MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 21250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021911	GCA	2	6	300079	300084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837802
5502	NC_021911	CG	3	6	300101	300106	0 %	0 %	50 %	50 %	528837802
5503	NC_021911	CGG	2	6	300131	300136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837802
5504	NC_021911	GAG	2	6	300138	300143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837802
5505	NC_021911	CAC	2	6	300315	300320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837803
5506	NC_021911	CG	3	6	300341	300346	0 %	0 %	50 %	50 %	528837803
5507	NC_021911	AAC	2	6	300351	300356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837803
5508	NC_021911	CTT	2	6	300359	300364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837803
5509	NC_021911	CGA	2	6	300410	300415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837803
5510	NC_021911	CTA	2	6	300434	300439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837803
5511	NC_021911	CGA	2	6	300443	300448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837803
5512	NC_021911	TGA	2	6	300469	300474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837803
5513	NC_021911	ATG	2	6	300495	300500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837803
5514	NC_021911	TCG	2	6	300585	300590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837803
5515	NC_021911	GCCG	2	8	300630	300637	0 %	0 %	50 %	50 %	528837803
5516	NC_021911	CGA	2	6	300689	300694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837803
5517	NC_021911	CGC	2	6	300696	300701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837803
5518	NC_021911	CGG	2	6	300719	300724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837803
5519	NC_021911	GAC	2	6	300732	300737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837803
5520	NC_021911	GC	3	6	300824	300829	0 %	0 %	50 %	50 %	528837803
5521	NC_021911	AGG	2	6	300835	300840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837803
5522	NC_021911	CGAT	2	8	300886	300893	25 %	25 %	25 %	25 %	528837803
5523	NC_021911	CCA	2	6	300944	300949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837803
5524	NC_021911	ACT	2	6	301045	301050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837803
5525	NC_021911	CCA	2	6	301099	301104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837803
5526	NC_021911	CG	3	6	301185	301190	0 %	0 %	50 %	50 %	528837803
5527	NC_021911	GCTG	2	8	301214	301221	0 %	25 %	50 %	25 %	528837803
5528	NC_021911	CAGC	2	8	301534	301541	25 %	0 %	25 %	50 %	528837804
5529	NC_021911	CAG	2	6	301556	301561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837804
5530	NC_021911	TCGA	2	8	301586	301593	25 %	25 %	25 %	25 %	528837804
5531	NC_021911	GAA	2	6	301606	301611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837804
5532	NC_021911	AGC	2	6	301633	301638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837804
5533	NC_021911	ACC	2	6	301658	301663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837804
5534	NC_021911	CAC	2	6	301666	301671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837804
5535	NC_021911	GAC	2	6	301769	301774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837804
5536	NC_021911	GAA	2	6	301798	301803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837804
5537	NC_021911	GCC	3	9	301805	301813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837804
5538	NC_021911	AAG	2	6	301820	301825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837804
5539	NC_021911	TCG	2	6	301827	301832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837804
5540	NC_021911	CT	3	6	301872	301877	0 %	50 %	0 %	50 %	528837804
5541	NC_021911	ACG	2	6	301887	301892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837804
5542	NC_021911	TGG	2	6	301914	301919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528837804
5543	NC_021911	CGG	2	6	301930	301935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837804
5544	NC_021911	GGCG	2	8	301981	301988	0 %	0 %	75 %	25 %	528837804
5545	NC_021911	GCA	2	6	302005	302010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837804
5546	NC_021911	ACG	2	6	302055	302060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837804
5547	NC_021911	CAC	2	6	302065	302070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837804
5548	NC_021911	ATCT	2	8	302257	302264	25 %	50 %	0 %	25 %	528837805
5549	NC_021911	TCG	2	6	302348	302353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837805
5550	NC_021911	CTG	2	6	302356	302361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837805
5551	NC_021911	AGC	2	6	302378	302383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837805
5552	NC_021911	GCG	2	6	302480	302485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837805
5553	NC_021911	TGA	2	6	302536	302541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837805
5554	NC_021911	GGGCG	2	10	302561	302570	0 %	0 %	80 %	20 %	528837806
5555	NC_021911	GCC	2	6	302610	302615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837806
5556	NC_021911	CAG	2	6	302622	302627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5557	NC_021911	TCC	2	6	302659	302664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837806
5558	NC_021911	GTTT	2	8	302731	302738	0 %	75 %	25 %	0 %	528837806
5559	NC_021911	CAT	2	6	302762	302767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837806
5560	NC_021911	ATC	2	6	302793	302798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837806
5561	NC_021911	GTC	2	6	302850	302855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5562	NC_021911	ACA	2	6	302872	302877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837806
5563	NC_021911	TCGC	2	8	302900	302907	0 %	25 %	25 %	50 %	528837806
5564	NC_021911	GGC	2	6	302979	302984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
5565	NC_021911	CGA	2	6	303019	303024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5566	NC_021911	GAG	2	6	303027	303032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837806
5567	NC_021911	TCC	2	6	303064	303069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837806
5568	NC_021911	CG	3	6	303084	303089	0 %	0 %	50 %	50 %	528837806
5569	NC_021911	GCG	2	6	303102	303107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
5570	NC_021911	GCGG	2	8	303110	303117	0 %	0 %	75 %	25 %	528837806
