MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 6251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005027	CGA	2	6	3382269	3382274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_005027	GCG	2	6	3382295	3382300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_005027	TGT	2	6	3384143	3384148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_005027	CCT	2	6	3388433	3388438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_005027	AACGC	2	10	3388444	3388453	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3006	NC_005027	GCT	2	6	3388461	3388466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_005027	ACG	2	6	3388480	3388485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_005027	AGTC	2	8	3389985	3389992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3009	NC_005027	AGA	2	6	3389999	3390004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_005027	AAAG	2	8	3390015	3390022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_005027	C	6	6	3390072	3390077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3012	NC_005027	AATC	2	8	3408765	3408772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_005027	GACGTA	2	12	3419423	3419434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3014	NC_005027	GTT	2	6	3419456	3419461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_005027	TCGCA	2	10	3419477	3419486	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3016	NC_005027	TCA	2	6	3424009	3424014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_005027	TGA	2	6	3424031	3424036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_005027	TG	3	6	3424051	3424056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_005027	GCAC	2	8	3424490	3424497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_005027	AGAT	2	8	3424512	3424519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_005027	CCG	2	6	3424520	3424525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_005027	GGC	2	6	3425686	3425691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_005027	TCGA	2	8	3427079	3427086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_005027	GAAAC	2	10	3427100	3427109	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_005027	T	6	6	3427133	3427138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_005027	TAT	2	6	3433170	3433175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_005027	CGC	2	6	3433194	3433199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_005027	ATCC	2	8	3433200	3433207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_005027	ACC	2	6	3433217	3433222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_005027	TCA	2	6	3438678	3438683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_005027	GA	3	6	3439733	3439738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_005027	GCT	2	6	3441808	3441813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_005027	GACC	2	8	3457375	3457382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_005027	TCT	2	6	3462616	3462621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_005027	TCG	2	6	3464268	3464273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_005027	GTC	2	6	3464290	3464295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_005027	CGA	2	6	3467785	3467790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_005027	GTG	2	6	3468545	3468550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_005027	TCT	2	6	3468655	3468660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_005027	GCA	2	6	3468663	3468668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_005027	ATC	2	6	3468717	3468722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_005027	GCT	2	6	3468732	3468737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_005027	GAT	2	6	3471714	3471719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_005027	TTTGAA	2	12	3472894	3472905	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_005027	AAC	2	6	3472920	3472925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_005027	CG	3	6	3475789	3475794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3047	NC_005027	GTTG	2	8	3477145	3477152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_005027	GATC	2	8	3477165	3477172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_005027	TCT	2	6	3479371	3479376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_005027	ACCA	2	8	3480811	3480818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_005027	GCAA	2	8	3480833	3480840	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_005027	ACG	2	6	3480999	3481004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_005027	AGA	2	6	3481009	3481014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_005027	GGGAG	2	10	3485206	3485215	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_005027	CTG	2	6	3488055	3488060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_005027	CAA	2	6	3488085	3488090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_005027	GTT	2	6	3488159	3488164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_005027	GCG	2	6	3488168	3488173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_005027	CGA	2	6	3490030	3490035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_005027	CCT	2	6	3493714	3493719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_005027	CAG	2	6	3495997	3496002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_005027	C	6	6	3496187	3496192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3063	NC_005027	CGG	2	6	3496211	3496216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_005027	GAT	2	6	3502610	3502615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_005027	TCG	2	6	3502680	3502685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_005027	GTG	2	6	3507079	3507084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_005027	CCCAG	2	10	3507146	3507155	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3068	NC_005027	TCC	2	6	3507228	3507233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_005027	CAC	2	6	3507275	3507280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_005027	ACC	2	6	3507341	3507346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_005027	TTC	2	6	3511440	3511445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_005027	AC	3	6	3511609	3511614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_005027	CGC	2	6	3511627	3511632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_005027	CG	3	6	3511658	3511663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_005027	CAAAG	2	10	3517434	3517443	