MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_022535	CGG	3	9	2220900	2220908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706704
44002	NC_022535	ACG	2	6	2220998	2221003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706705
44003	NC_022535	CGA	2	6	2221062	2221067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706705
44004	NC_022535	AGA	2	6	2221118	2221123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706705
44005	NC_022535	CCCGC	2	10	2221176	2221185	0 %	0 %	20 %	80 %	549706705
44006	NC_022535	TCC	2	6	2221235	2221240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706705
44007	NC_022535	CGA	2	6	2221269	2221274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706705
44008	NC_022535	CGA	2	6	2221284	2221289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706705
44009	NC_022535	GCG	2	6	2221377	2221382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706705
44010	NC_022535	CGC	2	6	2221446	2221451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706705
44011	NC_022535	CGCGG	2	10	2221513	2221522	0 %	0 %	60 %	40 %	549706705
44012	NC_022535	CGC	2	6	2221531	2221536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706705
44013	NC_022535	CAT	2	6	2221548	2221553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706705
44014	NC_022535	AG	3	6	2221657	2221662	50 %	0 %	50 %	0 %	549706706
44015	NC_022535	GGC	2	6	2221699	2221704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706706
44016	NC_022535	TGA	2	6	2221764	2221769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706707
44017	NC_022535	ATC	2	6	2221799	2221804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706707
44018	NC_022535	GCG	2	6	2221835	2221840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706707
44019	NC_022535	CG	3	6	2221844	2221849	0 %	0 %	50 %	50 %	549706707
44020	NC_022535	GGT	2	6	2221882	2221887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706707
44021	NC_022535	CGG	2	6	2221915	2221920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706707
44022	NC_022535	TCG	2	6	2221932	2221937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706707
44023	NC_022535	CAC	2	6	2221969	2221974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706707
44024	NC_022535	GCC	2	6	2222079	2222084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706707
44025	NC_022535	TCA	2	6	2222097	2222102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706707
44026	NC_022535	CGCA	2	8	2222159	2222166	25 %	0 %	25 %	50 %	549706707
44027	NC_022535	GCT	2	6	2222173	2222178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706707
44028	NC_022535	GGCC	2	8	2222209	2222216	0 %	0 %	50 %	50 %	549706707
44029	NC_022535	AGG	2	6	2222274	2222279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706707
44030	NC_022535	CTG	2	6	2222318	2222323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706707
44031	NC_022535	GCC	2	6	2222351	2222356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706707
44032	NC_022535	ATG	2	6	2222429	2222434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706707
44033	NC_022535	GGT	2	6	2222476	2222481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706707
44034	NC_022535	CCGC	2	8	2222508	2222515	0 %	0 %	25 %	75 %	549706707
44035	NC_022535	CAA	2	6	2222527	2222532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706707
44036	NC_022535	CG	3	6	2222568	2222573	0 %	0 %	50 %	50 %	549706707
44037	NC_022535	CGTGCG	2	12	2222600	2222611	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549706707
44038	NC_022535	AGGC	2	8	2222620	2222627	25 %	0 %	50 %	25 %	549706707
44039	NC_022535	GAA	2	6	2222758	2222763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706707
44040	NC_022535	CATC	2	8	2222797	2222804	25 %	25 %	0 %	50 %	549706708
44041	NC_022535	GC	6	12	2222844	2222855	0 %	0 %	50 %	50 %	549706708
44042	NC_022535	GC	3	6	2222858	2222863	0 %	0 %	50 %	50 %	549706708
44043	NC_022535	GCC	2	6	2222932	2222937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706708
44044	NC_022535	TC	3	6	2222996	2223001	0 %	50 %	0 %	50 %	549706708
44045	NC_022535	GGC	2	6	2223013	2223018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706708
44046	NC_022535	CCGC	2	8	2223022	2223029	0 %	0 %	25 %	75 %	549706708
44047	NC_022535	GAT	2	6	2223107	2223112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706708
44048	NC_022535	GCTGGC	2	12	2223167	2223178	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549706708
44049	NC_022535	CG	3	6	2223188	2223193	0 %	0 %	50 %	50 %	549706708
44050	NC_022535	GCC	2	6	2223249	2223254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706708
44051	NC_022535	CATG	2	8	2223275	2223282	25 %	25 %	25 %	25 %	549706708
44052	NC_022535	CGC	2	6	2223283	2223288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706708
44053	NC_022535	GCGA	2	8	2223327	2223334	25 %	0 %	50 %	25 %	549706708
44054	NC_022535	GAT	2	6	2223360	2223365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706708
44055	NC_022535	CGG	2	6	2223402	2223407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706708
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44059	NC_022535	GGCTG	2	10	2223595	2223604	0 %	20 %	60 %	20 %	549706708
