2	6	3136774	3136779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_005296	GAG	2	6	3137389	3137394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_005296	CGA	2	6	3137436	3137441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_005296	GCTTC	2	10	3137475	3137484	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8551	NC_005296	CGAA	2	8	3138406	3138413	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8552	NC_005296	TAT	2	6	3138878	3138883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_005296	GCA	2	6	3138909	3138914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_005296	GGGA	2	8	3138930	3138937	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_005296	T	7	7	3140016	3140022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_005296	GGAG	2	8	3140030	3140037	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_005296	CGG	2	6	3140043	3140048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_005296	CCA	2	6	3140225	3140230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8559	NC_005296	TACC	2	8	3140236	3140243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8560	NC_005296	GCC	2	6	3141507	3141512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8561	NC_005296	CG	3	6	3143014	3143019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8562	NC_005296	GC	3	6	3143037	3143042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8563	NC_005296	GC	3	6	3143063	3143068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8564	NC_005296	GACCG	2	10	3143074	3143083	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8565	NC_005296	TGTT	2	8	3145197	3145204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_005296	GATC	2	8	3145244	3145251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8567	NC_005296	CAC	2	6	3145258	3145263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8568	NC_005296	GGT	2	6	3145295	3145300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_005296	GCC	2	6	3148353	3148358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8570	NC_005296	CGC	2	6	3150753	3150758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8571	NC_005296	GCG	2	6	3151568	3151573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_005296	TCGT	2	8	3151592	3151599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8573	NC_005296	CGTC	2	8	3151614	3151621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8574	NC_005296	TAA	2	6	3151700	3151705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_005296	CG	3	6	3151730	3151735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8576	NC_005296	ACG	2	6	3153427	3153432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8578	NC_005296	TCA	2	6	3156442	3156447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_005296	CCG	2	6	3156479	3156484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8580	NC_005296	GCGA	2	8	3156492	3156499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8581	NC_005296	CCGG	2	8	3156558	3156565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8582	NC_005296	GCC	2	6	3156597	3156602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8583	NC_005296	CGG	2	6	3156610	3156615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_005296	GCC	2	6	3156665	3156670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8585	NC_005296	TCG	2	6	3157357	3157362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_005296	TTC	2	6	3157366	3157371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8587	NC_005296	GAG	2	6	3157498	3157503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_005296	TTGT	2	8	3157517	3157524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_005296	CT	3	6	3157531	3157536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8590	NC_005296	TCCG	2	8	3157555	3157562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8591	NC_005296	TAT	2	6	3158340	3158345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_005296	CCCTT	2	10	3158358	3158367	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8593	NC_005296	GCC	2	6	3158368	3158373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8594	NC_005296	TCT	2	6	3158389	3158394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_005296	GGT	2	6	3158412	3158417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_005296	CGC	2	6	3159772	3159777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8598	NC_005296	CAA	2	6	3160715	3160720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_005296	ATC	2	6	3160779	3160784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8601	NC_005296	CGC	2	6	3162754	3162759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8602	NC_005296	CG	3	6	3162799	3162804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8603	NC_005296	CAG	2	6	3162832	3162837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_005296	CGA	2	6	3162885	3162890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_005296	GA	3	6	3162905	3162910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_005296	TCT	2	6	3162923	3162928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_005296	TGC	2	6	3162929	3162934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_005296	CGC	2	6	3162941	3162946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8609	NC_005296	GC	3	6	3162945	3162950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8610	NC_005296	CGGCC	2	10	3162996	3163005	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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8613	NC_005296	CGG	2	6	3168811	3168816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_005296	GGC	2	6	3168830	3168835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_005296	CGA	2	6	3171323	3171328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8616	NC_005296	CG	3	6	3171334	3171339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8617	NC_005296	AGA	2	6	3171344	3171349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_005296	CCAA	2	8	3171423	3171430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8619	NC_005296	GGC	2	6	3172996	3173001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_005296	CAT	2	6	3175163	3175168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8622	NC_005296	ACA	2	6	3176152	3176157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_005296	GC	4	8	3176161	3176168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8624	NC_005296	CG	3	6	3176213	3176218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8625	NC_005296	CGGAT	2	10	3176235	3176244	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8626	NC_005296	GCGTC	2	10	3176786	3176795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8627	NC_005296	GGC	2	6	3176805	3176810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_005296	GAAT	2	8	3176841	3176848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_005296	CCT	2	6	3179398	3179403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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