5571	NC_021911	CG	3	6	303127	303132	0 %	0 %	50 %	50 %	528837806
5572	NC_021911	CCCG	2	8	303143	303150	0 %	0 %	25 %	75 %	528837806
5573	NC_021911	GCG	2	6	303151	303156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
5574	NC_021911	CTG	2	6	303192	303197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5575	NC_021911	GCG	2	6	303337	303342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
5576	NC_021911	CGA	2	6	303389	303394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5577	NC_021911	GAAG	2	8	303443	303450	50 %	0 %	50 %	0 %	528837806
5578	NC_021911	ACT	2	6	303505	303510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528837806
5579	NC_021911	TCT	2	6	303541	303546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837806
5580	NC_021911	GCC	2	6	303549	303554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837806
5581	NC_021911	GGA	2	6	303614	303619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528837806
5582	NC_021911	GTT	2	6	303621	303626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528837806
5583	NC_021911	CG	3	6	303690	303695	0 %	0 %	50 %	50 %	528837806
5584	NC_021911	CAA	2	6	303716	303721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837806
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5586	NC_021911	GGC	3	9	303807	303815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
5587	NC_021911	GCA	2	6	303824	303829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5588	NC_021911	TGGCG	2	10	303875	303884	0 %	20 %	60 %	20 %	528837806
5589	NC_021911	CGG	2	6	303934	303939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
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5591	NC_021911	CGG	2	6	304013	304018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
5592	NC_021911	AAG	2	6	304113	304118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528837806
5593	NC_021911	TCG	2	6	304150	304155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5594	NC_021911	CTT	2	6	304169	304174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837806
5595	NC_021911	CGG	2	6	304226	304231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
5596	NC_021911	CGA	2	6	304268	304273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5597	NC_021911	GC	3	6	304360	304365	0 %	0 %	50 %	50 %	528837806
5598	NC_021911	GCG	2	6	304373	304378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837806
5599	NC_021911	TTC	2	6	304482	304487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837806
5600	NC_021911	CTG	2	6	304505	304510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837806
5601	NC_021911	CAA	2	6	304719	304724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528837807
5602	NC_021911	CCTGC	2	10	304781	304790	0 %	20 %	20 %	60 %	528837807
5603	NC_021911	CTT	2	6	304802	304807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837807
5604	NC_021911	GCC	2	6	304817	304822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837807
5605	NC_021911	CTT	2	6	304906	304911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837807
5606	NC_021911	GTC	2	6	304955	304960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837807
5607	NC_021911	CTTGCG	2	12	304988	304999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837807
5608	NC_021911	ATG	2	6	305066	305071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837807
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5610	NC_021911	TCG	2	6	305121	305126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837807
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5613	NC_021911	GTC	2	6	305172	305177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837808
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5617	NC_021911	GCCG	2	8	305307	305314	0 %	0 %	50 %	50 %	528837808
5618	NC_021911	GGC	2	6	305331	305336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837808
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5621	NC_021911	CTG	2	6	305428	305433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528837808
5622	NC_021911	CTCG	2	8	305610	305617	0 %	25 %	25 %	50 %	528837808
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5734	NC_021911	CGG	2	6	313056	313061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837815
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5737	NC_021911	GGC	2	6	313114	313119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837815
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5739	NC_021911	GCA	2	6	313184	313189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837815
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5981	NC_021911	GCC	2	6	323930	323935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837823
5982	NC_021911	CGC	2	6	323953	323958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837823
5983	NC_021911	ATG	2	6	324027	324032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837823
5984	NC_021911	CGC	2	6	324038	324043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837823
5985	NC_021911	GCC	2	6	324077	324082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837823
5986	NC_021911	TGA	2	6	324120	324125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528837823
5987	NC_021911	GCC	2	6	324155	324160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528837823
5988	NC_021911	GACGC	2	10	324191	324200	20 %	0 %	40 %	40 %	528837823
5989	NC_021911	GCTC	2	8	324202	324209	0 %	25 %	25 %	50 %	528837823
5990	NC_021911	C	6	6	324273	324278	0 %	0 %	0 %	100 %	528837823
5991	NC_021911	AGCC	2	8	324291	324298	25 %	0 %	25 %	50 %	528837823
5992	NC_021911	GC	3	6	324323	324328	0 %	0 %	50 %	50 %	528837823
5993	NC_021911	G	6	6	324364	324369	0 %	0 %	100 %	0 %	528837823
5994	NC_021911	CGGA	2	8	324392	324399	25 %	0 %	50 %	25 %	528837823
5995	NC_021911	CCT	2	6	324412	324417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528837823
5996	NC_021911	CCA	2	6	324682	324687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528837824
5997	NC_021911	TCT	2	6	324688	324693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528837824
5998	NC_021911	GGC	2	6	324701	324706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528837824
5999	NC_021911	GC	4	8	324817	324824	0 %	0 %	50 %	50 %	528837824
6000	NC_021911	GAC	2	6	324905	324910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528837824

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