MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 40094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022545	GCT	3	9	249568	249576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728334
5002	NC_022545	CAT	2	6	249583	249588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728334
5003	NC_022545	GCA	2	6	249595	249600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728334
5004	NC_022545	TCG	2	6	249672	249677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728334
5005	NC_022545	CTG	2	6	249680	249685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728334
5006	NC_022545	GGC	2	6	249687	249692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728334
5007	NC_022545	GGC	2	6	249694	249699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728334
5008	NC_022545	CCCG	2	8	250020	250027	0 %	0 %	25 %	75 %	549728335
5009	NC_022545	CGCC	2	8	250069	250076	0 %	0 %	25 %	75 %	549728335
5010	NC_022545	AGA	2	6	250122	250127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728335
5011	NC_022545	GCT	3	9	250144	250152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728335
5012	NC_022545	GCC	2	6	250154	250159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728335
5013	NC_022545	TCCT	2	8	250214	250221	0 %	50 %	0 %	50 %	549728335
5014	NC_022545	GC	3	6	250222	250227	0 %	0 %	50 %	50 %	549728335
5015	NC_022545	AAGA	2	8	250307	250314	75 %	0 %	25 %	0 %	549728335
5016	NC_022545	TCG	2	6	250356	250361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728335
5017	NC_022545	CG	3	6	250377	250382	0 %	0 %	50 %	50 %	549728335
5018	NC_022545	GAA	2	6	250516	250521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728335
5019	NC_022545	CAA	2	6	250537	250542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728335
5020	NC_022545	CGG	2	6	250567	250572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728335
5021	NC_022545	CGA	2	6	250618	250623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728335
5022	NC_022545	GGC	2	6	250640	250645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728335
5023	NC_022545	GAA	2	6	250661	250666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728335
5024	NC_022545	GAA	3	9	250673	250681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728335
5025	NC_022545	CGA	2	6	250711	250716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728335
5026	NC_022545	GT	3	6	250719	250724	0 %	50 %	50 %	0 %	549728335
5027	NC_022545	GGT	2	6	250726	250731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728335
5028	NC_022545	TGGCC	2	10	250735	250744	0 %	20 %	40 %	40 %	549728335
5029	NC_022545	ACC	2	6	250752	250757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728335
5030	NC_022545	GCT	2	6	250839	250844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728335
5031	NC_022545	GAA	2	6	250859	250864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728335
5032	NC_022545	CAG	2	6	250892	250897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728335
5033	NC_022545	GCG	2	6	250917	250922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728335
5034	NC_022545	CCCG	2	8	251052	251059	0 %	0 %	25 %	75 %	549728336
5035	NC_022545	GCG	2	6	251071	251076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5036	NC_022545	CCG	2	6	251110	251115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728336
5037	NC_022545	TCG	2	6	251148	251153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5038	NC_022545	GCC	2	6	251175	251180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728336
5039	NC_022545	GCA	2	6	251251	251256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5040	NC_022545	AGCG	2	8	251262	251269	25 %	0 %	50 %	25 %	549728336
5041	NC_022545	GCC	2	6	251270	251275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728336
5042	NC_022545	ATG	2	6	251289	251294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728336
5043	NC_022545	CGAAGC	2	12	251320	251331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5044	NC_022545	TCG	2	6	251370	251375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5045	NC_022545	CGC	2	6	251414	251419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728336
5046	NC_022545	CGG	2	6	251480	251485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5047	NC_022545	TGCTG	2	10	251586	251595	0 %	40 %	40 %	20 %	549728336
5048	NC_022545	GCA	2	6	251611	251616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5049	NC_022545	CAG	2	6	251618	251623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5050	NC_022545	GCG	2	6	251658	251663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5051	NC_022545	CGGG	2	8	251674	251681	0 %	0 %	75 %	25 %	549728336
5052	NC_022545	GGC	2	6	251744	251749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5053	NC_022545	GAC	2	6	251753	251758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5054	NC_022545	ACC	2	6	251769	251774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728336
5055	NC_022545	TCG	2	6	251781	251786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5056	NC_022545	CG	3	6	251912	251917	0 %	0 %	50 %	50 %	549728336
5057	NC_022545	GCA	2	6	251920	251925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5058	NC_022545	CCCG	2	8	251946	251953	0 %	0 %	25 %	75 %	549728336
5059	NC_022545	TGC	2	6	251971	251976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5060	NC_022545	CAG	2	6	252029	252034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5061	NC_022545	CCAC	2	8	252058	252065	25 %	0 %	0 %	75 %	549728336
5062	NC_022545	CGT	2	6	252067	252072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5063	NC_022545	TCG	2	6	252096	252101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5064	NC_022545	CCG	2	6	252102	252107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728336
5065	NC_022545	GCC	3	9	252150	252158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728336
5066	NC_022545	TGA	2	6	252166	252171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728336
5067	NC_022545	CGC	2	6	252182	252187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728336
