MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1a

Total Repeats: 3959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021906	ACG	2	6	138314	138319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831059
3002	NC_021906	TC	4	8	138442	138449	0 %	50 %	0 %	50 %	528831059
3003	NC_021906	CGCC	2	8	138471	138478	0 %	0 %	25 %	75 %	528831059
3004	NC_021906	CCT	2	6	138533	138538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831059
3005	NC_021906	GCG	2	6	138548	138553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831059
3006	NC_021906	ACG	2	6	138587	138592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831059
3007	NC_021906	GGA	2	6	138654	138659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831059
3008	NC_021906	CGT	2	6	138666	138671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831059
3009	NC_021906	ATCCG	2	10	138716	138725	20 %	20 %	20 %	40 %	528831059
3010	NC_021906	CGC	2	6	138776	138781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831059
3011	NC_021906	CAGG	2	8	138802	138809	25 %	0 %	50 %	25 %	528831059
3012	NC_021906	GGC	2	6	138915	138920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831059
3013	NC_021906	CG	3	6	138941	138946	0 %	0 %	50 %	50 %	528831059
3014	NC_021906	GCGCA	2	10	139000	139009	20 %	0 %	40 %	40 %	528831059
3015	NC_021906	CCT	2	6	139034	139039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831059
3016	NC_021906	GC	3	6	139046	139051	0 %	0 %	50 %	50 %	528831059
3017	NC_021906	TGC	2	6	139109	139114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831059
3018	NC_021906	CGG	2	6	139218	139223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831059
3019	NC_021906	TCG	2	6	139238	139243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831059
3020	NC_021906	CGC	2	6	139247	139252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831059
3021	NC_021906	CTG	2	6	139357	139362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831059
3022	NC_021906	TCG	2	6	139451	139456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831059
3023	NC_021906	ATCT	2	8	139659	139666	25 %	50 %	0 %	25 %	528831060
3024	NC_021906	TGA	2	6	139679	139684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831060
3025	NC_021906	CTC	2	6	139699	139704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831060
3026	NC_021906	CGCC	2	8	139719	139726	0 %	0 %	25 %	75 %	528831060
3027	NC_021906	C	6	6	139747	139752	0 %	0 %	0 %	100 %	528831060
3028	NC_021906	GAA	2	6	139788	139793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831060
3029	NC_021906	TCG	2	6	139808	139813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831060
3030	NC_021906	T	7	7	139826	139832	0 %	100 %	0 %	0 %	528831060
3031	NC_021906	CCT	2	6	139910	139915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831060
3032	NC_021906	ACG	2	6	139976	139981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831060
3033	NC_021906	GAC	2	6	140092	140097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831060
3034	NC_021906	TGCCC	2	10	140151	140160	0 %	20 %	20 %	60 %	528831060
3035	NC_021906	AT	3	6	140186	140191	50 %	50 %	0 %	0 %	528831060
3036	NC_021906	CGC	2	6	140208	140213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831060
3037	NC_021906	CAA	2	6	140223	140228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528831060
3038	NC_021906	TCG	2	6	140234	140239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831060
3039	NC_021906	TAC	2	6	140281	140286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831060
3040	NC_021906	ATT	2	6	140306	140311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831060
3041	NC_021906	CGA	2	6	140334	140339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831060
3042	NC_021906	TGC	2	6	140354	140359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831060
3043	NC_021906	CGG	2	6	140372	140377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831060
3044	NC_021906	GCG	2	6	140380	140385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831060
3045	NC_021906	GCC	2	6	140410	140415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831060
3046	NC_021906	CGG	2	6	140420	140425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831060
3047	NC_021906	TCG	3	9	140510	140518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831060
3048	NC_021906	ATCA	2	8	140521	140528	50 %	25 %	0 %	25 %	528831060
3049	NC_021906	CCG	2	6	140529	140534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831060
3050	NC_021906	GCC	3	9	140623	140631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831060
3051	NC_021906	GAA	2	6	140649	140654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528831060
