MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021908	GC	4	8	158417	158424	0 %	0 %	50 %	50 %	528832618
3502	NC_021908	GCC	2	6	158450	158455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832618
3503	NC_021908	CGT	2	6	158569	158574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3504	NC_021908	GAG	2	6	158582	158587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832618
3505	NC_021908	CGC	2	6	158602	158607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832618
3506	NC_021908	TGC	2	6	158658	158663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3507	NC_021908	CCA	2	6	158709	158714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832618
3508	NC_021908	TCG	2	6	158736	158741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3509	NC_021908	CGG	2	6	158751	158756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832618
3510	NC_021908	GCG	2	6	158817	158822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832618
3511	NC_021908	CCCGG	2	10	158836	158845	0 %	0 %	40 %	60 %	528832618
3512	NC_021908	TGG	2	6	158895	158900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832618
3513	NC_021908	GCCG	2	8	158905	158912	0 %	0 %	50 %	50 %	528832618
3514	NC_021908	GTC	2	6	158924	158929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3515	NC_021908	CGC	2	6	158982	158987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832618
3516	NC_021908	TCG	2	6	158988	158993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3517	NC_021908	GC	3	6	158998	159003	0 %	0 %	50 %	50 %	528832618
3518	NC_021908	TCG	2	6	159045	159050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3519	NC_021908	CGA	3	9	159052	159060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832618
3520	NC_021908	ATG	2	6	159127	159132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832619
3521	NC_021908	CTG	2	6	159145	159150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832619
3522	NC_021908	CGC	2	6	159159	159164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832619
3523	NC_021908	TGGCGC	2	12	159173	159184	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528832619
3524	NC_021908	GCC	2	6	159226	159231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832619
3525	NC_021908	AAG	2	6	159275	159280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832619
3526	NC_021908	CAT	2	6	159291	159296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832619
3527	NC_021908	GCC	2	6	159316	159321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832619
3528	NC_021908	GGC	2	6	159363	159368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832619
3529	NC_021908	CGA	2	6	159423	159428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832619
3530	NC_021908	CGC	2	6	159443	159448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832619
3531	NC_021908	CGG	3	9	159449	159457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832619
3532	NC_021908	CGA	2	6	159492	159497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832619
3533	NC_021908	TCGA	2	8	159556	159563	25 %	25 %	25 %	25 %	528832619
3534	NC_021908	CAGG	2	8	159609	159616	25 %	0 %	50 %	25 %	528832619
3535	NC_021908	CG	3	6	159620	159625	0 %	0 %	50 %	50 %	528832619
3536	NC_021908	CGC	2	6	159650	159655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832619
3537	NC_021908	GGC	3	9	159658	159666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832619
3538	NC_021908	TCA	2	6	159668	159673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832619
3539	NC_021908	CGG	2	6	159745	159750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832619
3540	NC_021908	GAT	2	6	159777	159782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832619
3541	NC_021908	CGA	2	6	159816	159821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832619
3542	NC_021908	TGG	2	6	159869	159874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832619
3543	NC_021908	GC	3	6	159883	159888	0 %	0 %	50 %	50 %	528832619
3544	NC_021908	CGG	2	6	159903	159908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832619
3545	NC_021908	CCT	2	6	159929	159934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832619
3546	NC_021908	ACG	2	6	159998	160003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832619
3547	NC_021908	AGCG	2	8	160053	160060	25 %	0 %	50 %	25 %	528832619
3548	NC_021908	CAC	2	6	160080	160085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832619
3549	NC_021908	CG	3	6	160103	160108	0 %	0 %	50 %	50 %	528832619
3550	NC_021908	AGA	2	6	160115	160120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832619
3551	NC_021908	GAT	2	6	160122	160127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832619
3552	NC_021908	GCG	3	9	160153	160161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832619
3553	NC_021908	CGC	2	6	160269	160274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832619
3554	NC_021908	TGATC	2	10	160361	160370	20 %	40 %	20 %	20 %	528832620
3555	NC_021908	GGAT	2	8	160438	160445	25 %	25 %	50 %	0 %	528832620
3556	NC_021908	CGGCG	2	10	160543	160552	0 %	0 %	60 %	40 %	528832620
3557	NC_021908	TCG	2	6	160555	160560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832620
3558	NC_021908	CCG	2	6	160578	160583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832620
3559	NC_021908	GAC	2	6	160593	160598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832620
3560	NC_021908	TCG	2	6	160609	160614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832620
3561	NC_021908	TGG	2	6	160663	160668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832620
3562	NC_021908	GCC	2	6	160693	160698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832620
3563	NC_021908	GACC	2	8	160754	160761	25 %	0 %	25 %	50 %	528832620
3564	NC_021908	GGA	2	6	160778	160783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832620
