MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 15970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_005296	CGCTG	2	10	2015697	2015706	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5502	NC_005296	CGA	3	9	2015711	2015719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_005296	GACG	2	8	2017049	2017056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_005296	GAC	2	6	2017073	2017078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_005296	CTT	2	6	2017090	2017095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_005296	TCG	2	6	2017187	2017192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_005296	GAA	2	6	2017197	2017202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_005296	GTT	3	9	2018462	2018470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_005296	CCG	2	6	2018545	2018550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_005296	CG	3	6	2018604	2018609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_005296	CG	3	6	2018624	2018629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_005296	TGCG	2	8	2018642	2018649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_005296	GAA	2	6	2018681	2018686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_005296	TCC	2	6	2020191	2020196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_005296	TCC	2	6	2020217	2020222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_005296	TCGCT	2	10	2020231	2020240	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5517	NC_005296	A	6	6	2021553	2021558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_005296	TTA	2	6	2021612	2021617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_005296	GCG	2	6	2021687	2021692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_005296	CCG	2	6	2022490	2022495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_005296	GTC	2	6	2022502	2022507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_005296	GCC	2	6	2022508	2022513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_005296	TCC	2	6	2024000	2024005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_005296	GAG	2	6	2024016	2024021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_005296	CGA	2	6	2024029	2024034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_005296	GCTTC	2	10	2024066	2024075	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5527	NC_005296	GACT	2	8	2024097	2024104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_005296	GGC	2	6	2029710	2029715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_005296	GGA	2	6	2029730	2029735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_005296	GC	3	6	2031210	2031215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_005296	TCGG	2	8	2031219	2031226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_005296	TCA	2	6	2031244	2031249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_005296	GCT	2	6	2031253	2031258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_005296	CAGG	2	8	2031349	2031356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_005296	CGC	2	6	2032619	2032624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_005296	CGC	2	6	2032632	2032637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5537	NC_005296	TTC	2	6	2032672	2032677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_005296	CCG	2	6	2032702	2032707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_005296	CCG	2	6	2035882	2035887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_005296	GTA	2	6	2035905	2035910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_005296	CAA	2	6	2035959	2035964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_005296	AGG	2	6	2036042	2036047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_005296	CG	3	6	2036460	2036465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_005296	CGA	2	6	2038039	2038044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_005296	GC	3	6	2038049	2038054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_005296	CCGCGG	2	12	2038908	2038919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_005296	GCC	2	6	2038934	2038939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_005296	GC	3	6	2039860	2039865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_005296	TTG	2	6	2039871	2039876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_005296	GAAT	2	8	2041173	2041180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_005296	CG	4	8	2041612	2041619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_005296	GC	3	6	2041624	2041629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_005296	GCCG	2	8	2043910	2043917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_005296	GAC	2	6	2046365	2046370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_005296	GCCG	2	8	2046462	2046469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_005296	TTTA	2	8	2046546	2046553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_005296	GC	3	6	2048030	2048035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5558	NC_005296	GCTT	2	8	2048099	2048106	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_005296	CG	4	8	2048115	2048122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_005296	A	6	6	2048125	2048130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_005296	ACC	2	6	2048190	2048195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_005296	CCCG	2	8	2048256	2048263	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5563	NC_005296	C	6	6	2048269	2048274	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5564	NC_005296	CGG	2	6	2048304	2048309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_005296	CCG	2	6	2048315	2048320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_005296	AAC	2	6	2048409	2048414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_005296	T	6	6	2048460	2048465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_005296	GACC	2	8	2048478	2048485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5569	NC_005296	GTGA	2	8	2049028	2049035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_005296	CAG	2	6	2049046	2049051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_005296	TCG	2	6	2049067	2049072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_005296	TCG	2	6	2049085	2049090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_005296	CG	3	6	2049100	2049105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_005296	TC	3	6	2049110	2049115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_005296	TGCG	2	8	2049286	2049293	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_005296	CAG	2	6	2049326	2049331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_005296	G	6	6	2049331	2049336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_005296	TGC	2	6	2049365	2049370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_005296	TC	3	6	2049374	2049379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5580	NC_005296	CG	3	6	2049408	2049413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_005296	TCG	2	6	2049417	2049422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_005296	CTC	2	6	2051501	2051506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_005296	GC	4	8	2051557	2051564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5584	NC_005296	CCA	2	6	2051628	2051633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5585	NC_005296	TTG	2	6	2051641	2051646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5587	NC_005296	GC	3	6	2051746	2051751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5588	NC_005296	TGC	2	6	2051769	2051774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5590	NC_005296	TCG	2	6	2051797	2051802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5593	NC_005296	GCC	2	6	2051871	2051876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_005296	GCG	2	6	2051906	2051911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_005296	TCGA	2	8	2051926	2051933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5596	NC_005296	CGCC	2	8	2051942	2051949	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5597	NC_005296	GTG	3	9	2051965	2051973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_005296	GTGG	2	8	2054618	2054625	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5601	NC_005296	CGC	3	9	2055234	2055242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_005296	GGTCC	2	10	2055300	2055309	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5603	NC_005296	GGA	2	6	2055666	2055671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_005296	CCG	2	6	2057099	2057104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_005296	TCC	2	6	2057419	2057424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_005296	GCA	2	6	2057445	2057450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_005296	GCGAT	2	10	2057470	2057479	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5608	NC_005296	GC	4	8	2059174	2059181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_005296	TGA	2	6	2059194	2059199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_005296	GTC	2	6	2059797	2059802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_005296	TCCG	2	8	2059828	2059835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_005296	A	7	7	2059873	2059879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_005296	GCG	2	6	2059897	2059902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_005296	GTT	2	6	2059906	2059911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_005296	GA	3	6	2059920	2059925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_005296	CCG	2	6	2059972	2059977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_005296	GC	4	8	2060795	2060802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_005296	ATC	2	6	2060817	2060822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_005296	TTCG	2	8	2060833	2060840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_005296	TCG	2	6	2063783	2063788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5623	NC_005296	GCG	2	6	2066273	2066278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5627	NC_005296	TCTGC	2	10	2068908	2068917	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5628	NC_005296	CGG	2	6	2068957	2068962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_005296	CGA	2	6	2068998	2069003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5632	NC_005296	CGC	2	6	2069087	2069092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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