3052	NC_021906	GGC	2	6	140703	140708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831060
3053	NC_021906	CCG	2	6	140935	140940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831060
3054	NC_021906	CCA	3	9	140966	140974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831060
3055	NC_021906	ATC	2	6	141052	141057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831060
3056	NC_021906	CGG	2	6	141083	141088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831060
3057	NC_021906	TCG	3	9	141122	141130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831060
3058	NC_021906	GC	3	6	141178	141183	0 %	0 %	50 %	50 %	528831060
3059	NC_021906	CCT	2	6	141316	141321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831061
3060	NC_021906	CAG	2	6	141337	141342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831061
3061	NC_021906	TGC	2	6	141351	141356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831061
3062	NC_021906	GTG	2	6	141362	141367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831061
3063	NC_021906	CGG	3	9	141433	141441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831061
3064	NC_021906	CGCC	2	8	141499	141506	0 %	0 %	25 %	75 %	528831061
3065	NC_021906	TC	3	6	141517	141522	0 %	50 %	0 %	50 %	528831061
3066	NC_021906	GC	3	6	141530	141535	0 %	0 %	50 %	50 %	528831061
3067	NC_021906	GGTC	2	8	141549	141556	0 %	25 %	50 %	25 %	528831061
3068	NC_021906	CGGC	2	8	141562	141569	0 %	0 %	50 %	50 %	528831061
3069	NC_021906	GCT	2	6	141607	141612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831061
3070	NC_021906	GC	3	6	141675	141680	0 %	0 %	50 %	50 %	528831061
3071	NC_021906	GATCG	2	10	141712	141721	20 %	20 %	40 %	20 %	528831061
3072	NC_021906	ATC	2	6	141867	141872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831061
3073	NC_021906	ATCT	2	8	141902	141909	25 %	50 %	0 %	25 %	528831061
3074	NC_021906	TGC	2	6	142011	142016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831061
3075	NC_021906	CG	3	6	142024	142029	0 %	0 %	50 %	50 %	528831061
3076	NC_021906	GCT	2	6	142036	142041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831061
3077	NC_021906	CGG	2	6	142071	142076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831061
3078	NC_021906	CGG	2	6	142084	142089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831061
3079	NC_021906	CGT	2	6	142093	142098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831061
3080	NC_021906	CGC	2	6	142167	142172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831061
3081	NC_021906	TAT	2	6	142183	142188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831061
3082	NC_021906	TCG	2	6	142227	142232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831061
3083	NC_021906	CGG	2	6	142297	142302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831062
3084	NC_021906	GCTCG	2	10	142305	142314	0 %	20 %	40 %	40 %	528831062
3085	NC_021906	CG	3	6	142313	142318	0 %	0 %	50 %	50 %	528831062
3086	NC_021906	TAT	2	6	142377	142382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528831062
3087	NC_021906	GGGC	2	8	142411	142418	0 %	0 %	75 %	25 %	528831062
3088	NC_021906	GCT	2	6	142419	142424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831062
3089	NC_021906	CCG	2	6	142426	142431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831062
3090	NC_021906	ACCG	2	8	142459	142466	25 %	0 %	25 %	50 %	528831062
3091	NC_021906	GCTT	2	8	142490	142497	0 %	50 %	25 %	25 %	528831062
3092	NC_021906	GC	3	6	142502	142507	0 %	0 %	50 %	50 %	528831062
3093	NC_021906	GTC	2	6	142519	142524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831062
3094	NC_021906	CGG	2	6	142532	142537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831062
3095	NC_021906	CCG	2	6	142577	142582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831062
3096	NC_021906	CGG	2	6	142590	142595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831062
3097	NC_021906	TCG	2	6	142598	142603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831062
3098	NC_021906	GCTTGC	2	12	142656	142667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831062
3099	NC_021906	CGG	2	6	142694	142699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831062
3100	NC_021906	TCG	2	6	142700	142705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831062
3101	NC_021906	GCC	2	6	142860	142865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831062
3102	NC_021906	CCA	2	6	142883	142888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528831062
3103	NC_021906	TCG	2	6	142889	142894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831062
3104	NC_021906	GGC	2	6	142914	142919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831062
3105	NC_021906	CTTTC	2	10	142921	142930	0 %	60 %	0 %	40 %	528831062
