MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 56310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022535	GAC	2	6	530387	530392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704940
10502	NC_022535	GAA	2	6	530492	530497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704941
10503	NC_022535	GAT	2	6	530511	530516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704941
10504	NC_022535	GCG	2	6	530517	530522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704941
10505	NC_022535	CGT	2	6	530527	530532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704941
10506	NC_022535	CGG	2	6	530540	530545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704941
10507	NC_022535	GCTC	2	8	530602	530609	0 %	25 %	25 %	50 %	549704941
10508	NC_022535	GCC	3	9	530718	530726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704941
10509	NC_022535	CGAT	2	8	530800	530807	25 %	25 %	25 %	25 %	549704941
10510	NC_022535	TGA	2	6	530851	530856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704941
10511	NC_022535	GGA	2	6	530861	530866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704941
10512	NC_022535	CGA	2	6	530872	530877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704941
10513	NC_022535	GCC	2	6	530926	530931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704941
10514	NC_022535	GC	3	6	530937	530942	0 %	0 %	50 %	50 %	549704941
10515	NC_022535	GAC	2	6	530964	530969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704941
10516	NC_022535	ATTG	2	8	530990	530997	25 %	50 %	25 %	0 %	549704941
10517	NC_022535	GAA	2	6	531011	531016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704941
10518	NC_022535	ATG	2	6	531051	531056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704942
10519	NC_022535	GGC	2	6	531113	531118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704942
10520	NC_022535	CTT	2	6	531126	531131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704942
10521	NC_022535	GCT	2	6	531158	531163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704942
10522	NC_022535	GCA	2	6	531176	531181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704942
10523	NC_022535	GAT	2	6	531191	531196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704942
10524	NC_022535	TCC	2	6	531227	531232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704942
10525	NC_022535	GAA	2	6	531327	531332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704942
10526	NC_022535	GAA	2	6	531345	531350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704942
10527	NC_022535	GCC	2	6	531367	531372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704942
10528	NC_022535	TCG	2	6	531436	531441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704942
10529	NC_022535	CTG	2	6	531450	531455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704942
10530	NC_022535	TC	3	6	531485	531490	0 %	50 %	0 %	50 %	549704942
10531	NC_022535	TGC	2	6	531493	531498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704942
10532	NC_022535	AGC	2	6	531541	531546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704942
10533	NC_022535	GC	3	6	531545	531550	0 %	0 %	50 %	50 %	549704942
10534	NC_022535	AGG	2	6	531580	531585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704942
10535	NC_022535	GCC	2	6	531597	531602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704942
10536	NC_022535	ATC	2	6	531606	531611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704942
10537	NC_022535	TCA	2	6	531631	531636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704942
10538	NC_022535	CGG	2	6	531662	531667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704942
10539	NC_022535	TGA	2	6	531688	531693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704942
10540	NC_022535	GCTC	2	8	531730	531737	0 %	25 %	25 %	50 %	549704942
10541	NC_022535	CGA	2	6	531791	531796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704942
10542	NC_022535	CGCAG	2	10	531811	531820	20 %	0 %	40 %	40 %	549704942
10543	NC_022535	TGC	2	6	531829	531834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704942
10544	NC_022535	GCG	2	6	531874	531879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704942
10545	NC_022535	TG	3	6	531900	531905	0 %	50 %	50 %	0 %	549704942
10546	NC_022535	GCCGT	2	10	532000	532009	0 %	20 %	40 %	40 %	549704942
10547	NC_022535	AGG	2	6	532015	532020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704942
10548	NC_022535	GAA	2	6	532071	532076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704942
10549	NC_022535	AGGACA	2	12	532234	532245	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549704943
10550	NC_022535	A	6	6	532269	532274	100 %	0 %	0 %	0 %	549704943
10551	NC_022535	GCG	2	6	532284	532289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704943
10552	NC_022535	CGT	2	6	532333	532338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704943
10553	NC_022535	TTTC	2	8	532364	532371	0 %	75 %	0 %	25 %	549704943
10554	NC_022535	GCCTC	2	10	532537	532546	0 %	20 %	20 %	60 %	549704943
10555	NC_022535	CGCC	2	8	532612	532619	0 %	0 %	25 %	75 %	549704943
10556	NC_022535	AGCA	2	8	532641	532648	50 %	0 %	25 %	25 %	549704943
10557	NC_022535	CAT	2	6	532700	532705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704943
10558	NC_022535	TTC	2	6	532707	532712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704943
10559	NC_022535	GTC	2	6	532782	532787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704943
10560	NC_022535	GAT	3	9	532802	532810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704943
10561	NC_022535	TTGC	2	8	532833	532840	0 %	50 %	25 %	25 %	549704943
10562	NC_022535	GAAG	2	8	532907	532914	50 %	0 %	50 %	0 %	549704943
10563	NC_022535	CGAT	2	8	532959	532966	25 %	25 %	25 %	25 %	549704943
10564	NC_022535	CGC	3	9	532983	532991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704943
10565	NC_022535	CAA	2	6	532997	533002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704943
10566	NC_022535	CG	3	6	533010	533015	0 %	0 %	50 %	50 %	549704943
10567	NC_022535	CCAAC	2	10	533029	533038	40 %	0 %	0 %	60 %	549704943
