MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021911	CGC	2	6	126980	126985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837645
2502	NC_021911	AGG	2	6	127012	127017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837645
2503	NC_021911	CAG	2	6	127080	127085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837645
2504	NC_021911	GAGG	2	8	127131	127138	25 %	0 %	75 %	0 %	528837645
2505	NC_021911	CGT	2	6	127148	127153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837645
2506	NC_021911	TCG	2	6	127249	127254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837645
2507	NC_021911	CGC	2	6	127339	127344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837645
2508	NC_021911	TCC	2	6	127390	127395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837645
2509	NC_021911	GTCG	2	8	127566	127573	0 %	25 %	50 %	25 %	528837645
2510	NC_021911	TC	3	6	127614	127619	0 %	50 %	0 %	50 %	528837645
2511	NC_021911	CGT	2	6	127649	127654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837645
2512	NC_021911	AGCA	2	8	127663	127670	50 %	0 %	25 %	25 %	528837645
2513	NC_021911	ACG	2	6	127693	127698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837645
2514	NC_021911	CG	3	6	127713	127718	0 %	0 %	50 %	50 %	528837645
2515	NC_021911	ATC	2	6	127740	127745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837645
2516	NC_021911	TCG	2	6	127759	127764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837645
2517	NC_021911	CCG	2	6	127852	127857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837645
2518	NC_021911	CGC	2	6	127956	127961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837645
2519	NC_021911	TCC	3	9	127963	127971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837645
2520	NC_021911	GA	3	6	128000	128005	50 %	0 %	50 %	0 %	528837645
2521	NC_021911	ACC	2	6	128014	128019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837645
2522	NC_021911	TCGGC	2	10	128148	128157	0 %	20 %	40 %	40 %	528837645
2523	NC_021911	CGC	2	6	128219	128224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837645
2524	NC_021911	GC	3	6	128223	128228	0 %	0 %	50 %	50 %	528837645
2525	NC_021911	TCG	2	6	128297	128302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837645
2526	NC_021911	ACG	2	6	128308	128313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837645
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2529	NC_021911	TC	3	6	128397	128402	0 %	50 %	0 %	50 %	528837645
2530	NC_021911	ATTC	2	8	128469	128476	25 %	50 %	0 %	25 %	528837645
2531	NC_021911	AT	3	6	129019	129024	50 %	50 %	0 %	0 %	528837646
2532	NC_021911	CGA	2	6	129187	129192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837646
2533	NC_021911	CCA	2	6	129225	129230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837646
2534	NC_021911	GTC	2	6	129323	129328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837646
2535	NC_021911	ATCA	2	8	129367	129374	50 %	25 %	0 %	25 %	528837646
2536	NC_021911	TGA	2	6	129385	129390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837646
2537	NC_021911	TGC	2	6	129430	129435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837646
2538	NC_021911	GCCG	2	8	129596	129603	0 %	0 %	50 %	50 %	528837646
2539	NC_021911	GGC	3	9	129631	129639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837646
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2541	NC_021911	GCTG	2	8	129670	129677	0 %	25 %	50 %	25 %	528837646
2542	NC_021911	AAG	2	6	129680	129685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837646
2543	NC_021911	GTC	2	6	129805	129810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837646
2544	NC_021911	TCG	2	6	129819	129824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837646
2545	NC_021911	CGA	2	6	129871	129876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837646
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2547	NC_021911	CGC	2	6	130022	130027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837646
2548	NC_021911	TGA	2	6	130134	130139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837646
2549	NC_021911	CCT	2	6	130165	130170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837646
2550	NC_021911	GAT	2	6	130181	130186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837646
2551	NC_021911	GCTG	2	8	130234	130241	0 %	25 %	50 %	25 %	528837646
2552	NC_021911	GCC	2	6	130442	130447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837646
2553	NC_021911	CAA	2	6	130510	130515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837646
2554	NC_021911	GAT	2	6	130529	130534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837646
2555	NC_021911	GCGAC	2	10	130572	130581	20 %	0 %	40 %	40 %	528837646
2556	NC_021911	GAA	3	9	130615	130623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837646
2557	NC_021911	A	6	6	130622	130627	100 %	0 %	0 %	0 %	528837646
2558	NC_021911	GGT	2	6	130820	130825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837647
2559	NC_021911	GGCT	2	8	130832	130839	0 %	25 %	50 %	25 %	528837647
2560	NC_021911	CTG	2	6	130893	130898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837647
2561	NC_021911	GCC	2	6	130989	130994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837647
2562	NC_021911	GCC	2	6	131013	131018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837647
2563	NC_021911	GCT	2	6	131099	131104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837647
2564	NC_021911	TCGA	2	8	131115	131122	25 %	25 %	25 %	25 %	528837647
2565	NC_021911	GTG	2	6	131199	131204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837647
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2569	NC_021911	CGA	2	6	131324	131329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837647
2570	NC_021911	CAC	2	6	131460	131465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837647
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2572	NC_021911	GTGC	2	8	131574	131581	0 %	25 %	50 %	25 %	528837647
2573	NC_021911	CGGC	2	8	131668	131675	0 %	0 %	50 %	50 %	528837647
2574	NC_021911	GGC	2	6	131769	131774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837647
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2578	NC_021911	GCT	2	6	131960	131965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837647
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2580	NC_021911	CTC	2	6	132042	132047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837647
