MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022545	GCA	2	6	492425	492430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728556
10002	NC_022545	GGA	2	6	492453	492458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728556
10003	NC_022545	TCC	2	6	492515	492520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728556
10004	NC_022545	CGG	2	6	492543	492548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728556
10005	NC_022545	GCCGGA	2	12	492555	492566	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549728556
10006	NC_022545	GGA	2	6	492683	492688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728557
10007	NC_022545	GCT	2	6	492707	492712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728557
10008	NC_022545	CAG	2	6	492828	492833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728557
10009	NC_022545	AGCGA	2	10	492903	492912	40 %	0 %	40 %	20 %	549728557
10010	NC_022545	GCG	2	6	492915	492920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728557
10011	NC_022545	GC	3	6	492952	492957	0 %	0 %	50 %	50 %	549728557
10012	NC_022545	GGA	3	9	492959	492967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728557
10013	NC_022545	TCT	2	6	492989	492994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728558
10014	NC_022545	CGG	2	6	493000	493005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728558
10015	NC_022545	ATC	2	6	493073	493078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728558
10016	NC_022545	GGCA	2	8	493091	493098	25 %	0 %	50 %	25 %	549728558
10017	NC_022545	GCG	2	6	493099	493104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728558
10018	NC_022545	GCA	2	6	493160	493165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728558
10019	NC_022545	CGGC	2	8	493168	493175	0 %	0 %	50 %	50 %	549728558
10020	NC_022545	CTG	2	6	493226	493231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728558
10021	NC_022545	CAT	2	6	493279	493284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728558
10022	NC_022545	CGA	2	6	493356	493361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728558
10023	NC_022545	TTGC	2	8	493414	493421	0 %	50 %	25 %	25 %	549728559
10024	NC_022545	GTT	2	6	493428	493433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728559
10025	NC_022545	GTTC	2	8	493527	493534	0 %	50 %	25 %	25 %	549728559
10026	NC_022545	TGC	2	6	493568	493573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728559
10027	NC_022545	CAG	2	6	493575	493580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728559
10028	NC_022545	CGA	2	6	493605	493610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728559
10029	NC_022545	CCCGG	2	10	493702	493711	0 %	0 %	40 %	60 %	549728559
10030	NC_022545	CGG	2	6	493922	493927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728560
10031	NC_022545	TCA	2	6	493939	493944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728560
10032	NC_022545	GCA	2	6	493948	493953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728560
10033	NC_022545	ACCGGA	2	12	494022	494033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728560
10034	NC_022545	GCC	2	6	494057	494062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728560
10035	NC_022545	GC	3	6	494299	494304	0 %	0 %	50 %	50 %	549728560
10036	NC_022545	GCC	2	6	494387	494392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728560
10037	NC_022545	GAA	2	6	494399	494404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728560
10038	NC_022545	CCA	2	6	494545	494550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728560
10039	NC_022545	AGC	2	6	494556	494561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728560
10040	NC_022545	CG	3	6	494581	494586	0 %	0 %	50 %	50 %	549728560
10041	NC_022545	ATC	2	6	494600	494605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728560
10042	NC_022545	CG	4	8	494631	494638	0 %	0 %	50 %	50 %	549728560
10043	NC_022545	ATA	2	6	494852	494857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728560
10044	NC_022545	GCG	2	6	494935	494940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728560
10045	NC_022545	CAC	2	6	494969	494974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728560
10046	NC_022545	CCG	2	6	495007	495012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728560
10047	NC_022545	GGA	2	6	495022	495027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728560
10048	NC_022545	CGC	2	6	495040	495045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728560
10049	NC_022545	ACG	2	6	495054	495059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728560
10050	NC_022545	GGC	2	6	495098	495103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728560
10051	NC_022545	CGC	2	6	495116	495121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728560
10052	NC_022545	GATC	2	8	495154	495161	25 %	25 %	25 %	25 %	549728560
10053	NC_022545	CGA	2	6	495178	495183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728560
10054	NC_022545	GTG	2	6	495264	495269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728560
10055	NC_022545	TGG	2	6	495307	495312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728560
10056	NC_022545	CTCA	2	8	495350	495357	25 %	25 %	0 %	50 %	549728560
10057	NC_022545	CACGA	2	10	495829	495838	40 %	0 %	20 %	40 %	549728561
10058	NC_022545	TCA	2	6	495861	495866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728561
10059	NC_022545	TTG	2	6	495917	495922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728561
10060	NC_022545	GAT	2	6	495928	495933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728561
10061	NC_022545	TGA	2	6	495951	495956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728561
10062	NC_022545	ACC	2	6	495973	495978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728561
10063	NC_022545	TGATGG	2	12	495996	496007	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549728561
10064	NC_022545	TTC	2	6	496021	496026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728561
10065	NC_022545	GAC	2	6	496183	496188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728561
10066	NC_022545	TCA	2	6	496196	496201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728561
10067	NC_022545	GAT	2	6	496224	496229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728561
10068	NC_022545	GC	4	8	496248	496255	0 %	0 %	50 %	50 %	549728561
10069	NC_022545	CGG	2	6	496295	496300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728561
10070	NC_022545	GC	3	6	496316	496321	0 %	0 %	50 %	50 %	549728561
10071	NC_022545	CTT	2	6	496347	496352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728561
