MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_021911	CAG	2	6	841790	841795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17003	NC_021911	GAT	2	6	841847	841852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838307
17004	NC_021911	CGGGG	2	10	841884	841893	0 %	0 %	80 %	20 %	528838307
17005	NC_021911	GAG	2	6	841911	841916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838307
17006	NC_021911	G	6	6	842026	842031	0 %	0 %	100 %	0 %	528838307
17007	NC_021911	ATT	2	6	842055	842060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528838307
17008	NC_021911	GGA	2	6	842069	842074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838307
17009	NC_021911	TGA	2	6	842194	842199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838307
17010	NC_021911	AAG	2	6	842238	842243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838307
17011	NC_021911	GTC	2	6	842280	842285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17012	NC_021911	GGC	2	6	842486	842491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838307
17013	NC_021911	GCCG	2	8	842525	842532	0 %	0 %	50 %	50 %	528838307
17014	NC_021911	CGC	2	6	842541	842546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838307
17015	NC_021911	GCT	2	6	842564	842569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17016	NC_021911	AACG	2	8	842604	842611	50 %	0 %	25 %	25 %	528838307
17017	NC_021911	CGA	2	6	842621	842626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17018	NC_021911	CGA	2	6	842660	842665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17019	NC_021911	TCCG	2	8	842666	842673	0 %	25 %	25 %	50 %	528838307
17020	NC_021911	GC	3	6	842691	842696	0 %	0 %	50 %	50 %	528838307
17021	NC_021911	AC	3	6	842743	842748	50 %	0 %	0 %	50 %	528838307
17022	NC_021911	CGG	2	6	842770	842775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838307
17023	NC_021911	CAC	2	6	842780	842785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838307
17024	NC_021911	TGC	2	6	842794	842799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17025	NC_021911	GAT	2	6	842970	842975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838307
17026	NC_021911	GCT	2	6	842982	842987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17027	NC_021911	CGCCGG	2	12	842999	843010	0 %	0 %	50 %	50 %	528838307
17028	NC_021911	GCT	2	6	843020	843025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
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17032	NC_021911	CGA	2	6	843206	843211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17033	NC_021911	GTC	2	6	843224	843229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17034	NC_021911	TCG	2	6	843256	843261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17035	NC_021911	TCG	2	6	843286	843291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17036	NC_021911	GCGAT	2	10	843292	843301	20 %	20 %	40 %	20 %	528838307
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17040	NC_021911	TCG	2	6	843505	843510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
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17042	NC_021911	GGC	2	6	843591	843596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838307
17043	NC_021911	GCT	2	6	843602	843607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17044	NC_021911	CGGT	2	8	843657	843664	0 %	25 %	50 %	25 %	528838307
17045	NC_021911	GC	4	8	843718	843725	0 %	0 %	50 %	50 %	528838307
17046	NC_021911	GCC	2	6	843732	843737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838307
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17049	NC_021911	GTC	2	6	843834	843839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17050	NC_021911	CTG	2	6	843867	843872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17051	NC_021911	GCA	2	6	843892	843897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17052	NC_021911	GTC	2	6	843900	843905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17053	NC_021911	ATG	2	6	844008	844013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838307
17054	NC_021911	ACCGCG	2	12	844048	844059	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528838307
17055	NC_021911	AGG	2	6	844078	844083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838307
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17059	NC_021911	CGA	2	6	844229	844234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838307
17060	NC_021911	GACAG	2	10	844373	844382	40 %	0 %	40 %	20 %	528838307
17061	NC_021911	GAG	2	6	844392	844397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838307
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17065	NC_021911	GGA	2	6	844640	844645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838307
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17120	NC_021911	CGA	2	6	847507	847512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838309
17121	NC_021911	TGC	2	6	847539	847544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838309
17122	NC_021911	GAT	2	6	847607	847612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838309
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17124	NC_021911	TCT	2	6	847647	847652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838309
17125	NC_021911	GAT	2	6	847672	847677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838309
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17148	NC_021911	CG	3	6	849132	849137	0 %	0 %	50 %	50 %	528838310
17149	NC_021911	TCT	2	6	849143	849148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838310
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17220	NC_021911	GCCTGC	2	12	853340	853351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528838314
17221	NC_021911	AGG	2	6	853384	853389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838314
17222	NC_021911	TGC	2	6	853395	853400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838314
17223	NC_021911	TGA	2	6	853419	853424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838314
17224	NC_021911	CTT	2	6	853459	853464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838314
17225	NC_021911	TCG	2	6	853471	853476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838314
17226	NC_021911	CCA	2	6	853504	853509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838314
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17230	NC_021911	CG	3	6	853613	853618	0 %	0 %	50 %	50 %	528838314
17231	NC_021911	CCT	2	6	853642	853647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838314
