MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021911	ACC	2	6	418335	418340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837909
8002	NC_021911	GCCG	2	8	418376	418383	0 %	0 %	50 %	50 %	528837909
8003	NC_021911	CGA	2	6	418396	418401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837909
8004	NC_021911	GCC	2	6	418436	418441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837909
8005	NC_021911	GATA	2	8	418458	418465	50 %	25 %	25 %	0 %	528837909
8006	NC_021911	GGC	2	6	418607	418612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837909
8007	NC_021911	GCC	2	6	418662	418667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837909
8008	NC_021911	CGG	2	6	418687	418692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837909
8009	NC_021911	CGG	3	9	418705	418713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837909
8010	NC_021911	ACG	2	6	418716	418721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837909
8011	NC_021911	CTCG	2	8	418736	418743	0 %	25 %	25 %	50 %	528837909
8012	NC_021911	GTT	2	6	418796	418801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837909
8013	NC_021911	TCT	2	6	418813	418818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837909
8014	NC_021911	GGC	2	6	418853	418858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837909
8015	NC_021911	TGC	2	6	419183	419188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8016	NC_021911	GCT	2	6	419235	419240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8017	NC_021911	CGGT	2	8	419272	419279	0 %	25 %	50 %	25 %	528837910
8018	NC_021911	CAT	2	6	419298	419303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837910
8019	NC_021911	TGC	2	6	419330	419335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8020	NC_021911	GGC	2	6	419341	419346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837910
8021	NC_021911	CGCT	2	8	419428	419435	0 %	25 %	25 %	50 %	528837910
8022	NC_021911	TCG	2	6	419522	419527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8023	NC_021911	GAG	2	6	419538	419543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837910
8024	NC_021911	ATC	2	6	419578	419583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837910
8025	NC_021911	GCA	2	6	419584	419589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8026	NC_021911	GGGC	2	8	419609	419616	0 %	0 %	75 %	25 %	528837910
8027	NC_021911	GC	3	6	419640	419645	0 %	0 %	50 %	50 %	528837910
8028	NC_021911	CAT	2	6	419649	419654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837910
8029	NC_021911	CTG	2	6	419662	419667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8030	NC_021911	TTC	2	6	419677	419682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837910
8031	NC_021911	GGC	2	6	419691	419696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837910
8032	NC_021911	GCCCGC	2	12	419734	419745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837910
8033	NC_021911	CGG	2	6	419860	419865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837910
8034	NC_021911	GCA	2	6	419931	419936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8035	NC_021911	TGCA	2	8	419938	419945	25 %	25 %	25 %	25 %	528837910
8036	NC_021911	ATC	2	6	419959	419964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837910
8037	NC_021911	CAT	2	6	420019	420024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837910
8038	NC_021911	CGA	2	6	420075	420080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8039	NC_021911	GC	3	6	420089	420094	0 %	0 %	50 %	50 %	528837910
8040	NC_021911	ACCG	2	8	420108	420115	25 %	0 %	25 %	50 %	528837910
8041	NC_021911	AGG	2	6	420143	420148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837910
8042	NC_021911	CAA	2	6	420153	420158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837910
8043	NC_021911	GCC	2	6	420172	420177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837910
8044	NC_021911	CGA	3	9	420207	420215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8045	NC_021911	TCGA	2	8	420223	420230	25 %	25 %	25 %	25 %	528837910
8046	NC_021911	CGA	2	6	420237	420242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8047	NC_021911	CGG	2	6	420279	420284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837910
8048	NC_021911	CG	3	6	420321	420326	0 %	0 %	50 %	50 %	528837910
8049	NC_021911	ATA	2	6	420347	420352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837910
8050	NC_021911	CGT	2	6	420372	420377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8051	NC_021911	CGA	2	6	420389	420394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837910
8052	NC_021911	CGG	2	6	420401	420406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837910
8053	NC_021911	GAG	2	6	420419	420424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837910
8054	NC_021911	TCG	2	6	420447	420452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837911
8055	NC_021911	GAC	2	6	420455	420460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837911
8056	NC_021911	GCC	2	6	420497	420502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837911
8057	NC_021911	CCG	2	6	420543	420548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837911
8058	NC_021911	GGC	2	6	420625	420630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837911
8059	NC_021911	ATT	2	6	420681	420686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528837911
