MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021911	CTC	2	6	324953	324958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837824
6002	NC_021911	GCC	2	6	324986	324991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837824
6003	NC_021911	GA	3	6	325089	325094	50 %	0 %	50 %	0 %	528837824
6004	NC_021911	GGC	2	6	325109	325114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837824
6005	NC_021911	TGC	2	6	325181	325186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837824
6006	NC_021911	TGA	2	6	325273	325278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837824
6007	NC_021911	TGA	2	6	325300	325305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837824
6008	NC_021911	GAC	2	6	325329	325334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837824
6009	NC_021911	CGCC	2	8	325343	325350	0 %	0 %	25 %	75 %	528837824
6010	NC_021911	GCA	2	6	325378	325383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837824
6011	NC_021911	CGC	2	6	325454	325459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837824
6012	NC_021911	GCC	2	6	325463	325468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837824
6013	NC_021911	GAA	2	6	325499	325504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837824
6014	NC_021911	CGC	3	9	325627	325635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837824
6015	NC_021911	GACG	2	8	325711	325718	25 %	0 %	50 %	25 %	528837824
6016	NC_021911	CAG	2	6	325850	325855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837824
6017	NC_021911	TTGG	2	8	325856	325863	0 %	50 %	50 %	0 %	528837824
6018	NC_021911	TCT	2	6	325990	325995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837825
6019	NC_021911	CTGTC	2	10	326028	326037	0 %	40 %	20 %	40 %	528837825
6020	NC_021911	TTC	2	6	326150	326155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837825
6021	NC_021911	TGC	2	6	326162	326167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837825
6022	NC_021911	GCCT	2	8	326174	326181	0 %	25 %	25 %	50 %	528837825
6023	NC_021911	ATC	2	6	326219	326224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837825
6024	NC_021911	CGG	2	6	326290	326295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837825
6025	NC_021911	GCA	2	6	326334	326339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837825
6026	NC_021911	GCC	2	6	326373	326378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837825
6027	NC_021911	GC	3	6	326406	326411	0 %	0 %	50 %	50 %	528837825
6028	NC_021911	GCC	2	6	326441	326446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837825
6029	NC_021911	GAA	2	6	326555	326560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837825
6030	NC_021911	GCG	2	6	326617	326622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837826
6031	NC_021911	GCG	2	6	326767	326772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837826
6032	NC_021911	GC	4	8	326800	326807	0 %	0 %	50 %	50 %	528837826
6033	NC_021911	CG	3	6	326927	326932	0 %	0 %	50 %	50 %	528837826
6034	NC_021911	TCG	2	6	326944	326949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837826
6035	NC_021911	AG	3	6	326962	326967	50 %	0 %	50 %	0 %	528837826
6036	NC_021911	CGA	2	6	327005	327010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837826
6037	NC_021911	GAT	2	6	327011	327016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837826
6038	NC_021911	TCG	2	6	327064	327069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837826
6039	NC_021911	ATG	2	6	327070	327075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837826
6040	NC_021911	CGAT	2	8	327076	327083	25 %	25 %	25 %	25 %	528837826
6041	NC_021911	AGA	2	6	327110	327115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837826
6042	NC_021911	GCC	2	6	327810	327815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837827
6043	NC_021911	CGC	2	6	327830	327835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837827
6044	NC_021911	TCT	2	6	327930	327935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837827
6045	NC_021911	GTC	2	6	327954	327959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837827
6046	NC_021911	GCCT	2	8	328043	328050	0 %	25 %	25 %	50 %	528837827
6047	NC_021911	GCC	2	6	328059	328064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837827
6048	NC_021911	GCC	2	6	328082	328087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837827
6049	NC_021911	GCC	2	6	328091	328096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837827
6050	NC_021911	TGC	2	6	328207	328212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837827
6051	NC_021911	GCA	2	6	328300	328305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837827
6052	NC_021911	TGG	2	6	328351	328356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837827
6053	NC_021911	GGC	2	6	328411	328416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837827
6054	NC_021911	GAT	2	6	328451	328456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837827