44060	NC_022535	CACCG	2	10	2223618	2223627	20 %	0 %	20 %	60 %	549706708
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44062	NC_022535	GC	3	6	2223676	2223681	0 %	0 %	50 %	50 %	549706708
44063	NC_022535	GCC	2	6	2223709	2223714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706708
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44066	NC_022535	CTG	2	6	2223791	2223796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706709
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44103	NC_022535	GC	3	6	2225410	2225415	0 %	0 %	50 %	50 %	549706709
44104	NC_022535	C	6	6	2225447	2225452	0 %	0 %	0 %	100 %	549706709
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44106	NC_022535	GC	4	8	2225515	2225522	0 %	0 %	50 %	50 %	549706709
44107	NC_022535	GCC	2	6	2225534	2225539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706709
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44117	NC_022535	CTCG	2	8	2226088	2226095	0 %	25 %	25 %	50 %	549706709
44118	NC_022535	CCG	2	6	2226158	2226163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706709
44119	NC_022535	GGA	2	6	2226178	2226183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706709
44120	NC_022535	CGC	2	6	2226243	2226248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706709
44121	NC_022535	GCC	2	6	2226272	2226277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706709
44122	NC_022535	ACC	2	6	2226281	2226286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706709
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44124	NC_022535	CAT	2	6	2226445	2226450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706709
44125	NC_022535	TGACA	2	10	2226524	2226533	40 %	20 %	20 %	20 %	549706709
44126	NC_022535	GCA	2	6	2226585	2226590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706710
44127	NC_022535	TCCTT	2	10	2226595	2226604	0 %	60 %	0 %	40 %	549706710
44128	NC_022535	GCG	2	6	2226619	2226624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706710
44129	NC_022535	GCTCGC	2	12	2226647	2226658	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549706710
44130	NC_022535	GCC	2	6	2226669	2226674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706710
44131	NC_022535	AGG	2	6	2226697	2226702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549706710
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44135	NC_022535	GTGG	2	8	2226942	2226949	0 %	25 %	75 %	0 %	549706710
44136	NC_022535	TGCCC	2	10	2226992	2227001	0 %	20 %	20 %	60 %	549706710
44137	NC_022535	CG	3	6	2227026	2227031	0 %	0 %	50 %	50 %	549706710
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44141	NC_022535	CGG	2	6	2227271	2227276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706710
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44190	NC_022535	GCG	2	6	2229397	2229402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706712
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44201	NC_022535	CCG	2	6	2229821	2229826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706712
44202	NC_022535	TAT	2	6	2229950	2229955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549706712
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44204	NC_022535	CG	4	8	2229993	2230000	0 %	0 %	50 %	50 %	549706712
44205	NC_022535	CAT	2	6	2230017	2230022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706712
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44213	NC_022535	CGTC	2	8	2230440	2230447	0 %	25 %	25 %	50 %	549706713
44214	NC_022535	TCG	2	6	2230533	2230538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706713
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44217	NC_022535	GCA	2	6	2230715	2230720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706713
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44219	NC_022535	AAAG	2	8	2230754	2230761	75 %	0 %	25 %	0 %	549706713
44220	NC_022535	TCT	2	6	2230905	2230910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706713
44221	NC_022535	TCC	2	6	2230935	2230940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706713
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44225	NC_022535	CGC	2	6	2231239	2231244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706714
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44229	NC_022535	CAG	2	6	2231332	2231337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706714
44230	NC_022535	AG	3	6	2231421	2231426	50 %	0 %	50 %	0 %	549706714
44231	NC_022535	ATG	2	6	2231456	2231461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706714
44232	NC_022535	GGC	2	6	2231470	2231475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706714
44233	NC_022535	ATC	2	6	2231477	2231482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706714
44234	NC_022535	CCG	2	6	2231486	2231491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706714
44235	NC_022535	AAGC	2	8	2231493	2231500	50 %	0 %	25 %	25 %	549706714
44236	NC_022535	GCAG	2	8	2231529	2231536	25 %	0 %	50 %	25 %	549706714
44237	NC_022535	CCA	2	6	2231616	2231621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549706714
44238	NC_022535	GGAAAC	2	12	2231704	2231715	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549706714
44239	NC_022535	ATG	2	6	2231738	2231743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706714
