MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_022545	GCC	2	6	1520248	1520253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729515
30002	NC_022545	TGC	2	6	1520405	1520410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729515
30003	NC_022545	GTC	2	6	1520416	1520421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729515
30004	NC_022545	TCG	2	6	1520447	1520452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729515
30005	NC_022545	CGC	2	6	1520502	1520507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729515
30006	NC_022545	CTGA	2	8	1520524	1520531	25 %	25 %	25 %	25 %	549729515
30007	NC_022545	GCT	2	6	1520556	1520561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729515
30008	NC_022545	CTT	2	6	1520596	1520601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729515
30009	NC_022545	GGCT	2	8	1520623	1520630	0 %	25 %	50 %	25 %	549729515
30010	NC_022545	TCG	2	6	1520666	1520671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729515
30011	NC_022545	GC	4	8	1520743	1520750	0 %	0 %	50 %	50 %	549729515
30012	NC_022545	GGC	2	6	1520828	1520833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729515
30013	NC_022545	TCT	2	6	1520892	1520897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729515
30014	NC_022545	CGG	2	6	1520898	1520903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729515
30015	NC_022545	CTG	2	6	1521001	1521006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729515
30016	NC_022545	TCG	2	6	1521041	1521046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729515
30017	NC_022545	CG	3	6	1521071	1521076	0 %	0 %	50 %	50 %	549729515
30018	NC_022545	CGG	2	6	1521116	1521121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729516
30019	NC_022545	CCT	2	6	1521134	1521139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729516
30020	NC_022545	CCG	2	6	1521148	1521153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729516
30021	NC_022545	GCCA	2	8	1521225	1521232	25 %	0 %	25 %	50 %	549729516
30022	NC_022545	TCT	2	6	1521233	1521238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729516
30023	NC_022545	GCC	2	6	1521271	1521276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729516
30024	NC_022545	CGA	2	6	1521331	1521336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729516
30025	NC_022545	TCA	2	6	1521394	1521399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729516
30026	NC_022545	CAA	2	6	1521407	1521412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729516
30027	NC_022545	CTG	2	6	1521438	1521443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729516
30028	NC_022545	CAT	2	6	1521485	1521490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729516
30029	NC_022545	CCAT	2	8	1521516	1521523	25 %	25 %	0 %	50 %	549729516
30030	NC_022545	GTG	2	6	1521531	1521536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729516
30031	NC_022545	GCGTGA	2	12	1521557	1521568	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549729516
30032	NC_022545	TCCT	2	8	1521708	1521715	0 %	50 %	0 %	50 %	549729516
30033	NC_022545	GCC	3	9	1521728	1521736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729516
30034	NC_022545	GCC	2	6	1521762	1521767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729516
30035	NC_022545	CAG	2	6	1521783	1521788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729516
30036	NC_022545	GCT	2	6	1521833	1521838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729516
30037	NC_022545	ATA	2	6	1521909	1521914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729517
30038	NC_022545	GGT	2	6	1521967	1521972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729517
30039	NC_022545	TCG	2	6	1522017	1522022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30040	NC_022545	CG	3	6	1522055	1522060	0 %	0 %	50 %	50 %	549729517
30041	NC_022545	CGG	2	6	1522096	1522101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729517
30042	NC_022545	ATCG	2	8	1522102	1522109	25 %	25 %	25 %	25 %	549729517
30043	NC_022545	GATGT	2	10	1522124	1522133	20 %	40 %	40 %	0 %	549729517
30044	NC_022545	GCGCG	2	10	1522162	1522171	0 %	0 %	60 %	40 %	549729517
30045	NC_022545	GGTGT	2	10	1522178	1522187	0 %	40 %	60 %	0 %	549729517
30046	NC_022545	CCTC	2	8	1522203	1522210	0 %	25 %	0 %	75 %	549729517
30047	NC_022545	CG	3	6	1522286	1522291	0 %	0 %	50 %	50 %	549729517
30048	NC_022545	CGG	2	6	1522369	1522374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729517
30049	NC_022545	CAT	2	6	1522387	1522392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729517
30050	NC_022545	CGA	2	6	1522435	1522440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30051	NC_022545	CGA	2	6	1522443	1522448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30052	NC_022545	TGG	2	6	1522491	1522496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729517
30053	NC_022545	CCG	2	6	1522518	1522523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729517
30054	NC_022545	TCA	2	6	1522530	1522535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729517
30055	NC_022545	TGG	2	6	1522551	1522556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729517
30056	NC_022545	CTG	2	6	1522625	1522630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30057	NC_022545	CGC	2	6	1522635	1522640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729517
30058	NC_022545	AAG	2	6	1522655	1522660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729517
30059	NC_022545	TCC	2	6	1522667	1522672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729517
30060	NC_022545	GCT	2	6	1522768	1522773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30061	NC_022545	A	6	6	1522775	1522780	100 %	0 %	0 %	0 %	549729517
30062	NC_022545	TCG	2	6	1522845	1522850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30063	NC_022545	GGTTCC	2	12	1522853	1522864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30064	NC_022545	ACG	2	6	1522871	1522876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30065	NC_022545	TGG	2	6	1523037	1523042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729517