6055	NC_021911	CCA	2	6	328482	328487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837827
6056	NC_021911	TCG	3	9	328495	328503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837827
6057	NC_021911	GGC	2	6	328601	328606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837827
6058	NC_021911	TAG	2	6	328659	328664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837827
6059	NC_021911	GC	3	6	328665	328670	0 %	0 %	50 %	50 %	528837827
6060	NC_021911	GTC	2	6	328676	328681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837827
6061	NC_021911	CGA	2	6	328717	328722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837827
6062	NC_021911	GCC	2	6	328775	328780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837827
6063	NC_021911	TGT	2	6	328804	328809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837827
6064	NC_021911	GCC	2	6	328848	328853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837827
6065	NC_021911	GCC	2	6	328875	328880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837827
6066	NC_021911	ACC	2	6	328883	328888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837827
6067	NC_021911	CAGCG	2	10	328892	328901	20 %	0 %	40 %	40 %	528837827
6068	NC_021911	TGG	2	6	328924	328929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837827
6069	NC_021911	GT	3	6	328942	328947	0 %	50 %	50 %	0 %	528837827
6070	NC_021911	TCC	2	6	328962	328967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837827
6071	NC_021911	GGAA	2	8	329008	329015	50 %	0 %	50 %	0 %	528837827
6072	NC_021911	GTC	2	6	329016	329021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837827
6073	NC_021911	CGG	2	6	329030	329035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837827
6074	NC_021911	CGT	2	6	329048	329053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837827
6075	NC_021911	GC	3	6	329061	329066	0 %	0 %	50 %	50 %	528837827
6076	NC_021911	CGG	2	6	329598	329603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837828
6077	NC_021911	GTC	2	6	329650	329655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837828
6078	NC_021911	GAG	2	6	329680	329685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837828
6079	NC_021911	AGT	2	6	329697	329702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837828
6080	NC_021911	GCC	2	6	329749	329754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837828
6081	NC_021911	ATGG	2	8	329837	329844	25 %	25 %	50 %	0 %	528837828
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6083	NC_021911	CTG	2	6	329923	329928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837829
6084	NC_021911	CT	3	6	329956	329961	0 %	50 %	0 %	50 %	528837829
6085	NC_021911	CCG	2	6	329990	329995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837829
6086	NC_021911	CGT	2	6	330021	330026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837829
6087	NC_021911	CTT	2	6	330034	330039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837829
6088	NC_021911	ACC	2	6	330041	330046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837829
6089	NC_021911	ACT	2	6	330095	330100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837829
6090	NC_021911	AAGGC	2	10	330123	330132	40 %	0 %	40 %	20 %	528837829
6091	NC_021911	GTCG	2	8	330362	330369	0 %	25 %	50 %	25 %	528837830
6092	NC_021911	CG	3	6	330368	330373	0 %	0 %	50 %	50 %	528837830
6093	NC_021911	CGG	2	6	330549	330554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837830
6094	NC_021911	ATT	2	6	330646	330651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528837830
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6097	NC_021911	GCTGG	2	10	330736	330745	0 %	20 %	60 %	20 %	528837831
6098	NC_021911	CGG	2	6	330768	330773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837831
6099	NC_021911	GCGCG	2	10	330802	330811	0 %	0 %	60 %	40 %	528837831
6100	NC_021911	GCGG	2	8	330821	330828	0 %	0 %	75 %	25 %	528837831
6101	NC_021911	GGC	2	6	330830	330835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837831
6102	NC_021911	GCCTGG	2	12	330840	330851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528837831
6103	NC_021911	TCA	2	6	330873	330878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837831
6104	NC_021911	CGA	2	6	330890	330895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837831
6105	NC_021911	TGA	2	6	331000	331005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837831
6106	NC_021911	CGG	2	6	331048	331053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837831
6107	NC_021911	GCCT	2	8	331063	331070	0 %	25 %	25 %	50 %	528837831
6108	NC_021911	CGG	2	6	331105	331110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837831
6109	NC_021911	GCC	3	9	331160	331168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837831
6110	NC_021911	GCC	2	6	331175	331180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837831
6111	NC_021911	CG	3	6	331192	331197	0 %	0 %	50 %	50 %	528837831
