MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022535	CGG	2	6	579112	579117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704986
11502	NC_022535	GGC	2	6	579143	579148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704986
11503	NC_022535	CCGTCG	2	12	579187	579198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549704986
11504	NC_022535	CAT	2	6	579466	579471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704987
11505	NC_022535	TC	3	6	579482	579487	0 %	50 %	0 %	50 %	549704987
11506	NC_022535	CAC	2	6	579505	579510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704987
11507	NC_022535	GCA	2	6	579521	579526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704987
11508	NC_022535	GTC	2	6	579551	579556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704987
11509	NC_022535	CGA	2	6	579583	579588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704987
11510	NC_022535	GTC	2	6	579629	579634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704987
11511	NC_022535	GCT	2	6	579673	579678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704987
11512	NC_022535	ATG	2	6	579696	579701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704987
11513	NC_022535	TCG	2	6	579702	579707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704987
11514	NC_022535	CGCC	2	8	579727	579734	0 %	0 %	25 %	75 %	549704987
11515	NC_022535	CAC	2	6	579868	579873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704987
11516	NC_022535	CCG	2	6	580065	580070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704987
11517	NC_022535	GGCG	2	8	580078	580085	0 %	0 %	75 %	25 %	549704987
11518	NC_022535	CTC	2	6	580129	580134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704987
11519	NC_022535	TCC	2	6	580197	580202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704987
11520	NC_022535	GAAG	2	8	580261	580268	50 %	0 %	50 %	0 %	549704987
11521	NC_022535	CGG	2	6	580302	580307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704987
11522	NC_022535	GAA	2	6	580322	580327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704987
11523	NC_022535	TCA	2	6	580338	580343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704987
11524	NC_022535	GATG	2	8	580426	580433	25 %	25 %	50 %	0 %	549704987
11525	NC_022535	GAA	2	6	580480	580485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704987
11526	NC_022535	TCG	2	6	580808	580813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704988
11527	NC_022535	CAA	2	6	580818	580823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704988
11528	NC_022535	TTC	2	6	580852	580857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704988
11529	NC_022535	GCT	2	6	580860	580865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704988
11530	NC_022535	GCTG	2	8	580905	580912	0 %	25 %	50 %	25 %	549704988
11531	NC_022535	GAG	2	6	580918	580923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704988
11532	NC_022535	CCGA	2	8	580924	580931	25 %	0 %	25 %	50 %	549704988
11533	NC_022535	CTG	2	6	580942	580947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704988
11534	NC_022535	GCC	2	6	580971	580976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704988
11535	NC_022535	ATG	2	6	580996	581001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704988
11536	NC_022535	TCG	2	6	581090	581095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704988
11537	NC_022535	TGC	2	6	581111	581116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704988
11538	NC_022535	CGG	2	6	581166	581171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704988
11539	NC_022535	GCAGCG	2	12	581172	581183	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549704988
11540	NC_022535	GC	3	6	581246	581251	0 %	0 %	50 %	50 %	549704988
11541	NC_022535	AAG	2	6	581257	581262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704988
11542	NC_022535	CGCC	2	8	581411	581418	0 %	0 %	25 %	75 %	549704988
11543	NC_022535	AT	3	6	581422	581427	50 %	50 %	0 %	0 %	549704988
11544	NC_022535	GTC	2	6	581491	581496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704988
11545	NC_022535	GCT	2	6	581581	581586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704988
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11547	NC_022535	CGC	2	6	581754	581759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704988
11548	NC_022535	GAGG	2	8	581858	581865	25 %	0 %	75 %	0 %	549704988
11549	NC_022535	CAC	2	6	581879	581884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704989
11550	NC_022535	GCTG	2	8	581911	581918	0 %	25 %	50 %	25 %	549704989
11551	NC_022535	GTC	2	6	581919	581924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704989
11552	NC_022535	GCT	3	9	581942	581950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704989
11553	NC_022535	T	6	6	581952	581957	0 %	100 %	0 %	0 %	549704989
11554	NC_022535	TCA	2	6	581971	581976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704989
