MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_005296	GGGC	2	8	2919606	2919613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8002	NC_005296	CGG	2	6	2919674	2919679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_005296	GC	3	6	2919748	2919753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_005296	AAC	2	6	2919758	2919763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_005296	GGC	2	6	2919821	2919826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_005296	CAG	2	6	2919838	2919843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_005296	GCG	2	6	2919906	2919911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_005296	CGC	2	6	2919924	2919929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_005296	CGC	2	6	2922763	2922768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_005296	GCG	2	6	2922779	2922784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_005296	CG	4	8	2929875	2929882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8012	NC_005296	CG	3	6	2929892	2929897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_005296	CCG	2	6	2930082	2930087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_005296	GCG	2	6	2930111	2930116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_005296	GCG	2	6	2930170	2930175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_005296	GCA	2	6	2932834	2932839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_005296	CAG	2	6	2932850	2932855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_005296	GTCG	2	8	2932867	2932874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8019	NC_005296	GCA	2	6	2932881	2932886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_005296	GGC	2	6	2932912	2932917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_005296	TCG	2	6	2932926	2932931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_005296	CCA	2	6	2932932	2932937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_005296	CGG	2	6	2932938	2932943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_005296	ACG	2	6	2932949	2932954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_005296	CAG	2	6	2932996	2933001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_005296	TGT	2	6	2933065	2933070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_005296	CAT	2	6	2933111	2933116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_005296	A	7	7	2933156	2933162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_005296	GCC	2	6	2933163	2933168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8030	NC_005296	GGC	2	6	2933179	2933184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_005296	GCG	2	6	2933685	2933690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_005296	GGGC	2	8	2933697	2933704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8033	NC_005296	GCG	2	6	2933725	2933730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_005296	ATG	2	6	2933775	2933780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_005296	CCG	2	6	2933953	2933958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_005296	GCC	2	6	2933973	2933978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_005296	GCG	2	6	2933982	2933987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_005296	GC	3	6	2934008	2934013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_005296	GC	3	6	2934047	2934052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_005296	GCA	2	6	2934079	2934084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_005296	TTGC	2	8	2936427	2936434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8042	NC_005296	AAC	2	6	2936436	2936441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_005296	GTC	2	6	2936467	2936472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_005296	GTT	2	6	2936519	2936524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_005296	GCC	2	6	2936599	2936604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_005296	TC	3	6	2936618	2936623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_005296	TGA	2	6	2936660	2936665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_005296	TTG	2	6	2937519	2937524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_005296	GCG	2	6	2937529	2937534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_005296	CGT	2	6	2937552	2937557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_005296	T	6	6	2937591	2937596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_005296	GAG	2	6	2940906	2940911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_005296	CGA	2	6	2940917	2940922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_005296	CAAA	2	8	2941653	2941660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8055	NC_005296	GCT	2	6	2941781	2941786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_005296	GA	3	6	2941806	2941811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_005296	GGC	2	6	2942545	2942550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_005296	TAGG	2	8	2942556	2942563	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_005296	GAG	2	6	2944092	2944097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_005296	CGA	2	6	2944103	2944108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_005296	AGC	2	6	2946028	2946033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_005296	CGC	2	6	2946044	2946049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_005296	GCC	2	6	2946051	2946056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_005296	TGC	2	6	2946073	2946078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_005296	CGC	2	6	2946216	2946221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_005296	TTG	2	6	2949937	2949942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_005296	GCG	2	6	2949968	2949973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_005296	CATT	2	8	2949985	2949992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8069	NC_005296	ATT	2	6	2949994	2949999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_005296	CTTC	2	8	2953684	2953691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8071	NC_005296	TTGC	2	8	2954617	2954624	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_005296	AG	3	6	2954711	2954716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_005296	GCA	2	6	2955031	2955036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_005296	GC	4	8	2956401	2956408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8075	NC_005296	GCC	4	12	2956416	2956427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8076	NC_005296	GGT	2	6	2956529	2956534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_005296	GCC	2	6	2959333	2959338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_005296	GGC	2	6	2959350	2959355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_005296	TCG	2	6	2959361	2959366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_005296	GC	3	6	2959384	2959389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_005296	GCG	2	6	2959492	2959497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_005296	CG	3	6	2959993	2959998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8083	NC_005296	CGGTT	2	10	2960010	2960019	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8084	NC_005296	AAAT	2	8	2960029	2960036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_005296	CCG	2	6	2960037	2960042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_005296	CGGCG	2	10	2960085	2960094	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8087	NC_005296	CG	4	8	2962120	2962127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8088	NC_005296	CGGC	2	8	2962137	2962144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8089	NC_005296	GGCC	2	8	2962157	2962164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_005296	CGC	2	6	2964631	2964636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_005296	GTC	2	6	2964641	2964646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_005296	TCG	2	6	2964649	2964654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_005296	TGG	2	6	2964670	2964675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8095	NC_005296	GCCG	2	8	2964708	2964715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8096	NC_005296	CGGC	2	8	2964822	2964829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8097	NC_005296	GCC	2	6	2964916	2964921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8098	NC_005296	TTG	2	6	2964945	2964950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_005296	GAC	2	6	2964965	2964970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_005296	CAG	2	6	2965017	2965022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_005296	GA	3	6	2965049	2965054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_005296	GAT	2	6	2965075	2965080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_005296	GAT	2	6	2965084	2965089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_005296	ATGCCG	2	12	2965094	2965105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_005296	ATG	2	6	2965106	2965111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_005296	ATG	2	6	2965127	2965132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_005296	ATG	3	9	2965139	2965147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_005296	GAT	2	6	2965153	2965158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_005296	GGCA	2	8	2965159	2965166	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_005296	GAT	2	6	2965171	2965176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_005296	GAT	3	9	2965201	2965209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_005296	TGC	2	6	2965301	2965306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_005296	ATG	2	6	2965313	2965318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_005296	ATG	2	6	2965322	2965327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_005296	GGC	2	6	2965331	2965336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_005296	GAT	3	9	2965342	2965350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_005296	GCG	2	6	2965356	2965361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_005296	ATG	4	12	2965364	2965375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_005296	ATG	2	6	2965379	2965384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_005296	TCT	2	6	2965410	2965415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_005296	CTC	2	6	2965447	2965452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_005296	GCT	2	6	2965525	2965530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_005296	CGA	2	6	2965543	2965548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_005296	GCC	2	6	2966197	2966202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8125	NC_005296	GAA	3	9	2966245	2966253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_005296	GCG	2	6	2966315	2966320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_005296	AC	3	6	2966343	2966348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8128	NC_005296	GATC	2	8	2966352	2966359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8129	NC_005296	CATC	2	8	2966397	2966404	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8131	NC_005296	CTCTG	2	10	2966474	2966483	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8132	NC_005296	CTG	2	6	2966506	2966511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8147	NC_005296	GCCA	2	8	2972477	2972484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8151	NC_005296	GTC	2	6	2972621	2972626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8244	NC_005296	GGT	2	6	3007264	3007269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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