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3076	NC_005027	GCT	2	6	3517471	3517476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_005027	GTC	2	6	3517488	3517493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_005027	ATGA	2	8	3519410	3519417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_005027	GATG	2	8	3519473	3519480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_005027	AAC	2	6	3519481	3519486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_005027	CTC	2	6	3522106	3522111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_005027	CTTT	2	8	3525749	3525756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_005027	CCTA	2	8	3526928	3526935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3084	NC_005027	TAC	2	6	3526937	3526942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3087	NC_005027	A	6	6	3530605	3530610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_005027	AGTGA	2	10	3530653	3530662	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_005027	CAAC	2	8	3530667	3530674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3092	NC_005027	AGC	2	6	3537380	3537385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3098	NC_005027	GCA	2	6	3550849	3550854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_005027	CATC	2	8	3550859	3550866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3100	NC_005027	TCA	2	6	3551090	3551095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_005027	TCC	2	6	3551096	3551101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_005027	ACCA	2	8	3552212	3552219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_005027	T	6	6	3555807	3555812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_005027	A	7	7	3555864	3555870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_005027	CTC	2	6	3555876	3555881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_005027	TCAC	2	8	3556932	3556939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_005027	AC	3	6	3556953	3556958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3108	NC_005027	CGG	2	6	3559927	3559932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_005027	CGT	2	6	3560969	3560974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_005027	TCAA	2	8	3560982	3560989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_005027	ATTG	2	8	3561000	3561007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_005027	TTC	2	6	3564401	3564406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_005027	TTG	2	6	3564490	3564495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_005027	TCGT	2	8	3567236	3567243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3115	NC_005027	CAAC	2	8	3567271	3567278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3116	NC_005027	CCT	2	6	3567325	3567330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3118	NC_005027	TC	3	6	3567370	3567375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_005027	TC	3	6	3567982	3567987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_005027	AATA	2	8	3568003	3568010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_005027	TCT	2	6	3568019	3568024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3123	NC_005027	AAG	2	6	3569597	3569602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3126	NC_005027	AGA	2	6	3577036	3577041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_005027	AAG	2	6	3577052	3577057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_005027	CGAT	2	8	3577063	3577070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_005027	ACC	2	6	3577163	3577168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_005027	TAC	2	6	3577378	3577383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_005027	CGA	2	6	3577542	3577547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_005027	GCT	2	6	3578865	3578870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_005027	GTA	2	6	3578915	3578920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_005027	GAC	2	6	3578969	3578974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_005027	ATG	2	6	3579461	3579466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_005027	CAT	2	6	3580527	3580532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_005027	ATG	3	9	3580569	3580577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_005027	AGTC	2	8	3583507	3583514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3139	NC_005027	ATCC	2	8	3590269	3590276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3140	NC_005027	AC	3	6	3594103	3594108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3141	NC_005027	GAC	2	6	3594154	3594159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3143	NC_005027	ACGCC	2	10	3597566	3597575	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3144	NC_005027	GAA	3	9	3599593	3599601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3146	NC_005027	CCG	2	6	3603326	3603331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3147	NC_005027	CTT	2	6	3605102	3605107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3148	NC_005027	CCG	2	6	3607006	3607011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3149	NC_005027	TC	3	6	3607060	3607065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3150	NC_005027	GA	3	6	3607092	3607097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_005027	CGC	2	6	3607098	3607103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3154	NC_005027	TCCC	2	8	3615586	3615593	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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3162	NC_005027	CGA	2	6	3622073	3622078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3163	NC_005027	GCTC	2	8	3622106	3622113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3164	NC_005027	ATTTC	2	10	3622114	3622123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3175	NC_005027	CAC	3	9	3636259	3636267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3253	NC_005027	CCTA	2	8	3735255	3735262	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_005027	CCG	2	6	3735270	3735275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3255	NC_005027	T	6	6	3735574	3735579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3257	NC_005027	GATC	2	8	3735704	3735711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3258	NC_005027	CAG	2	6	3735735	3735740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3259	NC_005027	CTC	2	6	3735770	3735775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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