MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_022545	CGG	2	6	1265358	1265363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729290
25003	NC_022545	GAT	2	6	1265425	1265430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729290
25004	NC_022545	G	6	6	1265442	1265447	0 %	0 %	100 %	0 %	549729290
25005	NC_022545	AGG	2	6	1265485	1265490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729291
25006	NC_022545	TCG	2	6	1265551	1265556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729291
25007	NC_022545	ATC	2	6	1265579	1265584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729291
25008	NC_022545	CG	3	6	1265599	1265604	0 %	0 %	50 %	50 %	549729291
25009	NC_022545	TCCG	2	8	1265607	1265614	0 %	25 %	25 %	50 %	549729291
25010	NC_022545	GGC	2	6	1265618	1265623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729291
25011	NC_022545	ATG	2	6	1265754	1265759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729291
25012	NC_022545	CGG	2	6	1265779	1265784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729291
25013	NC_022545	GGT	2	6	1265816	1265821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729291
25014	NC_022545	CGG	2	6	1265825	1265830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729291
25015	NC_022545	CGCA	2	8	1265864	1265871	25 %	0 %	25 %	50 %	549729291
25016	NC_022545	CAG	2	6	1265891	1265896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729291
25017	NC_022545	GGC	2	6	1265939	1265944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729291
25018	NC_022545	CCGT	2	8	1265988	1265995	0 %	25 %	25 %	50 %	549729291
25019	NC_022545	GCC	2	6	1266002	1266007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729291
25020	NC_022545	GCC	2	6	1266149	1266154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729291
25021	NC_022545	CG	3	6	1266176	1266181	0 %	0 %	50 %	50 %	549729291
25022	NC_022545	CGA	2	6	1266184	1266189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729291
25023	NC_022545	GAG	2	6	1266251	1266256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729291
25024	NC_022545	CCAGCG	2	12	1266289	1266300	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549729291
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25027	NC_022545	GCGG	2	8	1266371	1266378	0 %	0 %	75 %	25 %	549729291
25028	NC_022545	ATG	2	6	1266384	1266389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729291
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25035	NC_022545	GGC	2	6	1266668	1266673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729291
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25039	NC_022545	CGG	2	6	1266772	1266777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729291
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25045	NC_022545	GCC	2	6	1266954	1266959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729291
25046	NC_022545	CGA	2	6	1266982	1266987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729291
25047	NC_022545	CTG	2	6	1267001	1267006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729291
25048	NC_022545	GCTC	2	8	1267015	1267022	0 %	25 %	25 %	50 %	549729291
25049	NC_022545	CG	3	6	1267045	1267050	0 %	0 %	50 %	50 %	549729292
25050	NC_022545	GCG	4	12	1267055	1267066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729292
25051	NC_022545	CAC	2	6	1267231	1267236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729292
25052	NC_022545	GCGG	2	8	1267237	1267244	0 %	0 %	75 %	25 %	549729292
25053	NC_022545	CGAC	2	8	1267253	1267260	25 %	0 %	25 %	50 %	549729292
25054	NC_022545	CGG	2	6	1267275	1267280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729292
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25058	NC_022545	CG	3	6	1267491	1267496	0 %	0 %	50 %	50 %	549729292
25059	NC_022545	CCA	2	6	1267512	1267517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729292
25060	NC_022545	GCA	2	6	1267540	1267545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729292
25061	NC_022545	CGC	2	6	1267555	1267560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729292
25062	NC_022545	GCG	2	6	1267568	1267573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729292
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25089	NC_022545	GAAG	2	8	1268861	1268868	50 %	0 %	50 %	0 %	549729293
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25093	NC_022545	GAC	2	6	1268923	1268928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729293
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25097	NC_022545	TAC	2	6	1269211	1269216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729294
25098	NC_022545	CG	3	6	1269261	1269266	0 %	0 %	50 %	50 %	549729294
25099	NC_022545	GCC	2	6	1269292	1269297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729294
25100	NC_022545	TGG	2	6	1269429	1269434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729294
