MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 89164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_021905	CTACGA	2	12	817305	817316	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	528827610
17003	NC_021905	CGC	2	6	817334	817339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827610
17004	NC_021905	GAC	2	6	817354	817359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827610
17005	NC_021905	GAAC	2	8	817378	817385	50 %	0 %	25 %	25 %	528827610
17006	NC_021905	GCC	2	6	817495	817500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827610
17007	NC_021905	CG	3	6	817598	817603	0 %	0 %	50 %	50 %	528827610
17008	NC_021905	CTGGCC	2	12	817645	817656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528827610
17009	NC_021905	CCAT	2	8	817728	817735	25 %	25 %	0 %	50 %	528827610
17010	NC_021905	TTTCG	2	10	817958	817967	0 %	60 %	20 %	20 %	528827611
17011	NC_021905	TGCGG	2	10	818020	818029	0 %	20 %	60 %	20 %	528827611
17012	NC_021905	G	6	6	818049	818054	0 %	0 %	100 %	0 %	528827611
17013	NC_021905	GGTG	2	8	818187	818194	0 %	25 %	75 %	0 %	528827611
17014	NC_021905	ACC	2	6	818195	818200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827611
17015	NC_021905	AGC	2	6	818235	818240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827611
17016	NC_021905	CGC	2	6	818321	818326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827611
17017	NC_021905	GC	3	6	818337	818342	0 %	0 %	50 %	50 %	528827611
17018	NC_021905	GGT	2	6	818419	818424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827611
17019	NC_021905	GGC	3	9	818434	818442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827611
17020	NC_021905	CGG	2	6	818470	818475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827611
17021	NC_021905	TGA	2	6	818517	818522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827611
17022	NC_021905	TCCCA	2	10	818546	818555	20 %	20 %	0 %	60 %	528827611
17023	NC_021905	CCTG	2	8	818710	818717	0 %	25 %	25 %	50 %	528827611
17024	NC_021905	CCT	2	6	818752	818757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827611
17025	NC_021905	CCG	2	6	818762	818767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827611
17026	NC_021905	CGT	2	6	819018	819023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827612
17027	NC_021905	GAAG	2	8	819036	819043	50 %	0 %	50 %	0 %	528827612
17028	NC_021905	AGT	2	6	819081	819086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827612
17029	NC_021905	GGGT	2	8	819105	819112	0 %	25 %	75 %	0 %	528827612
17030	NC_021905	CAAC	2	8	819403	819410	50 %	0 %	0 %	50 %	528827612
17031	NC_021905	TGA	2	6	819429	819434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827612
17032	NC_021905	TCG	2	6	819497	819502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827612
17033	NC_021905	CT	3	6	819504	819509	0 %	50 %	0 %	50 %	528827612
17034	NC_021905	ATGGT	2	10	819617	819626	20 %	40 %	40 %	0 %	528827612
17035	NC_021905	CAG	2	6	819698	819703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827612
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17038	NC_021905	CG	3	6	819843	819848	0 %	0 %	50 %	50 %	528827612
17039	NC_021905	GAC	2	6	819850	819855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827612
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17042	NC_021905	CTT	2	6	820127	820132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827613
17043	NC_021905	GGC	2	6	820220	820225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827613
17044	NC_021905	CGA	2	6	820241	820246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827613
17045	NC_021905	CGC	2	6	820303	820308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827613
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17047	NC_021905	CCTC	2	8	820420	820427	0 %	25 %	0 %	75 %	528827613
17048	NC_021905	GCG	2	6	820457	820462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827613
17049	NC_021905	CTGG	2	8	820493	820500	0 %	25 %	50 %	25 %	528827613
17050	NC_021905	CG	3	6	820502	820507	0 %	0 %	50 %	50 %	528827613
17051	NC_021905	TGTA	2	8	820521	820528	25 %	50 %	25 %	0 %	528827613
17052	NC_021905	AGC	2	6	820555	820560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827614
17053	NC_021905	CTG	2	6	820607	820612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827614
17054	NC_021905	CTG	2	6	820649	820654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827614
17055	NC_021905	AAC	2	6	820700	820705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528827614
17056	NC_021905	GTT	2	6	820794	820799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528827614
17057	NC_021905	A	7	7	820864	820870	100 %	0 %	0 %	0 %	528827614
17058	NC_021905	CGG	2	6	820875	820880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827614
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17060	NC_021905	CGT	2	6	820992	820997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827614
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17062	NC_021905	CGA	2	6	821088	821093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827614
