MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022535	CGAGGC	2	12	553978	553989	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549704966
11002	NC_022535	GCA	2	6	554038	554043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11003	NC_022535	AGC	2	6	554049	554054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11004	NC_022535	CGTGA	2	10	554060	554069	20 %	20 %	40 %	20 %	549704966
11005	NC_022535	ACA	2	6	554095	554100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704966
11006	NC_022535	GGC	3	9	554122	554130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704966
11007	NC_022535	GCC	3	9	554219	554227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704966
11008	NC_022535	CGC	2	6	554284	554289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704966
11009	NC_022535	GCT	2	6	554321	554326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11010	NC_022535	GC	3	6	554356	554361	0 %	0 %	50 %	50 %	549704966
11011	NC_022535	GCGA	2	8	554510	554517	25 %	0 %	50 %	25 %	549704966
11012	NC_022535	CGC	2	6	554519	554524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704966
11013	NC_022535	TC	3	6	554527	554532	0 %	50 %	0 %	50 %	549704966
11014	NC_022535	CTG	2	6	554535	554540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11015	NC_022535	GCC	2	6	554612	554617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704966
11016	NC_022535	ATG	2	6	554618	554623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704966
11017	NC_022535	GCGG	2	8	554624	554631	0 %	0 %	75 %	25 %	549704966
11018	NC_022535	CGG	3	9	554629	554637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704966
11019	NC_022535	TCT	2	6	554665	554670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704966
11020	NC_022535	TCG	2	6	554677	554682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11021	NC_022535	GAG	2	6	554744	554749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704966
11022	NC_022535	CGGC	2	8	554826	554833	0 %	0 %	50 %	50 %	549704966
11023	NC_022535	ACG	2	6	554847	554852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11024	NC_022535	ATT	2	6	554868	554873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704966
11025	NC_022535	CGG	2	6	554875	554880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704966
11026	NC_022535	ACG	2	6	554889	554894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11027	NC_022535	CGA	2	6	554911	554916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11028	NC_022535	GCC	2	6	554983	554988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704966
11029	NC_022535	GCT	2	6	554989	554994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11030	NC_022535	GGA	2	6	555040	555045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704966
11031	NC_022535	TCG	2	6	555090	555095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704966
11032	NC_022535	ACC	2	6	555105	555110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704966
11033	NC_022535	AAG	2	6	555111	555116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704966
11034	NC_022535	GAAGGC	2	12	555234	555245	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549704967
11035	NC_022535	GTC	2	6	555322	555327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704967
11036	NC_022535	TCG	2	6	555329	555334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704967
11037	NC_022535	GCCA	2	8	555346	555353	25 %	0 %	25 %	50 %	549704967
11038	NC_022535	TCCA	2	8	555403	555410	25 %	25 %	0 %	50 %	549704967
11039	NC_022535	GGA	2	6	555423	555428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704967
11040	NC_022535	CA	3	6	555432	555437	50 %	0 %	0 %	50 %	549704967
11041	NC_022535	CCT	2	6	555444	555449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704967
11042	NC_022535	TCCA	2	8	555481	555488	25 %	25 %	0 %	50 %	549704967
11043	NC_022535	GCTGCC	2	12	555504	555515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549704967
11044	NC_022535	ATC	2	6	555538	555543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704967
11045	NC_022535	GAC	2	6	555682	555687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704967
11046	NC_022535	CGG	2	6	555824	555829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704967
11047	NC_022535	TGG	2	6	555836	555841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704967
11048	NC_022535	CGG	2	6	555842	555847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704967
11049	NC_022535	CG	3	6	555853	555858	0 %	0 %	50 %	50 %	549704967
11050	NC_022535	TGG	2	6	555959	555964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704967
11051	NC_022535	ATG	2	6	555977	555982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704967
11052	NC_022535	AAGC	2	8	555983	555990	50 %	0 %	25 %	25 %	549704967
11053	NC_022535	GGT	2	6	556021	556026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704967
11054	NC_022535	CGC	2	6	556071	556076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704967
11055	NC_022535	GGC	2	6	556095	556100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704967
11056	NC_022535	CGGC	2	8	556123	556130	0 %	0 %	50 %	50 %	549704968
11057	NC_022535	ACC	2	6	556164	556169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704968
11058	NC_022535	CGA	2	6	556265	556270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11059	NC_022535	GTG	3	9	556275	556283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704968
11060	NC_022535	GCA	2	6	556318	556323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11061	NC_022535	CGT	2	6	556324	556329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11062	NC_022535	GAGC	2	8	556379	556386	25 %	0 %	50 %	25 %	549704968
11063	NC_022535	CGGT	2	8	556429	556436	0 %	25 %	50 %	25 %	549704968
11064	NC_022535	TCG	2	6	556482	556487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11065	NC_022535	TGC	2	6	556492	556497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11066	NC_022535	TTGC	2	8	556509	556516	0 %	50 %	25 %	25 %	549704968
11067	NC_022535	GCC	2	6	556536	556541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704968
11068	NC_022535	CAG	2	6	556601	556606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11069	NC_022535	TCC	3	9	556692	556700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704968