10072	NC_022545	TCT	2	6	496395	496400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728561
10073	NC_022545	TCACCT	2	12	496425	496436	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549728561
10074	NC_022545	GCC	2	6	496482	496487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728561
10075	NC_022545	GGC	2	6	496691	496696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728561
10076	NC_022545	CGG	2	6	496710	496715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728561
10077	NC_022545	GC	3	6	496758	496763	0 %	0 %	50 %	50 %	549728561
10078	NC_022545	GAC	2	6	496858	496863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728561
10079	NC_022545	TCA	2	6	496905	496910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728561
10080	NC_022545	TTCCA	2	10	496958	496967	20 %	40 %	0 %	40 %	549728561
10081	NC_022545	GC	3	6	497056	497061	0 %	0 %	50 %	50 %	549728562
10082	NC_022545	ACG	2	6	497263	497268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728562
10083	NC_022545	GCA	2	6	497285	497290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728562
10084	NC_022545	GAT	2	6	497304	497309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728562
10085	NC_022545	CCG	2	6	497333	497338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728562
10086	NC_022545	GCG	2	6	497397	497402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728562
10087	NC_022545	ATG	2	6	497490	497495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728562
10088	NC_022545	CGT	2	6	497585	497590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728562
10089	NC_022545	GGAA	2	8	497598	497605	50 %	0 %	50 %	0 %	549728562
10090	NC_022545	CCA	2	6	497606	497611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728562
10091	NC_022545	GCC	3	9	497679	497687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728562
10092	NC_022545	GAA	2	6	497699	497704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728562
10093	NC_022545	CCT	2	6	497753	497758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728562
10094	NC_022545	CTG	2	6	497907	497912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728562
10095	NC_022545	TCG	2	6	497977	497982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728562
10096	NC_022545	ATC	2	6	498025	498030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728562
10097	NC_022545	CTGGCG	2	12	498063	498074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549728563
10098	NC_022545	CTT	2	6	498120	498125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728563
10099	NC_022545	CGG	2	6	498126	498131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728563
10100	NC_022545	T	6	6	498132	498137	0 %	100 %	0 %	0 %	549728563
10101	NC_022545	TCCGCC	2	12	498202	498213	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	549728563
10102	NC_022545	TTC	2	6	498259	498264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728563
10103	NC_022545	GC	3	6	498347	498352	0 %	0 %	50 %	50 %	549728563
10104	NC_022545	GCG	2	6	498396	498401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728563
10105	NC_022545	GTT	2	6	498555	498560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728563
10106	NC_022545	CCG	2	6	498629	498634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728563
10107	NC_022545	GGC	2	6	498654	498659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728563
10108	NC_022545	GAA	2	6	498747	498752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728563
10109	NC_022545	GCC	2	6	498788	498793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728563
10110	NC_022545	TCA	2	6	498830	498835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728563
10111	NC_022545	GTC	2	6	498852	498857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728563
10112	NC_022545	CAG	2	6	498864	498869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728563
10113	NC_022545	CCTG	2	8	498871	498878	0 %	25 %	25 %	50 %	549728563
10114	NC_022545	CCT	2	6	498941	498946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728563
10115	NC_022545	TGC	2	6	498955	498960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728563
10116	NC_022545	GC	3	6	499002	499007	0 %	0 %	50 %	50 %	549728563
10117	NC_022545	TCA	2	6	499025	499030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728563
10118	NC_022545	TTC	2	6	499033	499038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728563
10119	NC_022545	CAG	2	6	499047	499052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728563
10120	NC_022545	GTC	2	6	499053	499058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728563
10121	NC_022545	AGC	2	6	499066	499071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728563
10122	NC_022545	TGA	2	6	499099	499104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728563
10123	NC_022545	CGG	2	6	499235	499240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728563
10124	NC_022545	CCG	2	6	499446	499451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728564
10125	NC_022545	CCT	2	6	499543	499548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728564
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10127	NC_022545	GCA	2	6	499564	499569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728564
10128	NC_022545	GCCGC	2	10	499576	499585	0 %	0 %	40 %	60 %	549728564
10129	NC_022545	GAT	2	6	499637	499642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728564
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10131	NC_022545	CGC	2	6	499694	499699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728564
10132	NC_022545	CGATGC	2	12	499726	499737	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728564
10133	NC_022545	GCC	2	6	499739	499744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728564
10134	NC_022545	CGG	2	6	499801	499806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728564
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10138	NC_022545	TGA	2	6	499993	499998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728564
10139	NC_022545	GCT	2	6	500140	500145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728564
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10144	NC_022545	TTC	2	6	500342	500347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728564
10145	NC_022545	CGA	2	6	500375	500380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728564
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10147	NC_022545	CTG	3	9	500432	500440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728564
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10149	NC_022545	CGC	2	6	500459	500464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728565
