MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 89164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021905	GATCG	2	10	619157	619166	20 %	20 %	40 %	20 %	528827445
13002	NC_021905	GCA	2	6	619180	619185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827445
13003	NC_021905	CAG	2	6	619232	619237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827445
13004	NC_021905	CCG	2	6	619238	619243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827445
13005	NC_021905	GCA	2	6	619255	619260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827445
13006	NC_021905	GCC	3	9	619378	619386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827446
13007	NC_021905	CCAC	2	8	619446	619453	25 %	0 %	0 %	75 %	528827446
13008	NC_021905	TCA	2	6	619479	619484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827446
13009	NC_021905	CCT	2	6	619494	619499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827446
13010	NC_021905	GCGG	2	8	619504	619511	0 %	0 %	75 %	25 %	528827446
13011	NC_021905	GGC	2	6	619519	619524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827446
13012	NC_021905	GCCG	2	8	619594	619601	0 %	0 %	50 %	50 %	528827446
13013	NC_021905	TGC	2	6	619635	619640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13014	NC_021905	GC	3	6	619742	619747	0 %	0 %	50 %	50 %	528827446
13015	NC_021905	GGC	2	6	619804	619809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827446
13016	NC_021905	GCG	2	6	619812	619817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827446
13017	NC_021905	TGATC	2	10	619857	619866	20 %	40 %	20 %	20 %	528827446
13018	NC_021905	CTTC	2	8	619875	619882	0 %	50 %	0 %	50 %	528827446
13019	NC_021905	AGC	2	6	619883	619888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13020	NC_021905	CATAGG	2	12	619908	619919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528827446
13021	NC_021905	CAC	2	6	619936	619941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827446
13022	NC_021905	GGC	2	6	619975	619980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827446
13023	NC_021905	GCC	2	6	619981	619986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827446
13024	NC_021905	GAT	2	6	619999	620004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827446
13025	NC_021905	GAC	2	6	620092	620097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13026	NC_021905	GC	3	6	620189	620194	0 %	0 %	50 %	50 %	528827446
13027	NC_021905	GCG	2	6	620198	620203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827446
13028	NC_021905	CGC	3	9	620206	620214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827446
13029	NC_021905	TGA	2	6	620235	620240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827446
13030	NC_021905	GCC	2	6	620260	620265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827446
13031	NC_021905	GGC	2	6	620281	620286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827446
13032	NC_021905	ACC	2	6	620355	620360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827446
13033	NC_021905	GCA	2	6	620412	620417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13034	NC_021905	TCA	2	6	620418	620423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827446
13035	NC_021905	TGA	2	6	620469	620474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827446
13036	NC_021905	GTC	2	6	620485	620490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13037	NC_021905	GC	3	6	620521	620526	0 %	0 %	50 %	50 %	528827446
13038	NC_021905	GTC	2	6	620642	620647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13039	NC_021905	CGA	2	6	620685	620690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13040	NC_021905	GCC	2	6	620752	620757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827446
13041	NC_021905	CCG	2	6	620792	620797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827446
13042	NC_021905	GCC	2	6	620812	620817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827446
13043	NC_021905	GTC	2	6	620864	620869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13044	NC_021905	CAT	2	6	620872	620877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827446
13045	NC_021905	GCA	2	6	620879	620884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827446
13046	NC_021905	GAT	2	6	620897	620902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827446
13047	NC_021905	CTC	2	6	620927	620932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827447
13048	NC_021905	GGC	2	6	620955	620960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827447
13049	NC_021905	CGA	2	6	621038	621043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827447
13050	NC_021905	CGC	2	6	621045	621050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827447
13051	NC_021905	TGA	2	6	621092	621097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827447
13052	NC_021905	GTT	2	6	621156	621161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528827447
13053	NC_021905	CAG	2	6	621174	621179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827447
13054	NC_021905	GC	3	6	621253	621258	0 %	0 %	50 %	50 %	528827447
13055	NC_021905	TCG	3	9	621271	621279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827447
13056	NC_021905	ATC	2	6	621283	621288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827447
13057	NC_021905	CGG	2	6	621325	621330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827447
13058	NC_021905	GC	3	6	621359	621364	0 %	0 %	50 %	50 %	528827447
13059	NC_021905	AGC	2	6	621391	621396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827447
13060	NC_021905	GATGCC	2	12	621423	621434	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528827447
13061	NC_021905	GCG	2	6	621435	621440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827447