11555	NC_022535	GCC	2	6	582014	582019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704989
11556	NC_022535	CTAT	2	8	582125	582132	25 %	50 %	0 %	25 %	549704989
11557	NC_022535	CGT	2	6	582133	582138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704989
11558	NC_022535	CG	3	6	582207	582212	0 %	0 %	50 %	50 %	549704989
11559	NC_022535	CTG	2	6	582318	582323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704989
11560	NC_022535	CAG	2	6	582363	582368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704989
11561	NC_022535	GCT	2	6	582476	582481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704989
11562	NC_022535	GCC	2	6	582489	582494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704989
11563	NC_022535	GAT	2	6	582572	582577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704989
11564	NC_022535	CGG	2	6	582623	582628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704989
11565	NC_022535	TGA	2	6	582640	582645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704989
11566	NC_022535	TTC	2	6	582669	582674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704989
11567	NC_022535	TGC	2	6	582712	582717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704989
11568	NC_022535	CTG	2	6	582720	582725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704989
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11587	NC_022535	GAT	5	15	583967	583981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704991
11588	NC_022535	CGG	2	6	583990	583995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704991
11589	NC_022535	CAG	2	6	584066	584071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704991
11590	NC_022535	CGC	2	6	584129	584134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704991
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11599	NC_022535	GCCGC	3	15	584676	584690	0 %	0 %	40 %	60 %	549704991
11600	NC_022535	GCGTT	2	10	584769	584778	0 %	40 %	40 %	20 %	549704991
11601	NC_022535	GC	3	6	584791	584796	0 %	0 %	50 %	50 %	549704991
11602	NC_022535	CGA	2	6	584797	584802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704991
11603	NC_022535	TGA	2	6	584803	584808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704991
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11608	NC_022535	GA	3	6	585078	585083	50 %	0 %	50 %	0 %	549704991
11609	NC_022535	ACCGC	2	10	585120	585129	20 %	0 %	20 %	60 %	549704991
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11974	NC_022535	GCGG	2	8	602324	602331	0 %	0 %	75 %	25 %	549705003
11975	NC_022535	TGT	2	6	602410	602415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549705003
11976	NC_022535	CCT	2	6	602431	602436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549705003
11977	NC_022535	CG	4	8	602453	602460	0 %	0 %	50 %	50 %	549705003
11978	NC_022535	TCCTTG	2	12	602544	602555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549705003
11979	NC_022535	CACG	2	8	602569	602576	25 %	0 %	25 %	50 %	549705003
11980	NC_022535	ATC	2	6	602667	602672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549705003
11981	NC_022535	CTT	2	6	602717	602722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549705003
11982	NC_022535	GCG	2	6	602892	602897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705003
11983	NC_022535	AGA	2	6	602916	602921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549705003
11984	NC_022535	CGC	2	6	602937	602942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705003
11985	NC_022535	CCTTTG	2	12	602952	602963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549705003
11986	NC_022535	TATCG	2	10	603252	603261	20 %	40 %	20 %	20 %	549705004
11987	NC_022535	TCG	2	6	603310	603315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705004
11988	NC_022535	GC	3	6	603352	603357	0 %	0 %	50 %	50 %	549705004
11989	NC_022535	TCG	2	6	603421	603426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705004
11990	NC_022535	GCC	2	6	603456	603461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549705004
11991	NC_022535	CGA	2	6	603554	603559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705004
11992	NC_022535	CGG	2	6	603578	603583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705004
11993	NC_022535	GGC	2	6	603693	603698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549705004
11994	NC_022535	GA	3	6	603723	603728	50 %	0 %	50 %	0 %	549705004
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11996	NC_022535	CGA	2	6	603776	603781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549705004
11997	NC_022535	GTGC	2	8	603808	603815	0 %	25 %	50 %	25 %	549705004
11998	NC_022535	CCA	2	6	603848	603853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549705004
11999	NC_022535	CGT	2	6	603854	603859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549705004
12000	NC_022535	TGG	2	6	603896	603901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549705004

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