3106	NC_021906	GAT	2	6	142968	142973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831062
3107	NC_021906	TGC	2	6	142991	142996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831062
3108	NC_021906	GCC	2	6	143002	143007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831062
3109	NC_021906	TC	3	6	143010	143015	0 %	50 %	0 %	50 %	528831062
3110	NC_021906	CGG	3	9	143097	143105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831062
3111	NC_021906	GGC	2	6	143109	143114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831062
3112	NC_021906	GCG	3	9	143178	143186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831063
3113	NC_021906	ATC	2	6	143232	143237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831063
3114	NC_021906	CTG	2	6	143286	143291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831063
3115	NC_021906	GCT	2	6	143612	143617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831063
3116	NC_021906	CGA	2	6	143624	143629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831063
3117	NC_021906	GC	3	6	143638	143643	0 %	0 %	50 %	50 %	528831063
3118	NC_021906	TGG	2	6	143650	143655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831063
3119	NC_021906	GCT	2	6	143675	143680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831063
3120	NC_021906	CGA	2	6	143681	143686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831063
3121	NC_021906	TCA	2	6	143719	143724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831063
3122	NC_021906	TCG	2	6	143752	143757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831063
3123	NC_021906	GAG	2	6	143793	143798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528831063
3124	NC_021906	GCC	2	6	143833	143838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831063
3125	NC_021906	CCG	2	6	143842	143847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831063
3126	NC_021906	GCCA	2	8	143856	143863	25 %	0 %	25 %	50 %	528831063
3127	NC_021906	GCGAC	2	10	143874	143883	20 %	0 %	40 %	40 %	528831063
3128	NC_021906	TCG	2	6	143948	143953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831064
3129	NC_021906	GCCG	2	8	143954	143961	0 %	0 %	50 %	50 %	528831064
3130	NC_021906	TCG	2	6	144021	144026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831064
3131	NC_021906	TC	3	6	144076	144081	0 %	50 %	0 %	50 %	528831064
3132	NC_021906	GGCTGA	2	12	144120	144131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528831064
3133	NC_021906	GC	3	6	144145	144150	0 %	0 %	50 %	50 %	528831064
3134	NC_021906	CG	4	8	144155	144162	0 %	0 %	50 %	50 %	528831064
3135	NC_021906	CGC	2	6	144190	144195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831064
3136	NC_021906	TCGGT	2	10	144216	144225	0 %	40 %	40 %	20 %	528831064
3137	NC_021906	GAT	2	6	144230	144235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831064
3138	NC_021906	CGT	2	6	144253	144258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831064
3139	NC_021906	CGA	2	6	144277	144282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831064
3140	NC_021906	CTC	2	6	144293	144298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528831064
3141	NC_021906	CCG	2	6	144315	144320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831064
3142	NC_021906	GCC	2	6	144326	144331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831064
3143	NC_021906	CGG	2	6	144352	144357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831064
3144	NC_021906	CAGCGC	2	12	144359	144370	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528831064
3145	NC_021906	GCT	2	6	144406	144411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831064
3146	NC_021906	CGA	2	6	144418	144423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831064
3147	NC_021906	CTGT	2	8	144505	144512	0 %	50 %	25 %	25 %	528831064
3148	NC_021906	TCG	2	6	144582	144587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831064
3149	NC_021906	GCCGC	2	10	144614	144623	0 %	0 %	40 %	60 %	528831064
3150	NC_021906	GCC	2	6	144632	144637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831064
3151	NC_021906	CG	3	6	144638	144643	0 %	0 %	50 %	50 %	528831064
3152	NC_021906	TTG	2	6	144645	144650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528831064
3153	NC_021906	CGG	2	6	144777	144782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831065
3154	NC_021906	TGA	2	6	144788	144793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831065
3155	NC_021906	ACG	2	6	144800	144805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831065
3156	NC_021906	GCAG	2	8	144816	144823	25 %	0 %	50 %	25 %	528831065
3157	NC_021906	GGCGGT	2	12	144843	144854	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	528831065
