MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021911	GCC	3	9	648336	648344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838121
13002	NC_021911	TCG	2	6	648459	648464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838121
13003	NC_021911	TGC	2	6	648480	648485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838121
13004	NC_021911	GTC	2	6	648581	648586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838121
13005	NC_021911	GTC	2	6	648710	648715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838121
13006	NC_021911	GCG	2	6	648756	648761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838121
13007	NC_021911	TCG	2	6	648765	648770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838121
13008	NC_021911	TGC	3	9	649037	649045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838122
13009	NC_021911	GCC	2	6	649047	649052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838122
13010	NC_021911	ATG	2	6	649082	649087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838122
13011	NC_021911	GAC	2	6	649105	649110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838122
13012	NC_021911	GAG	2	6	649117	649122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838122
13013	NC_021911	GCCG	2	8	649138	649145	0 %	0 %	50 %	50 %	528838122
13014	NC_021911	CGA	2	6	649200	649205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838122
13015	NC_021911	CGA	2	6	649212	649217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838122
13016	NC_021911	GAT	2	6	649225	649230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838122
13017	NC_021911	ACC	2	6	649289	649294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838122
13018	NC_021911	GAC	2	6	649390	649395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838122
13019	NC_021911	GAA	2	6	649396	649401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838122
13020	NC_021911	ATG	2	6	649406	649411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838122
13021	NC_021911	CATGAT	2	12	649447	649458	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	528838122
13022	NC_021911	CAC	2	6	649474	649479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838122
13023	NC_021911	GGCCGA	2	12	649542	649553	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528838122
13024	NC_021911	CGA	2	6	649557	649562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838122
13025	NC_021911	GAA	2	6	649585	649590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838122
13026	NC_021911	CCT	2	6	649602	649607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838122
13027	NC_021911	CGC	2	6	649686	649691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838122
13028	NC_021911	AGA	2	6	649704	649709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838122
13029	NC_021911	ATGTG	2	10	649887	649896	20 %	40 %	40 %	0 %	528838122
13030	NC_021911	CGCTT	2	10	649920	649929	0 %	40 %	20 %	40 %	528838123
13031	NC_021911	GCG	2	6	649932	649937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838123
13032	NC_021911	AGT	2	6	649985	649990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838123
13033	NC_021911	CG	3	6	650027	650032	0 %	0 %	50 %	50 %	528838123
13034	NC_021911	GGCCG	2	10	650070	650079	0 %	0 %	60 %	40 %	528838123
13035	NC_021911	ACC	2	6	650143	650148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838123
13036	NC_021911	CAG	2	6	650238	650243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838123
13037	NC_021911	GCC	2	6	650295	650300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838123
13038	NC_021911	GCCA	2	8	650350	650357	25 %	0 %	25 %	50 %	528838123
13039	NC_021911	GC	3	6	650383	650388	0 %	0 %	50 %	50 %	528838123
13040	NC_021911	CGGCC	2	10	650406	650415	0 %	0 %	40 %	60 %	528838123
13041	NC_021911	TTC	2	6	650434	650439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838123
13042	NC_021911	GCCC	2	8	650501	650508	0 %	0 %	25 %	75 %	528838123
13043	NC_021911	CGG	2	6	650525	650530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838123
13044	NC_021911	CGT	2	6	650562	650567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838123
13045	NC_021911	CGA	2	6	650591	650596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838123
13046	NC_021911	CGA	2	6	650600	650605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838123
13047	NC_021911	CGC	2	6	650609	650614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838123
13048	NC_021911	TGTT	2	8	650713	650720	0 %	75 %	25 %	0 %	528838123
13049	NC_021911	ACTT	2	8	650824	650831	25 %	50 %	0 %	25 %	528838124
13050	NC_021911	CGT	2	6	650850	650855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838124
13051	NC_021911	TCC	2	6	650938	650943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838124
13052	NC_021911	TGCCCT	2	12	650969	650980	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	528838124
13053	NC_021911	CGG	2	6	651050	651055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838124
13054	NC_021911	CTT	2	6	651113	651118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838124
13055	NC_021911	AGG	2	6	651137	651142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838124
13056	NC_021911	CGA	2	6	651215	651220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838124
13057	NC_021911	CGCT	2	8	651224	651231	0 %	25 %	25 %	50 %	528838124
13058	NC_021911	TCG	2	6	651257	651262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838124
13059	NC_021911	CGT	2	6	651267	651272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838124
13060	NC_021911	GATCT	2	10	651285	651294	20 %	40 %	20 %	20 %	528838124
13061	NC_021911	TGC	2	6	651295	651300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838124
