MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45005	NC_022535	GGC	2	6	2271287	2271292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706757
45006	NC_022535	CGG	2	6	2271360	2271365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706757
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45009	NC_022535	GCGCC	2	10	2271496	2271505	0 %	0 %	40 %	60 %	549706757
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45011	NC_022535	CAT	2	6	2271571	2271576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706757
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45116	NC_022535	CGG	2	6	2276894	2276899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706762
45117	NC_022535	TGA	2	6	2276962	2276967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706762
45118	NC_022535	GAC	2	6	2276972	2276977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706762
45119	NC_022535	TCG	2	6	2277010	2277015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706762
45120	NC_022535	GC	4	8	2277023	2277030	0 %	0 %	50 %	50 %	549706762
45121	NC_022535	GCC	2	6	2277268	2277273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706763
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45123	NC_022535	AGC	2	6	2277332	2277337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706763
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45126	NC_022535	AAG	2	6	2277404	2277409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706763
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45128	NC_022535	GCC	2	6	2277568	2277573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706763
45129	NC_022535	CGG	2	6	2277621	2277626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706763
45130	NC_022535	CCG	2	6	2277635	2277640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706763
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45132	NC_022535	GAT	2	6	2277696	2277701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706763
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45134	NC_022535	GAG	2	6	2277715	2277720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706763
45135	NC_022535	CCG	2	6	2277797	2277802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706763
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45139	NC_022535	GC	3	6	2278011	2278016	0 %	0 %	50 %	50 %	549706763
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45142	NC_022535	TG	3	6	2278171	2278176	0 %	50 %	50 %	0 %	549706763
45143	NC_022535	GAT	2	6	2278197	2278202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706763
45144	NC_022535	GC	3	6	2278207	2278212	0 %	0 %	50 %	50 %	549706763
45145	NC_022535	AAG	2	6	2278213	2278218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706763
45146	NC_022535	CGC	2	6	2278306	2278311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706764
45147	NC_022535	CAA	2	6	2278414	2278419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706764
45148	NC_022535	GTC	2	6	2278422	2278427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706764
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45150	NC_022535	TGT	2	6	2278552	2278557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706764
45151	NC_022535	TTC	2	6	2278623	2278628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706764
45152	NC_022535	AAC	2	6	2278641	2278646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706764
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45154	NC_022535	CGC	2	6	2278712	2278717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706764
45155	NC_022535	ACAGG	2	10	2278876	2278885	40 %	0 %	40 %	20 %	549706764
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45157	NC_022535	GGA	2	6	2278946	2278951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706764
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45159	NC_022535	AT	3	6	2279139	2279144	50 %	50 %	0 %	0 %	549706764
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45163	NC_022535	ACCAGA	2	12	2279314	2279325	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	549706764
45164	NC_022535	GGCA	2	8	2279423	2279430	25 %	0 %	50 %	25 %	549706764
45165	NC_022535	GGC	2	6	2279433	2279438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706764
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45170	NC_022535	CGC	2	6	2279750	2279755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706765
45171	NC_022535	GCA	2	6	2279772	2279777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706765
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45173	NC_022535	GAC	2	6	2279791	2279796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706765
45174	NC_022535	CGG	2	6	2279802	2279807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706765
45175	NC_022535	CGG	2	6	2279859	2279864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706765
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45180	NC_022535	GCA	2	6	2280033	2280038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706765
45181	NC_022535	GCG	2	6	2280146	2280151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706765
45182	NC_022535	TGA	2	6	2280159	2280164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706765
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45184	NC_022535	GC	3	6	2280205	2280210	0 %	0 %	50 %	50 %	549706765
45185	NC_022535	TGA	2	6	2280234	2280239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706765
45186	NC_022535	CGT	2	6	2280271	2280276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706765
45187	NC_022535	GCG	2	6	2280303	2280308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706765
45188	NC_022535	CGG	2	6	2280334	2280339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706765
45189	NC_022535	AGGA	2	8	2280377	2280384	50 %	0 %	50 %	0 %	549706765
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45191	NC_022535	GCG	2	6	2280620	2280625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706765
45192	NC_022535	GCC	2	6	2280638	2280643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706765
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45195	NC_022535	TCCCG	2	10	2280698	2280707	0 %	20 %	20 %	60 %	549706765
45196	NC_022535	GGC	2	6	2280721	2280726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706765
45197	NC_022535	GCC	2	6	2280764	2280769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706765
45198	NC_022535	CAT	2	6	2280808	2280813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706765
45199	NC_022535	CAT	2	6	2280865	2280870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706765
45200	NC_022535	CATG	2	8	2280931	2280938	25 %	25 %	25 %	25 %	549706765
45201	NC_022535	CGT	2	6	2281211	2281216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706766
45202	NC_022535	GC	3	6	2281287	2281292	0 %	0 %	50 %	50 %	549706766
45203	NC_022535	ATC	3	9	2281318	2281326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706766
45204	NC_022535	GAAA	2	8	2281355	2281362	75 %	0 %	25 %	0 %	549706766
45205	NC_022535	ATG	2	6	2281394	2281399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706766
45206	NC_022535	CGC	2	6	2281400	2281405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706766