30066	NC_022545	AGG	2	6	1523043	1523048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729517
30067	NC_022545	GCC	2	6	1523078	1523083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729517
30068	NC_022545	GGA	2	6	1523110	1523115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729517
30069	NC_022545	CGC	2	6	1523137	1523142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729517
30070	NC_022545	CGG	2	6	1523164	1523169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729517
30071	NC_022545	CCAGCG	2	12	1523170	1523181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549729517
30072	NC_022545	CCG	2	6	1523206	1523211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729517
30073	NC_022545	CGA	2	6	1523230	1523235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30074	NC_022545	CCTG	2	8	1523316	1523323	0 %	25 %	25 %	50 %	549729517
30075	NC_022545	TCA	2	6	1523325	1523330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729517
30076	NC_022545	GTG	2	6	1523345	1523350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729517
30077	NC_022545	GTC	3	9	1523369	1523377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30078	NC_022545	CAT	2	6	1523392	1523397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729517
30079	NC_022545	GAAG	2	8	1523434	1523441	50 %	0 %	50 %	0 %	549729517
30080	NC_022545	GCT	2	6	1523455	1523460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729517
30081	NC_022545	GCG	2	6	1523496	1523501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729517
30082	NC_022545	ATGACA	2	12	1523544	1523555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549729518
30083	NC_022545	GAG	2	6	1523658	1523663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729518
30084	NC_022545	GCA	2	6	1523674	1523679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729518
30085	NC_022545	ATG	2	6	1523697	1523702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729518
30086	NC_022545	GCC	2	6	1523715	1523720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729518
30087	NC_022545	GATC	2	8	1523732	1523739	25 %	25 %	25 %	25 %	549729518
30088	NC_022545	ATG	2	6	1523850	1523855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729518
30089	NC_022545	CAT	2	6	1523952	1523957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729518
30090	NC_022545	GGC	2	6	1523984	1523989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729518
30091	NC_022545	CAC	2	6	1524011	1524016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729518
30092	NC_022545	CGG	3	9	1524022	1524030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729518
30093	NC_022545	GAA	2	6	1524137	1524142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729518
30094	NC_022545	GTG	2	6	1524189	1524194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729518
30095	NC_022545	GC	3	6	1524256	1524261	0 %	0 %	50 %	50 %	549729518
30096	NC_022545	TCA	3	9	1524268	1524276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729518
30097	NC_022545	CGGC	2	8	1524350	1524357	0 %	0 %	50 %	50 %	549729518
30098	NC_022545	TCA	2	6	1524383	1524388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729518
30099	NC_022545	ACA	2	6	1524402	1524407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729519
30100	NC_022545	A	6	6	1524425	1524430	100 %	0 %	0 %	0 %	549729519
30101	NC_022545	CTT	2	6	1524431	1524436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729519
30102	NC_022545	GCA	2	6	1524476	1524481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729519
30103	NC_022545	GCA	2	6	1524516	1524521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729519
30104	NC_022545	TCG	2	6	1524573	1524578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729519
30105	NC_022545	TCG	2	6	1524585	1524590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729519
30106	NC_022545	GGTGA	2	10	1524605	1524614	20 %	20 %	60 %	0 %	549729519
30107	NC_022545	GTC	2	6	1524725	1524730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729519
30108	NC_022545	GCCT	2	8	1524770	1524777	0 %	25 %	25 %	50 %	549729519
30109	NC_022545	TCG	2	6	1524786	1524791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729519
30110	NC_022545	GCG	2	6	1524795	1524800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729519
30111	NC_022545	GTT	2	6	1524935	1524940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729519
30112	NC_022545	GAA	2	6	1524997	1525002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729519
30113	NC_022545	CAA	2	6	1525243	1525248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729519
30114	NC_022545	GCGT	2	8	1525302	1525309	0 %	25 %	50 %	25 %	549729519
30115	NC_022545	TGA	2	6	1525336	1525341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729519
30116	NC_022545	GCC	2	6	1525349	1525354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729519
30117	NC_022545	TAT	2	6	1525409	1525414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729519
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30122	NC_022545	ATC	2	6	1525505	1525510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729519
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30144	NC_022545	AAT	2	6	1526640	1526645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729520
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30177	NC_022545	CGA	2	6	1528565	1528570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729521
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30185	NC_022545	GCC	2	6	1529231	1529236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729522
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30190	NC_022545	TGA	2	6	1529400	1529405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729522
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30192	NC_022545	CCAG	2	8	1529425	1529432	25 %	0 %	25 %	50 %	549729522
30193	NC_022545	GCG	2	6	1529436	1529441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729522
30194	NC_022545	CCG	2	6	1529620	1529625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729522