5068	NC_022545	TCGAGA	2	12	252222	252233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549728336
5069	NC_022545	AGC	2	6	252237	252242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5070	NC_022545	ATT	2	6	252311	252316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728336
5071	NC_022545	CGC	3	9	252353	252361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728336
5072	NC_022545	GAT	2	6	252398	252403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728336
5073	NC_022545	AGC	2	6	252405	252410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5074	NC_022545	AGAA	2	8	252414	252421	75 %	0 %	25 %	0 %	549728336
5075	NC_022545	GAC	2	6	252449	252454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5076	NC_022545	GGC	2	6	252554	252559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5077	NC_022545	ACCG	2	8	252671	252678	25 %	0 %	25 %	50 %	549728336
5078	NC_022545	GCG	2	6	252723	252728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5079	NC_022545	CGG	2	6	252817	252822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5080	NC_022545	TCG	2	6	252891	252896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5081	NC_022545	CGG	2	6	252991	252996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5082	NC_022545	GGC	2	6	253007	253012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5083	NC_022545	CGT	2	6	253067	253072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728336
5084	NC_022545	CTGA	2	8	253118	253125	25 %	25 %	25 %	25 %	549728336
5085	NC_022545	CGG	2	6	253192	253197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5086	NC_022545	GCG	2	6	253234	253239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728336
5087	NC_022545	CCA	2	6	253559	253564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728337
5088	NC_022545	CTTGTC	2	12	253581	253592	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549728337
5089	NC_022545	TGCG	2	8	253594	253601	0 %	25 %	50 %	25 %	549728337
5090	NC_022545	CTT	2	6	253656	253661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728337
5091	NC_022545	GCC	2	6	253675	253680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728337
5092	NC_022545	TGA	2	6	253697	253702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728337
5093	NC_022545	AGCG	2	8	253723	253730	25 %	0 %	50 %	25 %	549728337
5094	NC_022545	GCG	2	6	253741	253746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728337
5095	NC_022545	CGA	2	6	253754	253759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728337
5096	NC_022545	TTC	2	6	253768	253773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728337
5097	NC_022545	CTT	2	6	253814	253819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728337
5098	NC_022545	CCTTGA	2	12	253820	253831	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549728337
5099	NC_022545	GCC	2	6	253866	253871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728337
5100	NC_022545	TGG	2	6	253874	253879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728337
5101	NC_022545	ACCG	2	8	253893	253900	25 %	0 %	25 %	50 %	549728337
5102	NC_022545	CTT	2	6	253935	253940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728337
5103	NC_022545	GTG	2	6	253960	253965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728337
5104	NC_022545	TGG	2	6	253967	253972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728337
5105	NC_022545	CGT	2	6	254060	254065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728337
5106	NC_022545	CGA	2	6	254102	254107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728337
5107	NC_022545	TATCGA	2	12	254108	254119	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549728337
5108	NC_022545	GGC	2	6	254127	254132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728337
5109	NC_022545	TCT	2	6	254138	254143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728337
5110	NC_022545	CGG	2	6	254171	254176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728337
5111	NC_022545	CGG	2	6	254216	254221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728337
5112	NC_022545	AG	3	6	254225	254230	50 %	0 %	50 %	0 %	549728337
5113	NC_022545	GCGA	2	8	254233	254240	25 %	0 %	50 %	25 %	549728337
5114	NC_022545	TTC	2	6	254257	254262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728337
5115	NC_022545	TTC	2	6	254302	254307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728338
5116	NC_022545	GC	3	6	254328	254333	0 %	0 %	50 %	50 %	549728338
5117	NC_022545	CGC	3	9	254453	254461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728338
5118	NC_022545	CCA	2	6	254471	254476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728338
5119	NC_022545	AGCGTG	2	12	254503	254514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549728338
5120	NC_022545	CAGC	2	8	254543	254550	25 %	0 %	25 %	50 %	549728338
5121	NC_022545	GCGG	2	8	254592	254599	0 %	0 %	75 %	25 %	549728338
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5232	NC_022545	GC	3	6	261811	261816	0 %	0 %	50 %	50 %	549728343
5233	NC_022545	CGCC	2	8	261821	261828	0 %	0 %	25 %	75 %	549728343
5234	NC_022545	CCA	2	6	261842	261847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728343
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5237	NC_022545	CGG	2	6	261935	261940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728343
5238	NC_022545	AT	3	6	261958	261963	50 %	50 %	0 %	0 %	549728343
5239	NC_022545	GCA	2	6	261998	262003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728343
5240	NC_022545	GTTC	2	8	262034	262041	0 %	50 %	25 %	25 %	549728343
5241	NC_022545	GCA	2	6	262178	262183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728343
5242	NC_022545	TCG	2	6	262298	262303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728343
5243	NC_022545	CCG	2	6	262316	262321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728343
5244	NC_022545	ATG	2	6	262341	262346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728343
5245	NC_022545	GCCGA	2	10	262375	262384	20 %	0 %	40 %	40 %	549728343
5246	NC_022545	CAG	2	6	262407	262412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728343
