MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021911	CGA	2	6	558100	558105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
11002	NC_021911	CCGA	2	8	558234	558241	25 %	0 %	25 %	50 %	528838036
11003	NC_021911	TCC	2	6	558267	558272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838036
11004	NC_021911	GGC	2	6	558378	558383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838036
11005	NC_021911	GCCG	2	8	558395	558402	0 %	0 %	50 %	50 %	528838036
11006	NC_021911	GCCG	2	8	558435	558442	0 %	0 %	50 %	50 %	528838036
11007	NC_021911	CGG	2	6	558565	558570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838036
11008	NC_021911	GC	3	6	558583	558588	0 %	0 %	50 %	50 %	528838036
11009	NC_021911	GCA	2	6	558598	558603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
11010	NC_021911	ACC	2	6	558654	558659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838036
11011	NC_021911	CGG	2	6	558664	558669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838036
11012	NC_021911	TCG	2	6	558735	558740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838036
11013	NC_021911	GAT	3	9	558743	558751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838036
11014	NC_021911	GAC	2	6	558761	558766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
11015	NC_021911	GATG	2	8	558775	558782	25 %	25 %	50 %	0 %	528838036
11016	NC_021911	TCG	2	6	558795	558800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838036
11017	NC_021911	CGA	2	6	558817	558822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
11018	NC_021911	GCA	2	6	558990	558995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838036
11019	NC_021911	CCG	2	6	559040	559045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838036
11020	NC_021911	GAT	2	6	559075	559080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838036
11021	NC_021911	CCG	2	6	559087	559092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838036
11022	NC_021911	CTTC	2	8	559240	559247	0 %	50 %	0 %	50 %	528838037
11023	NC_021911	CCTT	2	8	559277	559284	0 %	50 %	0 %	50 %	528838037
11024	NC_021911	TCG	2	6	559305	559310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838037
11025	NC_021911	CGG	2	6	559358	559363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838037
11026	NC_021911	CCGG	2	8	559408	559415	0 %	0 %	50 %	50 %	528838037
11027	NC_021911	CTC	2	6	559429	559434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838037
11028	NC_021911	TCT	2	6	559446	559451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838037
11029	NC_021911	CGT	2	6	559458	559463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838037
11030	NC_021911	GCC	2	6	559478	559483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838037
11031	NC_021911	CGA	2	6	559509	559514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838037
11032	NC_021911	GCC	2	6	559637	559642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838037
11033	NC_021911	CCGG	2	8	559961	559968	0 %	0 %	50 %	50 %	528838038
11034	NC_021911	CGG	2	6	559987	559992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838038
11035	NC_021911	GC	3	6	560022	560027	0 %	0 %	50 %	50 %	528838038
11036	NC_021911	GAC	2	6	560082	560087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838038
11037	NC_021911	TCC	2	6	560170	560175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838039
11038	NC_021911	CGG	2	6	560187	560192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838039
11039	NC_021911	CGC	2	6	560202	560207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
11040	NC_021911	GCC	2	6	560257	560262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
11041	NC_021911	CGC	2	6	560266	560271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
11042	NC_021911	TGCC	2	8	560284	560291	0 %	25 %	25 %	50 %	528838039
11043	NC_021911	TCG	2	6	560297	560302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11044	NC_021911	CG	4	8	560307	560314	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11045	NC_021911	GCA	2	6	560342	560347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11046	NC_021911	AAG	2	6	560435	560440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838039
11047	NC_021911	GCT	2	6	560469	560474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11048	NC_021911	CGG	3	9	560550	560558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838039
11049	NC_021911	GCC	2	6	560578	560583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
11050	NC_021911	TCG	2	6	560594	560599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11051	NC_021911	CGG	2	6	560642	560647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838039
11052	NC_021911	CG	4	8	560664	560671	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11053	NC_021911	CCG	2	6	560688	560693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
11054	NC_021911	ATG	2	6	560716	560721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838039
11055	NC_021911	GAG	2	6	560752	560757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838039
11056	NC_021911	GC	3	6	560766	560771	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11057	NC_021911	GGC	2	6	560823	560828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838039
11058	NC_021911	GAC	2	6	560829	560834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11059	NC_021911	GCA	2	6	560836	560841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11060	NC_021911	CAG	2	6	560967	560972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11061	NC_021911	GGCC	2	8	560979	560986	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11062	NC_021911	TGC	2	6	561002	561007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11063	NC_021911	GAG	2	6	561070	561075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838039
11064	NC_021911	CTG	2	6	561103	561108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11065	NC_021911	GAG	2	6	561109	561114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838039
11066	NC_021911	CAT	2	6	561204	561209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838039
11067	NC_021911	CGCC	2	8	561216	561223	0 %	0 %	25 %	75 %	528838039
