MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_022545	GCT	2	6	1089907	1089912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729120
21502	NC_022545	GCG	2	6	1089972	1089977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729120
21503	NC_022545	GAA	2	6	1089989	1089994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729120
21504	NC_022545	TCA	2	6	1090002	1090007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729120
21505	NC_022545	TGC	2	6	1090124	1090129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729120
21506	NC_022545	CTG	2	6	1090136	1090141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729120
21507	NC_022545	AGG	2	6	1090263	1090268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729120
21508	NC_022545	TCA	2	6	1090287	1090292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729120
21509	NC_022545	CTT	2	6	1090337	1090342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729120
21510	NC_022545	TGG	2	6	1090348	1090353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729120
21511	NC_022545	AGG	2	6	1090374	1090379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729120
21512	NC_022545	CAT	2	6	1090462	1090467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729121
21513	NC_022545	TGCA	2	8	1090469	1090476	25 %	25 %	25 %	25 %	549729121
21514	NC_022545	ATC	2	6	1090531	1090536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729121
21515	NC_022545	TCG	2	6	1090562	1090567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729121
21516	NC_022545	ACG	2	6	1091222	1091227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729123
21517	NC_022545	TC	3	6	1091298	1091303	0 %	50 %	0 %	50 %	549729123
21518	NC_022545	CCT	2	6	1091304	1091309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729123
21519	NC_022545	ATGACG	2	12	1091330	1091341	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549729123
21520	NC_022545	TGA	2	6	1091358	1091363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729123
21521	NC_022545	TGA	2	6	1091379	1091384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729123
21522	NC_022545	AGG	2	6	1091423	1091428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549729123
21523	NC_022545	ATG	2	6	1091483	1091488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729123
21524	NC_022545	AAT	2	6	1091503	1091508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549729123
21525	NC_022545	C	6	6	1091539	1091544	0 %	0 %	0 %	100 %	549729123
21526	NC_022545	GCGG	2	8	1091569	1091576	0 %	0 %	75 %	25 %	549729123
21527	NC_022545	CTTC	2	8	1091592	1091599	0 %	50 %	0 %	50 %	549729123
21528	NC_022545	GC	3	6	1091612	1091617	0 %	0 %	50 %	50 %	549729123
21529	NC_022545	TGA	2	6	1091670	1091675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729123
21530	NC_022545	CTGT	2	8	1091685	1091692	0 %	50 %	25 %	25 %	549729123
21531	NC_022545	GCC	2	6	1091739	1091744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729123
21532	NC_022545	GAA	2	6	1091794	1091799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729123
21533	NC_022545	GCA	2	6	1091826	1091831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729123
21534	NC_022545	CAA	2	6	1091871	1091876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729123
21535	NC_022545	TGA	2	6	1091894	1091899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729123
21536	NC_022545	GCC	2	6	1091953	1091958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729123
21537	NC_022545	ATCG	2	8	1091971	1091978	25 %	25 %	25 %	25 %	549729123
21538	NC_022545	TCC	2	6	1092095	1092100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729123
21539	NC_022545	C	6	6	1092123	1092128	0 %	0 %	0 %	100 %	549729123
21540	NC_022545	CGCGA	2	10	1092139	1092148	20 %	0 %	40 %	40 %	549729123
21541	NC_022545	GAC	2	6	1092163	1092168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729123
21542	NC_022545	GCT	2	6	1092210	1092215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729123
21543	NC_022545	GGT	2	6	1092268	1092273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729123
21544	NC_022545	ACC	2	6	1092343	1092348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729123
21545	NC_022545	CGC	2	6	1092377	1092382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729123
21546	NC_022545	CGA	2	6	1092399	1092404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729123
21547	NC_022545	CAG	2	6	1092409	1092414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729123
21548	NC_022545	GC	4	8	1092428	1092435	0 %	0 %	50 %	50 %	549729123
21549	NC_022545	GGT	2	6	1092456	1092461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729123
21550	NC_022545	TCGGC	2	10	1092468	1092477	0 %	20 %	40 %	40 %	549729123
21551	NC_022545	AG	3	6	1092498	1092503	50 %	0 %	50 %	0 %	549729123
21552	NC_022545	CGAG	2	8	1092507	1092514	25 %	0 %	50 %	25 %	549729123
21553	NC_022545	AAG	2	6	1092586	1092591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729123
21554	NC_022545	GCAA	2	8	1092638	1092645	50 %	0 %	25 %	25 %	549729123
21555	NC_022545	ATG	2	6	1092650	1092655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729123
21556	NC_022545	CAT	2	6	1092658	1092663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729123
21557	NC_022545	AGCG	2	8	1092700	1092707	25 %	0 %	50 %	25 %	549729123
21558	NC_022545	GTG	2	6	1092767	1092772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729123
21559	NC_022545	GTC	2	6	1092815	1092820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729123
21560	NC_022545	CGA	2	6	1092868	1092873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729124
21561	NC_022545	TTG	2	6	1092945	1092950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729124
21562	NC_022545	AGGA	2	8	1093008	1093015	50 %	0 %	50 %	0 %	549729124
21563	NC_022545	AGA	2	6	1093029	1093034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729124
21564	NC_022545	ACG	2	6	1093047	1093052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729124
21565	NC_022545	GAT	2	6	1093091	1093096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729124
21566	NC_022545	CGG	2	6	1093101	1093106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729124
21567	NC_022545	CGT	2	6	1093158	1093163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729124
21568	NC_022545	CACG	2	8	1093183	1093190	25 %	0 %	25 %	50 %	549729124
21569	NC_022545	GC	3	6	1093193	1093198	0 %	0 %	50 %	50 %	549729124
21570	NC_022545	A	6	6	1093256	1093261	100 %	0 %	0 %	0 %	549729124