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17064	NC_021905	GCG	2	6	821147	821152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827614
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17068	NC_021905	TTCA	2	8	823151	823158	25 %	50 %	0 %	25 %	528827615
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17072	NC_021905	CAG	2	6	823417	823422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827615
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17101	NC_021905	GCA	2	6	825083	825088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827615
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17121	NC_021905	GGCC	2	8	827117	827124	0 %	0 %	50 %	50 %	528827616
17122	NC_021905	TCG	2	6	827159	827164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827616
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17237	NC_021905	CAAGAA	2	12	834128	834139	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	528827621
17238	NC_021905	TCC	2	6	834150	834155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827621
17239	NC_021905	GC	3	6	834197	834202	0 %	0 %	50 %	50 %	528827621
17240	NC_021905	CGC	2	6	834227	834232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827621
17241	NC_021905	CGA	2	6	834251	834256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827621
17242	NC_021905	GCG	2	6	834274	834279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827621
17243	NC_021905	CAT	2	6	834287	834292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827621
17244	NC_021905	CGC	2	6	834329	834334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827621
17245	NC_021905	CGAT	2	8	834376	834383	25 %	25 %	25 %	25 %	528827621
17246	NC_021905	CGG	2	6	834473	834478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827621
17247	NC_021905	CCA	2	6	834524	834529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827621
17248	NC_021905	ATC	2	6	834538	834543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827621
17249	NC_021905	GGGC	2	8	834602	834609	0 %	0 %	75 %	25 %	528827621
17250	NC_021905	GGC	2	6	834633	834638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827621
17251	NC_021905	GTC	2	6	834684	834689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827621
17252	NC_021905	TCG	2	6	834705	834710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827621
17253	NC_021905	CG	3	6	834709	834714	0 %	0 %	50 %	50 %	528827621
17254	NC_021905	CTT	2	6	834826	834831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827622
17255	NC_021905	ATG	2	6	834878	834883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827622
17256	NC_021905	CGC	2	6	834907	834912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827622
17257	NC_021905	ATT	2	6	834917	834922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528827622
17258	NC_021905	GTG	2	6	834976	834981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827622
17259	NC_021905	CCG	2	6	834993	834998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827622
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17261	NC_021905	GCA	2	6	835075	835080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827622
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17264	NC_021905	CTG	2	6	835224	835229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827623
17265	NC_021905	TCG	2	6	835241	835246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827623
17266	NC_021905	GC	3	6	835283	835288	0 %	0 %	50 %	50 %	528827623
17267	NC_021905	GAT	2	6	835344	835349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827623
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17269	NC_021905	TCG	2	6	835501	835506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827623
17270	NC_021905	CCG	2	6	835561	835566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827623
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17274	NC_021905	ATG	2	6	835624	835629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827623
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17307	NC_021905	AT	3	6	836878	836883	50 %	50 %	0 %	0 %	528827624
17308	NC_021905	CGC	2	6	836920	836925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827624
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17312	NC_021905	AGCA	2	8	836989	836996	50 %	0 %	25 %	25 %	528827624
17313	NC_021905	ATCA	2	8	837026	837033	50 %	25 %	0 %	25 %	528827624
17314	NC_021905	CGT	2	6	837061	837066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827624
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17318	NC_021905	GC	3	6	837381	837386	0 %	0 %	50 %	50 %	528827624
17319	NC_021905	CG	4	8	837448	837455	0 %	0 %	50 %	50 %	528827624
17320	NC_021905	GGC	2	6	837473	837478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827624
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17322	NC_021905	TCG	2	6	837510	837515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827624
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17325	NC_021905	GGAA	2	8	837619	837626	50 %	0 %	50 %	0 %	528827624
17326	NC_021905	GCT	2	6	837673	837678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827624