13062	NC_021911	GCC	2	6	651318	651323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838124
13063	NC_021911	GAC	2	6	651342	651347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838124
13064	NC_021911	GGCC	2	8	651362	651369	0 %	0 %	50 %	50 %	528838124
13065	NC_021911	GAG	2	6	651403	651408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838124
13066	NC_021911	CGGC	2	8	651446	651453	0 %	0 %	50 %	50 %	528838124
13067	NC_021911	TGCT	2	8	651469	651476	0 %	50 %	25 %	25 %	528838124
13068	NC_021911	CGA	2	6	651527	651532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838124
13069	NC_021911	CA	3	6	651555	651560	50 %	0 %	0 %	50 %	528838124
13070	NC_021911	ACA	2	6	651577	651582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838124
13071	NC_021911	GCCA	2	8	651594	651601	25 %	0 %	25 %	50 %	528838124
13072	NC_021911	GCCG	2	8	651624	651631	0 %	0 %	50 %	50 %	528838124
13073	NC_021911	AGAT	2	8	651703	651710	50 %	25 %	25 %	0 %	528838124
13074	NC_021911	GCC	2	6	651723	651728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838124
13075	NC_021911	ATG	2	6	651733	651738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838124
13076	NC_021911	GCG	2	6	651760	651765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838124
13077	NC_021911	TGG	2	6	651767	651772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838124
13078	NC_021911	GAA	2	6	651829	651834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838124
13079	NC_021911	TCG	2	6	651869	651874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838125
13080	NC_021911	TCC	2	6	651897	651902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838125
13081	NC_021911	TGC	2	6	651907	651912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838125
13082	NC_021911	TCCG	2	8	651965	651972	0 %	25 %	25 %	50 %	528838125
13083	NC_021911	GC	3	6	651994	651999	0 %	0 %	50 %	50 %	528838125
13084	NC_021911	AGC	2	6	652000	652005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838125
13085	NC_021911	TGA	2	6	652019	652024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838125
13086	NC_021911	CAG	2	6	652035	652040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838125
13087	NC_021911	TGC	3	9	652048	652056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838125
13088	NC_021911	GCG	2	6	652068	652073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838125
13089	NC_021911	CCG	2	6	652078	652083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838125
13090	NC_021911	CAG	2	6	652114	652119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838126
13091	NC_021911	GC	3	6	652168	652173	0 %	0 %	50 %	50 %	528838126
13092	NC_021911	CGA	2	6	652200	652205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838126
13093	NC_021911	GAT	2	6	652291	652296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838126
13094	NC_021911	TCG	2	6	652341	652346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838126
13095	NC_021911	GGAT	2	8	652386	652393	25 %	25 %	50 %	0 %	528838126
13096	NC_021911	GGA	2	6	652413	652418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838126
13097	NC_021911	CGG	2	6	652463	652468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838126
13098	NC_021911	GCG	2	6	652640	652645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838126
13099	NC_021911	CAC	2	6	652657	652662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838126
13100	NC_021911	TCAG	2	8	652685	652692	25 %	25 %	25 %	25 %	528838126
13101	NC_021911	GCTC	2	8	652698	652705	0 %	25 %	25 %	50 %	528838126
13102	NC_021911	CGG	2	6	652719	652724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838126
13103	NC_021911	C	6	6	653198	653203	0 %	0 %	0 %	100 %	528838128
13104	NC_021911	CGG	2	6	653235	653240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838128
13105	NC_021911	CGG	3	9	653243	653251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838128
13106	NC_021911	CAG	2	6	653274	653279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838128
13107	NC_021911	GCC	2	6	653287	653292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838128
13108	NC_021911	CAC	2	6	653319	653324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838128
13109	NC_021911	GCG	2	6	653336	653341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838128
13110	NC_021911	TGA	2	6	653342	653347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838128
13111	NC_021911	TCG	2	6	653365	653370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838128
13112	NC_021911	CAT	2	6	653442	653447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838128
13113	NC_021911	GTT	2	6	653448	653453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838128
13114	NC_021911	GAT	2	6	653460	653465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838128
13115	NC_021911	CGG	2	6	653482	653487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838128
13116	NC_021911	AGC	2	6	653491	653496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838128
13117	NC_021911	GCC	2	6	653514	653519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838128
13118	NC_021911	GCC	2	6	653532	653537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838128
13119	NC_021911	ATCGAC	2	12	653556	653567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528838128
13120	NC_021911	GCCG	2	8	653568	653575	0 %	0 %	50 %	50 %	528838128
13121	NC_021911	TCG	2	6	653608	653613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838128
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13223	NC_021911	CGGCGA	2	12	657784	657795	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528838131
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13231	NC_021911	TCG	2	6	658211	658216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838132
