MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_005296	GCG	2	6	2393542	2393547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_005296	CG	3	6	2394434	2394439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6503	NC_005296	TGG	2	6	2394470	2394475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_005296	AGGGA	2	10	2394491	2394500	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_005296	ACC	2	6	2394581	2394586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_005296	TCG	2	6	2394607	2394612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_005296	GTGC	2	8	2394617	2394624	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_005296	CAC	2	6	2394646	2394651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_005296	GCCA	2	8	2394656	2394663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_005296	CCG	2	6	2394687	2394692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_005296	ACC	2	6	2394782	2394787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_005296	TCG	2	6	2394803	2394808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_005296	TTGCAA	2	12	2394824	2394835	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6514	NC_005296	GCA	2	6	2396104	2396109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_005296	GGCTG	2	10	2398381	2398390	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6516	NC_005296	TTCG	2	8	2398394	2398401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6517	NC_005296	TCA	2	6	2398449	2398454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_005296	CGGG	2	8	2398927	2398934	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6519	NC_005296	CCCG	2	8	2398949	2398956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6520	NC_005296	GCC	2	6	2401175	2401180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_005296	CCG	2	6	2401208	2401213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6522	NC_005296	CGC	2	6	2401232	2401237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6523	NC_005296	GAT	2	6	2401264	2401269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_005296	CGG	2	6	2401275	2401280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_005296	CGC	2	6	2401285	2401290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_005296	CGC	2	6	2401641	2401646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_005296	GC	4	8	2402973	2402980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6528	NC_005296	GAA	2	6	2403012	2403017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_005296	CG	4	8	2404210	2404217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6530	NC_005296	G	6	6	2404251	2404256	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_005296	GGGCG	2	10	2404320	2404329	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6532	NC_005296	GC	3	6	2404335	2404340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_005296	GAC	2	6	2404350	2404355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_005296	GGA	2	6	2405225	2405230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_005296	CAT	2	6	2406106	2406111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_005296	GCG	2	6	2406144	2406149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_005296	GCG	2	6	2407072	2407077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_005296	AGC	2	6	2407174	2407179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_005296	GCG	2	6	2408859	2408864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_005296	CG	3	6	2408918	2408923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_005296	CGA	2	6	2408999	2409004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_005296	GAG	2	6	2412689	2412694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_005296	CGA	2	6	2412700	2412705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_005296	CGC	2	6	2412725	2412730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_005296	CCG	2	6	2413558	2413563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_005296	GC	3	6	2413581	2413586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_005296	GGC	2	6	2413616	2413621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_005296	CGC	2	6	2413693	2413698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6549	NC_005296	GCG	2	6	2413704	2413709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_005296	CAGG	2	8	2413714	2413721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6551	NC_005296	ACG	2	6	2413727	2413732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_005296	CGG	2	6	2415299	2415304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_005296	CGG	2	6	2415321	2415326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_005296	GTT	2	6	2415348	2415353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_005296	CCG	2	6	2415406	2415411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6556	NC_005296	GC	4	8	2415412	2415419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_005296	TCG	2	6	2416873	2416878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_005296	GCG	2	6	2418296	2418301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_005296	CG	3	6	2418300	2418305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_005296	CCG	2	6	2418311	2418316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_005296	GTCC	2	8	2418320	2418327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_005296	GC	3	6	2420277	2420282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_005296	ACC	2	6	2420318	2420323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_005296	CCT	2	6	2420342	2420347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_005296	ACG	2	6	2420395	2420400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_005296	ACC	2	6	2421345	2421350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6567	NC_005296	TGTCGT	2	12	2421351	2421362	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6568	NC_005296	GAT	2	6	2421395	2421400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_005296	TGC	2	6	2423542	2423547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_005296	GCA	2	6	2423551	2423556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_005296	ATC	2	6	2423559	2423564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_005296	ATT	2	6	2423565	2423570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_005296	CG	3	6	2423573	2423578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_005296	AGA	2	6	2423584	2423589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_005296	GGT	2	6	2423681	2423686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_005296	CGAGG	2	10	2423709	2423718	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6577	NC_005296	CG	3	6	2423723	2423728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_005296	CAC	2	6	2423752	2423757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6579	NC_005296	ACC	2	6	2423760	2423765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6580	NC_005296	CGC	2	6	2425258	2425263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6581	NC_005296	GGAC	2	8	2426539	2426546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6582	NC_005296	TGC	2	6	2426554	2426559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_005296	CCG	2	6	2426567	2426572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6584	NC_005296	AGT	2	6	2426605	2426610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_005296	CGT	2	6	2426624	2426629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_005296	GCT	2	6	2426703	2426708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_005296	GCG	2	6	2426750	2426755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_005296	CCG	2	6	2426823	2426828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_005296	GTA	2	6	2428976	2428981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_005296	CGT	2	6	2429034	2429039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_005296	GTT	2	6	2429054	2429059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_005296	CTC	2	6	2429176	2429181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_005296	CGC	2	6	2429215	2429220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6594	NC_005296	AGCG	2	8	2429244	2429251	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6595	NC_005296	ACC	2	6	2430457	2430462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6596	NC_005296	GC	3	6	2430490	2430495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6597	NC_005296	TC	3	6	2430507	2430512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6598	NC_005296	TGT	2	6	2430974	2430979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_005296	GCT	2	6	2430992	2430997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_005296	TGGT	2	8	2431342	2431349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_005296	CG	3	6	2431411	2431416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_005296	GCC	3	9	2431434	2431442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_005296	CGAT	2	8	2432644	2432651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_005296	GCA	2	6	2432734	2432739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_005296	ACGCG	2	10	2432769	2432778	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6606	NC_005296	AGCG	2	8	2432787	2432794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6607	NC_005296	CGA	2	6	2432818	2432823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_005296	GCA	2	6	2432828	2432833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_005296	CA	3	6	2432840	2432845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6610	NC_005296	GCG	2	6	2432858	2432863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_005296	CA	3	6	2432879	2432884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_005296	AGA	2	6	2432892	2432897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_005296	GGTA	2	8	2432918	2432925	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_005296	TTG	2	6	2432928	2432933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_005296	CAA	2	6	2433011	2433016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_005296	CCG	2	6	2433106	2433111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_005296	CTCGA	2	10	2433121	2433130	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6618	NC_005296	ACG	2	6	2433288	2433293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_005296	GCC	2	6	2436177	2436182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6620	NC_005296	GGT	2	6	2436901	2436906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_005296	CG	3	6	2436935	2436940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6622	NC_005296	GCTC	2	8	2436946	2436953	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6623	NC_005296	CGG	2	6	2437053	2437058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_005296	CG	3	6	2437078	2437083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6625	NC_005296	TGCGC	2	10	2437105	2437114	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6626	NC_005296	GC	4	8	2437111	2437118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_005296	CAA	2	6	2437160	2437165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_005296	A	6	6	2437164	2437169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_005296	CCG	2	6	2437181	2437186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6630	NC_005296	GAG	2	6	2438903	2438908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_005296	CCGA	2	8	2438909	2438916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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