MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 5334

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021907	CGGC	2	8	236442	236449	0 %	0 %	50 %	50 %	528831317
5002	NC_021907	GGA	2	6	236535	236540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831317
5003	NC_021907	TCA	2	6	236551	236556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831317
5004	NC_021907	CTT	2	6	236579	236584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831317
5005	NC_021907	GCC	2	6	236633	236638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831317
5006	NC_021907	TCA	2	6	236775	236780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831317
5007	NC_021907	CGG	2	6	236794	236799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831317
5008	NC_021907	GAGC	2	8	236896	236903	25 %	0 %	50 %	25 %	528831317
5009	NC_021907	GTC	2	6	236906	236911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831317
5010	NC_021907	GCCA	2	8	236946	236953	25 %	0 %	25 %	50 %	528831317
5011	NC_021907	GCC	2	6	236984	236989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831317
5012	NC_021907	TGA	2	6	236995	237000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831317
5013	NC_021907	GTC	2	6	237033	237038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831317
5014	NC_021907	TTC	2	6	237059	237064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528831317
5015	NC_021907	CAC	2	6	237068	237073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831317
5016	NC_021907	TTG	2	6	237084	237089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831317
5017	NC_021907	ATG	2	6	237126	237131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831317
5018	NC_021907	TTG	2	6	237144	237149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831317
5019	NC_021907	CGG	2	6	237187	237192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831317
5020	NC_021907	CGA	2	6	237608	237613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831318
5021	NC_021907	TGG	2	6	237632	237637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831318
5022	NC_021907	GCG	2	6	237704	237709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831318
5023	NC_021907	CG	3	6	237735	237740	0 %	0 %	50 %	50 %	528831318
5024	NC_021907	CGGC	2	8	237752	237759	0 %	0 %	50 %	50 %	528831318
5025	NC_021907	ATC	2	6	237760	237765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831318
5026	NC_021907	CGGC	2	8	237789	237796	0 %	0 %	50 %	50 %	528831318
5027	NC_021907	ACG	2	6	237818	237823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831318
5028	NC_021907	TTCG	2	8	237877	237884	0 %	50 %	25 %	25 %	528831318
5029	NC_021907	CGGC	2	8	237935	237942	0 %	0 %	50 %	50 %	528831318
5030	NC_021907	GCC	2	6	237961	237966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831318
5031	NC_021907	GGT	2	6	238075	238080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831318
5032	NC_021907	GC	3	6	238130	238135	0 %	0 %	50 %	50 %	528831318
5033	NC_021907	CTG	3	9	238171	238179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831318
5034	NC_021907	GAG	2	6	238189	238194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831318
5035	NC_021907	CCG	3	9	238202	238210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831318
5036	NC_021907	GCG	2	6	238280	238285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831318
5037	NC_021907	CTTC	2	8	238295	238302	0 %	50 %	0 %	50 %	528831318
5038	NC_021907	CCGGCG	2	12	238364	238375	0 %	0 %	50 %	50 %	528831318
5039	NC_021907	GCC	2	6	238403	238408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831318
5040	NC_021907	GCC	2	6	238429	238434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831318
5041	NC_021907	CGGC	2	8	238451	238458	0 %	0 %	50 %	50 %	528831318
5042	NC_021907	GAG	2	6	238539	238544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831318
5043	NC_021907	GCC	2	6	238576	238581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831319
5044	NC_021907	GCGCG	2	10	238582	238591	0 %	0 %	60 %	40 %	528831319
5045	NC_021907	CGG	2	6	238657	238662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831319
5046	NC_021907	ACG	2	6	238670	238675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831319
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5048	NC_021907	CGG	2	6	238722	238727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831319
5049	NC_021907	CG	3	6	238798	238803	0 %	0 %	50 %	50 %	528831319
5050	NC_021907	GAT	2	6	238806	238811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831319
5051	NC_021907	CGG	2	6	238815	238820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831319
5052	NC_021907	AAG	2	6	238849	238854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831319
5053	NC_021907	AGC	2	6	238863	238868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831319
5054	NC_021907	GCAG	2	8	238875	238882	25 %	0 %	50 %	25 %	528831319
5055	NC_021907	CGA	2	6	238971	238976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831319
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5057	NC_021907	CCG	3	9	239047	239055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831319
5058	NC_021907	GAA	2	6	239110	239115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831319
5059	NC_021907	CCAT	2	8	239156	239163	25 %	25 %	0 %	50 %	528831319
5060	NC_021907	GGA	2	6	239190	239195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831319
5061	NC_021907	TCG	2	6	239219	239224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831319
5062	NC_021907	CGA	2	6	239304	239309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831319
5063	NC_021907	CG	3	6	239354	239359	0 %	0 %	50 %	50 %	528831319
5064	NC_021907	GGC	2	6	239436	239441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831319
5065	NC_021907	TGT	2	6	239522	239527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831319
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5069	NC_021907	GCT	2	6	239697	239702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831319
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5108	NC_021907	CGA	2	6	241487	241492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831322
5109	NC_021907	AGCGA	2	10	241529	241538	40 %	0 %	40 %	20 %	528831322
5110	NC_021907	GAC	2	6	241540	241545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831322
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5112	NC_021907	GAT	2	6	241587	241592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831322
5113	NC_021907	CGCC	2	8	241621	241628	0 %	0 %	25 %	75 %	528831322
5114	NC_021907	GCC	2	6	241641	241646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831322
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5118	NC_021907	CGC	2	6	241733	241738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831322
5119	NC_021907	GCC	2	6	241827	241832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831322
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5121	NC_021907	CGA	2	6	241898	241903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831322
5122	NC_021907	ACG	2	6	241966	241971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831322
5123	NC_021907	TGA	3	9	241973	241981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831322
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5125	NC_021907	CCG	2	6	241999	242004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831322
5126	NC_021907	GAC	2	6	242014	242019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831322
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5130	NC_021907	AATGC	2	10	242068	242077	40 %	20 %	20 %	20 %	528831322
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5132	NC_021907	GGC	2	6	242307	242312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831322
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5135	NC_021907	GAT	2	6	242535	242540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831322
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5142	NC_021907	TTG	2	6	242766	242771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831323
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5153	NC_021907	GAT	2	6	243679	243684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831324
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5231	NC_021907	CGA	3	9	247556	247564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831327
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.