21571	NC_022545	GAC	2	6	1093262	1093267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729124
21572	NC_022545	CGA	2	6	1093312	1093317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729124
21573	NC_022545	CAT	2	6	1093322	1093327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729124
21574	NC_022545	ACCG	2	8	1093412	1093419	25 %	0 %	25 %	50 %	549729124
21575	NC_022545	CG	3	6	1093447	1093452	0 %	0 %	50 %	50 %	549729124
21576	NC_022545	GAA	2	6	1093484	1093489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729124
21577	NC_022545	GCGT	2	8	1093525	1093532	0 %	25 %	50 %	25 %	549729124
21578	NC_022545	CGT	2	6	1093534	1093539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729124
21579	NC_022545	GC	3	6	1093599	1093604	0 %	0 %	50 %	50 %	549729124
21580	NC_022545	GCT	2	6	1093616	1093621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729124
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21582	NC_022545	CGA	2	6	1093810	1093815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729124
21583	NC_022545	TTG	2	6	1093866	1093871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729124
21584	NC_022545	TTG	2	6	1093919	1093924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729124
21585	NC_022545	AAG	2	6	1093974	1093979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729124
21586	NC_022545	CGA	2	6	1093994	1093999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729125
21587	NC_022545	AAC	2	6	1094034	1094039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729125
21588	NC_022545	GCG	3	9	1094149	1094157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729125
21589	NC_022545	GCA	2	6	1094183	1094188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729125
21590	NC_022545	CG	3	6	1094193	1094198	0 %	0 %	50 %	50 %	549729125
21591	NC_022545	ACG	3	9	1094212	1094220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729125
21592	NC_022545	GC	3	6	1094223	1094228	0 %	0 %	50 %	50 %	549729125
21593	NC_022545	CG	3	6	1094291	1094296	0 %	0 %	50 %	50 %	549729125
21594	NC_022545	ATC	2	6	1094338	1094343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729125
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21596	NC_022545	GTAGC	2	10	1094355	1094364	20 %	20 %	40 %	20 %	549729125
21597	NC_022545	CTGC	2	8	1094380	1094387	0 %	25 %	25 %	50 %	549729125
21598	NC_022545	GAA	2	6	1094390	1094395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549729125
21599	NC_022545	AGC	2	6	1094401	1094406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729125
21600	NC_022545	ACG	2	6	1094437	1094442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729125
21601	NC_022545	TGC	2	6	1094514	1094519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729125
21602	NC_022545	CGC	2	6	1094537	1094542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549729125
21603	NC_022545	CCA	2	6	1094543	1094548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729125
21604	NC_022545	AAC	2	6	1094567	1094572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729125
21605	NC_022545	GAT	2	6	1094711	1094716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729125
21606	NC_022545	G	6	6	1094746	1094751	0 %	0 %	100 %	0 %	549729125
21607	NC_022545	ACC	2	6	1094775	1094780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729125
21608	NC_022545	GAC	2	6	1094814	1094819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729125
21609	NC_022545	AAC	2	6	1094824	1094829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549729125
21610	NC_022545	GCG	2	6	1095029	1095034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729126
21611	NC_022545	GCA	2	6	1095074	1095079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729126
21612	NC_022545	GAGC	2	8	1095085	1095092	25 %	0 %	50 %	25 %	549729126
21613	NC_022545	CTT	2	6	1095117	1095122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729126
21614	NC_022545	CAT	2	6	1095131	1095136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549729126
21615	NC_022545	GTT	2	6	1095144	1095149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729126
21616	NC_022545	TTG	2	6	1095172	1095177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549729126
21617	NC_022545	TCCGCA	2	12	1095205	1095216	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549729126
21618	NC_022545	CAGC	2	8	1095229	1095236	25 %	0 %	25 %	50 %	549729126
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21724	NC_022545	GAT	2	6	1102187	1102192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549729130
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21726	NC_022545	CCGT	2	8	1102214	1102221	0 %	25 %	25 %	50 %	549729130
21727	NC_022545	CTC	2	6	1102236	1102241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549729130
21728	NC_022545	CCA	2	6	1102290	1102295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549729130
21729	NC_022545	GGT	2	6	1102329	1102334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549729130
21730	NC_022545	CGA	2	6	1102362	1102367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549729130
21731	NC_022545	GA	3	6	1102366	1102371	50 %	0 %	50 %	0 %	549729130
21732	NC_022545	ACAG	2	8	1102409	1102416	50 %	0 %	25 %	25 %	549729130
21733	NC_022545	CGGG	2	8	1102430	1102437	0 %	0 %	75 %	25 %	549729130
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21754	NC_022545	CG	3	6	1103481	1103486	0 %	0 %	50 %	50 %	549729131
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21953	NC_022545	A	7	7	1115012	1115018	100 %	0 %	0 %	0 %	549729144
21954	NC_022545	ACGG	2	8	1115185	1115192	25 %	0 %	50 %	25 %	549729144
21955	NC_022545	CTG	2	6	1115196	1115201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729144
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21957	NC_022545	CTG	2	6	1115364	1115369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729144
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21960	NC_022545	GGC	2	6	1115548	1115553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549729144
21961	NC_022545	TCT	2	6	1115731	1115736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549729144
21962	NC_022545	GC	3	6	1115793	1115798	0 %	0 %	50 %	50 %	549729144
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21991	NC_022545	CG	3	6	1117080	1117085	0 %	0 %	50 %	50 %	549729145
21992	NC_022545	TCG	2	6	1117098	1117103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549729145
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