MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_022545	GCG	2	6	1672029	1672034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729647
33003	NC_022545	GGT	2	6	1672174	1672179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729647
33004	NC_022545	GCC	2	6	1672217	1672222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729647
33005	NC_022545	TCA	2	6	1672245	1672250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729647
33006	NC_022545	GC	4	8	1672257	1672264	0 %	0 %	50 %	50 %	549729647
33007	NC_022545	CTG	2	6	1672268	1672273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729647
33008	NC_022545	AGC	2	6	1672299	1672304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729647
33009	NC_022545	AAG	2	6	1672313	1672318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729647
33010	NC_022545	CAC	2	6	1672369	1672374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729647
33011	NC_022545	CGGT	2	8	1672377	1672384	0 %	25 %	50 %	25 %	549729647
33012	NC_022545	CGT	2	6	1672525	1672530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729647
33013	NC_022545	TTA	2	6	1672531	1672536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729647
33014	NC_022545	GAC	2	6	1672562	1672567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729647
33015	NC_022545	GAA	2	6	1672568	1672573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729647
33016	NC_022545	AAG	2	6	1672574	1672579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729647
33017	NC_022545	TGC	2	6	1672683	1672688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729647
33018	NC_022545	TCG	2	6	1672752	1672757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729647
33019	NC_022545	GCG	2	6	1672915	1672920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729648
33020	NC_022545	CGGC	2	8	1673036	1673043	0 %	0 %	50 %	50 %	549729648
33021	NC_022545	GCA	2	6	1673061	1673066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729648
33022	NC_022545	TTC	2	6	1673152	1673157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729648
33023	NC_022545	CTT	2	6	1673199	1673204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729648
33024	NC_022545	CACG	2	8	1673298	1673305	25 %	0 %	25 %	50 %	549729648
33025	NC_022545	GCG	2	6	1673348	1673353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729648
33026	NC_022545	GA	3	6	1673435	1673440	50 %	0 %	50 %	0 %	549729648
33027	NC_022545	CAC	2	6	1673520	1673525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729648
33028	NC_022545	GGC	2	6	1673527	1673532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729648
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33032	NC_022545	TGC	2	6	1673678	1673683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729648
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33035	NC_022545	CGG	2	6	1673760	1673765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729648
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33039	NC_022545	CGA	2	6	1673993	1673998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729648
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33042	NC_022545	GTG	2	6	1674185	1674190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729648
33043	NC_022545	CTT	2	6	1674210	1674215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729648
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33050	NC_022545	GAC	2	6	1674705	1674710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729649
33051	NC_022545	CAT	2	6	1674789	1674794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729649
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33053	NC_022545	CGG	2	6	1674903	1674908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729649
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33055	NC_022545	CCATTC	2	12	1674991	1675002	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549729650
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33057	NC_022545	CG	3	6	1675100	1675105	0 %	0 %	50 %	50 %	549729650
33058	NC_022545	GTC	2	6	1675110	1675115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729650
33059	NC_022545	CGG	2	6	1675180	1675185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729650
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33065	NC_022545	CG	4	8	1675359	1675366	0 %	0 %	50 %	50 %	549729650
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33067	NC_022545	GA	3	6	1675450	1675455	50 %	0 %	50 %	0 %	549729650
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33085	NC_022545	TCA	2	6	1676370	1676375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729651
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33089	NC_022545	CGCC	2	8	1676758	1676765	0 %	0 %	25 %	75 %	549729651
33090	NC_022545	CAGA	2	8	1676780	1676787	50 %	0 %	25 %	25 %	549729651
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33099	NC_022545	GAAC	2	8	1677376	1677383	50 %	0 %	25 %	25 %	549729652
33100	NC_022545	CAG	2	6	1677392	1677397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
33101	NC_022545	CCAG	2	8	1677415	1677422	25 %	0 %	25 %	50 %	549729652
33102	NC_022545	CG	3	6	1677466	1677471	0 %	0 %	50 %	50 %	549729652
33103	NC_022545	GCG	2	6	1677496	1677501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729652
33104	NC_022545	GCA	2	6	1677505	1677510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