10150	NC_022545	CATC	2	8	500549	500556	25 %	25 %	0 %	50 %	549728565
10151	NC_022545	CGC	2	6	500620	500625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728565
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10153	NC_022545	CGGG	2	8	500814	500821	0 %	0 %	75 %	25 %	549728566
10154	NC_022545	CAT	2	6	500904	500909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728566
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10220	NC_022545	CTG	2	6	503569	503574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728568
10221	NC_022545	GGC	2	6	503645	503650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728568
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10224	NC_022545	CGG	2	6	503722	503727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728568
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10227	NC_022545	CGC	2	6	503855	503860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728568
10228	NC_022545	GAAG	2	8	503893	503900	50 %	0 %	50 %	0 %	549728568
10229	NC_022545	GAA	2	6	503903	503908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728568
10230	NC_022545	AGC	2	6	503916	503921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728568
10231	NC_022545	TAT	2	6	503957	503962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728568
10232	NC_022545	GC	3	6	503967	503972	0 %	0 %	50 %	50 %	549728568
10233	NC_022545	GAC	2	6	503981	503986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728568
10234	NC_022545	ATC	2	6	503990	503995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728568
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10236	NC_022545	CCG	2	6	504036	504041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728568
10237	NC_022545	ACCC	2	8	504061	504068	25 %	0 %	0 %	75 %	549728568
10238	NC_022545	CGA	2	6	504094	504099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728569
10239	NC_022545	CAT	2	6	504146	504151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728569
10240	NC_022545	CCGC	2	8	504157	504164	0 %	0 %	25 %	75 %	549728569
10241	NC_022545	CATG	2	8	504215	504222	25 %	25 %	25 %	25 %	549728569
10242	NC_022545	CGA	2	6	504233	504238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728569
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10244	NC_022545	CCT	2	6	504271	504276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728569
10245	NC_022545	ATC	2	6	504294	504299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728569
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10251	NC_022545	GGC	4	12	504582	504593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728569
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10257	NC_022545	GCC	3	9	504879	504887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728569
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10273	NC_022545	CGGC	2	8	506047	506054	0 %	0 %	50 %	50 %	549728569
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10303	NC_022545	GGA	2	6	507911	507916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728572
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10349	NC_022545	CCA	2	6	510057	510062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728575
10350	NC_022545	GATC	2	8	510144	510151	25 %	25 %	25 %	25 %	549728575
10351	NC_022545	TCGA	2	8	510233	510240	25 %	25 %	25 %	25 %	549728575
10352	NC_022545	ACC	2	6	510289	510294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728575
10353	NC_022545	CGA	2	6	510321	510326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728575
10354	NC_022545	ACG	2	6	510431	510436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728575
10355	NC_022545	GCG	2	6	510521	510526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728575
10356	NC_022545	CACC	2	8	510582	510589	25 %	0 %	0 %	75 %	549728575
10357	NC_022545	GGC	2	6	510670	510675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728575
10358	NC_022545	GAGC	2	8	510688	510695	25 %	0 %	50 %	25 %	549728575
10359	NC_022545	TGA	2	6	510861	510866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728575
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10361	NC_022545	CCG	2	6	510938	510943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728575
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10463	NC_022545	GCCG	2	8	515306	515313	0 %	0 %	50 %	50 %	549728578
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10475	NC_022545	GC	3	6	516152	516157	0 %	0 %	50 %	50 %	549728579
10476	NC_022545	TCA	2	6	516162	516167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728579
10477	NC_022545	ACCG	2	8	516175	516182	25 %	0 %	25 %	50 %	549728579
10478	NC_022545	GAT	2	6	516206	516211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728579
10479	NC_022545	TCG	2	6	516222	516227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728579
10480	NC_022545	TCA	2	6	516261	516266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728579
10481	NC_022545	TGG	2	6	516330	516335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728579
10482	NC_022545	ACC	2	6	516353	516358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728579
10483	NC_022545	TCA	2	6	516466	516471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728579
10484	NC_022545	TC	4	8	516489	516496	0 %	50 %	0 %	50 %	549728579
10485	NC_022545	CCCG	2	8	516582	516589	0 %	0 %	25 %	75 %	549728579
10486	NC_022545	GGA	2	6	516676	516681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728579
10487	NC_022545	GCC	2	6	516687	516692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728579
10488	NC_022545	TCAC	2	8	516740	516747	25 %	25 %	0 %	50 %	549728579
10489	NC_022545	GCC	3	9	516773	516781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728579
10490	NC_022545	GC	3	6	516797	516802	0 %	0 %	50 %	50 %	549728579
10491	NC_022545	GC	3	6	516826	516831	0 %	0 %	50 %	50 %	549728579
10492	NC_022545	CGC	3	9	516829	516837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728579
10493	NC_022545	CGGT	2	8	516849	516856	0 %	25 %	50 %	25 %	549728579
10494	NC_022545	GGC	2	6	516866	516871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728579
10495	NC_022545	CAG	2	6	516875	516880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728579
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10497	NC_022545	TCA	2	6	516921	516926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728579
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10499	NC_022545	ATC	2	6	517016	517021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728579
10500	NC_022545	GC	3	6	517138	517143	0 %	0 %	50 %	50 %	549728579

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