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17233	NC_021911	ATG	2	6	853844	853849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838314
17234	NC_021911	TTG	2	6	853851	853856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838314
17235	NC_021911	CCT	2	6	853894	853899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838314
17236	NC_021911	CGG	2	6	853919	853924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838314
17237	NC_021911	GCCAGG	2	12	853950	853961	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528838314
17238	NC_021911	GCG	2	6	854007	854012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838314
17239	NC_021911	GCCA	2	8	854035	854042	25 %	0 %	25 %	50 %	528838314
17240	NC_021911	GAC	2	6	854047	854052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838314
17241	NC_021911	GTC	2	6	854061	854066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838314
17242	NC_021911	GCTT	2	8	854090	854097	0 %	50 %	25 %	25 %	528838314
17243	NC_021911	GATC	2	8	854135	854142	25 %	25 %	25 %	25 %	528838314
17244	NC_021911	ACG	2	6	854150	854155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838314
17245	NC_021911	ACGT	2	8	854288	854295	25 %	25 %	25 %	25 %	528838315
17246	NC_021911	GCTC	2	8	854321	854328	0 %	25 %	25 %	50 %	528838315
17247	NC_021911	GGC	2	6	854355	854360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838315
17248	NC_021911	CCGACA	2	12	854413	854424	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	528838315
17249	NC_021911	CCA	2	6	854476	854481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838315
17250	NC_021911	GCC	2	6	854526	854531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838315
17251	NC_021911	CGAGAT	2	12	854549	854560	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528838315
17252	NC_021911	TGT	2	6	854564	854569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838315
17253	NC_021911	TCG	2	6	854591	854596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838315
17254	NC_021911	CGA	2	6	854637	854642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838315
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17256	NC_021911	ATC	2	6	854692	854697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838315
17257	NC_021911	GCC	2	6	854734	854739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838315
17258	NC_021911	AAGATC	2	12	854757	854768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	528838315
17259	NC_021911	GTTG	2	8	854783	854790	0 %	50 %	50 %	0 %	528838315
17260	NC_021911	CTT	2	6	854826	854831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838315
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17270	NC_021911	GCG	2	6	855607	855612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838316
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17276	NC_021911	AAG	2	6	855985	855990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838317
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17280	NC_021911	CGTC	2	8	856089	856096	0 %	25 %	25 %	50 %	528838317
17281	NC_021911	CGA	2	6	856101	856106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838317
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17308	NC_021911	GA	3	6	857596	857601	50 %	0 %	50 %	0 %	528838318
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17312	NC_021911	TCG	2	6	857721	857726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838318
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17345	NC_021911	GTC	3	9	861780	861788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838320
17346	NC_021911	ATCG	2	8	861821	861828	25 %	25 %	25 %	25 %	528838320
17347	NC_021911	GTC	2	6	861933	861938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838320
17348	NC_021911	TCA	2	6	861955	861960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838320
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17350	NC_021911	GCG	2	6	861988	861993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838320
17351	NC_021911	TGA	2	6	862009	862014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838320
17352	NC_021911	CTC	2	6	862234	862239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838321
17353	NC_021911	CG	3	6	862261	862266	0 %	0 %	50 %	50 %	528838321
17354	NC_021911	GGACG	2	10	862287	862296	20 %	0 %	60 %	20 %	528838321
17355	NC_021911	CAGG	2	8	862330	862337	25 %	0 %	50 %	25 %	528838321
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17475	NC_021911	CGA	2	6	869142	869147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838326
17476	NC_021911	CTC	2	6	869287	869292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838326
17477	NC_021911	TCCAG	2	10	869312	869321	20 %	20 %	20 %	40 %	528838326
17478	NC_021911	CGGT	2	8	869469	869476	0 %	25 %	50 %	25 %	528838326
17479	NC_021911	C	6	6	869687	869692	0 %	0 %	0 %	100 %	528838326
17480	NC_021911	TG	3	6	869799	869804	0 %	50 %	50 %	0 %	528838326
17481	NC_021911	ATG	2	6	869817	869822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838326
17482	NC_021911	TTA	2	6	869948	869953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528838326
17483	NC_021911	AGC	2	6	869962	869967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838326
17484	NC_021911	CGA	2	6	869973	869978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838326
17485	NC_021911	TGT	2	6	870042	870047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838326
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17487	NC_021911	CAG	3	9	870138	870146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838326
17488	NC_021911	TGC	2	6	870196	870201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838326
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17490	NC_021911	CAT	2	6	870231	870236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838326
17491	NC_021911	CGT	2	6	870253	870258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838326
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17495	NC_021911	GCC	2	6	870734	870739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838327
17496	NC_021911	TTCG	2	8	870821	870828	0 %	50 %	25 %	25 %	528838327
17497	NC_021911	CGG	2	6	870846	870851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838327
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17499	NC_021911	TGA	2	6	870979	870984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838327
17500	NC_021911	CGA	3	9	871007	871015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838327

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