MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021911	TCA	2	6	693157	693162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838157
14002	NC_021911	GC	3	6	693194	693199	0 %	0 %	50 %	50 %	528838157
14003	NC_021911	CGG	2	6	693211	693216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838157
14004	NC_021911	CAT	2	6	693278	693283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838157
14005	NC_021911	GCG	2	6	693321	693326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838157
14006	NC_021911	TAT	2	6	693336	693341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528838157
14007	NC_021911	CCA	2	6	693359	693364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838157
14008	NC_021911	GGA	2	6	693398	693403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838157
14009	NC_021911	GCT	2	6	693404	693409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14010	NC_021911	CTGG	2	8	693425	693432	0 %	25 %	50 %	25 %	528838157
14011	NC_021911	CCGCG	2	10	693539	693548	0 %	0 %	40 %	60 %	528838157
14012	NC_021911	CAAT	2	8	693590	693597	50 %	25 %	0 %	25 %	528838157
14013	NC_021911	GGA	2	6	693602	693607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838157
14014	NC_021911	CG	3	6	693610	693615	0 %	0 %	50 %	50 %	528838157
14015	NC_021911	CGA	2	6	693632	693637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14016	NC_021911	GC	3	6	693854	693859	0 %	0 %	50 %	50 %	528838157
14017	NC_021911	CCG	2	6	693911	693916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838157
14018	NC_021911	TGA	2	6	693928	693933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838157
14019	NC_021911	CTG	2	6	693942	693947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14020	NC_021911	ACA	2	6	694000	694005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838157
14021	NC_021911	CAATG	2	10	694039	694048	40 %	20 %	20 %	20 %	528838157
14022	NC_021911	CGG	2	6	694064	694069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838157
14023	NC_021911	CGGA	2	8	694077	694084	25 %	0 %	50 %	25 %	528838157
14024	NC_021911	GCT	2	6	694175	694180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14025	NC_021911	GGCA	2	8	694212	694219	25 %	0 %	50 %	25 %	528838157
14026	NC_021911	TC	3	6	694250	694255	0 %	50 %	0 %	50 %	528838157
14027	NC_021911	GCAG	2	8	694340	694347	25 %	0 %	50 %	25 %	528838157
14028	NC_021911	GCC	2	6	694448	694453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838157
14029	NC_021911	CTT	2	6	694460	694465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838157
14030	NC_021911	GCCGAT	2	12	694482	694493	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14031	NC_021911	CCG	2	6	694494	694499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838157
14032	NC_021911	CGC	2	6	694513	694518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838157
14033	NC_021911	TCC	2	6	694549	694554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838157
14034	NC_021911	TCG	2	6	694573	694578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14035	NC_021911	GGT	2	6	694642	694647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838157
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14040	NC_021911	GC	3	6	694899	694904	0 %	0 %	50 %	50 %	528838157
14041	NC_021911	TCG	2	6	695056	695061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
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14043	NC_021911	CGG	2	6	695317	695322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838157
14044	NC_021911	TCG	2	6	695362	695367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14045	NC_021911	GTC	2	6	695442	695447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14046	NC_021911	CGA	2	6	695453	695458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838157
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14048	NC_021911	GGCG	2	8	695486	695493	0 %	0 %	75 %	25 %	528838157
14049	NC_021911	CGAT	2	8	695548	695555	25 %	25 %	25 %	25 %	528838157
14050	NC_021911	GCTC	2	8	695558	695565	0 %	25 %	25 %	50 %	528838157
14051	NC_021911	TGA	2	6	695638	695643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838157
14052	NC_021911	CGCA	2	8	695646	695653	25 %	0 %	25 %	50 %	528838157
14053	NC_021911	TCA	2	6	695701	695706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838157
14054	NC_021911	TCG	2	6	695806	695811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
14055	NC_021911	CGC	2	6	695956	695961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838157
14056	NC_021911	CGG	2	6	695970	695975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838157
14057	NC_021911	TCT	2	6	695993	695998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838157
14058	NC_021911	GCC	2	6	696006	696011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838157
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14063	NC_021911	CGA	2	6	696517	696522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838158
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14065	NC_021911	CGC	2	6	696563	696568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838158
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14067	NC_021911	GTTC	2	8	696652	696659	0 %	50 %	25 %	25 %	528838158
14068	NC_021911	CGGC	2	8	696669	696676	0 %	0 %	50 %	50 %	528838158
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14075	NC_021911	CAGC	2	8	696937	696944	25 %	0 %	25 %	50 %	528838158
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14089	NC_021911	ATG	2	6	697872	697877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838158
14090	NC_021911	GACC	2	8	697901	697908	25 %	0 %	25 %	50 %	528838158
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14108	NC_021911	CGA	2	6	698839	698844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838159
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14119	NC_021911	GCA	2	6	699262	699267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838159
14120	NC_021911	CCG	2	6	699301	699306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838159
14121	NC_021911	CGC	2	6	699307	699312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838159
14122	NC_021911	ATC	2	6	699324	699329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838159
14123	NC_021911	GCT	2	6	699357	699362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838159
14124	NC_021911	GCG	2	6	699363	699368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838159
14125	NC_021911	GGC	2	6	699481	699486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838159
14126	NC_021911	AG	3	6	699488	699493	50 %	0 %	50 %	0 %	528838159
14127	NC_021911	CGA	2	6	699502	699507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838159
14128	NC_021911	GGT	2	6	699538	699543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838159
14129	NC_021911	TCG	2	6	699577	699582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838159
14130	NC_021911	ATG	2	6	699639	699644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838159
14131	NC_021911	CCGGG	2	10	699718	699727	0 %	0 %	60 %	40 %	528838159