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17330	NC_021905	TCG	2	6	837813	837818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827624
17331	NC_021905	GGC	2	6	837830	837835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827624
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17334	NC_021905	TGC	3	9	838138	838146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17335	NC_021905	CT	3	6	838230	838235	0 %	50 %	0 %	50 %	528827625
17336	NC_021905	CGG	2	6	838289	838294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827625
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17338	NC_021905	GTC	2	6	838377	838382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17339	NC_021905	TGA	2	6	838432	838437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827625
17340	NC_021905	GTC	2	6	838464	838469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17341	NC_021905	GCC	2	6	838480	838485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827625
17342	NC_021905	TCG	2	6	838486	838491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17343	NC_021905	TTCGC	2	10	838513	838522	0 %	40 %	20 %	40 %	528827625
17344	NC_021905	AGA	2	6	838537	838542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827625
17345	NC_021905	TGA	2	6	838552	838557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827625
17346	NC_021905	CAG	2	6	838596	838601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17347	NC_021905	CTG	2	6	838614	838619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17348	NC_021905	TCGCA	2	10	838623	838632	20 %	20 %	20 %	40 %	528827625
17349	NC_021905	GCT	2	6	838640	838645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17350	NC_021905	GTC	2	6	838647	838652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17351	NC_021905	TCA	2	6	838678	838683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827625
17352	NC_021905	CGC	4	12	838751	838762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827625
17353	NC_021905	GTC	2	6	838830	838835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
17354	NC_021905	AAG	2	6	838887	838892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827625
17355	NC_021905	CAC	2	6	839009	839014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827625
17356	NC_021905	TCG	2	6	839020	839025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827625
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17471	NC_021905	GAT	2	6	844165	844170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827631
17472	NC_021905	TGA	2	6	844233	844238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827631
17473	NC_021905	GCT	2	6	844242	844247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827631
17474	NC_021905	CGG	2	6	844287	844292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827631
17475	NC_021905	CGG	2	6	844314	844319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827631
17476	NC_021905	CGA	2	6	844341	844346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827631
17477	NC_021905	GGC	2	6	844666	844671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827632
17478	NC_021905	CCTC	2	8	844689	844696	0 %	25 %	0 %	75 %	528827632
17479	NC_021905	CCTCG	2	10	844801	844810	0 %	20 %	20 %	60 %	528827632
17480	NC_021905	T	6	6	844813	844818	0 %	100 %	0 %	0 %	528827632
17481	NC_021905	TTC	2	6	844874	844879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827632
17482	NC_021905	CGA	2	6	844888	844893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827632
17483	NC_021905	CTTC	2	8	845129	845136	0 %	50 %	0 %	50 %	528827633
17484	NC_021905	CTGC	2	8	845141	845148	0 %	25 %	25 %	50 %	528827633
17485	NC_021905	TGC	2	6	845154	845159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827633
17486	NC_021905	CGGC	2	8	845171	845178	0 %	0 %	50 %	50 %	528827633
17487	NC_021905	GGCC	2	8	845189	845196	0 %	0 %	50 %	50 %	528827633
17488	NC_021905	ATC	2	6	845197	845202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827633
17489	NC_021905	CCGGTT	2	12	845255	845266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827633
17490	NC_021905	GTC	2	6	845434	845439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827633
17491	NC_021905	GCCC	2	8	845450	845457	0 %	0 %	25 %	75 %	528827633
17492	NC_021905	GCA	2	6	845480	845485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827633
17493	NC_021905	GGC	2	6	845523	845528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827633
17494	NC_021905	TTG	2	6	845584	845589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528827633
17495	NC_021905	GGCTC	2	10	845616	845625	0 %	20 %	40 %	40 %	528827633
17496	NC_021905	TGC	2	6	845702	845707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827633
17497	NC_021905	CGG	2	6	845717	845722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827633
17498	NC_021905	GCC	2	6	845740	845745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827633
17499	NC_021905	TCG	2	6	845753	845758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827633
17500	NC_021905	CG	3	6	845785	845790	0 %	0 %	50 %	50 %	528827633

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