MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021911	CGA	2	6	670755	670760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13502	NC_021911	GCG	2	6	670780	670785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838140
13503	NC_021911	GAC	2	6	670836	670841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13504	NC_021911	GAT	2	6	670842	670847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838140
13505	NC_021911	TCG	2	6	670895	670900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13506	NC_021911	GC	3	6	670905	670910	0 %	0 %	50 %	50 %	528838140
13507	NC_021911	GGTCG	2	10	670912	670921	0 %	20 %	60 %	20 %	528838140
13508	NC_021911	ATC	2	6	670952	670957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838140
13509	NC_021911	TCG	2	6	670970	670975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13510	NC_021911	CGC	2	6	670991	670996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838140
13511	NC_021911	CAT	2	6	671004	671009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838140
13512	NC_021911	CGT	3	9	671043	671051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13513	NC_021911	GGC	2	6	671065	671070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838140
13514	NC_021911	CCG	2	6	671093	671098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838140
13515	NC_021911	CGGT	2	8	671105	671112	0 %	25 %	50 %	25 %	528838140
13516	NC_021911	TCG	2	6	671177	671182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13517	NC_021911	ATC	3	9	671251	671259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838140
13518	NC_021911	GGCCT	2	10	671350	671359	0 %	20 %	40 %	40 %	528838140
13519	NC_021911	GGT	2	6	671449	671454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838141
13520	NC_021911	TTCC	2	8	671552	671559	0 %	50 %	0 %	50 %	528838141
13521	NC_021911	CGG	2	6	671590	671595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838141
13522	NC_021911	TCG	2	6	671625	671630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838141
13523	NC_021911	CGG	2	6	671709	671714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838141
13524	NC_021911	GTC	2	6	671747	671752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838141
13525	NC_021911	TGG	3	9	671760	671768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838141
13526	NC_021911	CG	3	6	671806	671811	0 %	0 %	50 %	50 %	528838141
13527	NC_021911	CTT	2	6	671815	671820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838141
13528	NC_021911	TTC	2	6	671831	671836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838141
13529	NC_021911	CGT	2	6	671857	671862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838141
13530	NC_021911	CTG	2	6	671903	671908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838141
13531	NC_021911	CTT	2	6	671914	671919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838141
13532	NC_021911	C	6	6	671936	671941	0 %	0 %	0 %	100 %	528838141
13533	NC_021911	TCG	4	12	671979	671990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838141
13534	NC_021911	CGC	2	6	672098	672103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838141
13535	NC_021911	CTT	2	6	672128	672133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838141
13536	NC_021911	TCG	2	6	672147	672152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838141
13537	NC_021911	TGA	2	6	672165	672170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838141
13538	NC_021911	GGC	3	9	672215	672223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838141
13539	NC_021911	AT	3	6	672253	672258	50 %	50 %	0 %	0 %	528838141
13540	NC_021911	CCG	2	6	672306	672311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838141
13541	NC_021911	TC	3	6	672407	672412	0 %	50 %	0 %	50 %	528838142
13542	NC_021911	GCCGG	2	10	672421	672430	0 %	0 %	60 %	40 %	528838142
13543	NC_021911	CGG	2	6	672473	672478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838142
13544	NC_021911	GCT	2	6	672563	672568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838142
13545	NC_021911	GCC	2	6	672576	672581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838142
13546	NC_021911	CAG	2	6	672645	672650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838142
13547	NC_021911	GCG	2	6	672668	672673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838142
13548	NC_021911	GAA	2	6	672824	672829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838142
13549	NC_021911	TTG	2	6	672868	672873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838142
13550	NC_021911	TCA	3	9	672937	672945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838142
13551	NC_021911	TGA	2	6	672955	672960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838142
13552	NC_021911	CGT	2	6	672971	672976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838142
13553	NC_021911	TCGCC	2	10	673051	673060	0 %	20 %	20 %	60 %	528838142
13554	NC_021911	CTG	2	6	673074	673079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838142
13555	NC_021911	AT	3	6	673085	673090	50 %	50 %	0 %	0 %	528838142
13556	NC_021911	CGA	2	6	673103	673108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838142
13557	NC_021911	GGC	2	6	673118	673123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838142
13558	NC_021911	GC	3	6	673122	673127	0 %	0 %	50 %	50 %	528838142
13559	NC_021911	GCG	2	6	673134	673139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838142
13560	NC_021911	TCT	2	6	673153	673158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838142
13561	NC_021911	ATC	2	6	673164	673169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838142
13562	NC_021911	CGGCGC	2	12	673180	673191	0 %	0 %	50 %	50 %	528838142
13563	NC_021911	CGT	2	6	673373	673378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838142
13564	NC_021911	TTCCTG	2	12	673380	673391	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	528838142
13565	NC_021911	CAC	2	6	673403	673408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838142
13566	NC_021911	GAT	2	6	673659	673664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838143
13567	NC_021911	TTG	2	6	673717	673722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838143
13568	NC_021911	CGC	2	6	673769	673774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838143
13569	NC_021911	CCACT	2	10	673872	673881	20 %	20 %	0 %	60 %	528838143
13570	NC_021911	TTC	2	6	673891	673896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838143
13571	NC_021911	AGC	2	6	673945	673950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838143
13572	NC_021911	TCG	2	6	673969	673974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838143
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13574	NC_021911	GCC	3	9	674055	674063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838143
13575	NC_021911	CGC	2	6	674302	674307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838143
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13577	NC_021911	CGA	2	6	674373	674378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838143