13062	NC_021905	AGC	2	6	621538	621543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827447
13063	NC_021905	GC	3	6	621614	621619	0 %	0 %	50 %	50 %	528827447
13064	NC_021905	GAG	2	6	621890	621895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827448
13065	NC_021905	CCG	2	6	621981	621986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827448
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13067	NC_021905	TCT	2	6	621996	622001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827448
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13069	NC_021905	CGT	2	6	622033	622038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827448
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13072	NC_021905	CTG	2	6	622135	622140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827448
13073	NC_021905	GC	3	6	622177	622182	0 %	0 %	50 %	50 %	528827448
13074	NC_021905	CAG	2	6	622189	622194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827448
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13078	NC_021905	GCG	2	6	622360	622365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827448
13079	NC_021905	CGC	2	6	622404	622409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827448
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13089	NC_021905	TGC	2	6	622710	622715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827448
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13091	NC_021905	GAT	2	6	622759	622764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827448
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13100	NC_021905	GGCG	2	8	623579	623586	0 %	0 %	75 %	25 %	528827449
13101	NC_021905	TCA	2	6	623593	623598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827449
13102	NC_021905	CGATGC	2	12	623615	623626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528827449
13103	NC_021905	AAG	2	6	623628	623633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827449
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13105	NC_021905	TTC	2	6	623655	623660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827449
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13107	NC_021905	GCT	2	6	623822	623827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827449
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13115	NC_021905	CCG	2	6	624166	624171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827449
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13117	NC_021905	CTG	2	6	624472	624477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827450
13118	NC_021905	GGC	2	6	624478	624483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827450
13119	NC_021905	TTTC	2	8	624509	624516	0 %	75 %	0 %	25 %	528827450
13120	NC_021905	ATC	2	6	624530	624535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827450
13121	NC_021905	CGC	2	6	624542	624547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827450
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13123	NC_021905	TGG	2	6	624659	624664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827450
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13125	NC_021905	CTG	2	6	624697	624702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827450
13126	NC_021905	CGA	2	6	624728	624733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827450
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13132	NC_021905	GAG	2	6	624928	624933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827450
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13149	NC_021905	TCCTGA	2	12	625920	625931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	528827451
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13152	NC_021905	CGG	2	6	626047	626052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827451
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13154	NC_021905	GCT	2	6	626074	626079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827451
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13200	NC_021905	CCG	2	6	628058	628063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827452
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13204	NC_021905	A	7	7	628172	628178	100 %	0 %	0 %	0 %	528827452
13205	NC_021905	TC	3	6	628200	628205	0 %	50 %	0 %	50 %	528827452
13206	NC_021905	CTCG	2	8	628338	628345	0 %	25 %	25 %	50 %	528827453
13207	NC_021905	CGA	2	6	628373	628378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827453
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13210	NC_021905	TTC	2	6	628523	628528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827453
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13213	NC_021905	TCGA	2	8	628606	628613	25 %	25 %	25 %	25 %	528827453
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13220	NC_021905	TGA	2	6	628877	628882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827453
13221	NC_021905	GAAG	2	8	628893	628900	50 %	0 %	50 %	0 %	528827453
13222	NC_021905	AGC	2	6	628946	628951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827453
13223	NC_021905	GAT	2	6	628959	628964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827453
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13226	NC_021905	GGC	2	6	628992	628997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827453
13227	NC_021905	TCA	2	6	629039	629044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528827453
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13229	NC_021905	GGCG	2	8	629083	629090	0 %	0 %	75 %	25 %	528827453
13230	NC_021905	CTT	3	9	629129	629137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827454
13231	NC_021905	CGC	2	6	629150	629155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827454
13232	NC_021905	CCG	2	6	629278	629283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827454