30195	NC_022545	CTG	2	6	1529636	1529641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729522
30196	NC_022545	TCGATC	2	12	1529655	1529666	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549729522
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30199	NC_022545	CGA	2	6	1529887	1529892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729522
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30201	NC_022545	CG	3	6	1529949	1529954	0 %	0 %	50 %	50 %	549729522
30202	NC_022545	CAT	2	6	1529959	1529964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729522
30203	NC_022545	ATG	2	6	1529969	1529974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729522
30204	NC_022545	GAAG	2	8	1530004	1530011	50 %	0 %	50 %	0 %	549729522
30205	NC_022545	CTG	2	6	1530290	1530295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729522
30206	NC_022545	GGC	2	6	1530458	1530463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729522
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30208	NC_022545	CG	3	6	1530534	1530539	0 %	0 %	50 %	50 %	549729522
30209	NC_022545	GC	3	6	1530590	1530595	0 %	0 %	50 %	50 %	549729522
30210	NC_022545	TCA	2	6	1530609	1530614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729522
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30212	NC_022545	CAT	2	6	1530658	1530663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729522
30213	NC_022545	CATG	2	8	1530667	1530674	25 %	25 %	25 %	25 %	549729522
30214	NC_022545	CGC	3	9	1530792	1530800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729523
30215	NC_022545	CCG	2	6	1530850	1530855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729523
30216	NC_022545	TTC	2	6	1530868	1530873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729523
30217	NC_022545	TGA	2	6	1530938	1530943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729523
30218	NC_022545	CAG	2	6	1530946	1530951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729523
30219	NC_022545	CAT	2	6	1530960	1530965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729523
30220	NC_022545	CAT	2	6	1530990	1530995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729523
30221	NC_022545	TCA	2	6	1531016	1531021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729523
30222	NC_022545	CGG	2	6	1531026	1531031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729523
30223	NC_022545	TCC	2	6	1531042	1531047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729523
30224	NC_022545	GTCG	2	8	1531050	1531057	0 %	25 %	50 %	25 %	549729523
30225	NC_022545	TGT	2	6	1531073	1531078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729523
30226	NC_022545	TCA	2	6	1531145	1531150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729523
30227	NC_022545	TCA	2	6	1531193	1531198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729523
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30229	NC_022545	CG	4	8	1531263	1531270	0 %	0 %	50 %	50 %	549729523
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30345	NC_022545	CAC	2	6	1538248	1538253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729530
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30353	NC_022545	T	6	6	1538800	1538805	0 %	100 %	0 %	0 %	549729530
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30445	NC_022545	CAGCGC	2	12	1542967	1542978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549729533
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30447	NC_022545	GA	3	6	1543070	1543075	50 %	0 %	50 %	0 %	549729533
30448	NC_022545	GCT	2	6	1543086	1543091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729533
30449	NC_022545	CGAAGG	2	12	1543098	1543109	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549729533
30450	NC_022545	GC	3	6	1543146	1543151	0 %	0 %	50 %	50 %	549729533
30451	NC_022545	TGC	2	6	1543177	1543182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729533
30452	NC_022545	GGC	2	6	1543267	1543272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729533
30453	NC_022545	CGCGGC	2	12	1543327	1543338	0 %	0 %	50 %	50 %	549729533
30454	NC_022545	GTGGCG	2	12	1543355	1543366	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549729533
30455	NC_022545	CGA	2	6	1543431	1543436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729533
30456	NC_022545	GGC	2	6	1543441	1543446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729533
30457	NC_022545	CCG	2	6	1543458	1543463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729533
30458	NC_022545	GGTGG	2	10	1543513	1543522	0 %	20 %	80 %	0 %	549729533
30459	NC_022545	CGT	3	9	1543542	1543550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729533
30460	NC_022545	GGC	2	6	1543585	1543590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729533
30461	NC_022545	CGA	2	6	1543620	1543625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729533
30462	NC_022545	GCC	2	6	1543693	1543698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729533
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30487	NC_022545	GAA	2	6	1544785	1544790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729535
30488	NC_022545	GCGAG	2	10	1544809	1544818	20 %	0 %	60 %	20 %	549729535
30489	NC_022545	CGG	2	6	1544858	1544863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729535
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30491	NC_022545	AGCCC	2	10	1544923	1544932	20 %	0 %	20 %	60 %	549729535
30492	NC_022545	ATG	2	6	1545192	1545197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729535
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30494	NC_022545	CAG	2	6	1545293	1545298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729535
30495	NC_022545	CAG	3	9	1545356	1545364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729535
30496	NC_022545	GGC	2	6	1545378	1545383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729535
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30499	NC_022545	CGA	2	6	1545474	1545479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729536
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