MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 7882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000963	A	6	6	609249	609254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_000963	TTG	2	6	609255	609260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_000963	AT	3	6	609283	609288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_000963	T	6	6	609298	609303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_000963	T	7	7	609307	609313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_000963	A	7	7	609314	609320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_000963	TAAA	2	8	609413	609420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_000963	A	6	6	609428	609433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_000963	TA	4	8	609449	609456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_000963	ATT	2	6	609464	609469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_000963	CTAG	2	8	609495	609502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_000963	TA	3	6	609534	609539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_000963	ATA	2	6	609558	609563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_000963	AT	3	6	610298	610303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_000963	TAA	2	6	610308	610313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_000963	AGT	2	6	610324	610329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_000963	TAA	2	6	610404	610409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_000963	A	6	6	610445	610450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_000963	TC	3	6	610466	610471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_000963	TA	4	8	610536	610543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_000963	TTA	2	6	610563	610568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_000963	A	7	7	610603	610609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_000963	ATT	2	6	610631	610636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_000963	TA	3	6	610691	610696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_000963	TATTT	2	10	610711	610720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_000963	TTA	2	6	610769	610774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4029	NC_000963	A	6	6	610845	610850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_000963	AATT	2	8	610893	610900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_000963	AT	4	8	610923	610930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_000963	GTA	2	6	610936	610941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_000963	TAA	2	6	610993	610998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_000963	TAT	2	6	611014	611019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_000963	ACT	2	6	611034	611039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4037	NC_000963	T	6	6	611120	611125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_000963	TGT	2	6	611129	611134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_000963	ATT	2	6	611146	611151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_000963	TCA	2	6	611200	611205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_000963	ATT	2	6	612795	612800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_000963	T	7	7	612864	612870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_000963	AAT	2	6	612878	612883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_000963	GTT	2	6	613760	613765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_000963	ATT	2	6	613766	613771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_000963	TAAT	2	8	613808	613815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4048	NC_000963	GAAAT	2	10	613867	613876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_000963	T	6	6	613926	613931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_000963	CATAAT	2	12	613962	613973	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4051	NC_000963	T	7	7	614017	614023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_000963	AAT	2	6	614033	614038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_000963	TAT	2	6	614043	614048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_000963	AAT	2	6	614054	614059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_000963	A	6	6	614079	614084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_000963	ATT	2	6	614095	614100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_000963	ATT	2	6	614131	614136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_000963	ATT	2	6	614172	614177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_000963	TA	3	6	614193	614198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_000963	ATA	2	6	614206	614211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_000963	TTAT	2	8	614212	614219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_000963	ATT	2	6	614680	614685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_000963	A	6	6	617848	617853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_000963	A	8	8	617902	617909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_000963	AGA	2	6	617952	617957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_000963	TAA	2	6	617983	617988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_000963	A	6	6	618058	618063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_000963	TA	3	6	619643	619648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_000963	TAA	2	6	619714	619719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_000963	GTA	2	6	619725	619730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_000963	TAA	2	6	619740	619745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_000963	TTG	2	6	619774	619779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_000963	AT	3	6	619817	619822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_000963	AGA	2	6	620354	620359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_000963	ATTAAA	2	12	620442	620453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4080	NC_000963	GTT	2	6	620665	620670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_000963	ATTTA	2	10	620687	620696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_000963	TAT	2	6	621006	621011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_000963	TA	4	8	621067	621074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_000963	TGA	2	6	621097	621102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_000963	ATT	2	6	623396	623401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_000963	CAT	2	6	623439	623444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4091	NC_000963	TAA	2	6	625587	625592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4096	NC_000963	AT	3	6	628035	628040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_000963	ATG	2	6	628044	628049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_000963	ATTT	2	8	628103	628110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_000963	AATA	2	8	628126	628133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_000963	GTA	2	6	628138	628143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_000963	A	6	6	628168	628173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_000963	TTG	2	6	628238	628243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_000963	TA	3	6	628244	628249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_000963	TCT	2	6	628260	628265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_000963	ATT	2	6	628285	628290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_000963	ATT	2	6	628320	628325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_000963	TA	3	6	628344	628349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_000963	ACA	3	9	628375	628383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_000963	A	6	6	628391	628396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_000963	AT	3	6	628398	628403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_000963	AT	3	6	628413	628418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_000963	AAT	2	6	628429	628434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_000963	AT	3	6	629431	629436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_000963	ATC	2	6	629438	629443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_000963	T	6	6	629467	629472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_000963	ATTT	2	8	629492	629499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_000963	ATA	2	6	629527	629532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_000963	GA	3	6	629558	629563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_000963	TTA	2	6	629580	629585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_000963	TTTAAA	2	12	629586	629597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_000963	T	6	6	629612	629617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_000963	TTC	2	6	629645	629650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_000963	AACT	2	8	629681	629688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_000963	TAA	2	6	629692	629697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_000963	ATA	2	6	629713	629718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_000963	TAG	2	6	629743	629748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4129	NC_000963	TA	3	6	629781	629786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_000963	AGT	2	6	629794	629799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_000963	TGA	2	6	629807	629812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4133	NC_000963	TAT	2	6	629829	629834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_000963	AT	3	6	629939	629944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_000963	T	6	6	629950	629955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4137	NC_000963	ATC	2	6	630027	630032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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