MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12004	NC_021911	GAA	2	6	604508	604513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838077
12005	NC_021911	TCG	2	6	604542	604547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838077
12006	NC_021911	GGC	2	6	604556	604561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838077
12007	NC_021911	GAA	2	6	604589	604594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838077
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12009	NC_021911	GTC	2	6	604781	604786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838077
12010	NC_021911	CGT	2	6	604801	604806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838077
12011	NC_021911	ATTTC	2	10	604854	604863	20 %	60 %	0 %	20 %	528838077
12012	NC_021911	CGA	2	6	604927	604932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838077
12013	NC_021911	CTT	2	6	605012	605017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838077
12014	NC_021911	AGA	2	6	605020	605025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838077
12015	NC_021911	TGTTC	2	10	605027	605036	0 %	60 %	20 %	20 %	528838077
12016	NC_021911	CGG	2	6	605038	605043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838077
12017	NC_021911	ATC	2	6	605045	605050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838077
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12019	NC_021911	CGA	2	6	605263	605268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838078
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12022	NC_021911	CGGG	2	8	605379	605386	0 %	0 %	75 %	25 %	528838078
12023	NC_021911	CGG	2	6	605389	605394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838078
12024	NC_021911	GCG	2	6	605404	605409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838078
12025	NC_021911	TTG	2	6	605412	605417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838078
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12029	NC_021911	TC	3	6	605487	605492	0 %	50 %	0 %	50 %	528838078
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12040	NC_021911	AGGC	2	8	606079	606086	25 %	0 %	50 %	25 %	528838078
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12049	NC_021911	CTGG	2	8	606595	606602	0 %	25 %	50 %	25 %	528838079
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12053	NC_021911	CCGA	2	8	606641	606648	25 %	0 %	25 %	50 %	528838079
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12064	NC_021911	ATG	2	6	606968	606973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838079
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12092	NC_021911	GC	3	6	608176	608181	0 %	0 %	50 %	50 %	528838080
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12109	NC_021911	CG	3	6	608932	608937	0 %	0 %	50 %	50 %	528838081
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12119	NC_021911	CGG	2	6	609470	609475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838081
12120	NC_021911	TTG	2	6	609501	609506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838081
12121	NC_021911	CGG	2	6	609565	609570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838081
12122	NC_021911	GCG	2	6	609588	609593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838081
12123	NC_021911	CAT	2	6	609626	609631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838081
12124	NC_021911	GGC	2	6	609641	609646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838081
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12126	NC_021911	GC	3	6	609708	609713	0 %	0 %	50 %	50 %	528838082
12127	NC_021911	GCGA	2	8	609737	609744	25 %	0 %	50 %	25 %	528838082
12128	NC_021911	ATC	2	6	609748	609753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838082
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12130	NC_021911	GCCGGC	2	12	609766	609777	0 %	0 %	50 %	50 %	528838082
12131	NC_021911	GCC	2	6	609779	609784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838082
12132	NC_021911	TGC	2	6	609882	609887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838082
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12134	NC_021911	TGA	2	6	609963	609968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838082
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12139	NC_021911	CGC	2	6	610090	610095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838082
12140	NC_021911	GC	3	6	610141	610146	0 %	0 %	50 %	50 %	528838082
12141	NC_021911	GCCT	2	8	610157	610164	0 %	25 %	25 %	50 %	528838082
12142	NC_021911	CGC	2	6	610198	610203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838082
12143	NC_021911	GCCGC	2	10	610208	610217	0 %	0 %	40 %	60 %	528838082
12144	NC_021911	CGC	2	6	610264	610269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838082
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12146	NC_021911	TCG	2	6	610296	610301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838082
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12148	NC_021911	CCGCG	2	10	610317	610326	0 %	0 %	40 %	60 %	528838082
12149	NC_021911	AGC	2	6	610336	610341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838082
12150	NC_021911	GC	3	6	610377	610382	0 %	0 %	50 %	50 %	528838082
12151	NC_021911	ACC	2	6	610388	610393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838082
12152	NC_021911	GAC	2	6	610399	610404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838082
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12154	NC_021911	CGGC	2	8	610479	610486	0 %	0 %	50 %	50 %	528838082
12155	NC_021911	ACG	2	6	610502	610507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838082
12156	NC_021911	GC	3	6	610517	610522	0 %	0 %	50 %	50 %	528838082
12157	NC_021911	CCATTC	2	12	610536	610547	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	528838082
12158	NC_021911	CGA	2	6	610575	610580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838082
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12160	NC_021911	CGGC	2	8	610870	610877	0 %	0 %	50 %	50 %	528838083
12161	NC_021911	GCC	2	6	610953	610958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838083
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12177	NC_021911	CGGG	2	8	611330	611337	0 %	0 %	75 %	25 %	528838083
12178	NC_021911	GGCG	2	8	611489	611496	0 %	0 %	75 %	25 %	528838083
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12190	NC_021911	GATC	2	8	612156	612163	25 %	25 %	25 %	25 %	528838084