13578	NC_021911	TGG	2	6	674508	674513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838143
13579	NC_021911	GCCG	2	8	674567	674574	0 %	0 %	50 %	50 %	528838143
13580	NC_021911	CGTT	2	8	674671	674678	0 %	50 %	25 %	25 %	528838143
13581	NC_021911	GAT	2	6	674885	674890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838144
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13583	NC_021911	AGA	2	6	674901	674906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838144
13584	NC_021911	TGA	2	6	675164	675169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838144
13585	NC_021911	T	6	6	675189	675194	0 %	100 %	0 %	0 %	528838144
13586	NC_021911	CA	3	6	675201	675206	50 %	0 %	0 %	50 %	528838144
13587	NC_021911	CAA	2	6	675272	675277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838144
13588	NC_021911	ACCGC	2	10	675311	675320	20 %	0 %	20 %	60 %	528838144
13589	NC_021911	CTGGA	2	10	675336	675345	20 %	20 %	40 %	20 %	528838144
13590	NC_021911	CCTCG	2	10	675362	675371	0 %	20 %	20 %	60 %	528838144
13591	NC_021911	TGG	2	6	675373	675378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838144
13592	NC_021911	CG	3	6	675423	675428	0 %	0 %	50 %	50 %	528838144
13593	NC_021911	GCG	2	6	675484	675489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838144
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13596	NC_021911	CATG	2	8	675647	675654	25 %	25 %	25 %	25 %	528838144
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13598	NC_021911	GCCG	2	8	675755	675762	0 %	0 %	50 %	50 %	528838144
13599	NC_021911	GGC	2	6	675788	675793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838144
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13601	NC_021911	TCCG	2	8	675828	675835	0 %	25 %	25 %	50 %	528838144
13602	NC_021911	CAT	2	6	675881	675886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838144
13603	NC_021911	GCA	2	6	675892	675897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838144
13604	NC_021911	CG	3	6	675913	675918	0 %	0 %	50 %	50 %	528838144
13605	NC_021911	GCG	2	6	675996	676001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838145
13606	NC_021911	TGC	2	6	676008	676013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838145
13607	NC_021911	GCCG	2	8	676052	676059	0 %	0 %	50 %	50 %	528838145
13608	NC_021911	GAGCGC	2	12	676093	676104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528838145
13609	NC_021911	CGGT	2	8	676118	676125	0 %	25 %	50 %	25 %	528838145
13610	NC_021911	GCG	2	6	676146	676151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838145
13611	NC_021911	GTC	2	6	676177	676182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838145
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13615	NC_021911	GAT	2	6	676366	676371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838145
13616	NC_021911	GCG	2	6	676397	676402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838145
13617	NC_021911	CGG	2	6	676475	676480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838145
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13738	NC_021911	TCG	2	6	681434	681439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838149
13739	NC_021911	TCG	2	6	681470	681475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838149
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13844	NC_021911	CGA	2	6	685720	685725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838151
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13847	NC_021911	CGGT	2	8	685864	685871	0 %	25 %	50 %	25 %	528838151
13848	NC_021911	TGG	2	6	685920	685925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838151
13849	NC_021911	TTC	2	6	685941	685946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838151
13850	NC_021911	CGG	2	6	685958	685963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838151
13851	NC_021911	GC	3	6	685990	685995	0 %	0 %	50 %	50 %	528838151
13852	NC_021911	CG	3	6	686232	686237	0 %	0 %	50 %	50 %	528838152
13853	NC_021911	CCT	2	6	686260	686265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838152
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13855	NC_021911	CGT	2	6	686280	686285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838152
13856	NC_021911	TGC	3	9	686405	686413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838152
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13972	NC_021911	ATC	2	6	691810	691815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838156
13973	NC_021911	GAA	2	6	691889	691894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838156
13974	NC_021911	CT	3	6	691943	691948	0 %	50 %	0 %	50 %	528838156
13975	NC_021911	GTGG	2	8	691949	691956	0 %	25 %	75 %	0 %	528838156
13976	NC_021911	GTC	2	6	692085	692090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838156
13977	NC_021911	AT	3	6	692204	692209	50 %	50 %	0 %	0 %	528838156
13978	NC_021911	TTC	2	6	692241	692246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838156
13979	NC_021911	TTC	2	6	692256	692261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838156
13980	NC_021911	CGCGC	2	10	692300	692309	0 %	0 %	40 %	60 %	528838156
13981	NC_021911	GCC	2	6	692337	692342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838156
13982	NC_021911	CCGG	2	8	692462	692469	0 %	0 %	50 %	50 %	528838156
13983	NC_021911	CAT	2	6	692474	692479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838156
13984	NC_021911	GCT	2	6	692549	692554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838156
13985	NC_021911	ACA	2	6	692569	692574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838156
13986	NC_021911	TTC	2	6	692580	692585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838156
13987	NC_021911	CG	5	10	692598	692607	0 %	0 %	50 %	50 %	528838156
13988	NC_021911	GAT	2	6	692694	692699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838156
13989	NC_021911	GGC	2	6	692700	692705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838156
13990	NC_021911	GC	3	6	692704	692709	0 %	0 %	50 %	50 %	528838156
13991	NC_021911	GCT	2	6	692864	692869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
13992	NC_021911	ATC	2	6	692886	692891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838157
13993	NC_021911	ACG	2	6	692917	692922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838157
13994	NC_021911	CTTT	2	8	693013	693020	0 %	75 %	0 %	25 %	528838157
13995	NC_021911	CGC	2	6	693025	693030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838157
13996	NC_021911	CGA	2	6	693035	693040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838157
13997	NC_021911	GGA	2	6	693092	693097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838157
13998	NC_021911	TCG	2	6	693109	693114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838157
13999	NC_021911	CGC	2	6	693116	693121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838157
14000	NC_021911	TCA	2	6	693142	693147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838157

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