MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_022545	CAT	2	6	1287909	1287914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729311
25502	NC_022545	GGC	2	6	1288066	1288071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729312
25503	NC_022545	GCC	2	6	1288084	1288089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729312
25504	NC_022545	GAT	2	6	1288100	1288105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729312
25505	NC_022545	TGC	2	6	1288114	1288119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729312
25506	NC_022545	CGG	2	6	1288120	1288125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729312
25507	NC_022545	CTC	2	6	1288151	1288156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729312
25508	NC_022545	GGTCT	2	10	1288202	1288211	0 %	40 %	40 %	20 %	549729312
25509	NC_022545	GC	3	6	1288247	1288252	0 %	0 %	50 %	50 %	549729312
25510	NC_022545	A	6	6	1288288	1288293	100 %	0 %	0 %	0 %	549729312
25511	NC_022545	CAG	2	6	1288358	1288363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729312
25512	NC_022545	AGC	2	6	1288428	1288433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729312
25513	NC_022545	TCC	2	6	1288452	1288457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729312
25514	NC_022545	CAC	2	6	1288481	1288486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729312
25515	NC_022545	ACC	2	6	1288509	1288514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729312
25516	NC_022545	CAGG	2	8	1288535	1288542	25 %	0 %	50 %	25 %	549729312
25517	NC_022545	CGG	2	6	1288576	1288581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729312
25518	NC_022545	GCA	2	6	1288594	1288599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729312
25519	NC_022545	CGC	3	9	1288606	1288614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729312
25520	NC_022545	TGCG	2	8	1288633	1288640	0 %	25 %	50 %	25 %	549729312
25521	NC_022545	GT	3	6	1288684	1288689	0 %	50 %	50 %	0 %	549729312
25522	NC_022545	CCG	2	6	1288984	1288989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729313
25523	NC_022545	CCAC	2	8	1289041	1289048	25 %	0 %	0 %	75 %	549729313
25524	NC_022545	CAC	2	6	1289084	1289089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729313
25525	NC_022545	CTTG	2	8	1289186	1289193	0 %	50 %	25 %	25 %	549729313
25526	NC_022545	GCTC	2	8	1289234	1289241	0 %	25 %	25 %	50 %	549729313
25527	NC_022545	CGAT	2	8	1289299	1289306	25 %	25 %	25 %	25 %	549729313
25528	NC_022545	CT	3	6	1289311	1289316	0 %	50 %	0 %	50 %	549729313
25529	NC_022545	AGGC	2	8	1289335	1289342	25 %	0 %	50 %	25 %	549729313
25530	NC_022545	CGG	2	6	1289363	1289368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729313
25531	NC_022545	CGCA	2	8	1289369	1289376	25 %	0 %	25 %	50 %	549729313
25532	NC_022545	CGG	2	6	1289377	1289382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729313
25533	NC_022545	GGCT	2	8	1289409	1289416	0 %	25 %	50 %	25 %	549729313
25534	NC_022545	GCAG	2	8	1289442	1289449	25 %	0 %	50 %	25 %	549729313
25535	NC_022545	GGA	2	6	1289462	1289467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729313
25536	NC_022545	GAC	2	6	1289505	1289510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729313
25537	NC_022545	ATATCG	2	12	1289515	1289526	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549729313
25538	NC_022545	TGC	2	6	1289534	1289539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729313
25539	NC_022545	CATC	2	8	1289560	1289567	25 %	25 %	0 %	50 %	549729313
25540	NC_022545	GAG	2	6	1289658	1289663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729313
25541	NC_022545	GC	3	6	1289703	1289708	0 %	0 %	50 %	50 %	549729313
25542	NC_022545	AGC	2	6	1289737	1289742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729313
25543	NC_022545	CGTTC	2	10	1289758	1289767	0 %	40 %	20 %	40 %	549729313
25544	NC_022545	GGC	2	6	1289820	1289825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729313
25545	NC_022545	AT	3	6	1289834	1289839	50 %	50 %	0 %	0 %	549729313
25546	NC_022545	GCCT	2	8	1289869	1289876	0 %	25 %	25 %	50 %	549729313
25547	NC_022545	GTGCAT	2	12	1289907	1289918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549729313
25548	NC_022545	AT	3	6	1289954	1289959	50 %	50 %	0 %	0 %	549729313
25549	NC_022545	GAA	2	6	1289982	1289987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729313
25550	NC_022545	AGC	2	6	1290025	1290030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729313
25551	NC_022545	CAC	2	6	1290041	1290046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729313
25552	NC_022545	CG	3	6	1290065	1290070	0 %	0 %	50 %	50 %	549729313
25553	NC_022545	GCCA	2	8	1290285	1290292	25 %	0 %	25 %	50 %	549729314
25554	NC_022545	CAG	3	9	1290370	1290378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729314
25555	NC_022545	CGG	2	6	1290438	1290443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729314
25556	NC_022545	GTC	2	6	1290475	1290480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729314
25557	NC_022545	GTC	2	6	1290496	1290501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729314
25558	NC_022545	TGC	2	6	1290558	1290563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729314
25559	NC_022545	CCT	2	6	1290600	1290605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729314
25560	NC_022545	CTG	2	6	1290631	1290636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729314
25561	NC_022545	CTG	2	6	1290640	1290645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729314
25562	NC_022545	CGTC	2	8	1290669	1290676	0 %	25 %	25 %	50 %	549729314
25563	NC_022545	GCC	2	6	1290713	1290718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729314
25564	NC_022545	CCA	2	6	1290748	1290753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729314