14132	NC_021911	CCGG	2	8	699749	699756	0 %	0 %	50 %	50 %	528838159
14133	NC_021911	TGAA	2	8	699810	699817	50 %	25 %	25 %	0 %	528838159
14134	NC_021911	CGT	2	6	699847	699852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838159
14135	NC_021911	CATA	2	8	699859	699866	50 %	25 %	0 %	25 %	528838159
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14137	NC_021911	GCG	2	6	700012	700017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838160
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14139	NC_021911	GA	3	6	700129	700134	50 %	0 %	50 %	0 %	528838160
14140	NC_021911	CG	3	6	700197	700202	0 %	0 %	50 %	50 %	528838160
14141	NC_021911	GGC	2	6	700290	700295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838160
14142	NC_021911	CGG	2	6	700305	700310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838160
14143	NC_021911	GCC	2	6	700336	700341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838160
14144	NC_021911	GC	3	6	700394	700399	0 %	0 %	50 %	50 %	528838160
14145	NC_021911	GGC	2	6	700488	700493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838160
14146	NC_021911	GAG	2	6	700563	700568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838160
14147	NC_021911	GCA	2	6	700623	700628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838160
14148	NC_021911	AGC	2	6	700636	700641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838160
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14150	NC_021911	CTG	2	6	700698	700703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838160
14151	NC_021911	CGA	2	6	700715	700720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838160
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14154	NC_021911	GCC	2	6	700857	700862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838160
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14157	NC_021911	GCGT	2	8	701030	701037	0 %	25 %	50 %	25 %	528838160
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14165	NC_021911	CCG	2	6	701420	701425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838161
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14167	NC_021911	CGT	2	6	701462	701467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838161
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14175	NC_021911	CGA	2	6	701918	701923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838162
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14193	NC_021911	CG	3	6	702563	702568	0 %	0 %	50 %	50 %	528838163
14194	NC_021911	GAT	2	6	702584	702589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838163
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14197	NC_021911	GCA	2	6	702715	702720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838163
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14222	NC_021911	CGA	3	9	703510	703518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838163
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14227	NC_021911	CTGA	2	8	703720	703727	25 %	25 %	25 %	25 %	528838164
14228	NC_021911	CGA	3	9	703803	703811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838164
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14230	NC_021911	GAT	2	6	703831	703836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838164
14231	NC_021911	TTCCGC	2	12	703861	703872	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	528838164
14232	NC_021911	GCC	2	6	703930	703935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838164
14233	NC_021911	GGGCTG	2	12	703955	703966	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	528838164
14234	NC_021911	AGA	2	6	703974	703979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838164
14235	NC_021911	GA	3	6	704088	704093	50 %	0 %	50 %	0 %	528838164
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14237	NC_021911	GA	3	6	704192	704197	50 %	0 %	50 %	0 %	528838164
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14357	NC_021911	TGC	2	6	710171	710176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838168
14358	NC_021911	TGC	2	6	710210	710215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838168
14359	NC_021911	CGA	2	6	710274	710279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838168
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14472	NC_021911	TCA	2	6	714324	714329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838169
14473	NC_021911	CATGC	2	10	714335	714344	20 %	20 %	20 %	40 %	528838169
14474	NC_021911	CG	3	6	714367	714372	0 %	0 %	50 %	50 %	528838169
14475	NC_021911	AGC	2	6	714489	714494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838169
14476	NC_021911	CTC	2	6	715052	715057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838170
14477	NC_021911	AAGTG	2	10	715245	715254	40 %	20 %	40 %	0 %	528838170
14478	NC_021911	TGC	2	6	715263	715268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838170
14479	NC_021911	CG	3	6	715283	715288	0 %	0 %	50 %	50 %	528838170
14480	NC_021911	CCGG	2	8	715295	715302	0 %	0 %	50 %	50 %	528838170
14481	NC_021911	GAG	2	6	715309	715314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838170
14482	NC_021911	GCT	2	6	715340	715345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838170
14483	NC_021911	CGGC	2	8	715503	715510	0 %	0 %	50 %	50 %	528838170
14484	NC_021911	TGG	2	6	715529	715534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838170
14485	NC_021911	GCG	2	6	715537	715542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838170
14486	NC_021911	CCT	2	6	715613	715618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838170
14487	NC_021911	CGC	2	6	715622	715627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838170
14488	NC_021911	ATC	2	6	715637	715642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838170
14489	NC_021911	GACGGC	2	12	715675	715686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528838170
14490	NC_021911	GAT	2	6	715692	715697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838170
14491	NC_021911	TTC	2	6	715705	715710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838170
14492	NC_021911	TCT	2	6	715803	715808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838170
14493	NC_021911	CGC	2	6	715822	715827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838170
14494	NC_021911	ACG	2	6	715946	715951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838170
14495	NC_021911	CCA	2	6	715956	715961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838170
14496	NC_021911	GCC	2	6	716121	716126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838170
14497	NC_021911	CTG	2	6	716242	716247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838170
14498	NC_021911	CGA	2	6	716322	716327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838170
14499	NC_021911	GAG	2	6	716362	716367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838170
14500	NC_021911	GCC	2	6	716434	716439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838170

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