25101	NC_022545	GCTG	2	8	1269440	1269447	0 %	25 %	50 %	25 %	549729294
25102	NC_022545	ACA	2	6	1269451	1269456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729294
25103	NC_022545	TGATG	2	10	1269539	1269548	20 %	40 %	40 %	0 %	549729294
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25111	NC_022545	GA	3	6	1269937	1269942	50 %	0 %	50 %	0 %	549729295
25112	NC_022545	CAC	2	6	1269954	1269959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729295
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25114	NC_022545	AT	3	6	1270029	1270034	50 %	50 %	0 %	0 %	549729295
25115	NC_022545	GTG	2	6	1270045	1270050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729295
25116	NC_022545	GCG	2	6	1270058	1270063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729295
25117	NC_022545	CTT	2	6	1270431	1270436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729296
25118	NC_022545	CGT	2	6	1270437	1270442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729296
25119	NC_022545	GAT	2	6	1270456	1270461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729296
25120	NC_022545	GTC	4	12	1270471	1270482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729296
25121	NC_022545	TCG	3	9	1270487	1270495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729296
25122	NC_022545	GTC	5	15	1270510	1270524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729296
25123	NC_022545	TCG	2	6	1270538	1270543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729296
25124	NC_022545	TCG	2	6	1270562	1270567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729296
25125	NC_022545	TGT	2	6	1270572	1270577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729296
25126	NC_022545	CTT	2	6	1270647	1270652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729296
25127	NC_022545	GAA	2	6	1270690	1270695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729296
25128	NC_022545	CTT	2	6	1270759	1270764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729296
25129	NC_022545	GCG	2	6	1271072	1271077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729297
25130	NC_022545	TCA	2	6	1271122	1271127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729297
25131	NC_022545	TGA	2	6	1271301	1271306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729297
25132	NC_022545	GGCG	2	8	1271316	1271323	0 %	0 %	75 %	25 %	549729297
25133	NC_022545	GCA	2	6	1271335	1271340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729297
25134	NC_022545	GTA	2	6	1271396	1271401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729297
25135	NC_022545	GC	3	6	1271453	1271458	0 %	0 %	50 %	50 %	549729297
25136	NC_022545	GGC	2	6	1271486	1271491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729297
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25138	NC_022545	A	6	6	1271525	1271530	100 %	0 %	0 %	0 %	549729297
25139	NC_022545	CGA	2	6	1271533	1271538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729297
25140	NC_022545	CGG	2	6	1271574	1271579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729297
25141	NC_022545	GGC	2	6	1271620	1271625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729297
25142	NC_022545	CG	3	6	1271635	1271640	0 %	0 %	50 %	50 %	549729297
25143	NC_022545	ATC	2	6	1271645	1271650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729297
25144	NC_022545	CGC	2	6	1271653	1271658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729297
25145	NC_022545	CG	3	6	1271861	1271866	0 %	0 %	50 %	50 %	549729298
25146	NC_022545	GAA	2	6	1271887	1271892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729298
25147	NC_022545	TCG	2	6	1271969	1271974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729298
25148	NC_022545	CGA	2	6	1272054	1272059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729298
25149	NC_022545	CG	3	6	1272113	1272118	0 %	0 %	50 %	50 %	549729298
25150	NC_022545	CGC	2	6	1272127	1272132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729298
25151	NC_022545	GAA	2	6	1272133	1272138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729298
25152	NC_022545	GGT	2	6	1272211	1272216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729298
25153	NC_022545	GTT	2	6	1272358	1272363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729298
25154	NC_022545	CGT	2	6	1272367	1272372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729298
25155	NC_022545	AGC	2	6	1272398	1272403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729298
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25159	NC_022545	CGTT	2	8	1272479	1272486	0 %	50 %	25 %	25 %	549729298
25160	NC_022545	CGG	2	6	1272492	1272497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729298
25161	NC_022545	CTG	2	6	1272508	1272513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729298
25162	NC_022545	CATGG	2	10	1272525	1272534	20 %	20 %	40 %	20 %	549729298