8060	NC_021911	GCG	2	6	420705	420710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837911
8061	NC_021911	TC	3	6	420711	420716	0 %	50 %	0 %	50 %	528837911
8062	NC_021911	GCC	2	6	420734	420739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837911
8063	NC_021911	CGA	2	6	420766	420771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837911
8064	NC_021911	TGCGC	2	10	420784	420793	0 %	20 %	40 %	40 %	528837911
8065	NC_021911	GCA	2	6	420844	420849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837911
8066	NC_021911	GACC	2	8	420922	420929	25 %	0 %	25 %	50 %	528837911
8067	NC_021911	GCA	2	6	420982	420987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837911
8068	NC_021911	CAG	2	6	421017	421022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837911
8069	NC_021911	CGA	2	6	421024	421029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837911
8070	NC_021911	TCA	2	6	421235	421240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837912
8071	NC_021911	TTC	2	6	421266	421271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837912
8072	NC_021911	TCCA	2	8	421275	421282	25 %	25 %	0 %	50 %	528837912
8073	NC_021911	GGC	3	9	421392	421400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837912
8074	NC_021911	CTTTT	2	10	421451	421460	0 %	80 %	0 %	20 %	528837912
8075	NC_021911	CG	3	6	421579	421584	0 %	0 %	50 %	50 %	528837913
8076	NC_021911	ACCG	2	8	421597	421604	25 %	0 %	25 %	50 %	528837913
8077	NC_021911	CAG	2	6	421654	421659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837914
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8080	NC_021911	CTG	2	6	421755	421760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837914
8081	NC_021911	CCGA	2	8	421809	421816	25 %	0 %	25 %	50 %	528837914
8082	NC_021911	CAA	2	6	421838	421843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837914
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8084	NC_021911	TCT	2	6	421890	421895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837914
8085	NC_021911	GCG	2	6	421999	422004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837914
8086	NC_021911	GTGA	2	8	422028	422035	25 %	25 %	50 %	0 %	528837914
8087	NC_021911	TGT	2	6	422159	422164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837914
8088	NC_021911	TGC	2	6	422227	422232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837914
8089	NC_021911	TCG	2	6	422245	422250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837914
8090	NC_021911	GGC	2	6	422399	422404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837914
8091	NC_021911	GCTG	2	8	422449	422456	0 %	25 %	50 %	25 %	528837914
8092	NC_021911	TCC	2	6	422487	422492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837914
8093	NC_021911	GGCT	2	8	422659	422666	0 %	25 %	50 %	25 %	528837915
8094	NC_021911	GCCG	2	8	422667	422674	0 %	0 %	50 %	50 %	528837915
8095	NC_021911	CGA	3	9	422704	422712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837915
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8099	NC_021911	ACC	2	6	422873	422878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837915
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8103	NC_021911	GC	3	6	422950	422955	0 %	0 %	50 %	50 %	528837915
8104	NC_021911	TGGA	2	8	422983	422990	25 %	25 %	50 %	0 %	528837915
8105	NC_021911	GA	3	6	423018	423023	50 %	0 %	50 %	0 %	528837915
8106	NC_021911	AAT	2	6	423058	423063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837915
8107	NC_021911	GAC	2	6	423077	423082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837915
8108	NC_021911	GGCG	2	8	423103	423110	0 %	0 %	75 %	25 %	528837915
8109	NC_021911	CAC	2	6	423143	423148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837915
8110	NC_021911	GCA	2	6	423238	423243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837915
8111	NC_021911	CAG	2	6	423251	423256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837915
8112	NC_021911	CGA	2	6	423265	423270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837915
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8119	NC_021911	TGAA	2	8	423537	423544	50 %	25 %	25 %	0 %	528837915
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8121	NC_021911	GCC	2	6	423813	423818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837916
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8243	NC_021911	CGG	2	6	429971	429976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837921
8244	NC_021911	ATA	2	6	430027	430032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528837921
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8355	NC_021911	CCGAG	2	10	435511	435520	20 %	0 %	40 %	40 %	528837926
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8360	NC_021911	CGA	2	6	435610	435615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837926
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8484	NC_021911	ACG	2	6	440075	440080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837930
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8486	NC_021911	GGC	2	6	440122	440127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837930
8487	NC_021911	GC	3	6	440144	440149	0 %	0 %	50 %	50 %	528837930
8488	NC_021911	GGCG	2	8	440169	440176	0 %	0 %	75 %	25 %	528837930
8489	NC_021911	CGC	2	6	440211	440216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837930
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