11068	NC_021911	GAT	2	6	561237	561242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838039
11069	NC_021911	GC	3	6	561285	561290	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11070	NC_021911	CGA	2	6	561306	561311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11071	NC_021911	GCT	2	6	561372	561377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
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11075	NC_021911	GCT	2	6	561591	561596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
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11082	NC_021911	CG	3	6	561914	561919	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11083	NC_021911	CCG	2	6	561932	561937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
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11090	NC_021911	GC	3	6	562050	562055	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11091	NC_021911	GCC	2	6	562072	562077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
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11095	NC_021911	GCA	3	9	562300	562308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
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11102	NC_021911	CGGC	2	8	562472	562479	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11103	NC_021911	CGG	2	6	562581	562586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838039
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11108	NC_021911	CTGC	2	8	562698	562705	0 %	25 %	25 %	50 %	528838039
11109	NC_021911	GAC	2	6	562708	562713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
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11113	NC_021911	GCTGCC	2	12	562881	562892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528838039
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11116	NC_021911	ATC	2	6	562930	562935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838039
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11118	NC_021911	TGC	2	6	562982	562987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11119	NC_021911	GTC	2	6	562990	562995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11120	NC_021911	CGA	2	6	563028	563033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11121	NC_021911	CGA	2	6	563082	563087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838039
11122	NC_021911	CAT	2	6	563145	563150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838039
11123	NC_021911	CGG	2	6	563178	563183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838039
11124	NC_021911	CGG	2	6	563214	563219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838039
11125	NC_021911	GCC	2	6	563234	563239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
11126	NC_021911	GC	3	6	563247	563252	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11127	NC_021911	GCC	2	6	563259	563264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838039
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11130	NC_021911	CG	3	6	563441	563446	0 %	0 %	50 %	50 %	528838039
11131	NC_021911	AGACGG	2	12	563468	563479	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	528838039
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11133	NC_021911	GCTG	2	8	563559	563566	0 %	25 %	50 %	25 %	528838039
11134	NC_021911	CGG	2	6	563573	563578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838039
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11137	NC_021911	AAG	2	6	563680	563685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838039
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11144	NC_021911	CGG	2	6	564160	564165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838040
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11149	NC_021911	CATC	2	8	564433	564440	25 %	25 %	0 %	50 %	528838040
11150	NC_021911	CGC	2	6	564493	564498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838040
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11159	NC_021911	AC	3	6	565266	565271	50 %	0 %	0 %	50 %	528838041
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11166	NC_021911	TCA	2	6	565507	565512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838041
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11196	NC_021911	GCG	2	6	566552	566557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838042
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11202	NC_021911	GCGG	2	8	566797	566804	0 %	0 %	75 %	25 %	528838042
11203	NC_021911	CGAAG	2	10	566869	566878	40 %	0 %	40 %	20 %	528838042
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11206	NC_021911	GCC	2	6	567047	567052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838042
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11209	NC_021911	CTT	2	6	567172	567177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838042
11210	NC_021911	ACTC	2	8	567228	567235	25 %	25 %	0 %	50 %	528838042
11211	NC_021911	GAT	2	6	567247	567252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838042
11212	NC_021911	CCTGG	2	10	567314	567323	0 %	20 %	40 %	40 %	528838042
11213	NC_021911	ATCA	2	8	567332	567339	50 %	25 %	0 %	25 %	528838042
11214	NC_021911	GAAA	2	8	567378	567385	75 %	0 %	25 %	0 %	528838043
11215	NC_021911	CTCC	2	8	567387	567394	0 %	25 %	0 %	75 %	528838043
11216	NC_021911	TCG	2	6	567533	567538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838043
11217	NC_021911	GAC	3	9	567567	567575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838043
11218	NC_021911	AGCG	2	8	567579	567586	25 %	0 %	50 %	25 %	528838043
11219	NC_021911	GGC	2	6	567681	567686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838043
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11221	NC_021911	GC	3	6	567784	567789	0 %	0 %	50 %	50 %	528838043
11222	NC_021911	CCA	2	6	567824	567829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528838043
11223	NC_021911	CTA	2	6	567861	567866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838043
11224	NC_021911	TGC	2	6	567906	567911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838043
