MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021908	TGC	2	6	463965	463970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832913
10002	NC_021908	TTC	2	6	463981	463986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832913
10003	NC_021908	CGT	2	6	464001	464006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832913
10004	NC_021908	GCA	2	6	464010	464015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832913
10005	NC_021908	CCG	2	6	464037	464042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832913
10006	NC_021908	GCC	2	6	464062	464067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832913
10007	NC_021908	GCCG	2	8	464092	464099	0 %	0 %	50 %	50 %	528832913
10008	NC_021908	GAAA	2	8	464195	464202	75 %	0 %	25 %	0 %	528832913
10009	NC_021908	TCA	2	6	464253	464258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832913
10010	NC_021908	GATGC	2	10	464371	464380	20 %	20 %	40 %	20 %	528832913
10011	NC_021908	CG	3	6	464424	464429	0 %	0 %	50 %	50 %	528832913
10012	NC_021908	GGC	2	6	464455	464460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832913
10013	NC_021908	CAT	2	6	464482	464487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832913
10014	NC_021908	TCG	2	6	464588	464593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832913
10015	NC_021908	CATG	2	8	464610	464617	25 %	25 %	25 %	25 %	528832913
10016	NC_021908	GCC	2	6	464626	464631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832913
10017	NC_021908	GCA	2	6	464649	464654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832913
10018	NC_021908	GCG	2	6	464710	464715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832913
10019	NC_021908	GCC	2	6	464722	464727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832913
10020	NC_021908	GAT	2	6	464743	464748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832913
10021	NC_021908	GC	3	6	464751	464756	0 %	0 %	50 %	50 %	528832913
10022	NC_021908	AAC	2	6	464878	464883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832914
10023	NC_021908	GC	3	6	464897	464902	0 %	0 %	50 %	50 %	528832914
10024	NC_021908	GGC	2	6	464940	464945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832914
10025	NC_021908	GCC	2	6	464948	464953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832914
10026	NC_021908	CGT	2	6	465020	465025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832914
10027	NC_021908	TGA	2	6	465086	465091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832914
10028	NC_021908	CGAG	2	8	465194	465201	25 %	0 %	50 %	25 %	528832914
10029	NC_021908	TCG	2	6	465230	465235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832914
10030	NC_021908	GAA	2	6	465243	465248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832914
10031	NC_021908	GAGCC	2	10	465256	465265	20 %	0 %	40 %	40 %	528832914
10032	NC_021908	GCT	2	6	465356	465361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832914
10033	NC_021908	GCC	2	6	465407	465412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832914
10034	NC_021908	GC	3	6	465415	465420	0 %	0 %	50 %	50 %	528832914
10035	NC_021908	CTT	3	9	465506	465514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832915
10036	NC_021908	GTC	2	6	465521	465526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10037	NC_021908	GGCG	2	8	465616	465623	0 %	0 %	75 %	25 %	528832915
10038	NC_021908	TTC	2	6	465636	465641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832915
10039	NC_021908	TGA	2	6	465667	465672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832915
10040	NC_021908	GGC	2	6	465861	465866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832915
10041	NC_021908	CAG	2	6	465911	465916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10042	NC_021908	GCA	2	6	465931	465936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10043	NC_021908	AGC	2	6	465952	465957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10044	NC_021908	GAT	2	6	465962	465967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832915
10045	NC_021908	CGA	2	6	465988	465993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10046	NC_021908	ATC	2	6	466074	466079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832915
10047	NC_021908	GC	3	6	466084	466089	0 %	0 %	50 %	50 %	528832915
10048	NC_021908	CGT	2	6	466097	466102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10049	NC_021908	GTC	3	9	466199	466207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10050	NC_021908	CGC	2	6	466232	466237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832915
10051	NC_021908	GAC	2	6	466244	466249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10052	NC_021908	GCCGGA	2	12	466259	466270	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	528832915
10053	NC_021908	TCG	2	6	466320	466325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832915
10054	NC_021908	GTG	2	6	466398	466403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832915
10055	NC_021908	CTT	2	6	466448	466453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832915
10056	NC_021908	ATG	2	6	466470	466475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832915
10057	NC_021908	CGG	2	6	466723	466728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
10058	NC_021908	GCG	2	6	466739	466744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
10059	NC_021908	GCG	2	6	466751	466756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
10060	NC_021908	CCG	2	6	466802	466807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832916
10061	NC_021908	CCGG	2	8	466968	466975	0 %	0 %	50 %	50 %	528832916
10062	NC_021908	CGG	2	6	466980	466985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
10063	NC_021908	GAC	2	6	467116	467121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832916
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10065	NC_021908	GCG	2	6	467155	467160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832916
10066	NC_021908	GCCG	2	8	467176	467183	0 %	0 %	50 %	50 %	528832916
10067	NC_021908	GAC	2	6	467239	467244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832916