10568	NC_022535	AC	3	6	533037	533042	50 %	0 %	0 %	50 %	549704943
10569	NC_022535	GCGTT	2	10	533052	533061	0 %	40 %	40 %	20 %	549704943
10570	NC_022535	CGTG	2	8	533063	533070	0 %	25 %	50 %	25 %	549704943
10571	NC_022535	TGT	2	6	533087	533092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704943
10572	NC_022535	GAA	2	6	533142	533147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704943
10573	NC_022535	AAT	2	6	533148	533153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704943
10574	NC_022535	CGC	2	6	533173	533178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704943
10575	NC_022535	GC	3	6	533181	533186	0 %	0 %	50 %	50 %	549704943
10576	NC_022535	TCGA	2	8	533205	533212	25 %	25 %	25 %	25 %	549704943
10577	NC_022535	CCA	2	6	533223	533228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704943
10578	NC_022535	A	6	6	533312	533317	100 %	0 %	0 %	0 %	549704944
10579	NC_022535	TCG	2	6	533346	533351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704944
10580	NC_022535	GCT	2	6	533413	533418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704944
10581	NC_022535	GCA	2	6	533436	533441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704944
10582	NC_022535	TAT	2	6	533474	533479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704944
10583	NC_022535	CGG	2	6	533506	533511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704944
10584	NC_022535	GC	3	6	533535	533540	0 %	0 %	50 %	50 %	549704944
10585	NC_022535	TCTCGA	2	12	533551	533562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549704944
10586	NC_022535	GCG	2	6	533618	533623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704944
10587	NC_022535	ATCA	2	8	533630	533637	50 %	25 %	0 %	25 %	549704944
10588	NC_022535	CGA	2	6	533668	533673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704944
10589	NC_022535	TCC	2	6	533685	533690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704944
10590	NC_022535	GCC	2	6	533705	533710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704944
10591	NC_022535	CCA	2	6	533725	533730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704944
10592	NC_022535	GCG	2	6	534073	534078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704945
10593	NC_022535	GC	3	6	534136	534141	0 %	0 %	50 %	50 %	549704945
10594	NC_022535	TCC	2	6	534145	534150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704945
10595	NC_022535	GCG	2	6	534223	534228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704945
10596	NC_022535	GCC	2	6	534262	534267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704945
10597	NC_022535	GCC	2	6	534340	534345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704945
10598	NC_022535	GCA	2	6	534356	534361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704945
10599	NC_022535	GAA	2	6	534379	534384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704945
10600	NC_022535	AGC	2	6	534389	534394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704945
10601	NC_022535	CGC	2	6	534479	534484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704945
10602	NC_022535	TCA	2	6	534500	534505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704945
10603	NC_022535	AGA	2	6	534506	534511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704945
10604	NC_022535	TCG	2	6	534512	534517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704945
10605	NC_022535	CCG	2	6	534533	534538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704945
10606	NC_022535	GAC	2	6	534555	534560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704945
10607	NC_022535	ATT	2	6	534566	534571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704945
10608	NC_022535	GCG	2	6	534605	534610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704945
10609	NC_022535	CGC	2	6	534702	534707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704945
10610	NC_022535	GGC	2	6	534762	534767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704945
10611	NC_022535	GCC	2	6	534811	534816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704945
10612	NC_022535	GT	3	6	534848	534853	0 %	50 %	50 %	0 %	549704945
10613	NC_022535	CGGCAG	2	12	534878	534889	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549704945
10614	NC_022535	CGAC	2	8	534899	534906	25 %	0 %	25 %	50 %	549704945
10615	NC_022535	CAA	2	6	535023	535028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704945
10616	NC_022535	GAT	2	6	535101	535106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704945
10617	NC_022535	GCG	2	6	535144	535149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704945
10618	NC_022535	GTC	2	6	535235	535240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704945
10619	NC_022535	CAG	3	9	535294	535302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704945
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10976	NC_022535	TGA	2	6	552083	552088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704964
10977	NC_022535	TTC	2	6	552117	552122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704964
10978	NC_022535	AGC	2	6	552170	552175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704964
10979	NC_022535	GAT	2	6	552205	552210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704964
10980	NC_022535	GGT	2	6	552213	552218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704964
10981	NC_022535	TCG	2	6	552308	552313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704964
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10983	NC_022535	ACG	2	6	552584	552589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704965
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10991	NC_022535	GGCA	2	8	553156	553163	25 %	0 %	50 %	25 %	549704965
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10994	NC_022535	GCC	2	6	553481	553486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704966
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10998	NC_022535	TCT	2	6	553732	553737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704966
10999	NC_022535	CGA	2	6	553822	553827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704966
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