44240	NC_022535	GAC	2	6	2231857	2231862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706714
44241	NC_022535	TCC	2	6	2231873	2231878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549706714
44242	NC_022535	GACC	2	8	2231879	2231886	25 %	0 %	25 %	50 %	549706714
44243	NC_022535	GCG	2	6	2231904	2231909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706714
44244	NC_022535	AAGGCC	2	12	2231929	2231940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706714
44245	NC_022535	AT	3	6	2231972	2231977	50 %	50 %	0 %	0 %	549706714
44246	NC_022535	CAT	2	6	2232109	2232114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706714
44247	NC_022535	GCC	2	6	2232136	2232141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706714
44248	NC_022535	CGG	2	6	2232144	2232149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706714
44249	NC_022535	GCA	2	6	2232290	2232295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706714
44250	NC_022535	CCG	2	6	2232414	2232419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706714
44251	NC_022535	CG	3	6	2232472	2232477	0 %	0 %	50 %	50 %	549706714
44252	NC_022535	CAT	2	6	2232486	2232491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706714
44253	NC_022535	GAATT	2	10	2232568	2232577	40 %	40 %	20 %	0 %	549706715
44254	NC_022535	GGAG	2	8	2232582	2232589	25 %	0 %	75 %	0 %	549706715
44255	NC_022535	GTT	2	6	2232594	2232599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706715
44256	NC_022535	GAA	2	6	2232616	2232621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706715
44257	NC_022535	GC	3	6	2232671	2232676	0 %	0 %	50 %	50 %	549706715
44258	NC_022535	CGGC	2	8	2232897	2232904	0 %	0 %	50 %	50 %	549706716
44259	NC_022535	GCC	2	6	2233106	2233111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706716
44260	NC_022535	CAT	2	6	2233248	2233253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706716
44261	NC_022535	TGC	2	6	2233306	2233311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706716
44262	NC_022535	GCCG	2	8	2233323	2233330	0 %	0 %	50 %	50 %	549706716
44263	NC_022535	CTT	2	6	2233341	2233346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706716
44264	NC_022535	TGA	2	6	2233350	2233355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706716
44265	NC_022535	GAT	2	6	2233360	2233365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706716
44266	NC_022535	CGT	2	6	2233368	2233373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706716
44267	NC_022535	AGCGTC	2	12	2233486	2233497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549706717
44268	NC_022535	TCG	2	6	2233593	2233598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706717
44269	NC_022535	GCA	2	6	2233617	2233622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706717
44270	NC_022535	GCC	2	6	2233682	2233687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706717
44271	NC_022535	TGG	2	6	2233722	2233727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706718
44272	NC_022535	AGCGC	2	10	2233782	2233791	20 %	0 %	40 %	40 %	549706718
44273	NC_022535	CGG	2	6	2233815	2233820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706718
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44297	NC_022535	CG	3	6	2235121	2235126	0 %	0 %	50 %	50 %	549706719
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44300	NC_022535	GCC	2	6	2235187	2235192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706719
44301	NC_022535	TTG	2	6	2235237	2235242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706719
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44303	NC_022535	GCT	2	6	2235423	2235428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706720
44304	NC_022535	ATC	2	6	2235455	2235460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706720
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44307	NC_022535	GGTG	2	8	2235534	2235541	0 %	25 %	75 %	0 %	549706720
44308	NC_022535	CGT	2	6	2235558	2235563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706720
44309	NC_022535	ACG	2	6	2235575	2235580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706720
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44312	NC_022535	GAC	3	9	2235661	2235669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706720
44313	NC_022535	TGCGCG	2	12	2235689	2235700	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549706720
44314	NC_022535	GCT	2	6	2235719	2235724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706720
44315	NC_022535	GC	4	8	2235781	2235788	0 %	0 %	50 %	50 %	549706720
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44317	NC_022535	CGT	2	6	2235834	2235839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706720
44318	NC_022535	GAT	2	6	2235840	2235845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706720
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44320	NC_022535	GCC	2	6	2235868	2235873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706720
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44331	NC_022535	TGC	2	6	2236595	2236600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706721
44332	NC_022535	AAT	2	6	2236614	2236619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549706721