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2582	NC_021911	GAAG	2	8	132101	132108	50 %	0 %	50 %	0 %	528837647
2583	NC_021911	CT	3	6	132161	132166	0 %	50 %	0 %	50 %	528837647
2584	NC_021911	TC	3	6	132170	132175	0 %	50 %	0 %	50 %	528837647
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2589	NC_021911	GCA	2	6	132713	132718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837648
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2592	NC_021911	CAATGA	2	12	132819	132830	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	528837648
2593	NC_021911	TGC	2	6	132854	132859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837648
2594	NC_021911	GCGCA	2	10	132874	132883	20 %	0 %	40 %	40 %	528837648
2595	NC_021911	AGATC	2	10	132912	132921	40 %	20 %	20 %	20 %	528837648
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2600	NC_021911	TCG	2	6	133286	133291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837649
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2602	NC_021911	TCA	2	6	133433	133438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837650
2603	NC_021911	TGA	3	9	133557	133565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837650
2604	NC_021911	AAT	2	6	133588	133593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837650
2605	NC_021911	CGC	2	6	133605	133610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837650
2606	NC_021911	CTTTG	2	10	133646	133655	0 %	60 %	20 %	20 %	528837650
2607	NC_021911	CGG	2	6	133901	133906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837651
2608	NC_021911	GAT	2	6	133919	133924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837651
2609	NC_021911	AATG	2	8	134020	134027	50 %	25 %	25 %	0 %	528837651
2610	NC_021911	ATTCGT	2	12	134062	134073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	528837652
2611	NC_021911	TCG	2	6	134093	134098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837652
2612	NC_021911	GCTTT	2	10	134503	134512	0 %	60 %	20 %	20 %	528837653
2613	NC_021911	CGC	2	6	134533	134538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837653
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2615	NC_021911	CCGG	3	12	134652	134663	0 %	0 %	50 %	50 %	528837653
2616	NC_021911	AG	3	6	134666	134671	50 %	0 %	50 %	0 %	528837653
2617	NC_021911	AAGG	2	8	134752	134759	50 %	0 %	50 %	0 %	528837653
2618	NC_021911	CAA	2	6	134931	134936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837653
2619	NC_021911	CT	3	6	135080	135085	0 %	50 %	0 %	50 %	528837653
2620	NC_021911	CG	3	6	135094	135099	0 %	0 %	50 %	50 %	528837653
2621	NC_021911	GATC	2	8	135132	135139	25 %	25 %	25 %	25 %	528837653
2622	NC_021911	ATGC	2	8	135146	135153	25 %	25 %	25 %	25 %	528837653
2623	NC_021911	CGG	2	6	135186	135191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837653
2624	NC_021911	CGAT	2	8	135207	135214	25 %	25 %	25 %	25 %	528837653
2625	NC_021911	TCGG	2	8	135225	135232	0 %	25 %	50 %	25 %	528837653
2626	NC_021911	GGC	2	6	135265	135270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837653
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2628	NC_021911	GATC	2	8	135550	135557	25 %	25 %	25 %	25 %	528837654
2629	NC_021911	CGT	2	6	135571	135576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837654
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2738	NC_021911	CGG	2	6	142101	142106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837657
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2740	NC_021911	CCG	2	6	142183	142188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837657
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2742	NC_021911	C	7	7	142230	142236	0 %	0 %	0 %	100 %	528837657
2743	NC_021911	ATCG	2	8	142397	142404	25 %	25 %	25 %	25 %	528837657
2744	NC_021911	GC	3	6	142552	142557	0 %	0 %	50 %	50 %	528837657
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2774	NC_021911	GCA	2	6	144341	144346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837659
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2853	NC_021911	CTA	2	6	148431	148436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837662
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2858	NC_021911	GCG	2	6	148734	148739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837662
2859	NC_021911	ATTG	2	8	148762	148769	25 %	50 %	25 %	0 %	528837662
2860	NC_021911	GATC	2	8	148783	148790	25 %	25 %	25 %	25 %	528837662
2861	NC_021911	CAC	2	6	148798	148803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837662
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2864	NC_021911	TCG	2	6	148997	149002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837662
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2983	NC_021911	ACG	3	9	157968	157976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837666
2984	NC_021911	GGC	3	9	158025	158033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837666
2985	NC_021911	ACG	2	6	158037	158042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837666
2986	NC_021911	CAG	2	6	158043	158048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837666
2987	NC_021911	CCG	2	6	158062	158067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837666
2988	NC_021911	GAC	2	6	158129	158134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837666
2989	NC_021911	AGC	3	9	158289	158297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837666
2990	NC_021911	CGA	2	6	158303	158308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837666
2991	NC_021911	ACGGTA	2	12	158310	158321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528837666
2992	NC_021911	GCG	2	6	158326	158331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837666
2993	NC_021911	GC	3	6	158387	158392	0 %	0 %	50 %	50 %	528837666
2994	NC_021911	GCGCG	2	10	158447	158456	0 %	0 %	60 %	40 %	528837666
2995	NC_021911	CCGATG	2	12	158524	158535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528837666
2996	NC_021911	ATGGCG	2	12	158701	158712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528837666
2997	NC_021911	CGA	2	6	158858	158863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837666
2998	NC_021911	GGCGAT	2	12	158868	158879	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528837666
2999	NC_021911	CGA	2	6	158882	158887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837666
3000	NC_021911	TCA	2	6	158908	158913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837666

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