MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 7882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_000963	GTT	2	6	238378	238383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_000963	TAT	2	6	238392	238397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_000963	CTAT	2	8	238400	238407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_000963	TTA	2	6	238409	238414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_000963	ATT	2	6	238420	238425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_000963	CTT	2	6	238427	238432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_000963	A	7	7	238469	238475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_000963	ATA	2	6	238485	238490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_000963	AATGT	2	10	238573	238582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_000963	GGT	2	6	238632	238637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_000963	GTA	2	6	238726	238731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_000963	ATGT	2	8	238779	238786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_000963	ATA	2	6	238799	238804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_000963	GTAAAG	2	12	238807	238818	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_000963	ATT	2	6	238829	238834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_000963	TTA	2	6	238839	238844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_000963	TAA	2	6	238847	238852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_000963	TAT	2	6	238946	238951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_000963	TTAC	2	8	238964	238971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_000963	ATC	2	6	238987	238992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_000963	A	7	7	238998	239004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_000963	TGA	2	6	239017	239022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_000963	TAGTA	2	10	239025	239034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_000963	T	6	6	239075	239080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_000963	A	7	7	239110	239116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_000963	TCA	2	6	239198	239203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_000963	AAT	2	6	239235	239240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_000963	TATT	2	8	244393	244400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_000963	TTA	2	6	244408	244413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_000963	AACAA	2	10	244454	244463	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1531	NC_000963	AT	3	6	244472	244477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_000963	ACT	2	6	244523	244528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_000963	AAGA	2	8	244541	244548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_000963	TAT	3	9	244549	244557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_000963	TAT	2	6	245174	245179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_000963	CAT	2	6	245185	245190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_000963	ATA	2	6	247256	247261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_000963	TA	3	6	247260	247265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_000963	A	6	6	247275	247280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_000963	A	6	6	247282	247287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_000963	AAATAA	2	12	247651	247662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_000963	TAG	2	6	249536	249541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_000963	TG	3	6	249543	249548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_000963	CTTA	2	8	249581	249588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1545	NC_000963	AT	3	6	249628	249633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_000963	ATA	2	6	249677	249682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_000963	ATG	2	6	249693	249698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_000963	AT	3	6	249745	249750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_000963	TAG	3	9	249802	249810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_000963	TTA	2	6	249868	249873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_000963	TAA	2	6	249908	249913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_000963	A	7	7	249912	249918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_000963	AAG	2	6	249962	249967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_000963	CAATTA	2	12	249986	249997	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1555	NC_000963	GTA	2	6	250000	250005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_000963	CTAAA	2	10	250037	250046	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1557	NC_000963	TTTAA	2	10	250055	250064	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_000963	A	7	7	250103	250109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_000963	TACA	2	8	250168	250175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_000963	ATT	2	6	250186	250191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_000963	TGA	2	6	250265	250270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_000963	TAA	2	6	250286	250291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_000963	TAT	2	6	250317	250322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_000963	TGT	2	6	250481	250486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_000963	AAGC	2	8	250525	250532	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_000963	AAATT	2	10	250535	250544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_000963	GACC	2	8	250564	250571	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_000963	ATA	2	6	250580	250585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_000963	GAAA	2	8	250612	250619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_000963	TAT	2	6	250622	250627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_000963	ATTTA	2	10	250651	250660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_000963	TTTA	2	8	253410	253417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_000963	T	6	6	253428	253433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_000963	AT	4	8	253434	253441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_000963	AT	3	6	253475	253480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_000963	ATTA	2	8	253539	253546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_000963	TTAA	2	8	253567	253574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_000963	TGT	2	6	253598	253603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_000963	ATG	2	6	253631	253636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_000963	TGTT	2	8	253655	253662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_000963	T	6	6	253705	253710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_000963	TAC	2	6	253764	253769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_000963	TAA	2	6	253789	253794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_000963	ATT	3	9	253835	253843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_000963	ATTA	2	8	253882	253889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_000963	AC	4	8	253906	253913	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_000963	TAT	2	6	253928	253933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_000963	TCAT	2	8	253977	253984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_000963	AT	3	6	253983	253988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_000963	TAT	2	6	254051	254056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_000963	ATT	2	6	254110	254115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_000963	T	6	6	254132	254137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_000963	ATG	2	6	254374	254379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_000963	TA	3	6	254382	254387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_000963	TAG	2	6	254402	254407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_000963	ATA	2	6	254411	254416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_000963	A	6	6	254418	254423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_000963	TTA	2	6	254444	254449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_000963	AGTAAA	2	12	254451	254462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_000963	TATT	2	8	254463	254470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_000963	ATTG	2	8	254475	254482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_000963	GTAA	2	8	254501	254508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_000963	GTT	2	6	254518	254523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_000963	ATA	3	9	254541	254549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_000963	GGT	2	6	254553	254558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_000963	ATT	2	6	254562	254567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_000963	TGCT	2	8	254572	254579	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_000963	AT	3	6	254595	254600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_000963	T	6	6	254624	254629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_000963	ATG	2	6	254635	254640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_000963	T	7	7	254641	254647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_000963	GATA	2	8	254654	254661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_000963	TA	3	6	254665	254670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_000963	TAA	2	6	254729	254734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_000963	ATT	2	6	254746	254751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_000963	ATG	2	6	254812	254817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_000963	ATA	2	6	254818	254823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_000963	ATT	2	6	254850	254855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_000963	AT	3	6	254876	254881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_000963	TAT	3	9	254879	254887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_000963	T	7	7	254887	254893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_000963	AGA	2	6	254896	254901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_000963	ATTA	2	8	254923	254930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_000963	AGA	2	6	254972	254977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_000963	ATTTT	2	10	255215	255224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_000963	T	6	6	255221	255226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_000963	ACT	2	6	255323	255328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1631	NC_000963	ATC	2	6	255341	255346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_000963	T	6	6	255358	255363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_000963	T	6	6	255378	255383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_000963	TCA	2	6	255426	255431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_000963	AT	3	6	255510	255515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_000963	AT	3	6	255539	255544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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