3565	NC_021908	CAT	2	6	160844	160849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832620
3566	NC_021908	GC	3	6	160873	160878	0 %	0 %	50 %	50 %	528832620
3567	NC_021908	CCG	2	6	160912	160917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832620
3568	NC_021908	GGA	2	6	161009	161014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832620
3569	NC_021908	GAA	2	6	161039	161044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832620
3570	NC_021908	CATC	2	8	161045	161052	25 %	25 %	0 %	50 %	528832620
3571	NC_021908	CAC	2	6	161201	161206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832620
3572	NC_021908	CG	3	6	161233	161238	0 %	0 %	50 %	50 %	528832620
3573	NC_021908	GAA	2	6	161273	161278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832620
3574	NC_021908	GAT	2	6	161300	161305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832620
3575	NC_021908	GTC	2	6	161340	161345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832620
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3577	NC_021908	TCG	2	6	161380	161385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832620
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3580	NC_021908	CGC	2	6	161457	161462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832620
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3583	NC_021908	GGC	2	6	161573	161578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832620
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3585	NC_021908	GCC	2	6	161646	161651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832620
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3588	NC_021908	GCC	3	9	161718	161726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832620
3589	NC_021908	CAG	2	6	161727	161732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832620
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3591	NC_021908	TGA	2	6	161899	161904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832620
3592	NC_021908	AGGCCA	2	12	161908	161919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832620
3593	NC_021908	GCCG	2	8	161939	161946	0 %	0 %	50 %	50 %	528832620
3594	NC_021908	CGC	2	6	161966	161971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832620
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3599	NC_021908	GC	3	6	162210	162215	0 %	0 %	50 %	50 %	528832620
3600	NC_021908	CGGC	2	8	162259	162266	0 %	0 %	50 %	50 %	528832620
3601	NC_021908	TGA	2	6	162292	162297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832620
3602	NC_021908	TCG	2	6	162300	162305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832620
3603	NC_021908	CGG	2	6	162317	162322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832620
3604	NC_021908	TGCA	2	8	162369	162376	25 %	25 %	25 %	25 %	528832620
3605	NC_021908	AGC	2	6	162466	162471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832620
3606	NC_021908	CGA	2	6	162476	162481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832620
3607	NC_021908	ATGG	2	8	162566	162573	25 %	25 %	50 %	0 %	528832620
3608	NC_021908	GAC	2	6	162590	162595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832620
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3612	NC_021908	CGGC	2	8	162718	162725	0 %	0 %	50 %	50 %	528832620
3613	NC_021908	CAT	2	6	163248	163253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832621
3614	NC_021908	TTTGC	2	10	163274	163283	0 %	60 %	20 %	20 %	528832621
3615	NC_021908	GC	3	6	163328	163333	0 %	0 %	50 %	50 %	528832621
3616	NC_021908	TGA	2	6	163338	163343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832621
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3618	NC_021908	AT	3	6	163372	163377	50 %	50 %	0 %	0 %	528832621
3619	NC_021908	TGCG	2	8	163449	163456	0 %	25 %	50 %	25 %	528832621
3620	NC_021908	CGA	2	6	163459	163464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832621
3621	NC_021908	GGCA	2	8	163465	163472	25 %	0 %	50 %	25 %	528832621
3622	NC_021908	GCG	2	6	163510	163515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832621
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3742	NC_021908	GAT	2	6	171267	171272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832631
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3862	NC_021908	CGA	2	6	176065	176070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832635
3863	NC_021908	TCAA	2	8	176109	176116	50 %	25 %	0 %	25 %	528832635
3864	NC_021908	GAA	2	6	176129	176134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832635
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3981	NC_021908	TCG	2	6	180256	180261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832638
3982	NC_021908	ATC	2	6	180286	180291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832638
3983	NC_021908	GGC	2	6	180297	180302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832638
3984	NC_021908	CGG	2	6	180308	180313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832638
3985	NC_021908	TCC	2	6	180319	180324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832638
3986	NC_021908	GCT	2	6	180330	180335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832638
3987	NC_021908	GGC	2	6	180360	180365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832638
3988	NC_021908	GTC	2	6	180381	180386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832638
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3992	NC_021908	GC	3	6	180538	180543	0 %	0 %	50 %	50 %	528832638
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3997	NC_021908	TGC	2	6	180792	180797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832639
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3999	NC_021908	CGG	2	6	180843	180848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832639
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