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25165	NC_022545	ATC	2	6	1272592	1272597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729298
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25177	NC_022545	AGC	2	6	1273337	1273342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729298
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25181	NC_022545	GTTCG	2	10	1273470	1273479	0 %	40 %	40 %	20 %	549729298
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25193	NC_022545	CGA	2	6	1273867	1273872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729299
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25199	NC_022545	TCG	2	6	1274070	1274075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729299
25200	NC_022545	GGC	2	6	1274082	1274087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729299
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25202	NC_022545	CTG	2	6	1274114	1274119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729299
25203	NC_022545	CGT	2	6	1274120	1274125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729299
25204	NC_022545	GCCG	2	8	1274147	1274154	0 %	0 %	50 %	50 %	549729299
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25209	NC_022545	CTT	2	6	1274335	1274340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729299
25210	NC_022545	TGC	2	6	1274347	1274352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729299
25211	NC_022545	GCG	2	6	1274359	1274364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729299
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25215	NC_022545	GGAAC	2	10	1274597	1274606	40 %	0 %	40 %	20 %	549729299
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25218	NC_022545	CTGGG	2	10	1274640	1274649	0 %	20 %	60 %	20 %	549729299
25219	NC_022545	ATT	2	6	1274669	1274674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549729299
25220	NC_022545	CTG	2	6	1274675	1274680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729299
25221	NC_022545	AGG	2	6	1274683	1274688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729299
25222	NC_022545	ACC	2	6	1274691	1274696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729299
25223	NC_022545	C	6	6	1274716	1274721	0 %	0 %	0 %	100 %	549729299
25224	NC_022545	CAG	2	6	1274741	1274746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729299
25225	NC_022545	GCCGC	2	10	1274752	1274761	0 %	0 %	40 %	60 %	549729299
25226	NC_022545	CTG	2	6	1274834	1274839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729299
25227	NC_022545	GCGG	2	8	1274859	1274866	0 %	0 %	75 %	25 %	549729299
25228	NC_022545	CCGTC	2	10	1274919	1274928	0 %	20 %	20 %	60 %	549729299
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25230	NC_022545	GAGG	2	8	1275002	1275009	25 %	0 %	75 %	0 %	549729299
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25234	NC_022545	GCGA	2	8	1275108	1275115	25 %	0 %	50 %	25 %	549729299
25235	NC_022545	TGC	2	6	1275166	1275171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729299
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25337	NC_022545	CAG	2	6	1279922	1279927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729305
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25341	NC_022545	TA	3	6	1280045	1280050	50 %	50 %	0 %	0 %	549729305
25342	NC_022545	TCG	2	6	1280184	1280189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729305
25343	NC_022545	CAT	2	6	1280251	1280256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729305
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25345	NC_022545	GCC	2	6	1280417	1280422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729305
25346	NC_022545	GGCGA	2	10	1280468	1280477	20 %	0 %	60 %	20 %	549729305
25347	NC_022545	GGT	2	6	1280546	1280551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729305
25348	NC_022545	TTC	2	6	1280553	1280558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729305
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25350	NC_022545	GCC	2	6	1280666	1280671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729305
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25431	NC_022545	CAC	2	6	1284452	1284457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729308
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25442	NC_022545	CTG	2	6	1284934	1284939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729309
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25446	NC_022545	CG	3	6	1285099	1285104	0 %	0 %	50 %	50 %	549729309
25447	NC_022545	CGGG	2	8	1285175	1285182	0 %	0 %	75 %	25 %	549729309
25448	NC_022545	TGA	2	6	1285196	1285201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729309
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25450	NC_022545	CGA	2	6	1285250	1285255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729309