5247	NC_022545	TTC	2	6	262554	262559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728344
5248	NC_022545	GCG	2	6	262607	262612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728344
5249	NC_022545	GC	4	8	262631	262638	0 %	0 %	50 %	50 %	549728344
5250	NC_022545	CAG	2	6	262699	262704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728344
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5253	NC_022545	GCA	2	6	262911	262916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728344
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5256	NC_022545	CGC	2	6	263053	263058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728344
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5259	NC_022545	CGA	2	6	263199	263204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728344
5260	NC_022545	GC	3	6	263230	263235	0 %	0 %	50 %	50 %	549728344
5261	NC_022545	TCAG	2	8	263249	263256	25 %	25 %	25 %	25 %	549728344
5262	NC_022545	GCA	2	6	263261	263266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728344
5263	NC_022545	CGG	2	6	263272	263277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728344
5264	NC_022545	GC	3	6	263342	263347	0 %	0 %	50 %	50 %	549728344
5265	NC_022545	ATC	2	6	263390	263395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728344
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5268	NC_022545	CCCGCG	2	12	263472	263483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728344
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5270	NC_022545	CGCC	2	8	263541	263548	0 %	0 %	25 %	75 %	549728344
5271	NC_022545	TGG	2	6	263941	263946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728345
5272	NC_022545	CAG	2	6	264001	264006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728345
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5274	NC_022545	CTG	2	6	264049	264054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728345
5275	NC_022545	GTC	2	6	264196	264201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728345
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5279	NC_022545	TGT	2	6	264324	264329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728345
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5283	NC_022545	TGA	2	6	264447	264452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728345
5284	NC_022545	CAT	2	6	264463	264468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728345
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5332	NC_022545	GGC	2	6	266105	266110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728346
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5340	NC_022545	CGT	2	6	266383	266388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728346
5341	NC_022545	CGCC	2	8	266407	266414	0 %	0 %	25 %	75 %	549728346
5342	NC_022545	CGT	2	6	266503	266508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728346
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5345	NC_022545	CAG	2	6	266570	266575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728346
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5347	NC_022545	CTGC	2	8	266632	266639	0 %	25 %	25 %	50 %	549728346
5348	NC_022545	GCT	2	6	266641	266646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728346
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5357	NC_022545	TCG	2	6	267163	267168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728347
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5359	NC_022545	CAA	2	6	267266	267271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728347
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5361	NC_022545	ATCG	2	8	267321	267328	25 %	25 %	25 %	25 %	549728347
5362	NC_022545	AAC	2	6	267369	267374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728347
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5365	NC_022545	CTT	2	6	267485	267490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728347
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5393	NC_022545	GGGC	2	8	268777	268784	0 %	0 %	75 %	25 %	549728349
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5480	NC_022545	GCT	2	6	272536	272541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728351
5481	NC_022545	CGT	2	6	272551	272556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728351
5482	NC_022545	TGA	3	9	272615	272623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728351
5483	NC_022545	ACC	2	6	272889	272894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728352
5484	NC_022545	CTC	2	6	272900	272905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728352
5485	NC_022545	GCC	2	6	272923	272928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728352
5486	NC_022545	GCT	2	6	272939	272944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5487	NC_022545	ACGGTG	2	12	273054	273065	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549728352
5488	NC_022545	TCT	2	6	273139	273144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728352
5489	NC_022545	ACG	2	6	273156	273161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5490	NC_022545	GCG	2	6	273168	273173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728352
5491	NC_022545	CTG	2	6	273180	273185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5492	NC_022545	GAT	2	6	273188	273193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728352
5493	NC_022545	CAT	2	6	273206	273211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728352
5494	NC_022545	GAA	2	6	273267	273272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728352
5495	NC_022545	GCT	2	6	273293	273298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5496	NC_022545	TC	3	6	273368	273373	0 %	50 %	0 %	50 %	549728352
5497	NC_022545	TC	3	6	273416	273421	0 %	50 %	0 %	50 %	549728352
5498	NC_022545	CCG	2	6	273428	273433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728352
5499	NC_022545	TGC	2	6	273475	273480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728352
5500	NC_022545	GGC	2	6	273492	273497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728352

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