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12199	NC_021911	CTG	3	9	612394	612402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838084
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12207	NC_021911	CTCG	2	8	612873	612880	0 %	25 %	25 %	50 %	528838085
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12210	NC_021911	TGC	2	6	613178	613183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838085
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12212	NC_021911	CGT	2	6	613326	613331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838085
12213	NC_021911	GCCC	2	8	613385	613392	0 %	0 %	25 %	75 %	528838086
12214	NC_021911	GGC	2	6	613402	613407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838086
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12222	NC_021911	ATC	2	6	613676	613681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838086
12223	NC_021911	GAG	2	6	613685	613690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838086
12224	NC_021911	GAAGCT	2	12	613720	613731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528838086
12225	NC_021911	GCA	2	6	613744	613749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838086
12226	NC_021911	AG	3	6	613787	613792	50 %	0 %	50 %	0 %	528838086
12227	NC_021911	GAA	2	6	613831	613836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838086
12228	NC_021911	GAA	2	6	613873	613878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838086
12229	NC_021911	GAT	2	6	613885	613890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838086
12230	NC_021911	CTG	2	6	613923	613928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838086
12231	NC_021911	CAT	2	6	613945	613950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838086
12232	NC_021911	AGGCA	2	10	613979	613988	40 %	0 %	40 %	20 %	528838086
12233	NC_021911	GCC	2	6	613992	613997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838086
12234	NC_021911	CGGG	2	8	614011	614018	0 %	0 %	75 %	25 %	528838086
12235	NC_021911	CCG	2	6	614028	614033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838086
12236	NC_021911	CCG	2	6	614086	614091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838086
12237	NC_021911	ATC	2	6	614096	614101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838086
12238	NC_021911	CGA	2	6	614157	614162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838086
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12240	NC_021911	CGG	2	6	614242	614247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838086
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12342	NC_021911	GC	3	6	618959	618964	0 %	0 %	50 %	50 %	528838090
12343	NC_021911	CGCC	2	8	618975	618982	0 %	0 %	25 %	75 %	528838090
12344	NC_021911	GTCACG	2	12	618990	619001	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528838091
12345	NC_021911	ACC	2	6	619083	619088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838091
12346	NC_021911	GGGGA	2	10	619274	619283	20 %	0 %	80 %	0 %	528838091
12347	NC_021911	CG	3	6	619291	619296	0 %	0 %	50 %	50 %	528838091
12348	NC_021911	ATCG	2	8	619316	619323	25 %	25 %	25 %	25 %	528838091
12349	NC_021911	GCCGCG	2	12	619385	619396	0 %	0 %	50 %	50 %	528838092
12350	NC_021911	GCCC	2	8	619421	619428	0 %	0 %	25 %	75 %	528838092
12351	NC_021911	CCG	4	12	619453	619464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838092
12352	NC_021911	GCG	2	6	619495	619500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838092
12353	NC_021911	CAG	2	6	619502	619507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838092
12354	NC_021911	GAT	2	6	619516	619521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838092
12355	NC_021911	GA	3	6	619581	619586	50 %	0 %	50 %	0 %	528838092
12356	NC_021911	CGA	2	6	619606	619611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838092
12357	NC_021911	TGA	2	6	619617	619622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838092
12358	NC_021911	CGAC	2	8	619638	619645	25 %	0 %	25 %	50 %	528838092
12359	NC_021911	TCC	2	6	619710	619715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838092
12360	NC_021911	GCA	2	6	619723	619728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838092
12361	NC_021911	GGT	2	6	619745	619750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838092
12362	NC_021911	CGC	3	9	619774	619782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838092
12363	NC_021911	CG	4	8	619805	619812	0 %	0 %	50 %	50 %	528838092
12364	NC_021911	CCGAGC	2	12	619884	619895	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528838092
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12366	NC_021911	CAT	2	6	620021	620026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838092
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12369	NC_021911	ATC	2	6	620358	620363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838093
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12371	NC_021911	CGGT	2	8	620405	620412	0 %	25 %	50 %	25 %	528838093
12372	NC_021911	GCCCG	2	10	620429	620438	0 %	0 %	40 %	60 %	528838093
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12377	NC_021911	GCG	2	6	620545	620550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838093
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12384	NC_021911	TTCGGC	2	12	620813	620824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838093
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12474	NC_021911	CGTGA	2	10	625332	625341	20 %	20 %	40 %	20 %	528838098
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12477	NC_021911	ATA	2	6	625396	625401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528838098
12478	NC_021911	GCC	2	6	625432	625437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838098
12479	NC_021911	GCG	2	6	625474	625479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838098
12480	NC_021911	CTGTC	2	10	625531	625540	0 %	40 %	20 %	40 %	528838098
12481	NC_021911	GCT	2	6	625541	625546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838098
12482	NC_021911	GACG	2	8	625556	625563	25 %	0 %	50 %	25 %	528838098
12483	NC_021911	TCA	2	6	625579	625584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838098
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12486	NC_021911	GCT	2	6	625652	625657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838098
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