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25566	NC_022545	CGG	2	6	1290802	1290807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729314
25567	NC_022545	TCGGC	2	10	1290831	1290840	0 %	20 %	40 %	40 %	549729314
25568	NC_022545	TCT	2	6	1290896	1290901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729314
25569	NC_022545	GCCA	2	8	1290939	1290946	25 %	0 %	25 %	50 %	549729314
25570	NC_022545	TCC	2	6	1291025	1291030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729314
25571	NC_022545	CGATCT	2	12	1291077	1291088	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549729314
25572	NC_022545	CGG	2	6	1291107	1291112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729314
25573	NC_022545	GTG	2	6	1291150	1291155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729314
25574	NC_022545	TTC	2	6	1291186	1291191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729314
25575	NC_022545	GCA	2	6	1291218	1291223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729314
25576	NC_022545	G	6	6	1291254	1291259	0 %	0 %	100 %	0 %	549729314
25577	NC_022545	GGA	2	6	1291320	1291325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729314
25578	NC_022545	GTT	2	6	1291348	1291353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729314
25579	NC_022545	ATG	2	6	1291443	1291448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729315
25580	NC_022545	GC	4	8	1291479	1291486	0 %	0 %	50 %	50 %	549729315
25581	NC_022545	GGT	2	6	1291487	1291492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729315
25582	NC_022545	CGC	2	6	1291566	1291571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729315
25583	NC_022545	GC	3	6	1291613	1291618	0 %	0 %	50 %	50 %	549729315
25584	NC_022545	CCA	2	6	1291653	1291658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729315
25585	NC_022545	AGATC	2	10	1291753	1291762	40 %	20 %	20 %	20 %	549729315
25586	NC_022545	GAA	2	6	1291778	1291783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729315
25587	NC_022545	GAT	2	6	1291868	1291873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729315
25588	NC_022545	CGG	2	6	1291901	1291906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729315
25589	NC_022545	CCT	2	6	1291930	1291935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729315
25590	NC_022545	CTG	2	6	1291955	1291960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729315
25591	NC_022545	CCA	2	6	1291975	1291980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729315
25592	NC_022545	GGC	2	6	1291997	1292002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729315
25593	NC_022545	CGA	2	6	1292020	1292025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729315
25594	NC_022545	A	6	6	1292028	1292033	100 %	0 %	0 %	0 %	549729315
25595	NC_022545	CGC	2	6	1292068	1292073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729315
25596	NC_022545	GCA	2	6	1292074	1292079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729315
25597	NC_022545	GCCTCT	2	12	1292118	1292129	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549729315
25598	NC_022545	CGC	2	6	1292154	1292159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729315
25599	NC_022545	CGT	2	6	1292165	1292170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729315
25600	NC_022545	CG	3	6	1292182	1292187	0 %	0 %	50 %	50 %	549729315
25601	NC_022545	GTGGC	2	10	1292250	1292259	0 %	20 %	60 %	20 %	549729315
25602	NC_022545	GGC	2	6	1292276	1292281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729315
25603	NC_022545	GTC	2	6	1292327	1292332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729315
25604	NC_022545	GAG	2	6	1292474	1292479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729316
25605	NC_022545	ATC	2	6	1292544	1292549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729316
25606	NC_022545	GAG	2	6	1292555	1292560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729316
25607	NC_022545	GCC	2	6	1292605	1292610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729316
25608	NC_022545	CCG	2	6	1292615	1292620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729316
25609	NC_022545	GCC	2	6	1292626	1292631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729316
25610	NC_022545	CGG	2	6	1292697	1292702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729317
25611	NC_022545	GGC	2	6	1292746	1292751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729317
25612	NC_022545	GC	3	6	1292762	1292767	0 %	0 %	50 %	50 %	549729317
25613	NC_022545	ACC	2	6	1292789	1292794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729317
25614	NC_022545	TCGAT	2	10	1292852	1292861	20 %	40 %	20 %	20 %	549729317
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25616	NC_022545	AGA	2	6	1292921	1292926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729317
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25954	NC_022545	CAT	2	6	1308663	1308668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729332
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25962	NC_022545	GGGCA	2	10	1309056	1309065	20 %	0 %	60 %	20 %	549729332
25963	NC_022545	CCG	2	6	1309079	1309084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729332
25964	NC_022545	AGGTCG	2	12	1309144	1309155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549729332
25965	NC_022545	GCT	2	6	1309203	1309208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729333
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25967	NC_022545	A	6	6	1309616	1309621	100 %	0 %	0 %	0 %	549729334
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25986	NC_022545	CT	3	6	1310654	1310659	0 %	50 %	0 %	50 %	549729334
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