10068	NC_021908	GAT	2	6	467284	467289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832916
10069	NC_021908	CGA	2	6	467367	467372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832916
10070	NC_021908	TCC	2	6	467384	467389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832916
10071	NC_021908	CGT	2	6	467392	467397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832916
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10073	NC_021908	TGC	2	6	467414	467419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832916
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10080	NC_021908	GAC	2	6	467662	467667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832917
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10084	NC_021908	GAT	2	6	467809	467814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832917
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10086	NC_021908	AGGA	2	8	467921	467928	50 %	0 %	50 %	0 %	528832917
10087	NC_021908	GTG	2	6	467929	467934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832917
10088	NC_021908	TGA	2	6	467940	467945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832917
10089	NC_021908	GA	3	6	467978	467983	50 %	0 %	50 %	0 %	528832917
10090	NC_021908	CGA	2	6	468030	468035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832917
10091	NC_021908	CGA	2	6	468039	468044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832917
10092	NC_021908	TGG	2	6	468089	468094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832917
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10099	NC_021908	TCCT	2	8	468334	468341	0 %	50 %	0 %	50 %	528832917
10100	NC_021908	GAA	2	6	468364	468369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832917
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10102	NC_021908	GAT	2	6	468406	468411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832917
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10105	NC_021908	GCT	2	6	468585	468590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832918
10106	NC_021908	CATTC	2	10	468643	468652	20 %	40 %	0 %	40 %	528832918
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10108	NC_021908	GGA	2	6	468677	468682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832918
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10111	NC_021908	GC	3	6	468729	468734	0 %	0 %	50 %	50 %	528832918
10112	NC_021908	GGCGC	2	10	468760	468769	0 %	0 %	60 %	40 %	528832918
10113	NC_021908	CATA	2	8	468793	468800	50 %	25 %	0 %	25 %	528832918
10114	NC_021908	GAT	3	9	468860	468868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832918
10115	NC_021908	GTT	2	6	468956	468961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832918
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10118	NC_021908	ATG	2	6	469083	469088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528832918
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10359	NC_021908	CGA	2	6	478530	478535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832926
10360	NC_021908	GAC	4	12	478548	478559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832926
10361	NC_021908	GCC	2	6	478567	478572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832926
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10363	NC_021908	CCT	2	6	478637	478642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832926
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10472	NC_021908	GCG	2	6	485206	485211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832933
10473	NC_021908	CGCC	2	8	485267	485274	0 %	0 %	25 %	75 %	528832933
10474	NC_021908	CGT	2	6	485303	485308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832933
10475	NC_021908	GTC	2	6	485394	485399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832933
10476	NC_021908	CGG	3	9	485429	485437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832933
10477	NC_021908	GCA	2	6	485479	485484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832933
10478	NC_021908	GCT	2	6	485504	485509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832933
10479	NC_021908	AGA	2	6	485811	485816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832934
10480	NC_021908	CGCA	2	8	485819	485826	25 %	0 %	25 %	50 %	528832934
10481	NC_021908	CTG	2	6	485866	485871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832934
10482	NC_021908	CAG	2	6	485920	485925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832934
10483	NC_021908	GC	3	6	485987	485992	0 %	0 %	50 %	50 %	528832934
10484	NC_021908	GAC	2	6	486019	486024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832934
10485	NC_021908	CG	3	6	486083	486088	0 %	0 %	50 %	50 %	528832934
10486	NC_021908	GCG	2	6	486106	486111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832934
10487	NC_021908	TTC	2	6	486112	486117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832934
10488	NC_021908	AAG	2	6	486142	486147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832934
10489	NC_021908	CGAT	2	8	486259	486266	25 %	25 %	25 %	25 %	528832935
10490	NC_021908	TGC	2	6	486311	486316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832935
10491	NC_021908	GAC	2	6	486378	486383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832935
10492	NC_021908	GCA	2	6	486386	486391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832935
10493	NC_021908	CCT	3	9	486440	486448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832935
10494	NC_021908	TGT	2	6	486505	486510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832935
10495	NC_021908	TCG	2	6	486686	486691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832936
10496	NC_021908	CG	3	6	486716	486721	0 %	0 %	50 %	50 %	528832936
10497	NC_021908	TTGCGT	2	12	486725	486736	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	528832936
10498	NC_021908	GCG	2	6	486758	486763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832936
10499	NC_021908	AGG	2	6	486764	486769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832936
10500	NC_021908	CGCGG	2	10	486774	486783	0 %	0 %	60 %	40 %	528832936

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