MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 11103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021908	TCG	2	6	418870	418875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832870
9002	NC_021908	GCC	2	6	418935	418940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832870
9003	NC_021908	GC	3	6	418969	418974	0 %	0 %	50 %	50 %	528832870
9004	NC_021908	CGC	2	6	418987	418992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832870
9005	NC_021908	GGCA	2	8	419003	419010	25 %	0 %	50 %	25 %	528832870
9006	NC_021908	CGG	2	6	419054	419059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832870
9007	NC_021908	CCTC	2	8	419125	419132	0 %	25 %	0 %	75 %	528832870
9008	NC_021908	TGC	2	6	419161	419166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832870
9009	NC_021908	GCC	2	6	419217	419222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832870
9010	NC_021908	CGA	2	6	419237	419242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832870
9011	NC_021908	CGG	2	6	419308	419313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832870
9012	NC_021908	GCC	2	6	419480	419485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832871
9013	NC_021908	CAA	2	6	419499	419504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832871
9014	NC_021908	CGG	2	6	419531	419536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832871
9015	NC_021908	GAC	2	6	419611	419616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832871
9016	NC_021908	ATCG	2	8	419683	419690	25 %	25 %	25 %	25 %	528832871
9017	NC_021908	GCG	2	6	419716	419721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832871
9018	NC_021908	CAG	2	6	419724	419729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832871
9019	NC_021908	GAA	2	6	419749	419754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832871
9020	NC_021908	CGG	2	6	419776	419781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832871
9021	NC_021908	GCT	2	6	419799	419804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832871
9022	NC_021908	CTC	2	6	419830	419835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832871
9023	NC_021908	GAA	2	6	419848	419853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528832871
9024	NC_021908	AGC	2	6	419891	419896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832871
9025	NC_021908	CTT	2	6	419989	419994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832871
9026	NC_021908	CGT	2	6	420069	420074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832871
9027	NC_021908	GAG	2	6	420219	420224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528832872
9028	NC_021908	GCA	2	6	420274	420279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832872
9029	NC_021908	CGC	2	6	420293	420298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832872
9030	NC_021908	TGT	2	6	420308	420313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832872
9031	NC_021908	CAC	2	6	420380	420385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528832872
9032	NC_021908	CCGA	2	8	420420	420427	25 %	0 %	25 %	50 %	528832872
9033	NC_021908	GCCG	2	8	420446	420453	0 %	0 %	50 %	50 %	528832872
9034	NC_021908	ATCGAC	2	12	420591	420602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528832872
9035	NC_021908	CGC	2	6	420632	420637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832872
9036	NC_021908	TGC	2	6	420656	420661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832872
9037	NC_021908	GGT	2	6	420692	420697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832872
9038	NC_021908	GCC	2	6	420701	420706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832872
9039	NC_021908	ATC	2	6	420749	420754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528832873
9040	NC_021908	CCT	2	6	420772	420777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832873
9041	NC_021908	GCC	2	6	420833	420838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832873
9042	NC_021908	GGCTC	2	10	420851	420860	0 %	20 %	40 %	40 %	528832873
9043	NC_021908	TGG	2	6	420882	420887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528832873
9044	NC_021908	CGG	2	6	420894	420899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832873
9045	NC_021908	TCT	2	6	420920	420925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528832873
9046	NC_021908	GGAT	2	8	421020	421027	25 %	25 %	50 %	0 %	528832874
9047	NC_021908	CCT	2	6	421036	421041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528832874
9048	NC_021908	CGG	2	6	421077	421082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832874
9049	NC_021908	AGC	2	6	421119	421124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832874
9050	NC_021908	CCG	2	6	421145	421150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832874
9051	NC_021908	ATCG	2	8	421189	421196	25 %	25 %	25 %	25 %	528832874
9052	NC_021908	GGCT	2	8	421205	421212	0 %	25 %	50 %	25 %	528832874
9053	NC_021908	AGGC	2	8	421224	421231	25 %	0 %	50 %	25 %	528832874
9054	NC_021908	GCA	2	6	421241	421246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832874
9055	NC_021908	TGC	2	6	421285	421290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832874
9056	NC_021908	CGC	2	6	421296	421301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832874
9057	NC_021908	T	6	6	421304	421309	0 %	100 %	0 %	0 %	528832874
9058	NC_021908	TGC	2	6	421347	421352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832874
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9060	NC_021908	GCG	2	6	421400	421405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832874
9061	NC_021908	TTG	2	6	421412	421417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528832874
9062	NC_021908	CCTTA	2	10	421424	421433	20 %	40 %	0 %	40 %	528832874
9063	NC_021908	GCG	2	6	421451	421456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832874
9064	NC_021908	GGC	2	6	421473	421478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832874
9065	NC_021908	TCG	2	6	421529	421534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832875
9066	NC_021908	GCA	2	6	421548	421553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832875
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9068	NC_021908	CCGG	2	8	421608	421615	0 %	0 %	50 %	50 %	528832875
9069	NC_021908	CCG	2	6	421625	421630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832875
9070	NC_021908	CGG	2	6	421653	421658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832875
9071	NC_021908	CGA	2	6	421680	421685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832875
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9074	NC_021908	GGAT	2	8	421798	421805	25 %	25 %	50 %	0 %	528832875
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9082	NC_021908	CTCGC	2	10	422639	422648	0 %	20 %	20 %	60 %	528832876
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9089	NC_021908	GCCG	2	8	423006	423013	0 %	0 %	50 %	50 %	528832876
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9093	NC_021908	CG	3	6	423195	423200	0 %	0 %	50 %	50 %	528832876
9094	NC_021908	AGC	2	6	423212	423217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832876
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9103	NC_021908	TGAC	2	8	423633	423640	25 %	25 %	25 %	25 %	528832877
9104	NC_021908	GCG	2	6	423677	423682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832877
9105	NC_021908	CAA	2	6	423724	423729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528832877
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9121	NC_021908	CGG	2	6	424462	424467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832878
9122	NC_021908	CGA	2	6	424519	424524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832878
9123	NC_021908	GCAG	2	8	424539	424546	25 %	0 %	50 %	25 %	528832878
9124	NC_021908	CGC	2	6	424660	424665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528832878
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9143	NC_021908	CG	3	6	425399	425404	0 %	0 %	50 %	50 %	528832879
9144	NC_021908	CTG	2	6	425415	425420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832879
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9483	NC_021908	CGA	2	6	440252	440257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528832893
9484	NC_021908	TCG	2	6	440303	440308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832893
9485	NC_021908	GGC	2	6	440388	440393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832893
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9487	NC_021908	GGC	2	6	440412	440417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528832893
9488	NC_021908	TCCG	2	8	440421	440428	0 %	25 %	25 %	50 %	528832893
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9491	NC_021908	CTG	2	6	440545	440550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528832893
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