11225	NC_021911	GAG	2	6	567931	567936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528838043
11226	NC_021911	GCT	2	6	567957	567962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838043
11227	NC_021911	TGA	2	6	567992	567997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838043
11228	NC_021911	GC	3	6	567998	568003	0 %	0 %	50 %	50 %	528838043
11229	NC_021911	CGG	2	6	568041	568046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838043
11230	NC_021911	CGG	3	9	568049	568057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838043
11231	NC_021911	CA	3	6	568109	568114	50 %	0 %	0 %	50 %	528838044
11232	NC_021911	TGC	2	6	568195	568200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838044
11233	NC_021911	GC	4	8	568232	568239	0 %	0 %	50 %	50 %	528838044
11234	NC_021911	CCG	2	6	568245	568250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838044
11235	NC_021911	TTC	2	6	568254	568259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838044
11236	NC_021911	GCG	2	6	568281	568286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838044
11237	NC_021911	GGC	2	6	568325	568330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838044
11238	NC_021911	GCA	2	6	568467	568472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838044
11239	NC_021911	TGC	2	6	568490	568495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838044
11240	NC_021911	CGG	2	6	568505	568510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838044
11241	NC_021911	TCG	2	6	568525	568530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838044
11242	NC_021911	GGT	2	6	568589	568594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528838044
11243	NC_021911	GC	4	8	568630	568637	0 %	0 %	50 %	50 %	528838044
11244	NC_021911	TCG	2	6	568657	568662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838044
11245	NC_021911	TGC	2	6	568686	568691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838044
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11247	NC_021911	GCG	2	6	568819	568824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838044
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11250	NC_021911	ATC	2	6	568879	568884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528838044
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11252	NC_021911	AG	3	6	568940	568945	50 %	0 %	50 %	0 %	528838044
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11285	NC_021911	CCGC	2	8	570796	570803	0 %	0 %	25 %	75 %	528838046
11286	NC_021911	GC	3	6	570877	570882	0 %	0 %	50 %	50 %	528838046
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11293	NC_021911	CGT	3	9	571184	571192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838046
11294	NC_021911	GTC	2	6	571235	571240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838046
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11297	NC_021911	CGTCAT	2	12	571393	571404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528838047
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11348	NC_021911	AGA	2	6	573023	573028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528838049
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11351	NC_021911	AGC	2	6	573155	573160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838049
11352	NC_021911	CGA	2	6	573180	573185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838049
11353	NC_021911	CGA	2	6	573202	573207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838049
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11355	NC_021911	TCG	2	6	573282	573287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838049
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11475	NC_021911	TTG	2	6	580111	580116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838056
11476	NC_021911	CTT	2	6	580200	580205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528838056
11477	NC_021911	ACG	2	6	580216	580221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838056
11478	NC_021911	GACC	2	8	580232	580239	25 %	0 %	25 %	50 %	528838056
11479	NC_021911	CTG	2	6	580251	580256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838056
11480	NC_021911	CTC	2	6	580275	580280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838056
11481	NC_021911	TCG	2	6	580384	580389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11482	NC_021911	CG	3	6	580409	580414	0 %	0 %	50 %	50 %	528838057
11483	NC_021911	CG	3	6	580460	580465	0 %	0 %	50 %	50 %	528838057
11484	NC_021911	AGC	2	6	580480	580485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11485	NC_021911	CCT	2	6	580505	580510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528838057
11486	NC_021911	GT	3	6	580555	580560	0 %	50 %	50 %	0 %	528838057
11487	NC_021911	ATG	2	6	580606	580611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528838057
11488	NC_021911	CGT	2	6	580628	580633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11489	NC_021911	TTG	2	6	580672	580677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528838057
11490	NC_021911	TCG	2	6	580723	580728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11491	NC_021911	GCC	2	6	580741	580746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838057
11492	NC_021911	CGC	2	6	580749	580754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528838057
11493	NC_021911	CGG	2	6	580757	580762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838057
11494	NC_021911	CAG	3	9	580767	580775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11495	NC_021911	TCG	2	6	580792	580797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11496	NC_021911	GCG	3	9	580800	580808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528838057
11497	NC_021911	CGA	2	6	580835	580840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11498	NC_021911	TGC	2	6	580843	580848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11499	NC_021911	GAC	2	6	580851	580856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528838057
11500	NC_021911	GCCTTC	2	12	580860	580871	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	528838057

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