13232	NC_021911	CCGG	2	8	658289	658296	0 %	0 %	50 %	50 %	528838132
13233	NC_021911	TGC	2	6	658304	658309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838132
13234	NC_021911	TGA	2	6	658328	658333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838132
13235	NC_021911	TCC	2	6	658364	658369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838132
13236	NC_021911	CTTC	2	8	658430	658437	0 %	50 %	0 %	50 %	528838132
13237	NC_021911	CTG	2	6	658447	658452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838132
13238	NC_021911	CGA	2	6	658485	658490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838132
13239	NC_021911	GGC	2	6	658491	658496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838132
13240	NC_021911	GAT	2	6	658497	658502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838132
13241	NC_021911	CCA	2	6	658628	658633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838132
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13243	NC_021911	CCT	2	6	658694	658699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838132
13244	NC_021911	CAT	2	6	658707	658712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838132
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13247	NC_021911	CATC	2	8	659009	659016	25 %	25 %	0 %	50 %	528838133
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13265	NC_021911	TGA	2	6	659724	659729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838133
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13267	NC_021911	GCG	2	6	659797	659802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838133
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13341	NC_021911	CG	3	6	662798	662803	0 %	0 %	50 %	50 %	528838135
13342	NC_021911	CAG	2	6	662817	662822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838135
13343	NC_021911	CAT	2	6	662826	662831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838135
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13345	NC_021911	CGC	3	9	662963	662971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838135
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13347	NC_021911	GCA	2	6	663081	663086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838135
13348	NC_021911	CGG	2	6	663102	663107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838135
13349	NC_021911	TGC	2	6	663110	663115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838135
13350	NC_021911	ACG	2	6	663136	663141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838135
13351	NC_021911	GGTGAG	2	12	663144	663155	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	528838135
13352	NC_021911	GCCG	2	8	663182	663189	0 %	0 %	50 %	50 %	528838135
13353	NC_021911	GTG	2	6	663229	663234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838135
13354	NC_021911	AGG	2	6	663270	663275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838135
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13357	NC_021911	TTG	2	6	663829	663834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838136
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13472	NC_021911	CGA	2	6	669346	669351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13473	NC_021911	CGC	2	6	669455	669460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838139
13474	NC_021911	ACGG	2	8	669470	669477	25 %	0 %	50 %	25 %	528838139
13475	NC_021911	CGA	2	6	669535	669540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13476	NC_021911	GCT	2	6	669615	669620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13477	NC_021911	GC	3	6	669639	669644	0 %	0 %	50 %	50 %	528838139
13478	NC_021911	CGTCT	2	10	669703	669712	0 %	40 %	20 %	40 %	528838139
13479	NC_021911	CGG	2	6	669745	669750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838139
13480	NC_021911	GTC	2	6	669845	669850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13481	NC_021911	TCG	3	9	669891	669899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13482	NC_021911	CAT	2	6	669934	669939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838139
13483	NC_021911	CGG	2	6	669951	669956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838139
13484	NC_021911	CAG	2	6	669995	670000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13485	NC_021911	CGA	2	6	670041	670046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13486	NC_021911	GGC	2	6	670073	670078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838139
13487	NC_021911	CGGG	2	8	670111	670118	0 %	0 %	75 %	25 %	528838139
13488	NC_021911	CGG	2	6	670141	670146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838139
13489	NC_021911	CGG	2	6	670152	670157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838139
13490	NC_021911	CGT	2	6	670246	670251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13491	NC_021911	ACG	2	6	670259	670264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838139
13492	NC_021911	CAA	2	6	670311	670316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528838140
13493	NC_021911	TCG	2	6	670376	670381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13494	NC_021911	CTG	2	6	670417	670422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13495	NC_021911	GAG	2	6	670441	670446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838140
13496	NC_021911	GCCG	2	8	670497	670504	0 %	0 %	50 %	50 %	528838140
13497	NC_021911	GC	3	6	670618	670623	0 %	0 %	50 %	50 %	528838140
13498	NC_021911	GGC	2	6	670632	670637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838140
13499	NC_021911	AGC	2	6	670679	670684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838140
13500	NC_021911	GCCAGC	2	12	670694	670705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528838140

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