6112	NC_021911	CGG	2	6	331210	331215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837831
6113	NC_021911	GGT	2	6	331232	331237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837831
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6115	NC_021911	GAA	2	6	331310	331315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837831
6116	NC_021911	GAA	2	6	331355	331360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837831
6117	NC_021911	GCG	2	6	331373	331378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837831
6118	NC_021911	GGCG	2	8	331417	331424	0 %	0 %	75 %	25 %	528837831
6119	NC_021911	AAG	2	6	331439	331444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837831
6120	NC_021911	GAT	2	6	331454	331459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837831
6121	NC_021911	CGC	2	6	331691	331696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837831
6122	NC_021911	CAC	2	6	331700	331705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837831
6123	NC_021911	CCGC	2	8	331727	331734	0 %	0 %	25 %	75 %	528837831
6124	NC_021911	CGA	2	6	331762	331767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837831
6125	NC_021911	GAT	2	6	331801	331806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837831
6126	NC_021911	TTC	2	6	331830	331835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837831
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6130	NC_021911	TCG	2	6	331902	331907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837831
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6135	NC_021911	GCC	2	6	332160	332165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837831
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6142	NC_021911	CGG	2	6	332454	332459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837832
6143	NC_021911	ACG	2	6	332481	332486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837832
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6151	NC_021911	TCA	2	6	332946	332951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837832
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6153	NC_021911	CGG	2	6	333338	333343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837833
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6222	NC_021911	CAGA	2	8	335831	335838	50 %	0 %	25 %	25 %	528837835
6223	NC_021911	CAA	2	6	335851	335856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837835
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6227	NC_021911	AG	3	6	335926	335931	50 %	0 %	50 %	0 %	528837836
6228	NC_021911	GC	3	6	335936	335941	0 %	0 %	50 %	50 %	528837836
6229	NC_021911	CG	3	6	335943	335948	0 %	0 %	50 %	50 %	528837836
6230	NC_021911	GATC	2	8	335949	335956	25 %	25 %	25 %	25 %	528837836
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6233	NC_021911	CGC	2	6	336114	336119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837836
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6237	NC_021911	CTTCG	2	10	336199	336208	0 %	40 %	20 %	40 %	528837836
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6241	NC_021911	AGCC	2	8	336296	336303	25 %	0 %	25 %	50 %	528837836
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6482	NC_021911	CGA	2	6	347113	347118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837845
6483	NC_021911	CGGG	2	8	347122	347129	0 %	0 %	75 %	25 %	528837845
6484	NC_021911	CGG	2	6	347148	347153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837845
6485	NC_021911	CG	3	6	347164	347169	0 %	0 %	50 %	50 %	528837845
6486	NC_021911	CGA	2	6	347233	347238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837845
6487	NC_021911	CGG	2	6	347273	347278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837845
6488	NC_021911	GCC	2	6	347285	347290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837845
6489	NC_021911	GAT	3	9	347311	347319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837845
6490	NC_021911	GAT	2	6	347357	347362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837845
6491	NC_021911	CCTT	2	8	347379	347386	0 %	50 %	0 %	50 %	528837845
6492	NC_021911	TCG	2	6	347397	347402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837845
6493	NC_021911	TTC	2	6	347478	347483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837845
6494	NC_021911	GCG	2	6	347821	347826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837846
6495	NC_021911	TGC	2	6	347832	347837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837846
6496	NC_021911	CTG	2	6	347882	347887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837846
6497	NC_021911	AG	3	6	347947	347952	50 %	0 %	50 %	0 %	528837846
6498	NC_021911	CAA	2	6	348019	348024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837846
6499	NC_021911	CGC	2	6	348051	348056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837846
6500	NC_021911	CGT	2	6	348151	348156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837846

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