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33106	NC_022545	TGA	3	9	1677532	1677540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729652
33107	NC_022545	GCA	2	6	1677571	1677576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
33108	NC_022545	AGC	2	6	1677631	1677636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
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33115	NC_022545	GCT	2	6	1677894	1677899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729652
33116	NC_022545	GCC	2	6	1677929	1677934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729652
33117	NC_022545	TCA	2	6	1677952	1677957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729652
33118	NC_022545	CGG	2	6	1677967	1677972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729652
33119	NC_022545	CAT	2	6	1678079	1678084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729652
33120	NC_022545	CAC	2	6	1678085	1678090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729652
33121	NC_022545	ATC	3	9	1678182	1678190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729652
33122	NC_022545	GAC	2	6	1678202	1678207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
33123	NC_022545	ATG	2	6	1678215	1678220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729652
33124	NC_022545	CAT	2	6	1678256	1678261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729652
33125	NC_022545	GGC	2	6	1678316	1678321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729652
33126	NC_022545	ACCGA	2	10	1678437	1678446	40 %	0 %	20 %	40 %	549729652
33127	NC_022545	ACC	2	6	1678466	1678471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729652
33128	NC_022545	CGA	2	6	1678483	1678488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
33129	NC_022545	GCCG	2	8	1678523	1678530	0 %	0 %	50 %	50 %	549729652
33130	NC_022545	GAA	2	6	1678708	1678713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729652
33131	NC_022545	AGC	2	6	1678728	1678733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729652
33132	NC_022545	TTC	2	6	1678761	1678766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729653
33133	NC_022545	ACCG	2	8	1678819	1678826	25 %	0 %	25 %	50 %	549729653
33134	NC_022545	GAA	2	6	1678827	1678832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729653
33135	NC_022545	TGC	2	6	1678871	1678876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729653
33136	NC_022545	CGA	2	6	1678910	1678915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729653
33137	NC_022545	GAA	2	6	1678953	1678958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729653
33138	NC_022545	CGA	2	6	1678976	1678981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729653
33139	NC_022545	GCG	2	6	1679006	1679011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729653
33140	NC_022545	GCAC	2	8	1679057	1679064	25 %	0 %	25 %	50 %	549729653
33141	NC_022545	GAC	2	6	1679082	1679087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729653
33142	NC_022545	TTC	2	6	1679112	1679117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729653
33143	NC_022545	GAA	2	6	1679154	1679159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729653
33144	NC_022545	GGA	2	6	1679162	1679167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729653
33145	NC_022545	TCA	2	6	1679180	1679185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729653
33146	NC_022545	AGA	2	6	1679189	1679194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729653
33147	NC_022545	CGG	2	6	1679244	1679249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729653
33148	NC_022545	TCG	2	6	1679254	1679259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729653
33149	NC_022545	TTC	2	6	1679449	1679454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729654
33150	NC_022545	CTT	2	6	1679496	1679501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729654
33151	NC_022545	CGA	2	6	1679510	1679515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729654
33152	NC_022545	TGG	2	6	1679543	1679548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729654
33153	NC_022545	CGG	2	6	1679555	1679560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729654
33154	NC_022545	CTG	2	6	1679562	1679567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729654
33155	NC_022545	T	7	7	1679585	1679591	0 %	100 %	0 %	0 %	549729654
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33160	NC_022545	GAA	2	6	1679688	1679693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729654
33161	NC_022545	CTT	2	6	1679694	1679699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729654
33162	NC_022545	GTG	2	6	1679785	1679790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729654
33163	NC_022545	CGC	2	6	1679795	1679800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729654
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33165	NC_022545	GTCTT	2	10	1679941	1679950	0 %	60 %	20 %	20 %	549729654
33166	NC_022545	CG	3	6	1680061	1680066	0 %	0 %	50 %	50 %	549729654
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33171	NC_022545	TCC	2	6	1680429	1680434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729655
33172	NC_022545	TCT	2	6	1680454	1680459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729655
33173	NC_022545	TGC	2	6	1680474	1680479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729655