3158	NC_021906	GC	3	6	144862	144867	0 %	0 %	50 %	50 %	528831065
3159	NC_021906	GTC	2	6	144889	144894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831065
3160	NC_021906	GCG	2	6	144930	144935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831065
3161	NC_021906	GTG	2	6	144938	144943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831065
3162	NC_021906	GATCGA	2	12	144981	144992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528831065
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3166	NC_021906	CCGG	2	8	145225	145232	0 %	0 %	50 %	50 %	528831065
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3176	NC_021906	CG	3	6	145667	145672	0 %	0 %	50 %	50 %	528831065
3177	NC_021906	CAGG	2	8	145722	145729	25 %	0 %	50 %	25 %	528831065
3178	NC_021906	CCAT	2	8	145734	145741	25 %	25 %	0 %	50 %	528831065
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3182	NC_021906	CGG	2	6	146037	146042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831066
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3185	NC_021906	ATG	2	6	146057	146062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831066
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3215	NC_021906	GAC	2	6	147162	147167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831067
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3220	NC_021906	GCC	2	6	147463	147468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831067
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3222	NC_021906	GC	3	6	147512	147517	0 %	0 %	50 %	50 %	528831067
3223	NC_021906	GCA	2	6	147523	147528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831067
3224	NC_021906	TCA	2	6	147545	147550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831067
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3227	NC_021906	GTC	2	6	147716	147721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831068
3228	NC_021906	GCG	3	9	147739	147747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831068
3229	NC_021906	TCG	2	6	147750	147755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831068
3230	NC_021906	CCTGC	2	10	147761	147770	0 %	20 %	20 %	60 %	528831068
3231	NC_021906	ATG	2	6	147771	147776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831068
3232	NC_021906	CGC	2	6	147787	147792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831068
3233	NC_021906	GGTC	2	8	147844	147851	0 %	25 %	50 %	25 %	528831068
3234	NC_021906	CAT	2	6	147856	147861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831068
3235	NC_021906	CTTG	2	8	147916	147923	0 %	50 %	25 %	25 %	528831068
3236	NC_021906	CGG	2	6	147988	147993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831068
3237	NC_021906	CG	3	6	147999	148004	0 %	0 %	50 %	50 %	528831068
3238	NC_021906	GGT	2	6	148018	148023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528831068
3239	NC_021906	GTC	2	6	148049	148054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831068
3240	NC_021906	ATG	2	6	148059	148064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528831068
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3242	NC_021906	TCGG	2	8	148143	148150	0 %	25 %	50 %	25 %	528831068
3243	NC_021906	GCA	2	6	148192	148197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831068
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3246	NC_021906	CGA	2	6	148330	148335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528831068
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3251	NC_021906	CGG	2	6	148474	148479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831068
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3363	NC_021906	GCC	2	6	154268	154273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831073
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3482	NC_021906	CGG	2	6	159230	159235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528831077
3483	NC_021906	TCG	2	6	159244	159249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528831077
3484	NC_021906	CGC	2	6	159251	159256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831077
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3486	NC_021906	GCC	2	6	159354	159359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831077
3487	NC_021906	GCC	3	9	159372	159380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528831077
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3493	NC_021906	CAT	2	6	159584	159589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528831077
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3496	NC_021906	AT	3	6	159683	159688	50 %	50 %	0 %	0 %	528831077
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