44333	NC_022535	GA	3	6	2236628	2236633	50 %	0 %	50 %	0 %	549706721
44334	NC_022535	TGA	2	6	2236662	2236667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706721
44335	NC_022535	TCACC	2	10	2236707	2236716	20 %	20 %	0 %	60 %	549706721
44336	NC_022535	CGG	2	6	2236731	2236736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706721
44337	NC_022535	GCCG	2	8	2236762	2236769	0 %	0 %	50 %	50 %	549706721
44338	NC_022535	GTG	2	6	2236777	2236782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549706721
44339	NC_022535	CGA	2	6	2236785	2236790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706721
44340	NC_022535	GC	3	6	2236798	2236803	0 %	0 %	50 %	50 %	549706721
44341	NC_022535	CTG	2	6	2236945	2236950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549706721
44342	NC_022535	GAT	2	6	2236996	2237001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706721
44343	NC_022535	GATC	2	8	2237031	2237038	25 %	25 %	25 %	25 %	549706721
44344	NC_022535	GAT	2	6	2237064	2237069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706721
44345	NC_022535	TTG	2	6	2237096	2237101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706721
44346	NC_022535	CGACAT	2	12	2237277	2237288	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549706721
44347	NC_022535	CGC	2	6	2237362	2237367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706721
44348	NC_022535	GAT	2	6	2237404	2237409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706721
44349	NC_022535	TTG	2	6	2237513	2237518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549706721
44350	NC_022535	CGA	2	6	2237541	2237546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706721
44351	NC_022535	GCC	3	9	2237620	2237628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706721
44352	NC_022535	GCC	2	6	2237636	2237641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706721
44353	NC_022535	ATC	2	6	2237651	2237656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706721
44354	NC_022535	GAT	2	6	2237749	2237754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706721
44355	NC_022535	GGC	2	6	2237805	2237810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706721
44356	NC_022535	CGAAAT	2	12	2237874	2237885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549706721
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44359	NC_022535	GAC	2	6	2238574	2238579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706722
44360	NC_022535	CAT	2	6	2238669	2238674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549706722
44361	NC_022535	TTC	2	6	2238691	2238696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549706722
44362	NC_022535	ATG	2	6	2238716	2238721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706723
44363	NC_022535	CT	3	6	2238723	2238728	0 %	50 %	0 %	50 %	549706723
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44370	NC_022535	TGA	2	6	2239102	2239107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706724
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44375	NC_022535	CGC	2	6	2239349	2239354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549706724
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44422	NC_022535	GAA	2	6	2241881	2241886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706726
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44443	NC_022535	A	7	7	2242559	2242565	100 %	0 %	0 %	0 %	549706727
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44451	NC_022535	CT	3	6	2243024	2243029	0 %	50 %	0 %	50 %	549706728
44452	NC_022535	AGAC	2	8	2243070	2243077	50 %	0 %	25 %	25 %	549706728
44453	NC_022535	A	6	6	2243114	2243119	100 %	0 %	0 %	0 %	549706728
44454	NC_022535	AAG	2	6	2243141	2243146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706728
44455	NC_022535	TGCA	2	8	2243150	2243157	25 %	25 %	25 %	25 %	549706728
44456	NC_022535	GAA	2	6	2243185	2243190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549706728
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44458	NC_022535	ATG	2	6	2243216	2243221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706728
44459	NC_022535	AAC	2	6	2243226	2243231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549706728
44460	NC_022535	CGA	2	6	2243319	2243324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706729
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44464	NC_022535	TGA	2	6	2243457	2243462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549706729
44465	NC_022535	CG	3	6	2243499	2243504	0 %	0 %	50 %	50 %	549706729
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44467	NC_022535	GCA	2	6	2243523	2243528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549706729
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44491	NC_022535	GGC	2	6	2244522	2244527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549706730
44492	NC_022535	GC	3	6	2244544	2244549	0 %	0 %	50 %	50 %	549706730
44493	NC_022535	GC	3	6	2244658	2244663	0 %	0 %	50 %	50 %	549706730
44494	NC_022535	CTCG	2	8	2244683	2244690	0 %	25 %	25 %	50 %	549706730
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44500	NC_022535	CGCAG	2	10	2245053	2245062	20 %	0 %	40 %	40 %	549706731

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