25451	NC_022545	CTG	2	6	1285294	1285299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729309
25452	NC_022545	GAA	2	6	1285312	1285317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729309
25453	NC_022545	ATGGC	2	10	1285319	1285328	20 %	20 %	40 %	20 %	549729309
25454	NC_022545	TCA	2	6	1285337	1285342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729309
25455	NC_022545	CCG	2	6	1285370	1285375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729309
25456	NC_022545	GTC	2	6	1285381	1285386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729309
25457	NC_022545	GGA	2	6	1285410	1285415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729309
25458	NC_022545	GCA	2	6	1285446	1285451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729309
25459	NC_022545	TTC	2	6	1285525	1285530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729309
25460	NC_022545	AGG	2	6	1285535	1285540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729309
25461	NC_022545	CGG	2	6	1285598	1285603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729310
25462	NC_022545	CGG	2	6	1285610	1285615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729310
25463	NC_022545	CAT	2	6	1285721	1285726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729310
25464	NC_022545	CGG	2	6	1285748	1285753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729310
25465	NC_022545	GGTG	2	8	1285874	1285881	0 %	25 %	75 %	0 %	549729310
25466	NC_022545	TCA	3	9	1285900	1285908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729310
25467	NC_022545	CGG	2	6	1286012	1286017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729310
25468	NC_022545	CCAGCG	2	12	1286018	1286029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549729310
25469	NC_022545	GCT	2	6	1286066	1286071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729310
25470	NC_022545	CTG	2	6	1286130	1286135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729310
25471	NC_022545	GTG	2	6	1286193	1286198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729310
25472	NC_022545	TGA	2	6	1286210	1286215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729310
25473	NC_022545	CG	3	6	1286257	1286262	0 %	0 %	50 %	50 %	549729310
25474	NC_022545	CGC	2	6	1286309	1286314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729310
25475	NC_022545	GGC	2	6	1286366	1286371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729310
25476	NC_022545	T	6	6	1286440	1286445	0 %	100 %	0 %	0 %	549729311
25477	NC_022545	GCC	2	6	1286470	1286475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729311
25478	NC_022545	GGC	2	6	1286505	1286510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729311
25479	NC_022545	ACC	2	6	1286587	1286592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729311
25480	NC_022545	GTG	2	6	1286762	1286767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729311
25481	NC_022545	TGC	2	6	1286824	1286829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729311
25482	NC_022545	CGTC	2	8	1286898	1286905	0 %	25 %	25 %	50 %	549729311
25483	NC_022545	GGC	2	6	1286997	1287002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729311
25484	NC_022545	CAT	2	6	1287059	1287064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729311
25485	NC_022545	CGA	2	6	1287065	1287070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729311
25486	NC_022545	GTG	2	6	1287211	1287216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729311
25487	NC_022545	CCA	2	6	1287233	1287238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729311
25488	NC_022545	GGCA	2	8	1287248	1287255	25 %	0 %	50 %	25 %	549729311
25489	NC_022545	AGG	2	6	1287272	1287277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729311
25490	NC_022545	CAG	3	9	1287309	1287317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729311
25491	NC_022545	GCA	2	6	1287323	1287328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729311
25492	NC_022545	CAG	2	6	1287360	1287365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729311
25493	NC_022545	GCA	2	6	1287482	1287487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729311
25494	NC_022545	CG	3	6	1287551	1287556	0 %	0 %	50 %	50 %	549729311
25495	NC_022545	CCA	2	6	1287572	1287577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729311
25496	NC_022545	CGA	2	6	1287599	1287604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729311
25497	NC_022545	CGA	2	6	1287623	1287628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729311
25498	NC_022545	GCG	2	6	1287724	1287729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729311
25499	NC_022545	CGC	2	6	1287749	1287754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729311
25500	NC_022545	TCG	2	6	1287766	1287771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729311

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