33174	NC_022545	GAT	2	6	1680665	1680670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729655
33175	NC_022545	GAT	2	6	1680749	1680754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729655
33176	NC_022545	TCA	2	6	1680756	1680761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729655
33177	NC_022545	TCC	2	6	1680801	1680806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729655
33178	NC_022545	GAT	2	6	1680821	1680826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729655
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33180	NC_022545	ATATGG	2	12	1680933	1680944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729655
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33182	NC_022545	CCGT	2	8	1681038	1681045	0 %	25 %	25 %	50 %	549729655
33183	NC_022545	GGC	2	6	1681099	1681104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729655
33184	NC_022545	ATG	2	6	1681125	1681130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729655
33185	NC_022545	TCACC	2	10	1681548	1681557	20 %	20 %	0 %	60 %	549729656
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33188	NC_022545	CCA	2	6	1681617	1681622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729656
33189	NC_022545	CGG	2	6	1681656	1681661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729656
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33200	NC_022545	TTC	2	6	1682186	1682191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729657
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33202	NC_022545	CTG	2	6	1682276	1682281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729657
33203	NC_022545	TGT	2	6	1682293	1682298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729657
33204	NC_022545	GTC	2	6	1682336	1682341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729657
33205	NC_022545	GGCA	2	8	1682342	1682349	25 %	0 %	50 %	25 %	549729657
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33207	NC_022545	GCA	2	6	1682387	1682392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729658
33208	NC_022545	TCCT	2	8	1682636	1682643	0 %	50 %	0 %	50 %	549729659
33209	NC_022545	GTC	2	6	1682648	1682653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729659
33210	NC_022545	GAT	2	6	1682696	1682701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729659
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33212	NC_022545	CTT	2	6	1682722	1682727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729659
33213	NC_022545	GGT	2	6	1682740	1682745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729659
33214	NC_022545	CTG	2	6	1682792	1682797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729659
33215	NC_022545	GCG	2	6	1682798	1682803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729659
33216	NC_022545	CAT	2	6	1682824	1682829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729659
33217	NC_022545	CGTC	2	8	1682846	1682853	0 %	25 %	25 %	50 %	549729659
33218	NC_022545	GAT	2	6	1682854	1682859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729659
33219	NC_022545	GTCGAG	2	12	1682909	1682920	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549729659
33220	NC_022545	GGA	2	6	1682947	1682952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729659
33221	NC_022545	CGT	2	6	1682983	1682988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729659
33222	NC_022545	TCA	2	6	1683000	1683005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729659
33223	NC_022545	GTGAC	2	10	1683048	1683057	20 %	20 %	40 %	20 %	549729659
33224	NC_022545	ATC	2	6	1683089	1683094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729659
33225	NC_022545	GC	3	6	1683120	1683125	0 %	0 %	50 %	50 %	549729659
33226	NC_022545	GCGG	2	8	1683129	1683136	0 %	0 %	75 %	25 %	549729659
33227	NC_022545	GC	3	6	1683167	1683172	0 %	0 %	50 %	50 %	549729659
33228	NC_022545	TCT	2	6	1683174	1683179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729659
33229	NC_022545	GAC	2	6	1683242	1683247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729659
33230	NC_022545	CTGG	2	8	1683274	1683281	0 %	25 %	50 %	25 %	549729659
33231	NC_022545	ACGAT	2	10	1683285	1683294	40 %	20 %	20 %	20 %	549729659
33232	NC_022545	ACC	2	6	1683400	1683405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729660
33233	NC_022545	GTC	2	6	1683457	1683462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729660
33234	NC_022545	CGC	2	6	1683511	1683516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729660
33235	NC_022545	CTG	2	6	1683604	1683609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729660
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33341	NC_022545	CACCC	2	10	1688557	1688566	20 %	0 %	0 %	80 %	549729664
33342	NC_022545	GCGA	2	8	1688591	1688598	25 %	0 %	50 %	25 %	549729664
33343	NC_022545	GCC	2	6	1688601	1688606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729664
33344	NC_022545	CGA	2	6	1688608	1688613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729664
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33463	NC_022545	CAT	2	6	1696768	1696773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729674
33464	NC_022545	GCA	2	6	1696856	1696861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729674
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