45207	NC_022535	CTC	2	6	2281441	2281446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706766
45208	NC_022535	CTG	2	6	2281564	2281569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706766
45209	NC_022535	GC	3	6	2281586	2281591	0 %	0 %	50 %	50 %	549706766
45210	NC_022535	CGG	2	6	2281630	2281635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706766
45211	NC_022535	A	6	6	2281664	2281669	100 %	0 %	0 %	0 %	549706766
45212	NC_022535	TTC	2	6	2281673	2281678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706766
45213	NC_022535	CGCC	2	8	2281707	2281714	0 %	0 %	25 %	75 %	549706766
45214	NC_022535	GC	3	6	2281723	2281728	0 %	0 %	50 %	50 %	549706766
45215	NC_022535	GTG	2	6	2281862	2281867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706766
45216	NC_022535	TTC	2	6	2281945	2281950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706766
45217	NC_022535	TGATC	2	10	2282115	2282124	20 %	40 %	20 %	20 %	549706767
45218	NC_022535	GCA	2	6	2282151	2282156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706767
45219	NC_022535	TGA	2	6	2282190	2282195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706767
45220	NC_022535	CCA	2	6	2282205	2282210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706767
45221	NC_022535	TCA	2	6	2282310	2282315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706767
45222	NC_022535	GCC	2	6	2282345	2282350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706767
45223	NC_022535	GGT	2	6	2282356	2282361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706767
45224	NC_022535	GTC	2	6	2282402	2282407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706767
45225	NC_022535	CCG	2	6	2282422	2282427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706767
45226	NC_022535	GCG	2	6	2282454	2282459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706767
45227	NC_022535	GAT	2	6	2282482	2282487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706767
45228	NC_022535	GCAT	2	8	2282813	2282820	25 %	25 %	25 %	25 %	549706768
45229	NC_022535	AGGG	2	8	2282884	2282891	25 %	0 %	75 %	0 %	549706768
45230	NC_022535	CGA	2	6	2282919	2282924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706768
45231	NC_022535	A	6	6	2282936	2282941	100 %	0 %	0 %	0 %	549706768
45232	NC_022535	GCG	2	6	2282966	2282971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706768
45233	NC_022535	GTC	2	6	2283033	2283038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706768
45234	NC_022535	TCA	2	6	2283068	2283073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706768
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45236	NC_022535	ATC	2	6	2283136	2283141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706768
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45238	NC_022535	GC	3	6	2283174	2283179	0 %	0 %	50 %	50 %	549706768
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45331	NC_022535	GCTG	2	8	2287209	2287216	0 %	25 %	50 %	25 %	549706770
45332	NC_022535	GGA	2	6	2287222	2287227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706770
45333	NC_022535	TGG	2	6	2287232	2287237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706770
45334	NC_022535	GGC	2	6	2287248	2287253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706770
45335	NC_022535	CCA	2	6	2287353	2287358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706770
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45338	NC_022535	GAGG	2	8	2287530	2287537	25 %	0 %	75 %	0 %	549706770
45339	NC_022535	CCTC	2	8	2287737	2287744	0 %	25 %	0 %	75 %	549706771
45340	NC_022535	CG	3	6	2287812	2287817	0 %	0 %	50 %	50 %	549706771
45341	NC_022535	CGG	3	9	2287867	2287875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
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45343	NC_022535	TGC	2	6	2287914	2287919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706771
45344	NC_022535	TGC	2	6	2287976	2287981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706771
45345	NC_022535	GGCG	2	8	2287982	2287989	0 %	0 %	75 %	25 %	549706771
45346	NC_022535	CGG	2	6	2288016	2288021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
45347	NC_022535	GCC	2	6	2288027	2288032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
45348	NC_022535	AGGCA	2	10	2288040	2288049	40 %	0 %	40 %	20 %	549706771
45349	NC_022535	AGC	3	9	2288064	2288072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706771
45350	NC_022535	CCG	2	6	2288073	2288078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
45351	NC_022535	GCTG	2	8	2288113	2288120	0 %	25 %	50 %	25 %	549706771
45352	NC_022535	GCT	2	6	2288131	2288136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706771
45353	NC_022535	CTGACC	2	12	2288141	2288152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549706771
45354	NC_022535	GCG	2	6	2288198	2288203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
45355	NC_022535	TTCG	2	8	2288231	2288238	0 %	50 %	25 %	25 %	549706771
45356	NC_022535	AGG	2	6	2288307	2288312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706771
45357	NC_022535	GCC	2	6	2288404	2288409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
45358	NC_022535	CGG	2	6	2288440	2288445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
45359	NC_022535	GCG	2	6	2288448	2288453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706771
45360	NC_022535	CCG	2	6	2288469	2288474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
45361	NC_022535	CGC	2	6	2288531	2288536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706771
45362	NC_022535	CT	3	6	2288626	2288631	0 %	50 %	0 %	50 %	549706772
45363	NC_022535	CG	3	6	2288661	2288666	0 %	0 %	50 %	50 %	549706772
45364	NC_022535	CG	3	6	2288679	2288684	0 %	0 %	50 %	50 %	549706772
45365	NC_022535	GCC	2	6	2288867	2288872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706773
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45367	NC_022535	GAG	2	6	2288954	2288959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706773
45368	NC_022535	AGG	2	6	2289063	2289068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706773
45369	NC_022535	CTG	2	6	2289296	2289301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706773
45370	NC_022535	TGC	2	6	2289321	2289326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706773
45371	NC_022535	CGG	2	6	2289349	2289354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706773
45372	NC_022535	CTG	2	6	2289374	2289379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706773
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45374	NC_022535	GCC	2	6	2289474	2289479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706773
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45459	NC_022535	CAT	2	6	2293685	2293690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706778
45460	NC_022535	CGG	2	6	2293715	2293720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706778
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45463	NC_022535	CTGC	2	8	2293982	2293989	0 %	25 %	25 %	50 %	549706778
45464	NC_022535	GC	3	6	2294015	2294020	0 %	0 %	50 %	50 %	549706778
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