13233	NC_021905	CCGTGC	2	12	629291	629302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528827454
13234	NC_021905	CCG	2	6	629317	629322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827454
13235	NC_021905	TCC	2	6	629359	629364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827454
13236	NC_021905	TCG	2	6	629380	629385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827454
13237	NC_021905	CGG	2	6	629413	629418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827454
13238	NC_021905	GCG	2	6	629482	629487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827454
13239	NC_021905	CAC	2	6	629489	629494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528827454
13240	NC_021905	GCC	2	6	629507	629512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827454
13241	NC_021905	GGC	2	6	629528	629533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827454
13242	NC_021905	GCG	3	9	629571	629579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827454
13243	NC_021905	GTCG	2	8	629651	629658	0 %	25 %	50 %	25 %	528827454
13244	NC_021905	GCA	2	6	629731	629736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827454
13245	NC_021905	GCCG	2	8	629824	629831	0 %	0 %	50 %	50 %	528827454
13246	NC_021905	TCCG	2	8	629837	629844	0 %	25 %	25 %	50 %	528827454
13247	NC_021905	GAC	2	6	629873	629878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827454
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13250	NC_021905	GTC	2	6	630179	630184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827454
13251	NC_021905	GAAT	2	8	630185	630192	50 %	25 %	25 %	0 %	528827454
13252	NC_021905	GCC	2	6	630243	630248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827454
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13257	NC_021905	TCG	2	6	630537	630542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827454
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13264	NC_021905	CCG	2	6	630733	630738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827454
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13268	NC_021905	GTG	2	6	630988	630993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528827454
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13273	NC_021905	CTT	2	6	631146	631151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528827455
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13340	NC_021905	GC	3	6	634248	634253	0 %	0 %	50 %	50 %	528827459
13341	NC_021905	ACG	2	6	634321	634326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827459
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13350	NC_021905	CGG	2	6	634834	634839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827460
13351	NC_021905	GCGCTG	2	12	634901	634912	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528827460
13352	NC_021905	GCT	2	6	634933	634938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827460
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13355	NC_021905	GCC	2	6	635024	635029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827460
13356	NC_021905	GCT	2	6	635071	635076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827460
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13466	NC_021905	TCCCG	2	10	639467	639476	0 %	20 %	20 %	60 %	528827464
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13472	NC_021905	CTC	2	6	639761	639766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827464
13473	NC_021905	GCT	2	6	639835	639840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827464
13474	NC_021905	GCC	2	6	639919	639924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827464
13475	NC_021905	CGT	3	9	639931	639939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827464
13476	NC_021905	GAG	2	6	639962	639967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528827464
13477	NC_021905	TGC	2	6	640051	640056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827464
13478	NC_021905	CTC	2	6	640109	640114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827464
13479	NC_021905	CG	4	8	640119	640126	0 %	0 %	50 %	50 %	528827464
13480	NC_021905	CGA	2	6	640150	640155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827464
13481	NC_021905	CGC	2	6	640168	640173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827464
13482	NC_021905	GAC	3	9	640175	640183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528827464
13483	NC_021905	GCC	2	6	640225	640230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827464
13484	NC_021905	CGT	2	6	640244	640249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827464
13485	NC_021905	GAT	2	6	640253	640258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827464
13486	NC_021905	TCC	2	6	640263	640268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528827464
13487	NC_021905	CGT	2	6	640297	640302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827464
13488	NC_021905	GCC	2	6	640386	640391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528827464
13489	NC_021905	CGATGA	2	12	640423	640434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528827464
13490	NC_021905	TGC	2	6	640447	640452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528827464
13491	NC_021905	GC	3	6	640459	640464	0 %	0 %	50 %	50 %	528827464
13492	NC_021905	GTT	2	6	640496	640501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528827464
13493	NC_021905	TAG	2	6	640512	640517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528827464
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13499	NC_021905	GAA	2	6	640646	640651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528827464
13500	NC_021905	GCG	2	6	640654	640659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528827464

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