11070	NC_022535	CAT	2	6	556748	556753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704968
11071	NC_022535	TTC	2	6	556773	556778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704968
11072	NC_022535	GCG	2	6	556815	556820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704968
11073	NC_022535	ATG	2	6	556863	556868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704968
11074	NC_022535	TCT	2	6	557032	557037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704968
11075	NC_022535	CGG	2	6	557055	557060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704968
11076	NC_022535	CTG	2	6	557100	557105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11077	NC_022535	GTC	2	6	557109	557114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11078	NC_022535	CAG	2	6	557126	557131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704968
11079	NC_022535	TGTC	2	8	557155	557162	0 %	50 %	25 %	25 %	549704968
11080	NC_022535	GCT	2	6	557454	557459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704969
11081	NC_022535	TGC	2	6	557467	557472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704969
11082	NC_022535	GCC	2	6	557490	557495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704969
11083	NC_022535	GGC	2	6	557558	557563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704969
11084	NC_022535	CGTGG	2	10	557605	557614	0 %	20 %	60 %	20 %	549704969
11085	NC_022535	TCG	2	6	557688	557693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704969
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11087	NC_022535	CGC	2	6	557737	557742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704969
11088	NC_022535	CGC	2	6	557786	557791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704969
11089	NC_022535	CGA	2	6	557816	557821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704969
11090	NC_022535	CAA	2	6	557900	557905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704969
11091	NC_022535	GGC	2	6	558045	558050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704969
11092	NC_022535	GGT	2	6	558078	558083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704969
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11094	NC_022535	GAC	2	6	558161	558166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704969
11095	NC_022535	GGC	2	6	558252	558257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704969
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11100	NC_022535	CGA	2	6	558643	558648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704969
11101	NC_022535	CGGCGC	2	12	558689	558700	0 %	0 %	50 %	50 %	549704969
11102	NC_022535	TCG	2	6	558724	558729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704969
11103	NC_022535	CGC	2	6	558752	558757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704969
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11105	NC_022535	TGC	2	6	558953	558958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704970
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11108	NC_022535	TCG	2	6	559168	559173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704970
11109	NC_022535	CAA	2	6	559229	559234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704970
11110	NC_022535	CGT	2	6	559250	559255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704970
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11112	NC_022535	CTT	2	6	559271	559276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704970
11113	NC_022535	TGG	2	6	559311	559316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704970
11114	NC_022535	TCG	2	6	559363	559368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704970
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11116	NC_022535	CTG	2	6	559431	559436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704970
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11118	NC_022535	GGT	2	6	559458	559463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704970
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11120	NC_022535	TTC	2	6	559503	559508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704970
11121	NC_022535	CT	3	6	559557	559562	0 %	50 %	0 %	50 %	549704970
11122	NC_022535	GGC	2	6	559598	559603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704970
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11147	NC_022535	CTTC	2	8	560822	560829	0 %	50 %	0 %	50 %	549704971
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11155	NC_022535	CA	3	6	561094	561099	50 %	0 %	0 %	50 %	549704972
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11223	NC_022535	GCAG	2	8	564804	564811	25 %	0 %	50 %	25 %	549704975
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11232	NC_022535	CG	3	6	565309	565314	0 %	0 %	50 %	50 %	549704975
11233	NC_022535	CGA	2	6	565357	565362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704975
11234	NC_022535	CGCTT	2	10	565417	565426	0 %	40 %	20 %	40 %	549704975
11235	NC_022535	GAT	2	6	565430	565435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704975
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11476	NC_022535	CCG	2	6	577185	577190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704985
11477	NC_022535	CGG	3	9	577567	577575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704985
11478	NC_022535	CG	3	6	577930	577935	0 %	0 %	50 %	50 %	549704986
11479	NC_022535	ATCTCA	2	12	578008	578019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704986
11480	NC_022535	GCT	2	6	578051	578056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704986
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11482	NC_022535	GCT	2	6	578153	578158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704986
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11486	NC_022535	TCT	2	6	578288	578293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704986
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11499	NC_022535	GGC	2	6	578955	578960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704986
11500	NC_022535	GCG	2	6	579104	579109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704986

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